MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010263	CTAT	2	8	117295	117302	25 %	50 %	0 %	25 %	165932683
3002	NC_010263	TAA	2	6	117303	117308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932683
3003	NC_010263	T	6	6	117320	117325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010263	TAA	2	6	117332	117337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010263	TGC	2	6	117433	117438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932684
3006	NC_010263	TGC	2	6	117448	117453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932684
3007	NC_010263	ATG	2	6	117492	117497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932684
3008	NC_010263	TTA	2	6	117513	117518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932684
3009	NC_010263	TA	3	6	117665	117670	50 %	50 %	0 %	0 %	165932684
3010	NC_010263	A	7	7	117802	117808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010263	GTC	2	6	117881	117886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_010263	CTA	2	6	117943	117948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_010263	GTT	2	6	117957	117962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_010263	TAT	2	6	118001	118006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932685
3015	NC_010263	TAC	2	6	118102	118107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932685
3016	NC_010263	AGA	2	6	118108	118113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932685
3017	NC_010263	T	6	6	118189	118194	0 %	100 %	0 %	0 %	165932686
3018	NC_010263	AGT	2	6	118323	118328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010263	TAT	2	6	118332	118337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010263	TAA	2	6	118502	118507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932687
3021	NC_010263	ATT	2	6	118548	118553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932687
3022	NC_010263	TTAGT	2	10	118571	118580	20 %	60 %	20 %	0 %	165932687
3023	NC_010263	GCT	2	6	118612	118617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932687
3024	NC_010263	ATA	2	6	118675	118680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932687
3025	NC_010263	TGC	2	6	118695	118700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932687
3026	NC_010263	CCG	2	6	118735	118740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932687
3027	NC_010263	A	7	7	118763	118769	100 %	0 %	0 %	0 %	165932687
3028	NC_010263	TA	3	6	118797	118802	50 %	50 %	0 %	0 %	165932687
3029	NC_010263	ATC	2	6	118806	118811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932687
3030	NC_010263	TAGCGG	2	12	118841	118852	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	165932687
3031	NC_010263	ATA	2	6	118918	118923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932687
3032	NC_010263	CTT	2	6	119051	119056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932687
3033	NC_010263	A	6	6	119193	119198	100 %	0 %	0 %	0 %	165932687
3034	NC_010263	TAG	2	6	119253	119258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932687
3035	NC_010263	ATA	2	6	119365	119370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932687
3036	NC_010263	TATC	2	8	119372	119379	25 %	50 %	0 %	25 %	165932687
3037	NC_010263	AAG	2	6	119447	119452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932687
3038	NC_010263	AACG	2	8	119462	119469	50 %	0 %	25 %	25 %	165932687
3039	NC_010263	TAT	2	6	119489	119494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932687
3040	NC_010263	TGCT	2	8	119528	119535	0 %	50 %	25 %	25 %	165932687
3041	NC_010263	TTA	2	6	119668	119673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932687
3042	NC_010263	TCT	2	6	119752	119757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932687
3043	NC_010263	TAA	2	6	119766	119771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932687
3044	NC_010263	TAA	2	6	119802	119807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932687
3045	NC_010263	ATA	2	6	119823	119828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932687
3046	NC_010263	TAA	2	6	119829	119834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932687
3047	NC_010263	CAT	2	6	119835	119840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932687
3048	NC_010263	TAT	2	6	119963	119968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932688
3049	NC_010263	TAA	2	6	120022	120027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932688
3050	NC_010263	TA	3	6	120076	120081	50 %	50 %	0 %	0 %	165932688
3051	NC_010263	TAT	2	6	120110	120115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932688
3052	NC_010263	TAG	2	6	120175	120180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932688
3053	NC_010263	CTA	2	6	120184	120189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932688
3054	NC_010263	CTA	2	6	120211	120216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932688
3055	NC_010263	AAGTA	2	10	120394	120403	60 %	20 %	20 %	0 %	165932688
3056	NC_010263	TATT	2	8	120453	120460	25 %	75 %	0 %	0 %	165932688
3057	NC_010263	T	6	6	120462	120467	0 %	100 %	0 %	0 %	165932688
3058	NC_010263	T	6	6	120473	120478	0 %	100 %	0 %	0 %	165932688
3059	NC_010263	ATT	2	6	120492	120497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932688
3060	NC_010263	T	7	7	120496	120502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010263	AAGT	2	8	120552	120559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010263	GCT	2	6	120607	120612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_010263	ATG	2	6	120617	120622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010263	TC	3	6	120668	120673	0 %	50 %	0 %	50 %	165932689
3065	NC_010263	TAC	2	6	120761	120766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932689
3066	NC_010263	CTT	2	6	120778	120783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932689
3067	NC_010263	AAT	2	6	120818	120823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932689
3068	NC_010263	T	7	7	120948	120954	0 %	100 %	0 %	0 %	165932689
3069	NC_010263	TA	3	6	120977	120982	50 %	50 %	0 %	0 %	165932689
3070	NC_010263	AGC	2	6	121010	121015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932689
3071	NC_010263	AAT	2	6	121058	121063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932689
3072	NC_010263	T	6	6	121164	121169	0 %	100 %	0 %	0 %	165932689
3073	NC_010263	ATC	2	6	121208	121213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932689
3074	NC_010263	ATC	2	6	121235	121240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932689
3075	NC_010263	TTC	2	6	121295	121300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932689
3076	NC_010263	TAA	3	9	121339	121347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932689
3077	NC_010263	AAT	2	6	121490	121495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932689
3078	NC_010263	TA	4	8	121534	121541	50 %	50 %	0 %	0 %	165932689
3079	NC_010263	CCG	2	6	121551	121556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932689
3080	NC_010263	TAT	2	6	121565	121570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932689
3081	NC_010263	TCA	2	6	121572	121577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932689
3082	NC_010263	TAT	2	6	121591	121596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932689
3083	NC_010263	TTGC	2	8	121621	121628	0 %	50 %	25 %	25 %	165932689
3084	NC_010263	CGC	2	6	121691	121696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932689
3085	NC_010263	ATA	2	6	121749	121754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932689
3086	NC_010263	T	6	6	121766	121771	0 %	100 %	0 %	0 %	165932689
3087	NC_010263	T	7	7	121783	121789	0 %	100 %	0 %	0 %	165932689
3088	NC_010263	AAT	2	6	121838	121843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932689
3089	NC_010263	TA	3	6	121882	121887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010263	AT	3	6	121913	121918	50 %	50 %	0 %	0 %	165932690
3091	NC_010263	ATA	2	6	121960	121965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932690
3092	NC_010263	CTT	2	6	122008	122013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932690
3093	NC_010263	T	6	6	122019	122024	0 %	100 %	0 %	0 %	165932690
3094	NC_010263	T	7	7	122048	122054	0 %	100 %	0 %	0 %	165932690
3095	NC_010263	T	6	6	122064	122069	0 %	100 %	0 %	0 %	165932690
3096	NC_010263	TCC	2	6	122083	122088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_010263	CTCAAT	2	12	122106	122117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_010263	T	7	7	122167	122173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_010263	ATTCG	2	10	122174	122183	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3100	NC_010263	AGATT	2	10	122192	122201	40 %	40 %	20 %	0 %	165932691
3101	NC_010263	TTC	3	9	122233	122241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932691
3102	NC_010263	AAT	2	6	122251	122256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932691
3103	NC_010263	TTCT	2	8	122267	122274	0 %	75 %	0 %	25 %	165932691
3104	NC_010263	TAA	2	6	122277	122282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932691
3105	NC_010263	T	6	6	122330	122335	0 %	100 %	0 %	0 %	165932691
3106	NC_010263	CTAC	2	8	122368	122375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_010263	TAA	2	6	122381	122386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_010263	ATT	3	9	122428	122436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010263	TAT	2	6	122465	122470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010263	TAAAA	2	10	122509	122518	80 %	20 %	0 %	0 %	165932692
3111	NC_010263	ATT	2	6	122532	122537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932692
3112	NC_010263	TAA	2	6	122547	122552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932692
3113	NC_010263	TTA	2	6	122565	122570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932692
3114	NC_010263	TA	3	6	122597	122602	50 %	50 %	0 %	0 %	165932692
3115	NC_010263	CT	3	6	122621	122626	0 %	50 %	0 %	50 %	165932692
3116	NC_010263	TA	3	6	122667	122672	50 %	50 %	0 %	0 %	165932692
3117	NC_010263	ATG	2	6	122685	122690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932692
3118	NC_010263	T	6	6	122720	122725	0 %	100 %	0 %	0 %	165932692
3119	NC_010263	T	6	6	122770	122775	0 %	100 %	0 %	0 %	165932692
3120	NC_010263	A	6	6	122776	122781	100 %	0 %	0 %	0 %	165932692
3121	NC_010263	T	6	6	122848	122853	0 %	100 %	0 %	0 %	165932692
3122	NC_010263	CTA	2	6	122931	122936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932692
3123	NC_010263	TAA	2	6	122941	122946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932692
3124	NC_010263	AT	3	6	123176	123181	50 %	50 %	0 %	0 %	165932692
3125	NC_010263	AAAAC	2	10	123205	123214	80 %	0 %	0 %	20 %	165932692
3126	NC_010263	TAA	2	6	123217	123222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932692
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3134	NC_010263	T	6	6	123406	123411	0 %	100 %	0 %	0 %	165932692
3135	NC_010263	A	7	7	123414	123420	100 %	0 %	0 %	0 %	165932692
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3352	NC_010263	TAA	2	6	131448	131453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3369	NC_010263	T	7	7	132332	132338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3370	NC_010263	ATT	2	6	132339	132344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3371	NC_010263	T	6	6	132343	132348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3372	NC_010263	ACT	2	6	132371	132376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3374	NC_010263	ATT	2	6	132439	132444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3375	NC_010263	AGC	2	6	132454	132459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3376	NC_010263	T	6	6	132523	132528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3377	NC_010263	CTG	2	6	132565	132570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932710
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3379	NC_010263	TCA	2	6	132653	132658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932710
3380	NC_010263	AAATC	2	10	132689	132698	60 %	20 %	0 %	20 %	165932710
3381	NC_010263	TAA	2	6	132760	132765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932710
3382	NC_010263	TAA	3	9	132776	132784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932710
3383	NC_010263	TTA	2	6	132856	132861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932710
3384	NC_010263	TTA	2	6	132935	132940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932710
3385	NC_010263	GTTA	2	8	132965	132972	25 %	50 %	25 %	0 %	165932710
3386	NC_010263	ATTG	2	8	132977	132984	25 %	50 %	25 %	0 %	165932710
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3482	NC_010263	GCTTT	2	10	137521	137530	0 %	60 %	20 %	20 %	165932714
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3485	NC_010263	TTGCTA	2	12	137587	137598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	165932714
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3488	NC_010263	TGA	2	6	137696	137701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932714
3489	NC_010263	AT	3	6	137733	137738	50 %	50 %	0 %	0 %	165932714
3490	NC_010263	AAGATA	2	12	137752	137763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	165932714
3491	NC_010263	AT	3	6	137816	137821	50 %	50 %	0 %	0 %	165932714
3492	NC_010263	CTTTAG	2	12	137914	137925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	165932714
3493	NC_010263	GATG	2	8	137946	137953	25 %	25 %	50 %	0 %	165932714
3494	NC_010263	AGT	2	6	137987	137992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932714
3495	NC_010263	TATGT	2	10	138171	138180	20 %	60 %	20 %	0 %	165932714
3496	NC_010263	T	6	6	138180	138185	0 %	100 %	0 %	0 %	165932714
3497	NC_010263	GCC	2	6	138215	138220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932714
3498	NC_010263	TA	3	6	138231	138236	50 %	50 %	0 %	0 %	165932714
3499	NC_010263	TGC	2	6	138395	138400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932714
3500	NC_010263	TCCG	2	8	138401	138408	0 %	25 %	25 %	50 %	165932714

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