MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_010263	TA	3	6	1258012	1258017	50 %	50 %	0 %	0 %	165933924
32003	NC_010263	T	8	8	1258049	1258056	0 %	100 %	0 %	0 %	165933924
32004	NC_010263	CTA	2	6	1258069	1258074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933924
32005	NC_010263	T	6	6	1258132	1258137	0 %	100 %	0 %	0 %	165933924
32006	NC_010263	TG	3	6	1258153	1258158	0 %	50 %	50 %	0 %	165933924
32007	NC_010263	ACTAT	2	10	1258179	1258188	40 %	40 %	0 %	20 %	165933924
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32009	NC_010263	CTT	2	6	1258291	1258296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933924
32010	NC_010263	AGT	2	6	1258376	1258381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933924
32011	NC_010263	TACT	2	8	1258423	1258430	25 %	50 %	0 %	25 %	165933924
32012	NC_010263	TTGT	2	8	1258436	1258443	0 %	75 %	25 %	0 %	165933924
32013	NC_010263	TAG	3	9	1258486	1258494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933924
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32015	NC_010263	AACCT	2	10	1258572	1258581	40 %	20 %	0 %	40 %	165933924
32016	NC_010263	CAA	2	6	1258609	1258614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933924
32017	NC_010263	GATT	2	8	1258621	1258628	25 %	50 %	25 %	0 %	165933924
32018	NC_010263	AAT	2	6	1258669	1258674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933924
32019	NC_010263	TAA	2	6	1258703	1258708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933924
32020	NC_010263	TAT	2	6	1258726	1258731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933924
32021	NC_010263	TAA	2	6	1258732	1258737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933924
32022	NC_010263	TAT	2	6	1258765	1258770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933924
32023	NC_010263	CTA	2	6	1258779	1258784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933924
32024	NC_010263	TA	3	6	1258823	1258828	50 %	50 %	0 %	0 %	165933924
32025	NC_010263	GCG	2	6	1258830	1258835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933924
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32038	NC_010263	TAC	2	6	1259386	1259391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933924
32039	NC_010263	TAC	2	6	1259423	1259428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933924
32040	NC_010263	GCA	2	6	1259457	1259462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933924
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32044	NC_010263	ATCT	2	8	1259562	1259569	25 %	50 %	0 %	25 %	165933925
32045	NC_010263	TAAA	2	8	1259571	1259578	75 %	25 %	0 %	0 %	165933925
32046	NC_010263	ATT	2	6	1259662	1259667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933925
32047	NC_010263	TAAA	2	8	1259699	1259706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32048	NC_010263	TTG	2	6	1259755	1259760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32049	NC_010263	GTAA	2	8	1259798	1259805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32050	NC_010263	CA	3	6	1259843	1259848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32051	NC_010263	GCTG	2	8	1259879	1259886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32052	NC_010263	AAT	2	6	1259918	1259923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32053	NC_010263	A	6	6	1260017	1260022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32054	NC_010263	A	6	6	1260041	1260046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32055	NC_010263	AAT	2	6	1260177	1260182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933926
32056	NC_010263	AC	3	6	1260217	1260222	50 %	0 %	0 %	50 %	165933926
32057	NC_010263	A	6	6	1260318	1260323	100 %	0 %	0 %	0 %	165933926
32058	NC_010263	TGA	2	6	1260335	1260340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933926
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32064	NC_010263	TAAC	2	8	1260470	1260477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32065	NC_010263	CTT	2	6	1260486	1260491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32105	NC_010263	TC	3	6	1262490	1262495	0 %	50 %	0 %	50 %	165933929
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32115	NC_010263	CGG	2	6	1263085	1263090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933929
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32120	NC_010263	TAA	2	6	1263226	1263231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933929
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32247	NC_010263	TTA	2	6	1267828	1267833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32257	NC_010263	A	6	6	1268157	1268162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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