MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010263	TGC	2	6	98580	98585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932668
2502	NC_010263	GAT	2	6	98665	98670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932668
2503	NC_010263	AG	3	6	98692	98697	50 %	0 %	50 %	0 %	165932668
2504	NC_010263	AATT	2	8	98699	98706	50 %	50 %	0 %	0 %	165932668
2505	NC_010263	GCA	2	6	98746	98751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932668
2506	NC_010263	A	6	6	98815	98820	100 %	0 %	0 %	0 %	165932668
2507	NC_010263	TA	3	6	98912	98917	50 %	50 %	0 %	0 %	165932668
2508	NC_010263	TGA	2	6	98925	98930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932668
2509	NC_010263	ATT	2	6	98944	98949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932668
2510	NC_010263	TATT	2	8	98954	98961	25 %	75 %	0 %	0 %	165932668
2511	NC_010263	TGC	2	6	98988	98993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932668
2512	NC_010263	CGG	2	6	98994	98999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932668
2513	NC_010263	ATG	2	6	99050	99055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932668
2514	NC_010263	ACA	2	6	99060	99065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932668
2515	NC_010263	TAAT	2	8	99091	99098	50 %	50 %	0 %	0 %	165932668
2516	NC_010263	CTT	2	6	99110	99115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932669
2517	NC_010263	A	7	7	99124	99130	100 %	0 %	0 %	0 %	165932669
2518	NC_010263	ATG	2	6	99149	99154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932669
2519	NC_010263	TAT	2	6	99161	99166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932669
2520	NC_010263	AAT	2	6	99184	99189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932669
2521	NC_010263	AATA	2	8	99204	99211	75 %	25 %	0 %	0 %	165932669
2522	NC_010263	TAA	2	6	99213	99218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932669
2523	NC_010263	TAA	2	6	99270	99275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932669
2524	NC_010263	TA	3	6	99310	99315	50 %	50 %	0 %	0 %	165932669
2525	NC_010263	TAG	2	6	99335	99340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932669
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2527	NC_010263	TGT	2	6	99384	99389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932669
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2529	NC_010263	AC	3	6	99442	99447	50 %	0 %	0 %	50 %	165932669
2530	NC_010263	GAT	2	6	99520	99525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932669
2531	NC_010263	AAT	2	6	99541	99546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932669
2532	NC_010263	ATA	2	6	99560	99565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932669
2533	NC_010263	AGA	3	9	99594	99602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932669
2534	NC_010263	TCAAA	2	10	99620	99629	60 %	20 %	0 %	20 %	165932669
2535	NC_010263	A	6	6	99684	99689	100 %	0 %	0 %	0 %	165932669
2536	NC_010263	TTTC	2	8	99805	99812	0 %	75 %	0 %	25 %	165932669
2537	NC_010263	TA	3	6	99817	99822	50 %	50 %	0 %	0 %	165932669
2538	NC_010263	GGA	2	6	99838	99843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932669
2539	NC_010263	TTA	2	6	99905	99910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932669
2540	NC_010263	AAT	2	6	99914	99919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932669
2541	NC_010263	T	7	7	100051	100057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_010263	TCCA	2	8	100104	100111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_010263	AAT	2	6	100187	100192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_010263	AAGC	2	8	100199	100206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2545	NC_010263	CTA	2	6	100276	100281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932670
2546	NC_010263	TAG	2	6	100390	100395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932670
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2548	NC_010263	AT	3	6	100454	100459	50 %	50 %	0 %	0 %	165932670
2549	NC_010263	T	9	9	100508	100516	0 %	100 %	0 %	0 %	165932670
2550	NC_010263	TCA	2	6	100525	100530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932670
2551	NC_010263	TCA	2	6	100533	100538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932670
2552	NC_010263	AAG	2	6	100726	100731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932670
2553	NC_010263	T	6	6	100780	100785	0 %	100 %	0 %	0 %	165932670
2554	NC_010263	T	6	6	100804	100809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_010263	ACT	2	6	100884	100889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932671
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2557	NC_010263	T	6	6	100941	100946	0 %	100 %	0 %	0 %	165932671
2558	NC_010263	TAA	2	6	100978	100983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932671
2559	NC_010263	AGC	2	6	101054	101059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932671
2560	NC_010263	TTC	2	6	101126	101131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932671
2561	NC_010263	AT	3	6	101251	101256	50 %	50 %	0 %	0 %	165932671
2562	NC_010263	GAT	2	6	101325	101330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932671
2563	NC_010263	AGT	2	6	101337	101342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932671
2564	NC_010263	TCG	2	6	101385	101390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932671
2565	NC_010263	TTAA	2	8	101445	101452	50 %	50 %	0 %	0 %	165932671
2566	NC_010263	TA	3	6	101477	101482	50 %	50 %	0 %	0 %	165932671
2567	NC_010263	CTA	2	6	101499	101504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932671
2568	NC_010263	TAA	3	9	101521	101529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932671
2569	NC_010263	CTG	2	6	101560	101565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932671
2570	NC_010263	TAT	2	6	101630	101635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932671
2571	NC_010263	TAAA	2	8	101677	101684	75 %	25 %	0 %	0 %	165932671
2572	NC_010263	AT	3	6	101686	101691	50 %	50 %	0 %	0 %	165932671
2573	NC_010263	ATT	2	6	101730	101735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932671
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2575	NC_010263	AT	4	8	101749	101756	50 %	50 %	0 %	0 %	165932671
2576	NC_010263	GCA	2	6	101955	101960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932671
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2581	NC_010263	A	6	6	102099	102104	100 %	0 %	0 %	0 %	165932671
2582	NC_010263	TAA	2	6	102221	102226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932671
2583	NC_010263	ATGT	2	8	102254	102261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_010263	TAT	2	6	102265	102270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_010263	A	8	8	102311	102318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_010263	A	7	7	102320	102326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_010263	CCTATA	2	12	102399	102410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932672
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2589	NC_010263	ACCTAT	2	12	102632	102643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932672
2590	NC_010263	AT	3	6	102642	102647	50 %	50 %	0 %	0 %	165932672
2591	NC_010263	GTTT	2	8	102715	102722	0 %	75 %	25 %	0 %	165932672
2592	NC_010263	T	6	6	102720	102725	0 %	100 %	0 %	0 %	165932672
2593	NC_010263	ATT	2	6	102830	102835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932672
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2596	NC_010263	GAG	2	6	102904	102909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932672
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2598	NC_010263	CCT	2	6	102954	102959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932672
2599	NC_010263	AAACT	2	10	102973	102982	60 %	20 %	0 %	20 %	165932672
2600	NC_010263	CAT	3	9	103033	103041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932672
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2603	NC_010263	T	6	6	103100	103105	0 %	100 %	0 %	0 %	165932672
2604	NC_010263	TAT	3	9	103158	103166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_010263	TA	3	6	103181	103186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_010263	ATT	2	6	103258	103263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_010263	AATG	2	8	103274	103281	50 %	25 %	25 %	0 %	165932673
2608	NC_010263	GGTT	2	8	103311	103318	0 %	50 %	50 %	0 %	165932673
2609	NC_010263	TTAGT	2	10	103324	103333	20 %	60 %	20 %	0 %	165932673
2610	NC_010263	AGT	3	9	103335	103343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932673
2611	NC_010263	ATG	2	6	103348	103353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932673
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2613	NC_010263	CTT	2	6	103409	103414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932673
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2618	NC_010263	AT	3	6	103492	103497	50 %	50 %	0 %	0 %	165932673
2619	NC_010263	TTA	3	9	103506	103514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932673
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2621	NC_010263	TAC	2	6	103562	103567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932673
2622	NC_010263	TTTA	2	8	103595	103602	25 %	75 %	0 %	0 %	165932673
2623	NC_010263	T	6	6	103620	103625	0 %	100 %	0 %	0 %	165932673
2624	NC_010263	ATT	2	6	103638	103643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932673
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