MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010263	TAA	2	6	58571	58576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010263	CT	3	6	58599	58604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_010263	TAT	2	6	58672	58677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932622
1504	NC_010263	A	7	7	58711	58717	100 %	0 %	0 %	0 %	165932622
1505	NC_010263	TAA	2	6	58814	58819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932622
1506	NC_010263	TAT	2	6	58820	58825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932622
1507	NC_010263	CTA	2	6	58871	58876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010263	AAG	2	6	58888	58893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_010263	A	8	8	58901	58908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010263	GTTA	2	8	58931	58938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010263	TTA	2	6	58946	58951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010263	TAA	2	6	58976	58981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010263	AGC	2	6	58993	58998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010263	A	7	7	59004	59010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010263	TTA	2	6	59042	59047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010263	CT	4	8	59060	59067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_010263	T	6	6	59097	59102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010263	T	7	7	59104	59110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010263	TCA	2	6	59140	59145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010263	TTAA	2	8	59161	59168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010263	AAT	2	6	59178	59183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010263	TTA	2	6	59205	59210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010263	ATA	2	6	59249	59254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010263	T	6	6	59256	59261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010263	ATA	2	6	59266	59271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010263	TTG	2	6	59319	59324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932623
1527	NC_010263	TA	3	6	59333	59338	50 %	50 %	0 %	0 %	165932623
1528	NC_010263	TAT	2	6	59364	59369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932623
1529	NC_010263	TGA	2	6	59409	59414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932623
1530	NC_010263	ATT	2	6	59425	59430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932623
1531	NC_010263	ATA	2	6	59435	59440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932623
1532	NC_010263	A	7	7	59454	59460	100 %	0 %	0 %	0 %	165932623
1533	NC_010263	TAA	2	6	59499	59504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932623
1534	NC_010263	A	6	6	59506	59511	100 %	0 %	0 %	0 %	165932623
1535	NC_010263	ATT	3	9	59516	59524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932623
1536	NC_010263	T	6	6	59523	59528	0 %	100 %	0 %	0 %	165932623
1537	NC_010263	AGA	2	6	59556	59561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932623
1538	NC_010263	AGAA	2	8	59565	59572	75 %	0 %	25 %	0 %	165932623
1539	NC_010263	TAG	2	6	59628	59633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932623
1540	NC_010263	A	6	6	59652	59657	100 %	0 %	0 %	0 %	165932623
1541	NC_010263	TAA	2	6	59697	59702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932623
1542	NC_010263	TAA	2	6	59742	59747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932624
1543	NC_010263	GCT	2	6	59761	59766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932624
1544	NC_010263	A	6	6	59791	59796	100 %	0 %	0 %	0 %	165932624
1545	NC_010263	T	6	6	59800	59805	0 %	100 %	0 %	0 %	165932624
1546	NC_010263	AGA	2	6	59806	59811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932624
1547	NC_010263	TAA	2	6	59876	59881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932624
1548	NC_010263	AAAG	2	8	59945	59952	75 %	0 %	25 %	0 %	165932624
1549	NC_010263	AAT	2	6	59956	59961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932624
1550	NC_010263	TTA	2	6	59989	59994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932624
1551	NC_010263	TAAA	2	8	60012	60019	75 %	25 %	0 %	0 %	165932624
1552	NC_010263	ATA	2	6	60023	60028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010263	TAA	2	6	60043	60048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932625
1554	NC_010263	TAA	2	6	60155	60160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932625
1555	NC_010263	AGA	2	6	60215	60220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932625
1556	NC_010263	A	6	6	60226	60231	100 %	0 %	0 %	0 %	165932625
1557	NC_010263	TTA	2	6	60241	60246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932625
1558	NC_010263	CAA	2	6	60252	60257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932625
1559	NC_010263	TCGGT	2	10	60298	60307	0 %	40 %	40 %	20 %	165932625
1560	NC_010263	TAA	2	6	60311	60316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932625
1561	NC_010263	AT	3	6	60343	60348	50 %	50 %	0 %	0 %	165932625
1562	NC_010263	TTG	2	6	60460	60465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932625
1563	NC_010263	ATCAGA	2	12	60470	60481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	165932625
1564	NC_010263	ATT	2	6	60490	60495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932625
1565	NC_010263	AGA	2	6	60521	60526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932625
1566	NC_010263	T	8	8	60547	60554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010263	ATC	2	6	60555	60560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_010263	T	6	6	60572	60577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010263	TTG	2	6	60601	60606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010263	T	6	6	60711	60716	0 %	100 %	0 %	0 %	165932626
1571	NC_010263	CAA	2	6	60756	60761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932626
1572	NC_010263	TAC	2	6	60786	60791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932626
1573	NC_010263	ACAA	2	8	60821	60828	75 %	0 %	0 %	25 %	165932626
1574	NC_010263	AAT	2	6	60877	60882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1575	NC_010263	TGG	2	6	60927	60932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932627
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1577	NC_010263	ATA	2	6	60983	60988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1578	NC_010263	ATT	2	6	60993	60998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932627
1579	NC_010263	AAT	2	6	61114	61119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1580	NC_010263	AAGA	2	8	61133	61140	75 %	0 %	25 %	0 %	165932627
1581	NC_010263	TGA	2	6	61163	61168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932627
1582	NC_010263	AT	3	6	61190	61195	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
1583	NC_010263	GAT	2	6	61222	61227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932627
1584	NC_010263	TAG	2	6	61281	61286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932627
1585	NC_010263	TAA	2	6	61305	61310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1586	NC_010263	TA	3	6	61331	61336	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
1587	NC_010263	TAG	2	6	61355	61360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932627
1588	NC_010263	AGTC	2	8	61368	61375	25 %	25 %	25 %	25 %	165932627
1589	NC_010263	ATA	2	6	61376	61381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1590	NC_010263	TTA	2	6	61433	61438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932627
1591	NC_010263	AG	3	6	61495	61500	50 %	0 %	50 %	0 %	165932627
1592	NC_010263	AAT	2	6	61623	61628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1593	NC_010263	CAA	2	6	61633	61638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932627
1594	NC_010263	CAA	2	6	61647	61652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932627
1595	NC_010263	GCTTT	2	10	61724	61733	0 %	60 %	20 %	20 %	165932627
1596	NC_010263	TAAT	2	8	61784	61791	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
1597	NC_010263	T	6	6	61791	61796	0 %	100 %	0 %	0 %	165932627
1598	NC_010263	ATA	2	6	61801	61806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1599	NC_010263	AGC	2	6	61824	61829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932627
1600	NC_010263	ATTA	2	8	61860	61867	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
1601	NC_010263	TA	3	6	61935	61940	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
1602	NC_010263	A	6	6	61954	61959	100 %	0 %	0 %	0 %	165932627
1603	NC_010263	ATA	2	6	62003	62008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1604	NC_010263	A	6	6	62022	62027	100 %	0 %	0 %	0 %	165932627
1605	NC_010263	AAG	2	6	62030	62035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932627
1606	NC_010263	ATA	2	6	62080	62085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932627
1607	NC_010263	ATCT	2	8	62117	62124	25 %	50 %	0 %	25 %	165932627
1608	NC_010263	AT	3	6	62198	62203	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
1609	NC_010263	TAAA	2	8	62308	62315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010263	ATTT	2	8	62329	62336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_010263	CT	3	6	62343	62348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_010263	TTA	2	6	62365	62370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010263	AAT	2	6	62386	62391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932628
1614	NC_010263	TGG	2	6	62475	62480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932628
1615	NC_010263	ATA	2	6	62486	62491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932628
1616	NC_010263	T	6	6	62505	62510	0 %	100 %	0 %	0 %	165932628
1617	NC_010263	TGA	2	6	62520	62525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932628
1618	NC_010263	AGT	2	6	62661	62666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932628
1619	NC_010263	GAAT	2	8	62681	62688	50 %	25 %	25 %	0 %	165932628
1620	NC_010263	T	7	7	62747	62753	0 %	100 %	0 %	0 %	165932628
1621	NC_010263	AGA	2	6	62874	62879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932628
1622	NC_010263	TAG	2	6	62891	62896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932628
1623	NC_010263	T	6	6	62898	62903	0 %	100 %	0 %	0 %	165932628
1624	NC_010263	CAAG	2	8	62912	62919	50 %	0 %	25 %	25 %	165932628
1625	NC_010263	TGG	2	6	62931	62936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932628
1626	NC_010263	GCT	2	6	62951	62956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932628
1627	NC_010263	TCC	2	6	62967	62972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932628
1628	NC_010263	CTT	2	6	62989	62994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932628
1629	NC_010263	T	6	6	63028	63033	0 %	100 %	0 %	0 %	165932628
1630	NC_010263	TTG	2	6	63053	63058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932628
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1632	NC_010263	GGC	2	6	63187	63192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932628
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