MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010263	AGT	2	6	40297	40302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932598
1002	NC_010263	AGC	2	6	40393	40398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932598
1003	NC_010263	TTG	2	6	40434	40439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932598
1004	NC_010263	TTG	2	6	40465	40470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932598
1005	NC_010263	TA	3	6	40497	40502	50 %	50 %	0 %	0 %	165932598
1006	NC_010263	TAA	2	6	40561	40566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932598
1007	NC_010263	AT	3	6	40621	40626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010263	CTTG	2	8	40701	40708	0 %	50 %	25 %	25 %	165932599
1009	NC_010263	CTGA	2	8	40709	40716	25 %	25 %	25 %	25 %	165932599
1010	NC_010263	TAT	2	6	40746	40751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932599
1011	NC_010263	AAT	2	6	40802	40807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932599
1012	NC_010263	T	6	6	40865	40870	0 %	100 %	0 %	0 %	165932599
1013	NC_010263	TA	5	10	40875	40884	50 %	50 %	0 %	0 %	165932599
1014	NC_010263	ATTG	2	8	40887	40894	25 %	50 %	25 %	0 %	165932599
1015	NC_010263	ATCTTT	2	12	40973	40984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1016	NC_010263	TAA	2	6	41009	41014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010263	CTTTT	2	10	41015	41024	0 %	80 %	0 %	20 %	165932601
1018	NC_010263	TAAA	2	8	41043	41050	75 %	25 %	0 %	0 %	165932601
1019	NC_010263	T	6	6	41092	41097	0 %	100 %	0 %	0 %	165932601
1020	NC_010263	AGA	2	6	41135	41140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932601
1021	NC_010263	ATTT	2	8	41148	41155	25 %	75 %	0 %	0 %	165932601
1022	NC_010263	T	6	6	41188	41193	0 %	100 %	0 %	0 %	165932601
1023	NC_010263	TCT	2	6	41231	41236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932601
1024	NC_010263	TAA	2	6	41246	41251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932601
1025	NC_010263	ATTA	2	8	41314	41321	50 %	50 %	0 %	0 %	165932600
1026	NC_010263	TA	3	6	41327	41332	50 %	50 %	0 %	0 %	165932600
1027	NC_010263	CTT	2	6	41364	41369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932600
1028	NC_010263	ATTA	2	8	41371	41378	50 %	50 %	0 %	0 %	165932600
1029	NC_010263	AT	3	6	41396	41401	50 %	50 %	0 %	0 %	165932600
1030	NC_010263	TTATT	2	10	41424	41433	20 %	80 %	0 %	0 %	165932600
1031	NC_010263	ATC	2	6	41458	41463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_010263	TGCT	3	12	41494	41505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_010263	TTTTA	2	10	41528	41537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010263	TCA	2	6	41586	41591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010263	ATT	2	6	41615	41620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010263	GCTT	2	8	41621	41628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_010263	ACT	2	6	41641	41646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_010263	TTTA	2	8	41661	41668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010263	T	6	6	41762	41767	0 %	100 %	0 %	0 %	165932602
1040	NC_010263	TAG	2	6	41784	41789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932602
1041	NC_010263	T	6	6	41805	41810	0 %	100 %	0 %	0 %	165932602
1042	NC_010263	TAG	2	6	41829	41834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932602
1043	NC_010263	AGC	2	6	41851	41856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932602
1044	NC_010263	T	6	6	41894	41899	0 %	100 %	0 %	0 %	165932602
1045	NC_010263	T	7	7	41940	41946	0 %	100 %	0 %	0 %	165932602
1046	NC_010263	TCT	2	6	42025	42030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010263	TTA	2	6	42058	42063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010263	AAT	2	6	42072	42077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010263	ATTA	2	8	42102	42109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010263	TCT	2	6	42174	42179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932603
1051	NC_010263	T	6	6	42179	42184	0 %	100 %	0 %	0 %	165932603
1052	NC_010263	CAT	2	6	42188	42193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932603
1053	NC_010263	ATT	2	6	42230	42235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932603
1054	NC_010263	AGTTG	2	10	42276	42285	20 %	40 %	40 %	0 %	165932603
1055	NC_010263	TTG	3	9	42288	42296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932603
1056	NC_010263	CTA	2	6	42323	42328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932604
1057	NC_010263	T	6	6	42345	42350	0 %	100 %	0 %	0 %	165932604
1058	NC_010263	TAAT	2	8	42395	42402	50 %	50 %	0 %	0 %	165932604
1059	NC_010263	GTT	2	6	42413	42418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932604
1060	NC_010263	T	6	6	42417	42422	0 %	100 %	0 %	0 %	165932604
1061	NC_010263	TAA	2	6	42426	42431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932604
1062	NC_010263	A	6	6	42441	42446	100 %	0 %	0 %	0 %	165932604
1063	NC_010263	TAA	2	6	42459	42464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010263	ATTA	2	8	42465	42472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010263	GAT	2	6	42526	42531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010263	AT	3	6	42541	42546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010263	TAT	2	6	42562	42567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010263	AAAT	2	8	42568	42575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010263	TAA	2	6	42578	42583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010263	ATA	2	6	42602	42607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932605
1071	NC_010263	TAT	2	6	42621	42626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932605
1072	NC_010263	ATA	2	6	42661	42666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932605
1073	NC_010263	TTC	2	6	42684	42689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932605
1074	NC_010263	TAG	2	6	42726	42731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932605
1075	NC_010263	AAG	2	6	42773	42778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932605
1076	NC_010263	GAAA	2	8	42779	42786	75 %	0 %	25 %	0 %	165932605
1077	NC_010263	ATTT	2	8	42823	42830	25 %	75 %	0 %	0 %	165932605
1078	NC_010263	TAC	2	6	42834	42839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932605
1079	NC_010263	AGA	2	6	42876	42881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932605
1080	NC_010263	TAT	2	6	42882	42887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932605
1081	NC_010263	GAA	2	6	42897	42902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932605
1082	NC_010263	AGT	2	6	42921	42926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932605
1083	NC_010263	TTA	2	6	42929	42934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932605
1084	NC_010263	A	7	7	42969	42975	100 %	0 %	0 %	0 %	165932605
1085	NC_010263	A	6	6	42983	42988	100 %	0 %	0 %	0 %	165932605
1086	NC_010263	GAT	2	6	42991	42996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932605
1087	NC_010263	TCT	2	6	43058	43063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932605
1088	NC_010263	ACAA	2	8	43090	43097	75 %	0 %	0 %	25 %	165932605
1089	NC_010263	ACA	2	6	43107	43112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932605
1090	NC_010263	ATT	2	6	43160	43165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932605
1091	NC_010263	TGA	2	6	43220	43225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932606
1092	NC_010263	TCA	2	6	43236	43241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932606
1093	NC_010263	AAAT	2	8	43294	43301	75 %	25 %	0 %	0 %	165932606
1094	NC_010263	TTA	2	6	43305	43310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932606
1095	NC_010263	TTC	3	9	43343	43351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932606
1096	NC_010263	TCT	2	6	43425	43430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932606
1097	NC_010263	TAT	2	6	43489	43494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932606
1098	NC_010263	GAA	2	6	43507	43512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932606
1099	NC_010263	A	6	6	43511	43516	100 %	0 %	0 %	0 %	165932606
1100	NC_010263	AT	3	6	43547	43552	50 %	50 %	0 %	0 %	165932606
1101	NC_010263	GTT	2	6	43569	43574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932606
1102	NC_010263	T	6	6	43584	43589	0 %	100 %	0 %	0 %	165932606
1103	NC_010263	A	6	6	43595	43600	100 %	0 %	0 %	0 %	165932606
1104	NC_010263	CTT	2	6	43654	43659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932606
1105	NC_010263	GT	3	6	43662	43667	0 %	50 %	50 %	0 %	165932606
1106	NC_010263	TA	3	6	43787	43792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010263	AT	3	6	43793	43798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010263	ATT	2	6	43813	43818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010263	AAT	2	6	43833	43838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932607
1110	NC_010263	T	6	6	43846	43851	0 %	100 %	0 %	0 %	165932607
1111	NC_010263	TAT	2	6	43869	43874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932607
1112	NC_010263	TTA	2	6	43940	43945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932607
1113	NC_010263	T	6	6	43965	43970	0 %	100 %	0 %	0 %	165932607
1114	NC_010263	AT	3	6	43977	43982	50 %	50 %	0 %	0 %	165932607
1115	NC_010263	AT	3	6	44001	44006	50 %	50 %	0 %	0 %	165932607
1116	NC_010263	ATT	2	6	44029	44034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932607
1117	NC_010263	TTA	2	6	44146	44151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932607
1118	NC_010263	TAC	2	6	44169	44174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932607
1119	NC_010263	T	6	6	44191	44196	0 %	100 %	0 %	0 %	165932607
1120	NC_010263	GTA	2	6	44254	44259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932607
1121	NC_010263	GGA	2	6	44281	44286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932607
1122	NC_010263	ATT	2	6	44312	44317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932607
1123	NC_010263	AAT	2	6	44401	44406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932607
1124	NC_010263	CT	3	6	44415	44420	0 %	50 %	0 %	50 %	165932607
1125	NC_010263	GAT	2	6	44443	44448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932607
1126	NC_010263	GAT	2	6	44494	44499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932607
1127	NC_010263	ATT	2	6	44542	44547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010263	GAC	2	6	44596	44601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_010263	TACC	2	8	44648	44655	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_010263	AAAC	2	8	44656	44663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_010263	TAAT	2	8	44732	44739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010263	ATTT	2	8	44759	44766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_010263	TAA	2	6	49528	49533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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