MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010263	AT	3	6	19830	19835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010263	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_010263	A	6	6	19872	19877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010263	A	7	7	19880	19886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010263	TTG	2	6	19887	19892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010263	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010263	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010263	ATT	2	6	19969	19974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010263	AT	3	6	20115	20120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010263	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010263	TTTAA	2	10	20162	20171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010263	AAC	2	6	20203	20208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932577
513	NC_010263	A	7	7	20216	20222	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
514	NC_010263	AAG	2	6	20302	20307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
515	NC_010263	TAA	2	6	20327	20332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
516	NC_010263	TTG	2	6	20334	20339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932577
517	NC_010263	GCA	2	6	20387	20392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932577
518	NC_010263	GTA	2	6	20536	20541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
519	NC_010263	A	6	6	20608	20613	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
520	NC_010263	TAA	2	6	20680	20685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
521	NC_010263	TAC	2	6	20750	20755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932577
522	NC_010263	TAC	2	6	20777	20782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932577
523	NC_010263	CAT	2	6	20797	20802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932577
524	NC_010263	ACC	2	6	20870	20875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932577
525	NC_010263	GCA	2	6	20892	20897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932577
526	NC_010263	CAA	2	6	20928	20933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932577
527	NC_010263	TCC	2	6	20972	20977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932577
528	NC_010263	A	7	7	21005	21011	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
529	NC_010263	GTAA	2	8	21039	21046	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
530	NC_010263	GAT	2	6	21065	21070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
531	NC_010263	A	6	6	21120	21125	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
532	NC_010263	A	6	6	21172	21177	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
533	NC_010263	TCAAG	2	10	21190	21199	40 %	20 %	20 %	20 %	165932577
534	NC_010263	ATAAA	2	10	21244	21253	80 %	20 %	0 %	0 %	165932577
535	NC_010263	AGAT	2	8	21293	21300	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
536	NC_010263	A	6	6	21316	21321	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
537	NC_010263	AGCA	2	8	21412	21419	50 %	0 %	25 %	25 %	165932577
538	NC_010263	TAA	2	6	21449	21454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
539	NC_010263	AAAT	2	8	21455	21462	75 %	25 %	0 %	0 %	165932577
540	NC_010263	AGAAA	2	10	21506	21515	80 %	0 %	20 %	0 %	165932577
541	NC_010263	A	6	6	21513	21518	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
542	NC_010263	AAG	2	6	21520	21525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
543	NC_010263	GCT	2	6	21600	21605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932577
544	NC_010263	AGA	2	6	21614	21619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
545	NC_010263	AATG	2	8	21656	21663	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
546	NC_010263	TTA	2	6	21705	21710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932577
547	NC_010263	TGT	2	6	21716	21721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932577
548	NC_010263	AAAGC	2	10	21762	21771	60 %	0 %	20 %	20 %	165932577
549	NC_010263	AAC	2	6	21814	21819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932577
550	NC_010263	CAG	2	6	21858	21863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932577
551	NC_010263	ATTA	2	8	21957	21964	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
552	NC_010263	GAATA	2	10	21968	21977	60 %	20 %	20 %	0 %	165932577
553	NC_010263	ATAG	2	8	22005	22012	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
554	NC_010263	ATAG	2	8	22017	22024	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
555	NC_010263	TAT	2	6	22246	22251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932577
556	NC_010263	ATC	2	6	22280	22285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932577
557	NC_010263	GAA	2	6	22293	22298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
558	NC_010263	ACA	2	6	22348	22353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932577
559	NC_010263	TTC	2	6	22376	22381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932577
560	NC_010263	TAA	2	6	22394	22399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
561	NC_010263	ATTTAG	2	12	22414	22425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	165932577
562	NC_010263	CGTT	2	8	22435	22442	0 %	50 %	25 %	25 %	165932577
563	NC_010263	TAA	2	6	22489	22494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
564	NC_010263	AAT	2	6	22542	22547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
565	NC_010263	ACA	2	6	22571	22576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932577
566	NC_010263	A	6	6	22588	22593	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
567	NC_010263	GAT	2	6	22620	22625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
568	NC_010263	GAA	2	6	22668	22673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
569	NC_010263	A	6	6	22698	22703	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
570	NC_010263	TAATA	2	10	22709	22718	60 %	40 %	0 %	0 %	165932577
571	NC_010263	AG	3	6	22720	22725	50 %	0 %	50 %	0 %	165932577
572	NC_010263	CA	3	6	22752	22757	50 %	0 %	0 %	50 %	165932577
573	NC_010263	ATT	2	6	22759	22764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932577
574	NC_010263	CAAAG	2	10	22801	22810	60 %	0 %	20 %	20 %	165932577
575	NC_010263	TAGT	2	8	22882	22889	25 %	50 %	25 %	0 %	165932577
576	NC_010263	A	6	6	22898	22903	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
577	NC_010263	AAC	2	6	22955	22960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932577
578	NC_010263	TTAGT	2	10	22984	22993	20 %	60 %	20 %	0 %	165932577
579	NC_010263	TC	3	6	23035	23040	0 %	50 %	0 %	50 %	165932577
580	NC_010263	CAG	2	6	23049	23054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932577
581	NC_010263	A	8	8	23104	23111	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
582	NC_010263	AGCAG	2	10	23127	23136	40 %	0 %	40 %	20 %	165932577
583	NC_010263	ATA	2	6	23149	23154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
584	NC_010263	A	6	6	23237	23242	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
585	NC_010263	TA	3	6	23278	23283	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
586	NC_010263	CAA	2	6	23298	23303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932577
587	NC_010263	TAA	2	6	23329	23334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
588	NC_010263	CTA	2	6	23410	23415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932577
589	NC_010263	TA	3	6	23414	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
590	NC_010263	TGA	2	6	23432	23437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
591	NC_010263	AT	3	6	23457	23462	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
592	NC_010263	ATT	2	6	23528	23533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932577
593	NC_010263	ATTTAG	2	12	23566	23577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	165932577
594	NC_010263	AAGC	2	8	23622	23629	50 %	0 %	25 %	25 %	165932577
595	NC_010263	TGA	2	6	23813	23818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
596	NC_010263	GTG	2	6	23836	23841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932577
597	NC_010263	TAAA	2	8	23947	23954	75 %	25 %	0 %	0 %	165932577
598	NC_010263	ATG	2	6	24061	24066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
599	NC_010263	AGT	2	6	24072	24077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
600	NC_010263	TGT	2	6	24083	24088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932577
601	NC_010263	TAA	2	6	24119	24124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
602	NC_010263	TA	3	6	24141	24146	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
603	NC_010263	AGA	2	6	24176	24181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
604	NC_010263	AAG	2	6	24226	24231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
605	NC_010263	TA	3	6	24240	24245	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
606	NC_010263	A	6	6	24280	24285	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
607	NC_010263	TAA	2	6	24295	24300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
608	NC_010263	ATG	2	6	24319	24324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
609	NC_010263	A	6	6	24325	24330	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
610	NC_010263	TTC	2	6	24332	24337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932577
611	NC_010263	GAA	2	6	24348	24353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
612	NC_010263	TACCT	2	10	24419	24428	20 %	40 %	0 %	40 %	165932577
613	NC_010263	GAA	2	6	24438	24443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
614	NC_010263	AAG	2	6	24445	24450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
615	NC_010263	AAGT	2	8	24457	24464	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
616	NC_010263	TACCT	2	10	24506	24515	20 %	40 %	0 %	40 %	165932577
617	NC_010263	GAA	2	6	24525	24530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
618	NC_010263	AAG	2	6	24532	24537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
619	NC_010263	AAGT	2	8	24544	24551	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
620	NC_010263	GCATTA	2	12	24597	24608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165932577
621	NC_010263	GAA	2	6	24660	24665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
622	NC_010263	GAA	3	9	24690	24698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932577
623	NC_010263	TCCGAT	2	12	24714	24725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	165932577
624	NC_010263	A	7	7	24782	24788	100 %	0 %	0 %	0 %	165932577
625	NC_010263	AAATGC	2	12	24790	24801	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	165932577
626	NC_010263	GTT	2	6	24840	24845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932577
627	NC_010263	ATA	2	6	24859	24864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
628	NC_010263	TAA	2	6	24896	24901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
629	NC_010263	TGA	2	6	24920	24925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932577
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631	NC_010263	TAA	2	6	24977	24982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932577
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760	NC_010263	A	7	7	29911	29917	100 %	0 %	0 %	0 %	165932584
761	NC_010263	TAAT	2	8	29926	29933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
762	NC_010263	A	6	6	29935	29940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
763	NC_010263	TAA	2	6	29985	29990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
764	NC_010263	A	6	6	30034	30039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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