MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010263	ATT	2	6	239481	239486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932808
6002	NC_010263	CCG	2	6	239506	239511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932808
6003	NC_010263	AGC	2	6	239520	239525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932808
6004	NC_010263	AGC	2	6	239574	239579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932808
6005	NC_010263	TGC	2	6	239609	239614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932808
6006	NC_010263	TTGCT	2	10	239637	239646	0 %	60 %	20 %	20 %	165932808
6007	NC_010263	CGAA	2	8	239741	239748	50 %	0 %	25 %	25 %	165932808
6008	NC_010263	TCA	2	6	239788	239793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932808
6009	NC_010263	CTA	2	6	239846	239851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932808
6010	NC_010263	TTAG	2	8	239854	239861	25 %	50 %	25 %	0 %	165932808
6011	NC_010263	ATG	2	6	239913	239918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932808
6012	NC_010263	CAC	2	6	239963	239968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932808
6013	NC_010263	TGTA	2	8	240003	240010	25 %	50 %	25 %	0 %	165932808
6014	NC_010263	CTTCTA	2	12	240026	240037	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	165932808
6015	NC_010263	T	7	7	240056	240062	0 %	100 %	0 %	0 %	165932808
6016	NC_010263	AGA	2	6	240069	240074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932808
6017	NC_010263	TTA	2	6	240097	240102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932808
6018	NC_010263	TA	3	6	240101	240106	50 %	50 %	0 %	0 %	165932808
6019	NC_010263	T	6	6	240112	240117	0 %	100 %	0 %	0 %	165932808
6020	NC_010263	TCT	2	6	240247	240252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932808
6021	NC_010263	T	6	6	240301	240306	0 %	100 %	0 %	0 %	165932808
6022	NC_010263	AGA	2	6	240411	240416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932808
6023	NC_010263	ATT	3	9	240420	240428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932808
6024	NC_010263	T	7	7	240438	240444	0 %	100 %	0 %	0 %	165932808
6025	NC_010263	TCA	2	6	240448	240453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932808
6026	NC_010263	ATT	2	6	240460	240465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932808
6027	NC_010263	TAT	3	9	240491	240499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932808
6028	NC_010263	A	6	6	240513	240518	100 %	0 %	0 %	0 %	165932808
6029	NC_010263	TA	3	6	240566	240571	50 %	50 %	0 %	0 %	165932808
6030	NC_010263	CAA	2	6	240578	240583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932808
6031	NC_010263	AAAT	2	8	240600	240607	75 %	25 %	0 %	0 %	165932808
6032	NC_010263	T	7	7	240614	240620	0 %	100 %	0 %	0 %	165932808
6033	NC_010263	TCT	2	6	240625	240630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932808
6034	NC_010263	ATT	2	6	240636	240641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_010263	GTT	2	6	240656	240661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_010263	TTC	2	6	240713	240718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_010263	TTA	2	6	240765	240770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010263	TA	3	6	240798	240803	50 %	50 %	0 %	0 %	165932809
6039	NC_010263	T	6	6	240818	240823	0 %	100 %	0 %	0 %	165932809
6040	NC_010263	TAA	2	6	240843	240848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932809
6041	NC_010263	T	6	6	240859	240864	0 %	100 %	0 %	0 %	165932809
6042	NC_010263	ATT	2	6	240900	240905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932809
6043	NC_010263	AT	3	6	240929	240934	50 %	50 %	0 %	0 %	165932809
6044	NC_010263	T	6	6	240966	240971	0 %	100 %	0 %	0 %	165932809
6045	NC_010263	TA	3	6	241256	241261	50 %	50 %	0 %	0 %	165932809
6046	NC_010263	TGC	2	6	241266	241271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932809
6047	NC_010263	TTC	2	6	241278	241283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932809
6048	NC_010263	CTAC	2	8	241345	241352	25 %	25 %	0 %	50 %	165932809
6049	NC_010263	ATAA	2	8	241363	241370	75 %	25 %	0 %	0 %	165932809
6050	NC_010263	AAT	2	6	241473	241478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932809
6051	NC_010263	TAG	2	6	241517	241522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932809
6052	NC_010263	TTCT	2	8	241671	241678	0 %	75 %	0 %	25 %	165932809
6053	NC_010263	TTTA	2	8	241701	241708	25 %	75 %	0 %	0 %	165932809
6054	NC_010263	T	6	6	241725	241730	0 %	100 %	0 %	0 %	165932809
6055	NC_010263	A	6	6	241739	241744	100 %	0 %	0 %	0 %	165932809
6056	NC_010263	CTT	2	6	241841	241846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932809
6057	NC_010263	TAG	3	9	241934	241942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932809
6058	NC_010263	CTA	2	6	241946	241951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932809
6059	NC_010263	GCT	2	6	241964	241969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932809
6060	NC_010263	TC	3	6	241998	242003	0 %	50 %	0 %	50 %	165932809
6061	NC_010263	TC	3	6	242006	242011	0 %	50 %	0 %	50 %	165932809
6062	NC_010263	TCA	2	6	242032	242037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932809
6063	NC_010263	TTC	2	6	242049	242054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932809
6064	NC_010263	ATT	2	6	242202	242207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932809
6065	NC_010263	GTT	3	9	242250	242258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932809
6066	NC_010263	TAT	2	6	242270	242275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_010263	CAA	2	6	242336	242341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932810
6068	NC_010263	TGC	2	6	242348	242353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932810
6069	NC_010263	TCC	2	6	242403	242408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932810
6070	NC_010263	TTTC	2	8	242449	242456	0 %	75 %	0 %	25 %	165932810
6071	NC_010263	TAA	2	6	242521	242526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932810
6072	NC_010263	CTA	2	6	242544	242549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932810
6073	NC_010263	T	7	7	242552	242558	0 %	100 %	0 %	0 %	165932810
6074	NC_010263	TCA	2	6	242610	242615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932810
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6077	NC_010263	CCG	2	6	242688	242693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932810
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6080	NC_010263	TAG	2	6	242734	242739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932810
6081	NC_010263	ATCTCA	2	12	242793	242804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932810
6082	NC_010263	GCT	2	6	242827	242832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932810
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6087	NC_010263	AGT	2	6	242925	242930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932810
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6089	NC_010263	GCT	2	6	242986	242991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932810
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6093	NC_010263	TTC	2	6	243083	243088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932810
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6096	NC_010263	TTG	2	6	243204	243209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932810
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6108	NC_010263	AATA	2	8	243597	243604	75 %	25 %	0 %	0 %	165932810
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6111	NC_010263	A	6	6	243654	243659	100 %	0 %	0 %	0 %	165932810
6112	NC_010263	T	6	6	243660	243665	0 %	100 %	0 %	0 %	165932810
6113	NC_010263	ACAA	2	8	243693	243700	75 %	0 %	0 %	25 %	165932810
6114	NC_010263	T	6	6	243738	243743	0 %	100 %	0 %	0 %	165932810
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6124	NC_010263	TGG	2	6	243979	243984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932811
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