MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_010263	TAG	2	6	178501	178506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932748
4503	NC_010263	TAAAA	2	10	178516	178525	80 %	20 %	0 %	0 %	165932748
4504	NC_010263	CTC	2	6	178527	178532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932748
4505	NC_010263	CTT	2	6	178536	178541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932748
4506	NC_010263	CTA	2	6	178584	178589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932748
4507	NC_010263	A	6	6	178589	178594	100 %	0 %	0 %	0 %	165932748
4508	NC_010263	GTA	2	6	178601	178606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932748
4509	NC_010263	GAT	2	6	178622	178627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932748
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4511	NC_010263	AGC	2	6	178681	178686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932748
4512	NC_010263	ATT	2	6	178694	178699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932748
4513	NC_010263	TGC	2	6	178708	178713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932748
4514	NC_010263	AGT	2	6	178729	178734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932748
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4516	NC_010263	AAGA	2	8	178759	178766	75 %	0 %	25 %	0 %	165932749
4517	NC_010263	GCG	2	6	178784	178789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932749
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4519	NC_010263	TA	3	6	178835	178840	50 %	50 %	0 %	0 %	165932749
4520	NC_010263	CAT	2	6	178874	178879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932749
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4529	NC_010263	A	6	6	179334	179339	100 %	0 %	0 %	0 %	165932749
4530	NC_010263	TCT	2	6	179419	179424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932749
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4532	NC_010263	TAA	3	9	179498	179506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_010263	A	7	7	179505	179511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_010263	AT	3	6	179544	179549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_010263	TAT	2	6	179557	179562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_010263	ATT	2	6	179649	179654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932750
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4545	NC_010263	TAA	2	6	180150	180155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_010263	T	6	6	180158	180163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_010263	ATT	2	6	180171	180176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_010263	A	6	6	180185	180190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_010263	TTAA	2	8	180218	180225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_010263	GTA	2	6	180242	180247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932751
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4552	NC_010263	A	7	7	180260	180266	100 %	0 %	0 %	0 %	165932751
4553	NC_010263	A	6	6	180276	180281	100 %	0 %	0 %	0 %	165932751
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4567	NC_010263	GCT	2	6	180635	180640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932751
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4572	NC_010263	GTT	3	9	180756	180764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4586	NC_010263	TATTT	2	10	181292	181301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4593	NC_010263	TGA	2	6	181505	181510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4602	NC_010263	A	7	7	181726	181732	100 %	0 %	0 %	0 %	165932752
4603	NC_010263	GAAA	2	8	181776	181783	75 %	0 %	25 %	0 %	165932752
4604	NC_010263	A	6	6	181781	181786	100 %	0 %	0 %	0 %	165932752
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4609	NC_010263	TGC	2	6	181925	181930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932752
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4611	NC_010263	TA	3	6	182020	182025	50 %	50 %	0 %	0 %	165932752
4612	NC_010263	TAT	2	6	182063	182068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932752
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4616	NC_010263	AAAG	2	8	182257	182264	75 %	0 %	25 %	0 %	165932752
4617	NC_010263	CTA	2	6	182272	182277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932752
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4622	NC_010263	A	6	6	182487	182492	100 %	0 %	0 %	0 %	165932752
4623	NC_010263	TAA	2	6	182510	182515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932752
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4750	NC_010263	TTA	2	6	188559	188564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932753
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4835	NC_010263	CAA	2	6	191965	191970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932755
4836	NC_010263	CAT	2	6	191971	191976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932755
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4860	NC_010263	ATG	2	6	193115	193120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932755
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4867	NC_010263	AATA	2	8	193589	193596	75 %	25 %	0 %	0 %	165932756
4868	NC_010263	TA	3	6	193602	193607	50 %	50 %	0 %	0 %	165932756
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4997	NC_010263	T	6	6	198953	198958	0 %	100 %	0 %	0 %	165932759
4998	NC_010263	ATT	2	6	198959	198964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932759
4999	NC_010263	AT	3	6	199019	199024	50 %	50 %	0 %	0 %	165932759
5000	NC_010263	CAG	2	6	199032	199037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932759

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