MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010168	TGCT	2	8	190934	190941	0 %	50 %	25 %	25 %	163838988
3502	NC_010168	GCG	2	6	190978	190983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838988
3503	NC_010168	GAT	2	6	191004	191009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838988
3504	NC_010168	CTT	2	6	191039	191044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_010168	ATC	2	6	191060	191065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_010168	GTT	2	6	191087	191092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_010168	AC	3	6	191104	191109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_010168	ACG	2	6	191130	191135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_010168	GC	3	6	191217	191222	0 %	0 %	50 %	50 %	163838989
3510	NC_010168	CCG	2	6	191440	191445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838990
3511	NC_010168	CTT	2	6	191483	191488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838990
3512	NC_010168	TCG	2	6	191563	191568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838990
3513	NC_010168	GTT	3	9	191603	191611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838990
3514	NC_010168	ATG	2	6	191641	191646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838990
3515	NC_010168	GAC	2	6	191711	191716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838990
3516	NC_010168	GTTT	2	8	191735	191742	0 %	75 %	25 %	0 %	163838990
3517	NC_010168	CTA	2	6	191825	191830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838990
3518	NC_010168	GCG	2	6	192016	192021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838990
3519	NC_010168	GC	3	6	192031	192036	0 %	0 %	50 %	50 %	163838990
3520	NC_010168	GAC	2	6	192066	192071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838990
3521	NC_010168	AGG	2	6	192158	192163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838990
3522	NC_010168	TGC	2	6	192262	192267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838990
3523	NC_010168	AGTG	2	8	192350	192357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_010168	GCC	2	6	192418	192423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_010168	GCTT	2	8	192452	192459	0 %	50 %	25 %	25 %	163838991
3526	NC_010168	CCG	2	6	192490	192495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838991
3527	NC_010168	GAATG	2	10	192498	192507	40 %	20 %	40 %	0 %	163838991
3528	NC_010168	GAT	2	6	192579	192584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838991
3529	NC_010168	ACG	2	6	192607	192612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838991
3530	NC_010168	GAC	2	6	192649	192654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838991
3531	NC_010168	CTG	2	6	192655	192660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838991
3532	NC_010168	TTG	2	6	192683	192688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838991
3533	NC_010168	GCA	2	6	192716	192721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838991
3534	NC_010168	CCA	2	6	192768	192773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838991
3535	NC_010168	GTA	2	6	192819	192824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838991
3536	NC_010168	GCA	2	6	192971	192976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_010168	GCG	2	6	193024	193029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838992
3538	NC_010168	GCG	2	6	193209	193214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838992
3539	NC_010168	TCAT	2	8	193272	193279	25 %	50 %	0 %	25 %	163838992
3540	NC_010168	GTG	2	6	193335	193340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838992
3541	NC_010168	CTTGG	2	10	193384	193393	0 %	40 %	40 %	20 %	163838992
3542	NC_010168	TAC	2	6	193563	193568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838992
3543	NC_010168	TTGGT	2	10	193569	193578	0 %	60 %	40 %	0 %	163838992
3544	NC_010168	TGC	2	6	193630	193635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838992
3545	NC_010168	CAAGT	2	10	193653	193662	40 %	20 %	20 %	20 %	163838992
3546	NC_010168	CG	3	6	193700	193705	0 %	0 %	50 %	50 %	163838992
3547	NC_010168	TTG	2	6	193722	193727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838992
3548	NC_010168	GCT	2	6	193739	193744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838992
3549	NC_010168	TGG	2	6	193785	193790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838992
3550	NC_010168	GCAGC	2	10	193824	193833	20 %	0 %	40 %	40 %	163838992
3551	NC_010168	GTG	2	6	193949	193954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838992
3552	NC_010168	GCA	2	6	193982	193987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838992
3553	NC_010168	GTC	2	6	194048	194053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838992
3554	NC_010168	TGGT	2	8	194056	194063	0 %	50 %	50 %	0 %	163838992
3555	NC_010168	GAC	2	6	194093	194098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838992
3556	NC_010168	TCA	2	6	194116	194121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838992
3557	NC_010168	GCTG	2	8	194124	194131	0 %	25 %	50 %	25 %	163838992
3558	NC_010168	CAG	2	6	194181	194186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838992
3559	NC_010168	GGCTG	2	10	194280	194289	0 %	20 %	60 %	20 %	163838992
3560	NC_010168	CGG	2	6	194493	194498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838993
3561	NC_010168	TAG	2	6	194517	194522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838993
3562	NC_010168	CGG	2	6	194568	194573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838993
3563	NC_010168	CG	3	6	194618	194623	0 %	0 %	50 %	50 %	163838993
3564	NC_010168	TTA	2	6	194639	194644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838993
3565	NC_010168	CGT	2	6	194674	194679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838993
3566	NC_010168	CTC	2	6	194680	194685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838993
3567	NC_010168	AC	4	8	194745	194752	50 %	0 %	0 %	50 %	163838993
3568	NC_010168	ATT	2	6	194870	194875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838993
3569	NC_010168	GC	3	6	194881	194886	0 %	0 %	50 %	50 %	163838993
3570	NC_010168	GAA	2	6	194912	194917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838993
3571	NC_010168	GTT	2	6	194939	194944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838993
3572	NC_010168	CTG	2	6	194954	194959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838993
3573	NC_010168	AAT	2	6	195121	195126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163838994
3574	NC_010168	AAGCC	2	10	195313	195322	40 %	0 %	20 %	40 %	163838994
3575	NC_010168	TCA	2	6	195421	195426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838994
3576	NC_010168	AC	3	6	195536	195541	50 %	0 %	0 %	50 %	163838994
3577	NC_010168	GCCA	2	8	195722	195729	25 %	0 %	25 %	50 %	163838994
3578	NC_010168	GCTA	2	8	195738	195745	25 %	25 %	25 %	25 %	163838994
3579	NC_010168	CCGA	2	8	195797	195804	25 %	0 %	25 %	50 %	163838994
3580	NC_010168	GTC	2	6	195925	195930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838994
3581	NC_010168	CCGT	2	8	196042	196049	0 %	25 %	25 %	50 %	163838994
3582	NC_010168	ACCG	2	8	196065	196072	25 %	0 %	25 %	50 %	163838994
3583	NC_010168	CCAC	2	8	196120	196127	25 %	0 %	0 %	75 %	163838994
3584	NC_010168	CAT	2	6	196221	196226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838995
3585	NC_010168	TTGA	2	8	196375	196382	25 %	50 %	25 %	0 %	163838995
3586	NC_010168	TTC	2	6	196507	196512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838995
3587	NC_010168	GAT	2	6	196533	196538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838995
3588	NC_010168	TTG	2	6	196539	196544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838995
3589	NC_010168	AGC	2	6	196648	196653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838995
3590	NC_010168	ACCA	2	8	196981	196988	50 %	0 %	0 %	50 %	163838996
3591	NC_010168	CGG	2	6	197112	197117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838996
3592	NC_010168	CGT	2	6	197157	197162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838996
3593	NC_010168	TTC	2	6	197258	197263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838996
3594	NC_010168	GCTT	2	8	197333	197340	0 %	50 %	25 %	25 %	163838996
3595	NC_010168	GTC	2	6	197404	197409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838996
3596	NC_010168	ATT	2	6	197500	197505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838996
3597	NC_010168	CGT	2	6	197508	197513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838996
3598	NC_010168	TGC	2	6	197631	197636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838997
3599	NC_010168	GCA	2	6	197714	197719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838997
3600	NC_010168	GATG	2	8	197782	197789	25 %	25 %	50 %	0 %	163838997
3601	NC_010168	TAG	2	6	197802	197807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838997
3602	NC_010168	CGG	2	6	197839	197844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838997
3603	NC_010168	CGA	2	6	197857	197862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838997
3604	NC_010168	ATC	2	6	198052	198057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838998
3605	NC_010168	GTTC	2	8	198142	198149	0 %	50 %	25 %	25 %	163838998
3606	NC_010168	GTTG	2	8	198171	198178	0 %	50 %	50 %	0 %	163838998
3607	NC_010168	CCA	2	6	198188	198193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838998
3608	NC_010168	GTG	2	6	198265	198270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838998
3609	NC_010168	CAC	2	6	198294	198299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838998
3610	NC_010168	GACC	2	8	198308	198315	25 %	0 %	25 %	50 %	163838998
3611	NC_010168	CTG	2	6	198339	198344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838998
3612	NC_010168	TGC	2	6	198402	198407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838998
3613	NC_010168	CGC	2	6	198556	198561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838999
3614	NC_010168	AAT	2	6	198566	198571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163838999
3615	NC_010168	CCT	2	6	198675	198680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838999
3616	NC_010168	CATT	2	8	198769	198776	25 %	50 %	0 %	25 %	163838999
3617	NC_010168	CTG	2	6	198875	198880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838999
3618	NC_010168	CGG	2	6	198909	198914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839000
3619	NC_010168	CTG	2	6	198963	198968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839000
3620	NC_010168	TCA	2	6	198978	198983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839000
3621	NC_010168	TTG	2	6	199002	199007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839000
3622	NC_010168	GCA	2	6	199016	199021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839000
3623	NC_010168	GTT	2	6	199077	199082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839000
3624	NC_010168	TTG	2	6	199104	199109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839000
3625	NC_010168	ATC	2	6	199184	199189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839000
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3635	NC_010168	CAT	2	6	199897	199902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3636	NC_010168	T	6	6	199932	199937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_010168	TGCGC	2	10	199967	199976	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3652	NC_010168	GCACTG	2	12	200942	200953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163839004
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3740	NC_010168	TAG	2	6	205524	205529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839007
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3742	NC_010168	CAG	2	6	205574	205579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839007
3743	NC_010168	AGC	2	6	205591	205596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839007
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3747	NC_010168	GCA	2	6	205675	205680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839007
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3846	NC_010168	ACTC	2	8	211090	211097	25 %	25 %	0 %	50 %	163839013
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3854	NC_010168	CAC	2	6	211606	211611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839014
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3860	NC_010168	CGC	2	6	211720	211725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839014
3861	NC_010168	CT	3	6	211759	211764	0 %	50 %	0 %	50 %	163839014
3862	NC_010168	CGT	2	6	211837	211842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839014
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3864	NC_010168	GCT	2	6	212034	212039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3865	NC_010168	TCG	3	9	212042	212050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3866	NC_010168	CCA	2	6	212080	212085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839015
3867	NC_010168	ATC	2	6	212086	212091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839015
3868	NC_010168	ACT	2	6	212092	212097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839015
3869	NC_010168	CAA	2	6	212106	212111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839015
3870	NC_010168	TGG	2	6	212174	212179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839015
3871	NC_010168	GCA	2	6	212239	212244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3872	NC_010168	GCTGCG	2	12	212352	212363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163839015
3873	NC_010168	CAT	2	6	212424	212429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839015
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3875	NC_010168	CGCC	2	8	212470	212477	0 %	0 %	25 %	75 %	163839015
3876	NC_010168	ATT	2	6	212557	212562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839015
3877	NC_010168	TGC	2	6	212564	212569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839015
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3883	NC_010168	CAA	2	6	212820	212825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839015
3884	NC_010168	GGC	2	6	212842	212847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839015
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3887	NC_010168	TGC	2	6	212924	212929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3888	NC_010168	TGA	2	6	212930	212935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839015
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3893	NC_010168	AG	3	6	213543	213548	50 %	0 %	50 %	0 %	163839016
3894	NC_010168	GCT	2	6	213578	213583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839016
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3901	NC_010168	ACGG	2	8	213974	213981	25 %	0 %	50 %	25 %	163839017
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3913	NC_010168	GCT	2	6	214602	214607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839017
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3916	NC_010168	ATG	2	6	214822	214827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3918	NC_010168	TTG	2	6	214860	214865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3920	NC_010168	TTC	2	6	214935	214940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3921	NC_010168	TCGG	2	8	214944	214951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3922	NC_010168	CCA	2	6	214957	214962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3937	NC_010168	TGC	2	6	215881	215886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839020
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3944	NC_010168	CGAG	2	8	216069	216076	25 %	0 %	50 %	25 %	163839019
3945	NC_010168	GTC	2	6	216150	216155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839019
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3972	NC_010168	GGAT	2	8	217521	217528	25 %	25 %	50 %	0 %	163839022
3973	NC_010168	TGG	2	6	217549	217554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839022
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3980	NC_010168	TGA	2	6	218071	218076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839022
3981	NC_010168	TCA	2	6	218142	218147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839022
3982	NC_010168	CAT	2	6	218194	218199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839022
3983	NC_010168	CAG	2	6	218215	218220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3984	NC_010168	TGC	2	6	218233	218238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3985	NC_010168	CGA	2	6	218239	218244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3986	NC_010168	ACG	2	6	218289	218294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3987	NC_010168	GTC	2	6	218301	218306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3988	NC_010168	CAA	2	6	218314	218319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839022
3989	NC_010168	GGT	2	6	218362	218367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839023
3990	NC_010168	TGC	2	6	218530	218535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839023
3991	NC_010168	CCG	2	6	218553	218558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839023
3992	NC_010168	GGA	2	6	218565	218570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839023
3993	NC_010168	GCT	2	6	218611	218616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839023
3994	NC_010168	CTG	2	6	218663	218668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839023
3995	NC_010168	TGG	2	6	218737	218742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839023
3996	NC_010168	TTC	2	6	218750	218755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839023
3997	NC_010168	GGT	2	6	218773	218778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839023
3998	NC_010168	GGC	2	6	218812	218817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839023
3999	NC_010168	TGCCT	2	10	218948	218957	0 %	40 %	20 %	40 %	163839023
4000	NC_010168	TGCGG	2	10	218966	218975	0 %	20 %	60 %	20 %	163839023

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