MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010168	CGC	2	6	137538	137543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838923
2502	NC_010168	ATC	2	6	137549	137554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838923
2503	NC_010168	GC	3	6	137557	137562	0 %	0 %	50 %	50 %	163838923
2504	NC_010168	CAGGC	2	10	137569	137578	20 %	0 %	40 %	40 %	163838923
2505	NC_010168	GCC	2	6	137627	137632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838923
2506	NC_010168	CGG	2	6	137706	137711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838923
2507	NC_010168	GCC	2	6	137783	137788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838923
2508	NC_010168	CGC	2	6	137793	137798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838923
2509	NC_010168	CAG	2	6	137832	137837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838923
2510	NC_010168	GTC	2	6	138042	138047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838924
2511	NC_010168	GCG	2	6	138074	138079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838924
2512	NC_010168	CGG	2	6	138080	138085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838924
2513	NC_010168	GAAC	2	8	138170	138177	50 %	0 %	25 %	25 %	163838924
2514	NC_010168	CGG	2	6	138209	138214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838924
2515	NC_010168	CGT	2	6	138266	138271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838924
2516	NC_010168	GCT	2	6	138287	138292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838924
2517	NC_010168	CCA	2	6	138330	138335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838924
2518	NC_010168	GGC	2	6	138378	138383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838924
2519	NC_010168	GCA	2	6	138385	138390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838924
2520	NC_010168	TTC	2	6	138417	138422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838924
2521	NC_010168	GCG	2	6	138487	138492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_010168	CAG	2	6	138519	138524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838925
2523	NC_010168	GCA	2	6	138600	138605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838925
2524	NC_010168	CGG	2	6	138622	138627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838925
2525	NC_010168	TCT	2	6	138669	138674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838925
2526	NC_010168	GGC	2	6	138682	138687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838925
2527	NC_010168	TGC	2	6	138727	138732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838925
2528	NC_010168	GA	3	6	138741	138746	50 %	0 %	50 %	0 %	163838925
2529	NC_010168	CAA	2	6	138833	138838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_010168	GC	3	6	138962	138967	0 %	0 %	50 %	50 %	163838926
2531	NC_010168	CGC	2	6	138972	138977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838926
2532	NC_010168	GCC	2	6	139084	139089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838926
2533	NC_010168	GCC	2	6	139158	139163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838926
2534	NC_010168	CG	3	6	139166	139171	0 %	0 %	50 %	50 %	163838926
2535	NC_010168	GGC	2	6	139256	139261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838926
2536	NC_010168	CCGG	2	8	139358	139365	0 %	0 %	50 %	50 %	163838926
2537	NC_010168	CAG	2	6	139419	139424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838926
2538	NC_010168	CCAG	2	8	139432	139439	25 %	0 %	25 %	50 %	163838926
2539	NC_010168	CCG	2	6	139441	139446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838926
2540	NC_010168	ACG	2	6	139523	139528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838926
2541	NC_010168	CAT	2	6	139533	139538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838926
2542	NC_010168	CG	3	6	139552	139557	0 %	0 %	50 %	50 %	163838926
2543	NC_010168	ATT	2	6	139705	139710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838926
2544	NC_010168	GGCC	2	8	139754	139761	0 %	0 %	50 %	50 %	163838926
2545	NC_010168	GCGT	2	8	139767	139774	0 %	25 %	50 %	25 %	163838926
2546	NC_010168	GAA	2	6	139807	139812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838926
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2548	NC_010168	GGT	2	6	139923	139928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838926
2549	NC_010168	CGG	2	6	139935	139940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838926
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2551	NC_010168	GC	3	6	139996	140001	0 %	0 %	50 %	50 %	163838926
2552	NC_010168	GCG	2	6	140122	140127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838926
2553	NC_010168	GCT	2	6	140133	140138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838926
2554	NC_010168	GCG	2	6	140442	140447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838927
2555	NC_010168	GCC	2	6	140472	140477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838927
2556	NC_010168	GCG	2	6	140485	140490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838927
2557	NC_010168	GGT	2	6	140511	140516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838927
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2559	NC_010168	CGT	2	6	140699	140704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838927
2560	NC_010168	CGG	2	6	140786	140791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838927
2561	NC_010168	CTA	2	6	140885	140890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838927
2562	NC_010168	CAA	2	6	140891	140896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838927
2563	NC_010168	GCG	2	6	140955	140960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838927
2564	NC_010168	A	6	6	140961	140966	100 %	0 %	0 %	0 %	163838927
2565	NC_010168	GTG	2	6	141108	141113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838927
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2568	NC_010168	TTCCC	2	10	141304	141313	0 %	40 %	0 %	60 %	163838927
2569	NC_010168	TTG	2	6	141349	141354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838927
2570	NC_010168	TC	3	6	141365	141370	0 %	50 %	0 %	50 %	163838927
2571	NC_010168	CGC	2	6	141398	141403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838927
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2577	NC_010168	CGG	2	6	141727	141732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_010168	TTG	2	6	141912	141917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838928
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2581	NC_010168	AGC	2	6	142020	142025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838928
2582	NC_010168	GC	3	6	142024	142029	0 %	0 %	50 %	50 %	163838928
2583	NC_010168	CGTT	2	8	142098	142105	0 %	50 %	25 %	25 %	163838928
2584	NC_010168	TGG	3	9	142132	142140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838928
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2587	NC_010168	GTTG	2	8	142379	142386	0 %	50 %	50 %	0 %	163838928
2588	NC_010168	TGG	2	6	142387	142392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838928
2589	NC_010168	CGCT	2	8	142411	142418	0 %	25 %	25 %	50 %	163838928
2590	NC_010168	CTGATG	2	12	142422	142433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163838928
2591	NC_010168	GGCAGT	2	12	142501	142512	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163838928
2592	NC_010168	ATG	2	6	142527	142532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838928
2593	NC_010168	TGC	2	6	142549	142554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838928
2594	NC_010168	TGT	2	6	142603	142608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838928
2595	NC_010168	GC	3	6	142615	142620	0 %	0 %	50 %	50 %	163838928
2596	NC_010168	CCG	2	6	142623	142628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838928
2597	NC_010168	GATCT	2	10	142635	142644	20 %	40 %	20 %	20 %	163838928
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2599	NC_010168	ATCT	2	8	142743	142750	25 %	50 %	0 %	25 %	163838928
2600	NC_010168	GCGT	2	8	142775	142782	0 %	25 %	50 %	25 %	163838928
2601	NC_010168	TGG	2	6	142912	142917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838929
2602	NC_010168	GCTG	2	8	142968	142975	0 %	25 %	50 %	25 %	163838929
2603	NC_010168	TGGC	8	32	143000	143031	0 %	25 %	50 %	25 %	163838929
2604	NC_010168	CGC	2	6	143067	143072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838929
2605	NC_010168	CTG	2	6	143161	143166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838929
2606	NC_010168	GTT	2	6	143169	143174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838929
2607	NC_010168	CG	3	6	143309	143314	0 %	0 %	50 %	50 %	163838929
2608	NC_010168	GCA	2	6	143326	143331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838929
2609	NC_010168	CTG	2	6	143381	143386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838929
2610	NC_010168	GTT	2	6	143445	143450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838929
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2612	NC_010168	GGC	2	6	143544	143549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838929
2613	NC_010168	GTG	2	6	143557	143562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838929
2614	NC_010168	GTC	3	9	143572	143580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838929
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2619	NC_010168	GTT	2	6	144115	144120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838930
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2621	NC_010168	CGG	2	6	144160	144165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838930
2622	NC_010168	CGT	2	6	144331	144336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838930
2623	NC_010168	GCC	2	6	144408	144413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838930
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2625	NC_010168	TGC	2	6	144507	144512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838930
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2738	NC_010168	GATG	2	8	151122	151129	25 %	25 %	50 %	0 %	163838939
2739	NC_010168	AGCTG	2	10	151155	151164	20 %	20 %	40 %	20 %	163838939
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2742	NC_010168	ACC	2	6	151352	151357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838939
2743	NC_010168	TCA	2	6	151371	151376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838939
2744	NC_010168	GAA	2	6	151419	151424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838939
2745	NC_010168	TGC	3	9	151478	151486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838939
2746	NC_010168	TTTC	2	8	151540	151547	0 %	75 %	0 %	25 %	163838939
2747	NC_010168	ACTA	2	8	151561	151568	50 %	25 %	0 %	25 %	163838939
2748	NC_010168	CGG	2	6	151574	151579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838939
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2750	NC_010168	GC	3	6	151620	151625	0 %	0 %	50 %	50 %	163838939
2751	NC_010168	GGC	2	6	151629	151634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838939
2752	NC_010168	AGA	2	6	151650	151655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838939
2753	NC_010168	GCG	2	6	151690	151695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838939
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2755	NC_010168	CG	3	6	151862	151867	0 %	0 %	50 %	50 %	163838939
2756	NC_010168	GCCG	2	8	151920	151927	0 %	0 %	50 %	50 %	163838939
2757	NC_010168	CGG	2	6	151965	151970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838939
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2760	NC_010168	GAGCG	2	10	152104	152113	20 %	0 %	60 %	20 %	163838939
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2771	NC_010168	GCT	2	6	152708	152713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838940
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2776	NC_010168	CAG	2	6	152906	152911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838940
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2778	NC_010168	ACC	2	6	152970	152975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838940
2779	NC_010168	TGCT	2	8	153018	153025	0 %	50 %	25 %	25 %	163838940
2780	NC_010168	CGT	2	6	153041	153046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838940
2781	NC_010168	TTGC	2	8	153077	153084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2782	NC_010168	CGA	2	6	153214	153219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838941
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2803	NC_010168	TTC	2	6	154677	154682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2804	NC_010168	CTT	2	6	154718	154723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838943
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2823	NC_010168	AAT	2	6	155447	155452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163838945
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2855	NC_010168	ATC	2	6	157009	157014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838947
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2984	NC_010168	GAG	2	6	164508	164513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838957
2985	NC_010168	GGC	2	6	164525	164530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838957
2986	NC_010168	CCA	2	6	164584	164589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838957
2987	NC_010168	GCG	2	6	164636	164641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838957
2988	NC_010168	TCG	2	6	164674	164679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838957
2989	NC_010168	TGC	2	6	164768	164773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838958
2990	NC_010168	CGA	3	9	164861	164869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838958
2991	NC_010168	GAA	2	6	164932	164937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838958
2992	NC_010168	GAT	2	6	165040	165045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838959
2993	NC_010168	AT	5	10	165077	165086	50 %	50 %	0 %	0 %	163838959
2994	NC_010168	TGT	2	6	165099	165104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838959
2995	NC_010168	CCG	2	6	165133	165138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838959
2996	NC_010168	GCCC	2	8	165217	165224	0 %	0 %	25 %	75 %	163838959
2997	NC_010168	GAA	2	6	165355	165360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838959
2998	NC_010168	TGT	2	6	165361	165366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838959
2999	NC_010168	ACA	2	6	165382	165387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838959
3000	NC_010168	GCC	2	6	165399	165404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838959

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