MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010168	CAG	2	6	82221	82226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838861
1502	NC_010168	CAT	2	6	82250	82255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838861
1503	NC_010168	CGG	2	6	82390	82395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838862
1504	NC_010168	GCAC	2	8	82595	82602	25 %	0 %	25 %	50 %	163838862
1505	NC_010168	AACT	2	8	82614	82621	50 %	25 %	0 %	25 %	163838862
1506	NC_010168	CGG	2	6	82623	82628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838862
1507	NC_010168	GCT	2	6	82744	82749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838862
1508	NC_010168	CCG	2	6	82779	82784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838862
1509	NC_010168	GCC	2	6	82889	82894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838863
1510	NC_010168	GCT	2	6	82956	82961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838863
1511	NC_010168	TCA	2	6	82995	83000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838863
1512	NC_010168	TGC	2	6	83016	83021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838863
1513	NC_010168	CCG	2	6	83064	83069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838863
1514	NC_010168	CGC	2	6	83149	83154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838863
1515	NC_010168	TG	3	6	83174	83179	0 %	50 %	50 %	0 %	163838863
1516	NC_010168	TAA	2	6	83194	83199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163838863
1517	NC_010168	GCT	2	6	83290	83295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010168	CTT	3	9	83473	83481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838864
1519	NC_010168	GAA	2	6	83537	83542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838864
1520	NC_010168	CGC	2	6	83588	83593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838865
1521	NC_010168	TCA	2	6	83597	83602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838865
1522	NC_010168	CGA	2	6	83635	83640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838865
1523	NC_010168	T	7	7	83649	83655	0 %	100 %	0 %	0 %	163838865
1524	NC_010168	GAC	2	6	83761	83766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838865
1525	NC_010168	CGC	2	6	83800	83805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838865
1526	NC_010168	CAG	2	6	83933	83938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838866
1527	NC_010168	TGC	2	6	83943	83948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838866
1528	NC_010168	AGT	2	6	83982	83987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838866
1529	NC_010168	ACA	2	6	84004	84009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838866
1530	NC_010168	TGC	2	6	84034	84039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838866
1531	NC_010168	CCG	2	6	84079	84084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838866
1532	NC_010168	CG	4	8	84122	84129	0 %	0 %	50 %	50 %	163838866
1533	NC_010168	TGAC	2	8	84154	84161	25 %	25 %	25 %	25 %	163838866
1534	NC_010168	CGG	2	6	84164	84169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838866
1535	NC_010168	GCA	2	6	84187	84192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838866
1536	NC_010168	TAC	2	6	84270	84275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838866
1537	NC_010168	CGC	2	6	84315	84320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838866
1538	NC_010168	GCC	3	9	84348	84356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838866
1539	NC_010168	GCC	2	6	84403	84408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838866
1540	NC_010168	GTAG	2	8	84444	84451	25 %	25 %	50 %	0 %	163838866
1541	NC_010168	ACC	2	6	84462	84467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838866
1542	NC_010168	CAC	2	6	84474	84479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838866
1543	NC_010168	GCA	2	6	84619	84624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838866
1544	NC_010168	ATA	2	6	84675	84680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010168	AT	3	6	84768	84773	50 %	50 %	0 %	0 %	163838867
1546	NC_010168	TCG	2	6	84795	84800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838867
1547	NC_010168	GTTT	2	8	84856	84863	0 %	75 %	25 %	0 %	163838867
1548	NC_010168	CGC	2	6	84882	84887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838867
1549	NC_010168	ATC	2	6	84901	84906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838867
1550	NC_010168	ATGA	2	8	85045	85052	50 %	25 %	25 %	0 %	163838868
1551	NC_010168	ACG	2	6	85185	85190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838868
1552	NC_010168	TGAT	2	8	85317	85324	25 %	50 %	25 %	0 %	163838868
1553	NC_010168	CAC	2	6	85345	85350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838868
1554	NC_010168	TCA	2	6	85383	85388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838868
1555	NC_010168	AAG	2	6	85524	85529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838868
1556	NC_010168	AGA	2	6	85639	85644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838868
1557	NC_010168	CGC	2	6	85646	85651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838868
1558	NC_010168	CGG	2	6	85689	85694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838868
1559	NC_010168	ATT	2	6	85828	85833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838868
1560	NC_010168	GAC	2	6	85859	85864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838868
1561	NC_010168	GCT	2	6	85882	85887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838868
1562	NC_010168	GCT	2	6	85999	86004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838868
1563	NC_010168	CGA	2	6	86005	86010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838868
1564	NC_010168	GAC	2	6	86060	86065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838868
1565	NC_010168	GCC	2	6	86070	86075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838868
1566	NC_010168	GGC	2	6	86097	86102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838868
1567	NC_010168	GTG	2	6	86149	86154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010168	AAT	2	6	86165	86170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010168	ACC	2	6	86181	86186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_010168	GTT	2	6	86211	86216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838869
1571	NC_010168	GCA	3	9	86230	86238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838869
1572	NC_010168	CAA	2	6	86267	86272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838869
1573	NC_010168	CAG	2	6	86324	86329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838869
1574	NC_010168	TGT	2	6	86334	86339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838869
1575	NC_010168	GCC	2	6	86434	86439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838869
1576	NC_010168	AGC	2	6	86457	86462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838869
1577	NC_010168	GGT	2	6	86475	86480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838869
1578	NC_010168	TTGA	2	8	86550	86557	25 %	50 %	25 %	0 %	163838869
1579	NC_010168	CT	3	6	86590	86595	0 %	50 %	0 %	50 %	163838869
1580	NC_010168	ATTGC	2	10	86674	86683	20 %	40 %	20 %	20 %	163838869
1581	NC_010168	AAC	2	6	86722	86727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838869
1582	NC_010168	GTG	2	6	86788	86793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838870
1583	NC_010168	CTT	2	6	86810	86815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838870
1584	NC_010168	GTCGA	2	10	86878	86887	20 %	20 %	40 %	20 %	163838870
1585	NC_010168	CCTT	2	8	86926	86933	0 %	50 %	0 %	50 %	163838870
1586	NC_010168	TAG	2	6	86972	86977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838870
1587	NC_010168	CGA	2	6	87068	87073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838870
1588	NC_010168	ATT	2	6	87153	87158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838870
1589	NC_010168	GTC	2	6	87213	87218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838870
1590	NC_010168	GCC	2	6	87421	87426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838870
1591	NC_010168	ATC	2	6	87468	87473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838870
1592	NC_010168	CCA	2	6	87737	87742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838870
1593	NC_010168	GCG	2	6	87899	87904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838870
1594	NC_010168	TCG	2	6	87998	88003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838870
1595	NC_010168	CTT	2	6	88092	88097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838871
1596	NC_010168	AGCC	2	8	88131	88138	25 %	0 %	25 %	50 %	163838871
1597	NC_010168	CAG	2	6	88143	88148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838871
1598	NC_010168	GTT	2	6	88207	88212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838871
1599	NC_010168	TGC	3	9	88281	88289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838871
1600	NC_010168	GCA	3	9	88306	88314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838871
1601	NC_010168	GTG	2	6	88348	88353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838871
1602	NC_010168	GCG	2	6	88501	88506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838871
1603	NC_010168	AACGCA	2	12	88583	88594	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	163838871
1604	NC_010168	GGT	2	6	88659	88664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838871
1605	NC_010168	CGT	4	12	88706	88717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838871
1606	NC_010168	TGCC	2	8	88745	88752	0 %	25 %	25 %	50 %	163838871
1607	NC_010168	CCTT	2	8	88798	88805	0 %	50 %	0 %	50 %	163838871
1608	NC_010168	TTG	2	6	88834	88839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838871
1609	NC_010168	CTTC	2	8	88919	88926	0 %	50 %	0 %	50 %	163838871
1610	NC_010168	CCA	2	6	88975	88980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838871
1611	NC_010168	GAT	2	6	89199	89204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838871
1612	NC_010168	TCA	2	6	89224	89229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838871
1613	NC_010168	CAT	2	6	89267	89272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838871
1614	NC_010168	TGT	2	6	89451	89456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838871
1615	NC_010168	GACG	2	8	89549	89556	25 %	0 %	50 %	25 %	163838871
1616	NC_010168	TGCTG	2	10	89584	89593	0 %	40 %	40 %	20 %	163838871
1617	NC_010168	GC	3	6	89618	89623	0 %	0 %	50 %	50 %	163838871
1618	NC_010168	CAA	2	6	89630	89635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838871
1619	NC_010168	GCCA	2	8	89670	89677	25 %	0 %	25 %	50 %	163838871
1620	NC_010168	CTG	2	6	89679	89684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838871
1621	NC_010168	CGG	2	6	89726	89731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838871
1622	NC_010168	GTCA	2	8	89733	89740	25 %	25 %	25 %	25 %	163838871
1623	NC_010168	GTT	2	6	89759	89764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838871
1624	NC_010168	GCT	2	6	89818	89823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838871
1625	NC_010168	GCT	2	6	89859	89864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838871
1626	NC_010168	CAG	5	15	89876	89890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838871
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1994	NC_010168	CAG	2	6	111010	111015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1995	NC_010168	CTTT	2	8	111027	111034	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1996	NC_010168	GCC	2	6	111047	111052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1997	NC_010168	CTT	2	6	111072	111077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1998	NC_010168	CAA	2	6	111135	111140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1999	NC_010168	TTA	2	6	111155	111160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_010168	A	6	6	111173	111178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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