MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010168	TTC	2	6	54874	54879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838824
1002	NC_010168	CAA	2	6	54942	54947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838824
1003	NC_010168	CAA	2	6	54957	54962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838824
1004	NC_010168	TCG	2	6	55059	55064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838825
1005	NC_010168	GGC	2	6	55072	55077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838825
1006	NC_010168	GGC	2	6	55233	55238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838825
1007	NC_010168	TGG	2	6	55254	55259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838825
1008	NC_010168	TG	3	6	55281	55286	0 %	50 %	50 %	0 %	163838825
1009	NC_010168	GTG	2	6	55319	55324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838825
1010	NC_010168	GGCG	2	8	55345	55352	0 %	0 %	75 %	25 %	163838825
1011	NC_010168	CGT	2	6	55532	55537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838826
1012	NC_010168	ACTT	2	8	55552	55559	25 %	50 %	0 %	25 %	163838826
1013	NC_010168	TCG	2	6	55573	55578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838826
1014	NC_010168	GCA	2	6	55725	55730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838826
1015	NC_010168	GTG	2	6	55798	55803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838826
1016	NC_010168	GCC	2	6	55900	55905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838827
1017	NC_010168	CG	3	6	55914	55919	0 %	0 %	50 %	50 %	163838827
1018	NC_010168	GCT	2	6	55935	55940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838827
1019	NC_010168	GCC	2	6	55941	55946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838827
1020	NC_010168	TCAA	2	8	55968	55975	50 %	25 %	0 %	25 %	163838827
1021	NC_010168	GCT	2	6	56002	56007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838827
1022	NC_010168	CGA	2	6	56125	56130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838827
1023	NC_010168	GAA	2	6	56176	56181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838827
1024	NC_010168	GCG	2	6	56194	56199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838827
1025	NC_010168	TTG	2	6	56267	56272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838827
1026	NC_010168	GCCG	2	8	56312	56319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_010168	TGC	2	6	56368	56373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838828
1028	NC_010168	GGC	2	6	56383	56388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838828
1029	NC_010168	CTG	2	6	56395	56400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838828
1030	NC_010168	GTG	2	6	56414	56419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838828
1031	NC_010168	GCCAA	2	10	56444	56453	40 %	0 %	20 %	40 %	163838828
1032	NC_010168	ACCC	2	8	56568	56575	25 %	0 %	0 %	75 %	163838828
1033	NC_010168	GCT	2	6	56658	56663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838828
1034	NC_010168	GCCA	2	8	56734	56741	25 %	0 %	25 %	50 %	163838828
1035	NC_010168	CAAG	2	8	56745	56752	50 %	0 %	25 %	25 %	163838828
1036	NC_010168	TCA	2	6	56828	56833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838829
1037	NC_010168	GCA	2	6	57043	57048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838829
1038	NC_010168	GTTCG	2	10	57051	57060	0 %	40 %	40 %	20 %	163838829
1039	NC_010168	TCA	2	6	57080	57085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838829
1040	NC_010168	CTG	2	6	57106	57111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838829
1041	NC_010168	CCA	2	6	57288	57293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838829
1042	NC_010168	CT	3	6	57578	57583	0 %	50 %	0 %	50 %	163838830
1043	NC_010168	CACGG	2	10	57604	57613	20 %	0 %	40 %	40 %	163838830
1044	NC_010168	AAT	2	6	57676	57681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163838830
1045	NC_010168	GAT	2	6	57702	57707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838830
1046	NC_010168	CGG	2	6	57768	57773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838830
1047	NC_010168	CAG	2	6	57775	57780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838830
1048	NC_010168	CGG	2	6	57783	57788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838830
1049	NC_010168	GCAA	2	8	57824	57831	50 %	0 %	25 %	25 %	163838830
1050	NC_010168	CTC	2	6	57841	57846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838830
1051	NC_010168	GGC	2	6	57851	57856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838830
1052	NC_010168	CGT	2	6	57903	57908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838830
1053	NC_010168	TTTG	2	8	57978	57985	0 %	75 %	25 %	0 %	163838830
1054	NC_010168	ATT	2	6	58022	58027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838830
1055	NC_010168	GC	3	6	58033	58038	0 %	0 %	50 %	50 %	163838830
1056	NC_010168	ATC	2	6	58042	58047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838830
1057	NC_010168	GCT	2	6	58092	58097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838830
1058	NC_010168	GTG	2	6	58172	58177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838830
1059	NC_010168	CTC	2	6	58198	58203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838830
1060	NC_010168	TGT	2	6	58266	58271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838830
1061	NC_010168	CCA	2	6	58335	58340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838830
1062	NC_010168	ACC	2	6	58428	58433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838830
1063	NC_010168	CGG	2	6	58453	58458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838830
1064	NC_010168	CGC	2	6	58525	58530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_010168	TTGT	2	8	58604	58611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010168	CCA	2	6	58658	58663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_010168	TG	3	6	58680	58685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010168	TGT	2	6	58743	58748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010168	TTTGC	2	10	58841	58850	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_010168	TCG	2	6	58908	58913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838831
1071	NC_010168	GTAG	2	8	59039	59046	25 %	25 %	50 %	0 %	163838831
1072	NC_010168	CAG	2	6	59048	59053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838831
1073	NC_010168	AGC	2	6	59124	59129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838831
1074	NC_010168	GCC	2	6	59204	59209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838831
1075	NC_010168	CGG	2	6	59243	59248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838831
1076	NC_010168	CCA	2	6	59249	59254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838831
1077	NC_010168	GCC	2	6	59283	59288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838831
1078	NC_010168	GCAA	2	8	59310	59317	50 %	0 %	25 %	25 %	163838831
1079	NC_010168	ACGA	2	8	59327	59334	50 %	0 %	25 %	25 %	163838831
1080	NC_010168	GCC	2	6	59336	59341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838831
1081	NC_010168	TGC	2	6	59359	59364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838831
1082	NC_010168	ATG	2	6	59382	59387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838831
1083	NC_010168	TTGA	2	8	59397	59404	25 %	50 %	25 %	0 %	163838832
1084	NC_010168	TGT	2	6	59447	59452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838832
1085	NC_010168	GC	3	6	59528	59533	0 %	0 %	50 %	50 %	163838832
1086	NC_010168	CAA	2	6	59571	59576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838832
1087	NC_010168	TGGT	2	8	59617	59624	0 %	50 %	50 %	0 %	163838832
1088	NC_010168	AT	4	8	59762	59769	50 %	50 %	0 %	0 %	163838832
1089	NC_010168	TCG	2	6	59872	59877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838833
1090	NC_010168	A	6	6	59928	59933	100 %	0 %	0 %	0 %	163838833
1091	NC_010168	GGA	2	6	59981	59986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838833
1092	NC_010168	CTG	2	6	60003	60008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838833
1093	NC_010168	GAACC	2	10	60012	60021	40 %	0 %	20 %	40 %	163838833
1094	NC_010168	AAG	2	6	60046	60051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838833
1095	NC_010168	GCT	2	6	60078	60083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838833
1096	NC_010168	CGT	2	6	60098	60103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838833
1097	NC_010168	CAC	2	6	60173	60178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838833
1098	NC_010168	GAC	2	6	60189	60194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838833
1099	NC_010168	AAC	2	6	60225	60230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838833
1100	NC_010168	GCG	2	6	60384	60389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838834
1101	NC_010168	TTG	2	6	60390	60395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838834
1102	NC_010168	GCGG	2	8	60416	60423	0 %	0 %	75 %	25 %	163838834
1103	NC_010168	ACG	2	6	60527	60532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838835
1104	NC_010168	GGC	2	6	60698	60703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838835
1105	NC_010168	TCA	2	6	60714	60719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838835
1106	NC_010168	GCT	2	6	60728	60733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838835
1107	NC_010168	TTA	2	6	60749	60754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838835
1108	NC_010168	AGC	2	6	60769	60774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838835
1109	NC_010168	CCG	2	6	60844	60849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838835
1110	NC_010168	GCC	2	6	60922	60927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838835
1111	NC_010168	CGG	2	6	60970	60975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010168	AGA	2	6	61039	61044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838836
1113	NC_010168	GCG	2	6	61101	61106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838836
1114	NC_010168	ACC	2	6	61206	61211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838836
1115	NC_010168	GAC	2	6	61242	61247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838836
1116	NC_010168	ATG	2	6	61522	61527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838836
1117	NC_010168	GCC	2	6	61563	61568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838836
1118	NC_010168	CTGG	2	8	61645	61652	0 %	25 %	50 %	25 %	163838836
1119	NC_010168	GTT	2	6	61679	61684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838836
1120	NC_010168	GGTC	2	8	61761	61768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_010168	GAT	2	6	61803	61808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010168	AGC	2	6	61826	61831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838837
1123	NC_010168	CAT	2	6	61847	61852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838837
1124	NC_010168	CG	3	6	61862	61867	0 %	0 %	50 %	50 %	163838837
1125	NC_010168	GCTG	2	8	61915	61922	0 %	25 %	50 %	25 %	163838837
1126	NC_010168	CAGC	2	8	61927	61934	25 %	0 %	25 %	50 %	163838837
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1249	NC_010168	ACTC	2	8	69226	69233	25 %	25 %	0 %	50 %	163838844
1250	NC_010168	TCA	2	6	69346	69351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838844
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1252	NC_010168	CGC	2	6	69547	69552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_010168	GGT	2	6	69609	69614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838845
1254	NC_010168	TTC	2	6	69636	69641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838845
1255	NC_010168	TCGC	2	8	69670	69677	0 %	25 %	25 %	50 %	163838845
1256	NC_010168	CCA	2	6	69710	69715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838845
1257	NC_010168	ACG	2	6	69748	69753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838845
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1262	NC_010168	CGA	2	6	69902	69907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1264	NC_010168	CGCAC	2	10	70005	70014	20 %	0 %	20 %	60 %	163838846
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1363	NC_010168	CGA	2	6	75001	75006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1373	NC_010168	CCA	2	6	75424	75429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1374	NC_010168	CGA	2	6	75460	75465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1376	NC_010168	CGG	2	6	75587	75592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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