MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010168	ACG	2	6	26919	26924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838794
502	NC_010168	TAG	2	6	26938	26943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010168	ACG	2	6	27002	27007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838795
504	NC_010168	TCG	2	6	27017	27022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838795
505	NC_010168	GCG	2	6	27110	27115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838795
506	NC_010168	TCC	2	6	27328	27333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838795
507	NC_010168	GTA	2	6	27499	27504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838795
508	NC_010168	ATGGC	2	10	27515	27524	20 %	20 %	40 %	20 %	163838795
509	NC_010168	GCT	2	6	27558	27563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838795
510	NC_010168	GCC	2	6	27670	27675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838795
511	NC_010168	GTC	2	6	27676	27681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838795
512	NC_010168	GCT	2	6	27728	27733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838795
513	NC_010168	TC	3	6	27761	27766	0 %	50 %	0 %	50 %	163838795
514	NC_010168	GAA	2	6	27826	27831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838795
515	NC_010168	ATC	2	6	27841	27846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838795
516	NC_010168	CG	4	8	27863	27870	0 %	0 %	50 %	50 %	163838795
517	NC_010168	CGG	2	6	27894	27899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838795
518	NC_010168	GTCCG	2	10	27902	27911	0 %	20 %	40 %	40 %	163838795
519	NC_010168	TGG	2	6	27969	27974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838795
520	NC_010168	TAC	2	6	27991	27996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838795
521	NC_010168	GCC	2	6	28033	28038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838795
522	NC_010168	TTC	2	6	28113	28118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838795
523	NC_010168	GGC	3	9	28149	28157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838795
524	NC_010168	TGG	2	6	28246	28251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838795
525	NC_010168	CCA	2	6	28473	28478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838796
526	NC_010168	GCG	2	6	28481	28486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838796
527	NC_010168	TCG	2	6	28494	28499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838796
528	NC_010168	CT	3	6	28503	28508	0 %	50 %	0 %	50 %	163838796
529	NC_010168	CAG	2	6	28513	28518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838796
530	NC_010168	GCT	2	6	28555	28560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838796
531	NC_010168	GCCAG	2	10	28694	28703	20 %	0 %	40 %	40 %	163838796
532	NC_010168	GCC	2	6	28709	28714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838796
533	NC_010168	CAG	2	6	28717	28722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838796
534	NC_010168	GCG	2	6	28724	28729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838796
535	NC_010168	CTTG	2	8	28774	28781	0 %	50 %	25 %	25 %	163838796
536	NC_010168	CGT	2	6	28816	28821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838796
537	NC_010168	GCA	2	6	28834	28839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838796
538	NC_010168	GAC	2	6	28859	28864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838796
539	NC_010168	CAG	3	9	28876	28884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838796
540	NC_010168	AG	3	6	28901	28906	50 %	0 %	50 %	0 %	163838796
541	NC_010168	GCC	2	6	28979	28984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838796
542	NC_010168	GGT	2	6	29153	29158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838796
543	NC_010168	CCA	2	6	29168	29173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838796
544	NC_010168	CCG	2	6	29178	29183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838796
545	NC_010168	GC	3	6	29307	29312	0 %	0 %	50 %	50 %	163838796
546	NC_010168	GC	3	6	29314	29319	0 %	0 %	50 %	50 %	163838796
547	NC_010168	TCG	3	9	29322	29330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838796
548	NC_010168	TCA	2	6	29349	29354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838796
549	NC_010168	GCC	3	9	29433	29441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838796
550	NC_010168	GTA	2	6	29444	29449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838796
551	NC_010168	TCT	2	6	29452	29457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838796
552	NC_010168	GCCA	2	8	29496	29503	25 %	0 %	25 %	50 %	163838796
553	NC_010168	CAA	2	6	29558	29563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838796
554	NC_010168	CCA	2	6	29571	29576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838796
555	NC_010168	CACGGC	2	12	29643	29654	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163838796
556	NC_010168	GAA	2	6	29708	29713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838796
557	NC_010168	ATG	2	6	29763	29768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838796
558	NC_010168	CGA	2	6	29779	29784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838796
559	NC_010168	CGG	2	6	29920	29925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838796
560	NC_010168	TCCA	2	8	29928	29935	25 %	25 %	0 %	50 %	163838796
561	NC_010168	ATT	2	6	29936	29941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838796
562	NC_010168	CTC	2	6	29987	29992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838796
563	NC_010168	TTA	2	6	30189	30194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838796
564	NC_010168	ATTT	2	8	30306	30313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010168	ATT	2	6	30383	30388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010168	GCCTG	2	10	30473	30482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
567	NC_010168	AGG	2	6	30505	30510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010168	CGC	2	6	30524	30529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838797
569	NC_010168	TCG	2	6	30566	30571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838797
570	NC_010168	CAT	2	6	30581	30586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838797
571	NC_010168	AGA	2	6	30612	30617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838797
572	NC_010168	CGG	2	6	30654	30659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838797
573	NC_010168	GCGG	2	8	30715	30722	0 %	0 %	75 %	25 %	163838797
574	NC_010168	GGC	2	6	30750	30755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838797
575	NC_010168	GGC	2	6	30796	30801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838797
576	NC_010168	GCA	2	6	30871	30876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838797
577	NC_010168	ACT	2	6	30904	30909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838797
578	NC_010168	GGC	2	6	30943	30948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838797
579	NC_010168	TAC	2	6	31071	31076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838797
580	NC_010168	AGA	2	6	31106	31111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838797
581	NC_010168	TAC	2	6	31128	31133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838797
582	NC_010168	G	7	7	31153	31159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010168	CCT	2	6	31294	31299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838798
584	NC_010168	AGC	2	6	31387	31392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838799
585	NC_010168	TCC	2	6	31429	31434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838799
586	NC_010168	GCGACC	2	12	31501	31512	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163838799
587	NC_010168	GGTC	2	8	31577	31584	0 %	25 %	50 %	25 %	163838799
588	NC_010168	GCCT	2	8	31633	31640	0 %	25 %	25 %	50 %	163838799
589	NC_010168	CAG	2	6	31712	31717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838799
590	NC_010168	ACCA	2	8	31750	31757	50 %	0 %	0 %	50 %	163838799
591	NC_010168	CCT	2	6	31790	31795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838799
592	NC_010168	TGG	2	6	31818	31823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838799
593	NC_010168	CCT	2	6	31892	31897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838799
594	NC_010168	ATC	2	6	31947	31952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838799
595	NC_010168	ACCA	2	8	31959	31966	50 %	0 %	0 %	50 %	163838799
596	NC_010168	CAT	2	6	32022	32027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838799
597	NC_010168	TGA	2	6	32048	32053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838799
598	NC_010168	GCA	2	6	32092	32097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838799
599	NC_010168	CGCAA	2	10	32108	32117	40 %	0 %	20 %	40 %	163838799
600	NC_010168	TCG	2	6	32132	32137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838799
601	NC_010168	GCT	2	6	32179	32184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838799
602	NC_010168	AGT	2	6	32199	32204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838799
603	NC_010168	CGC	2	6	32237	32242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838799
604	NC_010168	GTG	2	6	32254	32259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838799
605	NC_010168	CCG	2	6	32328	32333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838799
606	NC_010168	GCG	2	6	32347	32352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838799
607	NC_010168	CGT	2	6	32363	32368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838799
608	NC_010168	TCT	2	6	32395	32400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010168	AGC	2	6	32559	32564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010168	GCT	2	6	32585	32590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010168	CAG	2	6	32637	32642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_010168	CAA	2	6	32668	32673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010168	TGA	2	6	32692	32697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010168	TCA	2	6	32829	32834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838800
615	NC_010168	GAT	2	6	32852	32857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838800
616	NC_010168	GCG	2	6	33005	33010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838801
617	NC_010168	GAG	2	6	33108	33113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838801
618	NC_010168	CCA	2	6	33121	33126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838801
619	NC_010168	GCG	2	6	33181	33186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838801
620	NC_010168	CCG	2	6	33196	33201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838801
621	NC_010168	ATG	2	6	33291	33296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838801
622	NC_010168	CTG	2	6	33338	33343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
623	NC_010168	GTGCC	2	10	33379	33388	0 %	20 %	40 %	40 %	163838801
624	NC_010168	CGT	3	9	33404	33412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
625	NC_010168	CGT	2	6	33463	33468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
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627	NC_010168	TGC	2	6	33605	33610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
628	NC_010168	GCA	2	6	33789	33794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838801
629	NC_010168	TCA	2	6	33913	33918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838801
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642	NC_010168	GTG	2	6	34912	34917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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732	NC_010168	GCGT	2	8	39976	39983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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741	NC_010168	TCAGT	2	10	40210	40219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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743	NC_010168	CAA	2	6	40271	40276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838808
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751	NC_010168	TGG	2	6	40773	40778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838808
752	NC_010168	GCCG	2	8	40797	40804	0 %	0 %	50 %	50 %	163838808
753	NC_010168	CGG	2	6	40836	40841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838808
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755	NC_010168	CG	3	6	40886	40891	0 %	0 %	50 %	50 %	163838808
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997	NC_010168	CGG	2	6	54693	54698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838824
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1000	NC_010168	GCG	2	6	54762	54767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838824

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