MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_010168	CCA	2	6	3111977	3111982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842224
58003	NC_010168	TGG	2	6	3112001	3112006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842224
58004	NC_010168	GGT	2	6	3112056	3112061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842224
58005	NC_010168	CAG	2	6	3112125	3112130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842224
58006	NC_010168	TAGA	2	8	3112131	3112138	50 %	25 %	25 %	0 %	163842224
58007	NC_010168	CGACGG	2	12	3112145	3112156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163842224
58008	NC_010168	CAAT	2	8	3112190	3112197	50 %	25 %	0 %	25 %	163842224
58009	NC_010168	C	6	6	3112204	3112209	0 %	0 %	0 %	100 %	163842224
58010	NC_010168	CCA	2	6	3112304	3112309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842224
58011	NC_010168	ATC	2	6	3112312	3112317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842224
58012	NC_010168	GT	3	6	3112394	3112399	0 %	50 %	50 %	0 %	163842224
58013	NC_010168	CAC	2	6	3112428	3112433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842224
58014	NC_010168	CG	3	6	3112567	3112572	0 %	0 %	50 %	50 %	163842225
58015	NC_010168	GAA	2	6	3112603	3112608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842225
58016	NC_010168	TGC	2	6	3112621	3112626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842225
58017	NC_010168	CAG	2	6	3112670	3112675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842225
58018	NC_010168	TGC	2	6	3112720	3112725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842225
58019	NC_010168	CAA	3	9	3112735	3112743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842225
58020	NC_010168	CGC	2	6	3112763	3112768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842225
58021	NC_010168	GAA	2	6	3112801	3112806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842225
58022	NC_010168	CGC	2	6	3112814	3112819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842225
58023	NC_010168	ATC	2	6	3112844	3112849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842225
58024	NC_010168	CGT	2	6	3112930	3112935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842225
58025	NC_010168	TAC	2	6	3113053	3113058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842225
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58027	NC_010168	GCA	2	6	3113104	3113109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842225
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58029	NC_010168	TGCTTC	2	12	3113144	3113155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	163842225
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58031	NC_010168	CGG	2	6	3113270	3113275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842225
58032	NC_010168	GCA	2	6	3113305	3113310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842225
58033	NC_010168	TAGC	2	8	3113344	3113351	25 %	25 %	25 %	25 %	163842225
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58042	NC_010168	TGT	2	6	3113818	3113823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842226
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58044	NC_010168	CGC	2	6	3113961	3113966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842226
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58053	NC_010168	TGC	2	6	3114336	3114341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842226
58054	NC_010168	CG	3	6	3114376	3114381	0 %	0 %	50 %	50 %	163842226
58055	NC_010168	CGT	2	6	3114517	3114522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842226
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58081	NC_010168	CG	3	6	3116007	3116012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58082	NC_010168	TCGA	2	8	3116021	3116028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58083	NC_010168	CTT	3	9	3116046	3116054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58084	NC_010168	GGC	2	6	3116076	3116081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58085	NC_010168	TC	3	6	3116092	3116097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58086	NC_010168	GCG	2	6	3116130	3116135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58087	NC_010168	TCC	2	6	3116151	3116156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58088	NC_010168	TGC	2	6	3116227	3116232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58117	NC_010168	TCA	2	6	3117544	3117549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842229
58118	NC_010168	CCG	2	6	3117585	3117590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842229
58119	NC_010168	ACC	3	9	3117606	3117614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842229
58120	NC_010168	GCA	2	6	3117642	3117647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842229
58121	NC_010168	CAC	2	6	3117743	3117748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842229
58122	NC_010168	CGA	2	6	3117967	3117972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842229
58123	NC_010168	ACC	2	6	3117986	3117991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842229
58124	NC_010168	CAG	2	6	3117996	3118001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842229
58125	NC_010168	CCA	2	6	3118008	3118013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842229
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58128	NC_010168	CTGC	2	8	3118127	3118134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58129	NC_010168	CGT	2	6	3118180	3118185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58130	NC_010168	CAC	2	6	3118215	3118220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58131	NC_010168	CGC	2	6	3118297	3118302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58132	NC_010168	AGC	3	9	3118309	3118317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58133	NC_010168	ACT	2	6	3118403	3118408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842230
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58138	NC_010168	TGC	2	6	3118624	3118629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842230
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58142	NC_010168	CAAT	2	8	3118826	3118833	50 %	25 %	0 %	25 %	163842230
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58148	NC_010168	CGT	2	6	3119413	3119418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842230
58149	NC_010168	GCCT	2	8	3119453	3119460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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58151	NC_010168	TTCC	2	8	3119479	3119486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58152	NC_010168	GCC	2	6	3119500	3119505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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58155	NC_010168	GAT	2	6	3119547	3119552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58156	NC_010168	CTTC	2	8	3119619	3119626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58157	NC_010168	CGT	2	6	3119699	3119704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842231
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58178	NC_010168	AGGT	2	8	3120869	3120876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58179	NC_010168	TGG	2	6	3120907	3120912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842233
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58190	NC_010168	GGC	2	6	3121579	3121584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842233
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58194	NC_010168	GCA	2	6	3121682	3121687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58217	NC_010168	CGTG	2	8	3122974	3122981	0 %	25 %	50 %	25 %	163842237
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58225	NC_010168	TGCA	2	8	3123358	3123365	25 %	25 %	25 %	25 %	163842237
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58227	NC_010168	TGG	2	6	3123462	3123467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842237
58228	NC_010168	GCA	2	6	3123479	3123484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842237
58229	NC_010168	CGA	3	9	3123510	3123518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842237
58230	NC_010168	CGCA	2	8	3123535	3123542	25 %	0 %	25 %	50 %	163842237
58231	NC_010168	CGAA	2	8	3123554	3123561	50 %	0 %	25 %	25 %	163842237
58232	NC_010168	AGCC	2	8	3123563	3123570	25 %	0 %	25 %	50 %	163842237
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58349	NC_010168	TGAT	2	8	3129305	3129312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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58352	NC_010168	CAG	2	6	3129425	3129430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842245
58353	NC_010168	GCG	2	6	3129486	3129491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842245
58354	NC_010168	GAT	2	6	3129597	3129602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842245
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58468	NC_010168	GTA	2	6	3135667	3135672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842253
58469	NC_010168	GGT	2	6	3135682	3135687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842253
58470	NC_010168	TCGAC	2	10	3135719	3135728	20 %	20 %	20 %	40 %	163842253
58471	NC_010168	ATT	2	6	3135744	3135749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163842254
58472	NC_010168	TCAGC	2	10	3135858	3135867	20 %	20 %	20 %	40 %	163842254
58473	NC_010168	GTT	2	6	3135911	3135916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842254
58474	NC_010168	CACACC	2	12	3135976	3135987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842254
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58478	NC_010168	GTG	2	6	3136388	3136393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842255
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58481	NC_010168	TG	3	6	3136530	3136535	0 %	50 %	50 %	0 %	163842255
58482	NC_010168	AGC	2	6	3136561	3136566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842255
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58486	NC_010168	TGCC	2	8	3136738	3136745	0 %	25 %	25 %	50 %	163842255
58487	NC_010168	TCA	2	6	3136774	3136779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842255
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58489	NC_010168	T	6	6	3136929	3136934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58490	NC_010168	CAA	2	6	3137005	3137010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58500	NC_010168	GGTC	2	8	3137755	3137762	0 %	25 %	50 %	25 %	163842258

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