MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 3137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009900	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	157964073
2	NC_009900	TA	3	6	1015	1020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009900	TC	3	6	1586	1591	0 %	50 %	0 %	50 %	157964075
4	NC_009900	AT	3	6	1711	1716	50 %	50 %	0 %	0 %	157964075
5	NC_009900	TA	3	6	1829	1834	50 %	50 %	0 %	0 %	157964075
6	NC_009900	GA	3	6	2397	2402	50 %	0 %	50 %	0 %	157964076
7	NC_009900	TA	3	6	2561	2566	50 %	50 %	0 %	0 %	157964076
8	NC_009900	TG	3	6	2677	2682	0 %	50 %	50 %	0 %	157964076
9	NC_009900	AT	3	6	2821	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	157964076
10	NC_009900	TC	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	157964077
11	NC_009900	GA	3	6	3609	3614	50 %	0 %	50 %	0 %	157964077
12	NC_009900	AT	3	6	4071	4076	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
13	NC_009900	AT	3	6	4381	4386	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
14	NC_009900	AG	3	6	4400	4405	50 %	0 %	50 %	0 %	157964077
15	NC_009900	TA	3	6	4488	4493	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
16	NC_009900	TA	3	6	4740	4745	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
17	NC_009900	AT	3	6	4932	4937	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
18	NC_009900	AT	3	6	5903	5908	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
19	NC_009900	TA	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009900	AT	3	6	6475	6480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009900	TA	3	6	8581	8586	50 %	50 %	0 %	0 %	157964080
22	NC_009900	GT	3	6	8711	8716	0 %	50 %	50 %	0 %	157964080
23	NC_009900	TA	3	6	9012	9017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009900	AT	3	6	9353	9358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009900	TA	3	6	9844	9849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009900	GT	3	6	9854	9859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009900	TA	3	6	9955	9960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009900	TA	3	6	11205	11210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009900	TA	3	6	11942	11947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009900	TA	3	6	12106	12111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009900	TA	3	6	13686	13691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009900	AG	3	6	14332	14337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009900	AT	3	6	14749	14754	50 %	50 %	0 %	0 %	157964081
34	NC_009900	AT	3	6	15166	15171	50 %	50 %	0 %	0 %	157964082
35	NC_009900	TA	3	6	15194	15199	50 %	50 %	0 %	0 %	157964082
36	NC_009900	AT	3	6	16670	16675	50 %	50 %	0 %	0 %	157964083
37	NC_009900	TG	3	6	17152	17157	0 %	50 %	50 %	0 %	157964083
38	NC_009900	TA	3	6	17945	17950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009900	TA	3	6	18035	18040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009900	CA	3	6	18123	18128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009900	AT	3	6	18191	18196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009900	TA	3	6	18477	18482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009900	TA	3	6	18529	18534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009900	TA	3	6	20285	20290	50 %	50 %	0 %	0 %	157964084
45	NC_009900	AG	3	6	21057	21062	50 %	0 %	50 %	0 %	157964084
46	NC_009900	TC	3	6	21372	21377	0 %	50 %	0 %	50 %	157964084
47	NC_009900	TA	3	6	21622	21627	50 %	50 %	0 %	0 %	157964084
48	NC_009900	AT	3	6	21665	21670	50 %	50 %	0 %	0 %	157964084
49	NC_009900	TA	3	6	22328	22333	50 %	50 %	0 %	0 %	157964084
50	NC_009900	TA	3	6	22427	22432	50 %	50 %	0 %	0 %	157964084
51	NC_009900	AT	3	6	23595	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	157964084
52	NC_009900	AT	3	6	24006	24011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009900	GT	3	6	24319	24324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009900	GT	3	6	24947	24952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009900	TA	3	6	25169	25174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009900	AT	3	6	25220	25225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009900	AT	3	6	25450	25455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009900	CA	3	6	25718	25723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009900	TA	3	6	25830	25835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009900	AG	3	6	25872	25877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009900	AT	3	6	26919	26924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009900	AT	4	8	27143	27150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009900	CT	3	6	27238	27243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009900	TA	3	6	27291	27296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009900	AT	4	8	27499	27506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009900	TG	3	6	27806	27811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009900	AG	3	6	28968	28973	50 %	0 %	50 %	0 %	157964087
68	NC_009900	AT	3	6	28978	28983	50 %	50 %	0 %	0 %	157964087
69	NC_009900	AT	3	6	30664	30669	50 %	50 %	0 %	0 %	157964090
70	NC_009900	AT	3	6	31494	31499	50 %	50 %	0 %	0 %	157964091
71	NC_009900	AT	3	6	32224	32229	50 %	50 %	0 %	0 %	157964092
72	NC_009900	AT	3	6	32782	32787	50 %	50 %	0 %	0 %	157964092
73	NC_009900	AT	3	6	33682	33687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009900	TA	3	6	33689	33694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009900	TC	3	6	34652	34657	0 %	50 %	0 %	50 %	157964093
76	NC_009900	AT	3	6	34954	34959	50 %	50 %	0 %	0 %	157964093
77	NC_009900	GA	3	6	35149	35154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009900	TA	3	6	35597	35602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009900	TA	3	6	36231	36236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009900	TA	4	8	36459	36466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009900	AT	4	8	36504	36511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009900	AT	3	6	36614	36619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009900	AG	3	6	37070	37075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009900	AT	3	6	37665	37670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009900	GA	3	6	37798	37803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009900	AT	3	6	39145	39150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009900	AT	3	6	39310	39315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009900	TA	3	6	39519	39524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009900	AT	3	6	39655	39660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009900	AT	3	6	39801	39806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009900	TA	4	8	39908	39915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009900	TA	3	6	40382	40387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009900	AT	3	6	40449	40454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009900	AT	3	6	40728	40733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009900	AT	3	6	41637	41642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009900	AT	3	6	42640	42645	50 %	50 %	0 %	0 %	157964096
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99	NC_009900	AT	3	6	42888	42893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009900	AT	3	6	43072	43077	50 %	50 %	0 %	0 %	157964097
101	NC_009900	AT	3	6	43096	43101	50 %	50 %	0 %	0 %	157964097
102	NC_009900	CT	3	6	43510	43515	0 %	50 %	0 %	50 %	157964097
103	NC_009900	TG	3	6	43689	43694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009900	TA	3	6	46152	46157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009900	AT	3	6	47115	47120	50 %	50 %	0 %	0 %	157964098
106	NC_009900	AT	3	6	47311	47316	50 %	50 %	0 %	0 %	157964098
107	NC_009900	TA	4	8	47384	47391	50 %	50 %	0 %	0 %	157964098
108	NC_009900	AT	3	6	48267	48272	50 %	50 %	0 %	0 %	157964098
109	NC_009900	CT	3	6	48565	48570	0 %	50 %	0 %	50 %	157964099
110	NC_009900	AT	3	6	49032	49037	50 %	50 %	0 %	0 %	157964099
111	NC_009900	TC	3	6	49808	49813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009900	TA	3	6	49906	49911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009900	TA	3	6	50000	50005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009900	AT	3	6	50152	50157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009900	TA	3	6	50707	50712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009900	CA	3	6	51441	51446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009900	AT	3	6	51546	51551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009900	GT	3	6	52824	52829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009900	AT	3	6	53978	53983	50 %	50 %	0 %	0 %	157964100
120	NC_009900	AT	3	6	54917	54922	50 %	50 %	0 %	0 %	157964100
121	NC_009900	AT	3	6	56114	56119	50 %	50 %	0 %	0 %	157964101
122	NC_009900	AT	3	6	56339	56344	50 %	50 %	0 %	0 %	157964101
123	NC_009900	AT	3	6	58884	58889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009900	CT	3	6	59070	59075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009900	CT	3	6	59488	59493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009900	TA	3	6	59773	59778	50 %	50 %	0 %	0 %	157964104
127	NC_009900	TG	3	6	61005	61010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009900	AT	3	6	61622	61627	50 %	50 %	0 %	0 %	157964107
129	NC_009900	TA	3	6	61763	61768	50 %	50 %	0 %	0 %	157964107
130	NC_009900	AG	3	6	61927	61932	50 %	0 %	50 %	0 %	157964107
131	NC_009900	TA	3	6	62364	62369	50 %	50 %	0 %	0 %	157964107
132	NC_009900	AT	3	6	62627	62632	50 %	50 %	0 %	0 %	157964107
133	NC_009900	TG	3	6	64807	64812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009900	TA	3	6	65037	65042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009900	TA	3	6	65136	65141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009900	TA	3	6	65326	65331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009900	AT	4	8	65632	65639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009900	AG	3	6	66115	66120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009900	AG	3	6	66173	66178	50 %	0 %	50 %	0 %	157964109
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143	NC_009900	CT	3	6	68276	68281	0 %	50 %	0 %	50 %	157964110
144	NC_009900	TA	3	6	69012	69017	50 %	50 %	0 %	0 %	157964111
145	NC_009900	TA	3	6	69780	69785	50 %	50 %	0 %	0 %	157964112
146	NC_009900	AT	4	8	69946	69953	50 %	50 %	0 %	0 %	157964112
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149	NC_009900	TA	3	6	70413	70418	50 %	50 %	0 %	0 %	157964112
150	NC_009900	AT	4	8	70517	70524	50 %	50 %	0 %	0 %	157964112
151	NC_009900	AT	3	6	70645	70650	50 %	50 %	0 %	0 %	157964112
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