MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 1255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009900	TTTTA	2	10	2601	2610	20 %	80 %	0 %	0 %	157964076
2	NC_009900	ATTTA	2	10	2954	2963	40 %	60 %	0 %	0 %	157964076
3	NC_009900	GGTCA	2	10	4201	4210	20 %	20 %	40 %	20 %	157964077
4	NC_009900	TAAAT	2	10	4910	4919	60 %	40 %	0 %	0 %	157964077
5	NC_009900	ACTTT	2	10	6684	6693	20 %	60 %	0 %	20 %	157964078
6	NC_009900	AATAC	2	10	7225	7234	60 %	20 %	0 %	20 %	157964078
7	NC_009900	ATCCA	2	10	7724	7733	40 %	20 %	0 %	40 %	157964079
8	NC_009900	AATTA	2	10	9343	9352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009900	GGCTC	2	10	12721	12730	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009900	AGCAG	2	10	13141	13150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009900	TTAAT	2	10	13297	13306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009900	TAATA	2	10	14087	14096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009900	TAACT	2	10	14443	14452	40 %	40 %	0 %	20 %	157964081
14	NC_009900	ATTTA	2	10	16106	16115	40 %	60 %	0 %	0 %	157964083
15	NC_009900	TTAAA	2	10	16267	16276	60 %	40 %	0 %	0 %	157964083
16	NC_009900	TTTTA	2	10	16874	16883	20 %	80 %	0 %	0 %	157964083
17	NC_009900	TTTAA	2	10	18541	18550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009900	AGAAA	2	10	19924	19933	80 %	0 %	20 %	0 %	157964084
19	NC_009900	AAAGC	2	10	20177	20186	60 %	0 %	20 %	20 %	157964084
20	NC_009900	TAATA	2	10	21046	21055	60 %	40 %	0 %	0 %	157964084
21	NC_009900	CAAAG	2	10	21138	21147	60 %	0 %	20 %	20 %	157964084
22	NC_009900	AGCAG	2	10	21464	21473	40 %	0 %	40 %	20 %	157964084
23	NC_009900	TACCT	2	10	22621	22630	20 %	40 %	0 %	40 %	157964084
24	NC_009900	TATAA	2	10	24117	24126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009900	AGTTC	2	10	24214	24223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009900	ATATT	2	10	26442	26451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009900	ATATT	2	10	26477	26486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009900	ATGTT	2	10	27643	27652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009900	TTTGT	2	10	28596	28605	0 %	80 %	20 %	0 %	157964086
30	NC_009900	TCATT	2	10	30248	30257	20 %	60 %	0 %	20 %	157964090
31	NC_009900	TAATA	2	10	30537	30546	60 %	40 %	0 %	0 %	157964090
32	NC_009900	CTATA	2	10	31177	31186	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009900	AAGTG	2	10	33734	33743	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009900	TGAGT	2	10	35423	35432	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009900	TTAGT	2	10	37951	37960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009900	CTTTT	2	10	40047	40056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009900	TTATT	2	10	40477	40486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009900	TTTTA	2	10	40582	40591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009900	TAAGT	2	10	43723	43732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009900	GAGAG	2	10	44499	44508	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009900	CAAAC	2	10	44551	44560	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009900	ACGTA	2	10	44721	44730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009900	AAAAC	2	10	45881	45890	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009900	TAACT	2	10	46605	46614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009900	AGAAA	2	10	47016	47025	80 %	0 %	20 %	0 %	157964098
46	NC_009900	GTTTC	2	10	47456	47465	0 %	60 %	20 %	20 %	157964098
47	NC_009900	ATTTT	2	10	48005	48014	20 %	80 %	0 %	0 %	157964098
48	NC_009900	AAGAG	2	10	49465	49474	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009900	AGTAC	2	10	49919	49928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009900	TTTCT	2	10	51217	51226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009900	CATTA	2	10	52281	52290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009900	TTGAT	2	10	54187	54196	20 %	60 %	20 %	0 %	157964100
53	NC_009900	TAAAG	2	10	55214	55223	60 %	20 %	20 %	0 %	157964100
54	NC_009900	ATTAT	2	10	55287	55296	40 %	60 %	0 %	0 %	157964100
55	NC_009900	GCAAT	2	10	55755	55764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009900	TCGGT	2	10	60738	60747	0 %	40 %	40 %	20 %	157964106
57	NC_009900	GCTTT	2	10	62153	62162	0 %	60 %	20 %	20 %	157964107
58	NC_009900	GATAA	2	10	65510	65519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009900	TAAAA	2	10	66874	66883	80 %	20 %	0 %	0 %	157964109
60	NC_009900	CTTTA	2	10	69692	69701	20 %	60 %	0 %	20 %	157964112
61	NC_009900	GCTTA	2	10	69880	69889	20 %	40 %	20 %	20 %	157964112
62	NC_009900	CATTT	2	10	70583	70592	20 %	60 %	0 %	20 %	157964112
63	NC_009900	TTAAA	2	10	70608	70617	60 %	40 %	0 %	0 %	157964112
64	NC_009900	ACATA	2	10	73403	73412	60 %	20 %	0 %	20 %	157964115
65	NC_009900	TTTCT	2	10	76631	76640	0 %	80 %	0 %	20 %	157964118
66	NC_009900	ATTTA	2	10	77049	77058	40 %	60 %	0 %	0 %	157964119
67	NC_009900	AAAAG	2	10	77825	77834	80 %	0 %	20 %	0 %	157964119
68	NC_009900	GGGTT	2	10	78035	78044	0 %	40 %	60 %	0 %	157964119
69	NC_009900	TTTAT	2	10	78411	78420	20 %	80 %	0 %	0 %	157964119
70	NC_009900	GCTTA	2	10	79553	79562	20 %	40 %	20 %	20 %	157964120
71	NC_009900	ACAAT	2	10	79917	79926	60 %	20 %	0 %	20 %	157964121
72	NC_009900	GTTAT	2	10	80542	80551	20 %	60 %	20 %	0 %	157964122
73	NC_009900	GTAGA	2	10	80848	80857	40 %	20 %	40 %	0 %	157964122
74	NC_009900	CAATG	2	10	83200	83209	40 %	20 %	20 %	20 %	157964124
75	NC_009900	ATAAA	2	10	83663	83672	80 %	20 %	0 %	0 %	157964125
76	NC_009900	ATTAA	2	10	84372	84381	60 %	40 %	0 %	0 %	157964125
77	NC_009900	ATACA	2	10	84576	84585	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009900	GAAAA	2	10	84928	84937	80 %	0 %	20 %	0 %	157964126
79	NC_009900	GCTTG	2	10	85243	85252	0 %	40 %	40 %	20 %	157964126
80	NC_009900	CGCAT	3	15	92944	92958	20 %	20 %	20 %	40 %	157964131
81	NC_009900	TGAAA	2	10	96187	96196	60 %	20 %	20 %	0 %	157964133
82	NC_009900	TTTTA	2	10	98331	98340	20 %	80 %	0 %	0 %	157964134
83	NC_009900	TTGAT	2	10	98383	98392	20 %	60 %	20 %	0 %	157964134
84	NC_009900	TTGTA	2	10	99148	99157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009900	ATTTA	2	10	100087	100096	40 %	60 %	0 %	0 %	157964136
86	NC_009900	AATTA	2	10	100456	100465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009900	TCAAA	2	10	101744	101753	60 %	20 %	0 %	20 %	157964138
88	NC_009900	TTAAT	2	10	102534	102543	40 %	60 %	0 %	0 %	157964139
89	NC_009900	AAACT	2	10	105104	105113	60 %	20 %	0 %	20 %	157964141
90	NC_009900	TTAGT	2	10	105455	105464	20 %	60 %	20 %	0 %	157964142
91	NC_009900	CCAAA	2	10	107892	107901	60 %	0 %	0 %	40 %	157964144
92	NC_009900	TTTAT	2	10	108283	108292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009900	CGGAT	2	10	108440	108449	20 %	20 %	40 %	20 %	157964145
94	NC_009900	TAATA	2	10	109198	109207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009900	ATTAT	2	10	110136	110145	40 %	60 %	0 %	0 %	157964146
96	NC_009900	TTTTC	2	10	110998	111007	0 %	80 %	0 %	20 %	157964146
97	NC_009900	ATTTA	2	10	111869	111878	40 %	60 %	0 %	0 %	157964146
98	NC_009900	GCAAA	2	10	115851	115860	60 %	0 %	20 %	20 %	157964147
99	NC_009900	ATAAA	2	10	121769	121778	80 %	20 %	0 %	0 %	157964150
100	NC_009900	AAGTA	2	10	122375	122384	60 %	20 %	20 %	0 %	157964151
101	NC_009900	ATTCG	2	10	124207	124216	20 %	40 %	20 %	20 %	157964154
102	NC_009900	TAAAA	2	10	124547	124556	80 %	20 %	0 %	0 %	157964155
103	NC_009900	AAAAC	2	10	125243	125252	80 %	0 %	0 %	20 %	157964155
104	NC_009900	TTTAA	2	10	125319	125328	40 %	60 %	0 %	0 %	157964155
105	NC_009900	TGAAA	2	10	126769	126778	60 %	20 %	20 %	0 %	157964157
106	NC_009900	GCAAG	2	10	127382	127391	40 %	0 %	40 %	20 %	157964158
107	NC_009900	TTAAA	2	10	129321	129330	60 %	40 %	0 %	0 %	157964160
108	NC_009900	CTTGT	2	10	129811	129820	0 %	60 %	20 %	20 %	157964160
109	NC_009900	ATGAT	2	10	130876	130885	40 %	40 %	20 %	0 %	157964161
110	NC_009900	GGCTT	2	10	131212	131221	0 %	40 %	40 %	20 %	157964162
111	NC_009900	TATTT	2	10	131637	131646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009900	TTGCT	2	10	133044	133053	0 %	60 %	20 %	20 %	157964164
113	NC_009900	AAATC	2	10	134742	134751	60 %	20 %	0 %	20 %	157964167
114	NC_009900	TTAAC	2	10	135879	135888	40 %	40 %	0 %	20 %	157964168
115	NC_009900	TATAA	2	10	135971	135980	60 %	40 %	0 %	0 %	157964168
116	NC_009900	TTATA	2	10	136345	136354	40 %	60 %	0 %	0 %	157964169
117	NC_009900	TTTTA	2	10	137871	137880	20 %	80 %	0 %	0 %	157964170
118	NC_009900	GCTTT	2	10	139447	139456	0 %	60 %	20 %	20 %	157964171
119	NC_009900	TATGT	2	10	140097	140106	20 %	60 %	20 %	0 %	157964171
120	NC_009900	GTTTT	2	10	142692	142701	0 %	80 %	20 %	0 %	157964172
121	NC_009900	ACAAG	2	10	147223	147232	60 %	0 %	20 %	20 %	157964173
122	NC_009900	AGTTT	2	10	147565	147574	20 %	60 %	20 %	0 %	157964174
123	NC_009900	TTAGT	2	10	148088	148097	20 %	60 %	20 %	0 %	157964174
124	NC_009900	ATATA	2	10	148994	149003	60 %	40 %	0 %	0 %	157964174
125	NC_009900	TGCAG	2	10	149082	149091	20 %	20 %	40 %	20 %	157964174
126	NC_009900	GTTAT	2	10	149498	149507	20 %	60 %	20 %	0 %	157964174
127	NC_009900	ATGGT	2	10	150665	150674	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009900	TATTT	2	10	151599	151608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009900	AAATA	2	10	156650	156659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009900	AAAGA	2	10	157016	157025	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009900	AATTA	2	10	157055	157064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009900	AATTT	2	10	158864	158873	40 %	60 %	0 %	0 %	157964178
133	NC_009900	AGGTG	2	10	158970	158979	20 %	20 %	60 %	0 %	157964178
134	NC_009900	GAAGT	2	10	162845	162854	40 %	20 %	40 %	0 %	157964182
135	NC_009900	AAATT	2	10	166147	166156	60 %	40 %	0 %	0 %	157964187
136	NC_009900	TATCA	2	10	166524	166533	40 %	40 %	0 %	20 %	157964187
137	NC_009900	TAGCT	2	10	166611	166620	20 %	40 %	20 %	20 %	157964187
138	NC_009900	TATAT	2	10	166838	166847	40 %	60 %	0 %	0 %	157964188
139	NC_009900	TTATT	2	10	167473	167482	20 %	80 %	0 %	0 %	157964188
140	NC_009900	AATTT	2	10	167894	167903	40 %	60 %	0 %	0 %	157964189
141	NC_009900	ATTTT	2	10	168281	168290	20 %	80 %	0 %	0 %	157964189
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