MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009900	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964073
2	NC_009900	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964073
3	NC_009900	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964073
4	NC_009900	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	157964073
5	NC_009900	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964073
6	NC_009900	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964073
7	NC_009900	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964073
8	NC_009900	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964073
9	NC_009900	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964073
10	NC_009900	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964073
11	NC_009900	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	157964073
12	NC_009900	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964073
13	NC_009900	A	8	8	799	806	100 %	0 %	0 %	0 %	157964073
14	NC_009900	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964073
15	NC_009900	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009900	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009900	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009900	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009900	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009900	TA	3	6	1015	1020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009900	TAA	2	6	1034	1039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009900	A	7	7	1049	1055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009900	T	6	6	1060	1065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009900	ATA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964074
25	NC_009900	AAAGTA	2	12	1293	1304	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157964074
26	NC_009900	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964074
27	NC_009900	GTA	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964074
28	NC_009900	CAA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964074
29	NC_009900	A	7	7	1423	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	157964074
30	NC_009900	TAA	2	6	1448	1453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964074
31	NC_009900	ATTT	2	8	1465	1472	25 %	75 %	0 %	0 %	157964075
32	NC_009900	TCT	2	6	1568	1573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964075
33	NC_009900	A	6	6	1576	1581	100 %	0 %	0 %	0 %	157964075
34	NC_009900	TC	3	6	1586	1591	0 %	50 %	0 %	50 %	157964075
35	NC_009900	A	6	6	1646	1651	100 %	0 %	0 %	0 %	157964075
36	NC_009900	AT	3	6	1711	1716	50 %	50 %	0 %	0 %	157964075
37	NC_009900	TA	3	6	1829	1834	50 %	50 %	0 %	0 %	157964075
38	NC_009900	ATA	3	9	1832	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964075
39	NC_009900	A	7	7	1858	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	157964075
40	NC_009900	GTA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964075
41	NC_009900	TGA	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964075
42	NC_009900	GAA	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964075
43	NC_009900	A	7	7	2068	2074	100 %	0 %	0 %	0 %	157964075
44	NC_009900	AAT	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964075
45	NC_009900	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964075
46	NC_009900	TTA	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964075
47	NC_009900	CAA	3	9	2203	2211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964075
48	NC_009900	T	8	8	2235	2242	0 %	100 %	0 %	0 %	157964076
49	NC_009900	A	6	6	2245	2250	100 %	0 %	0 %	0 %	157964076
50	NC_009900	GGCA	2	8	2255	2262	25 %	0 %	50 %	25 %	157964076
51	NC_009900	T	6	6	2310	2315	0 %	100 %	0 %	0 %	157964076
52	NC_009900	T	6	6	2370	2375	0 %	100 %	0 %	0 %	157964076
53	NC_009900	T	6	6	2379	2384	0 %	100 %	0 %	0 %	157964076
54	NC_009900	GA	3	6	2397	2402	50 %	0 %	50 %	0 %	157964076
55	NC_009900	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964076
56	NC_009900	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964076
57	NC_009900	ATA	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964076
58	NC_009900	A	7	7	2505	2511	100 %	0 %	0 %	0 %	157964076
59	NC_009900	T	7	7	2529	2535	0 %	100 %	0 %	0 %	157964076
60	NC_009900	TA	3	6	2561	2566	50 %	50 %	0 %	0 %	157964076
61	NC_009900	TTTTA	2	10	2601	2610	20 %	80 %	0 %	0 %	157964076
62	NC_009900	ATA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964076
63	NC_009900	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964076
64	NC_009900	TG	3	6	2677	2682	0 %	50 %	50 %	0 %	157964076
65	NC_009900	TTAT	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	157964076
66	NC_009900	AT	3	6	2821	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	157964076
67	NC_009900	ATG	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964076
68	NC_009900	TAT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964076
69	NC_009900	TTA	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964076
70	NC_009900	ATTTA	2	10	2954	2963	40 %	60 %	0 %	0 %	157964076
71	NC_009900	TTAT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	157964076
72	NC_009900	A	6	6	3048	3053	100 %	0 %	0 %	0 %	157964077
73	NC_009900	CTC	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157964077
74	NC_009900	TC	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	157964077
75	NC_009900	ATT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
76	NC_009900	ATT	2	6	3154	3159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
77	NC_009900	T	6	6	3197	3202	0 %	100 %	0 %	0 %	157964077
78	NC_009900	ATT	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
79	NC_009900	A	7	7	3311	3317	100 %	0 %	0 %	0 %	157964077
80	NC_009900	A	6	6	3328	3333	100 %	0 %	0 %	0 %	157964077
81	NC_009900	CAAA	2	8	3413	3420	75 %	0 %	0 %	25 %	157964077
82	NC_009900	AGA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
83	NC_009900	AGA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
84	NC_009900	AGC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964077
85	NC_009900	TGC	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964077
86	NC_009900	A	7	7	3582	3588	100 %	0 %	0 %	0 %	157964077
87	NC_009900	A	7	7	3601	3607	100 %	0 %	0 %	0 %	157964077
88	NC_009900	GA	3	6	3609	3614	50 %	0 %	50 %	0 %	157964077
89	NC_009900	T	6	6	3638	3643	0 %	100 %	0 %	0 %	157964077
90	NC_009900	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
91	NC_009900	TATT	2	8	3680	3687	25 %	75 %	0 %	0 %	157964077
92	NC_009900	AGGATA	2	12	3697	3708	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157964077
93	NC_009900	GAG	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964077
94	NC_009900	TGA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964077
95	NC_009900	TCGC	2	8	3810	3817	0 %	25 %	25 %	50 %	157964077
96	NC_009900	A	6	6	3853	3858	100 %	0 %	0 %	0 %	157964077
97	NC_009900	TAT	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
98	NC_009900	GCA	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964077
99	NC_009900	AGA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
100	NC_009900	AT	3	6	4071	4076	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
101	NC_009900	CTA	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964077
102	NC_009900	TAT	2	6	4188	4193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
103	NC_009900	TTA	2	6	4194	4199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
104	NC_009900	GGTCA	2	10	4201	4210	20 %	20 %	40 %	20 %	157964077
105	NC_009900	TGT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964077
106	NC_009900	GGA	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964077
107	NC_009900	AT	3	6	4381	4386	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
108	NC_009900	AG	3	6	4400	4405	50 %	0 %	50 %	0 %	157964077
109	NC_009900	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
110	NC_009900	TA	3	6	4488	4493	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
111	NC_009900	CTAATA	2	12	4618	4629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157964077
112	NC_009900	GGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964077
113	NC_009900	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964077
114	NC_009900	A	6	6	4710	4715	100 %	0 %	0 %	0 %	157964077
115	NC_009900	TA	3	6	4740	4745	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
116	NC_009900	GGA	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964077
117	NC_009900	GAA	2	6	4782	4787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
118	NC_009900	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
119	NC_009900	AAT	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
120	NC_009900	GAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
121	NC_009900	TAA	2	6	4850	4855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
122	NC_009900	TAAAT	2	10	4910	4919	60 %	40 %	0 %	0 %	157964077
123	NC_009900	GAG	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964077
124	NC_009900	AT	3	6	4932	4937	50 %	50 %	0 %	0 %	157964077
125	NC_009900	CAAAAC	2	12	5072	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964077
126	NC_009900	GTG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964077
127	NC_009900	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
128	NC_009900	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964077
129	NC_009900	TAA	2	6	5222	5227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
130	NC_009900	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
131	NC_009900	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
132	NC_009900	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
133	NC_009900	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	157964077
134	NC_009900	GAT	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964077
135	NC_009900	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	157964077
136	NC_009900	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964077
137	NC_009900	T	6	6	5397	5402	0 %	100 %	0 %	0 %	157964077
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139	NC_009900	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964077
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452	NC_009900	ATT	2	6	17728	17733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_009900	TAAA	2	8	17756	17763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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