MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009900	TCTT	2	8	158049	158056	0 %	75 %	0 %	25 %	157964176
4002	NC_009900	GTA	2	6	158133	158138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964176
4003	NC_009900	AGT	2	6	158147	158152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964176
4004	NC_009900	CGT	2	6	158154	158159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964176
4005	NC_009900	TAT	2	6	158169	158174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964176
4006	NC_009900	AG	3	6	158210	158215	50 %	0 %	50 %	0 %	157964176
4007	NC_009900	GCA	2	6	158241	158246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964176
4008	NC_009900	AT	3	6	158256	158261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_009900	ATA	2	6	158363	158368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_009900	TTTATC	2	12	158482	158493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157964177
4011	NC_009900	GAA	2	6	158546	158551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964177
4012	NC_009900	CTT	2	6	158574	158579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964177
4013	NC_009900	TA	3	6	158623	158628	50 %	50 %	0 %	0 %	157964177
4014	NC_009900	TAC	3	9	158647	158655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964177
4015	NC_009900	A	6	6	158665	158670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009900	TA	3	6	158694	158699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_009900	CAA	2	6	158720	158725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_009900	AT	3	6	158727	158732	50 %	50 %	0 %	0 %	157964178
4019	NC_009900	AAT	2	6	158733	158738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964178
4020	NC_009900	TAA	2	6	158766	158771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964178
4021	NC_009900	GATTTT	2	12	158776	158787	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157964178
4022	NC_009900	A	6	6	158797	158802	100 %	0 %	0 %	0 %	157964178
4023	NC_009900	ATT	2	6	158821	158826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964178
4024	NC_009900	TA	4	8	158856	158863	50 %	50 %	0 %	0 %	157964178
4025	NC_009900	AATTT	2	10	158864	158873	40 %	60 %	0 %	0 %	157964178
4026	NC_009900	CGG	2	6	158889	158894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964178
4027	NC_009900	AGGTG	2	10	158970	158979	20 %	20 %	60 %	0 %	157964178
4028	NC_009900	GTA	3	9	159026	159034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964178
4029	NC_009900	GAA	2	6	159037	159042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964178
4030	NC_009900	TTAA	2	8	159064	159071	50 %	50 %	0 %	0 %	157964178
4031	NC_009900	TCTT	2	8	159184	159191	0 %	75 %	0 %	25 %	157964178
4032	NC_009900	TGC	2	6	159327	159332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964178
4033	NC_009900	TAT	2	6	159342	159347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964178
4034	NC_009900	GTA	2	6	159370	159375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964178
4035	NC_009900	AT	3	6	159376	159381	50 %	50 %	0 %	0 %	157964178
4036	NC_009900	A	8	8	159415	159422	100 %	0 %	0 %	0 %	157964178
4037	NC_009900	T	6	6	159559	159564	0 %	100 %	0 %	0 %	157964178
4038	NC_009900	ATA	2	6	159568	159573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964178
4039	NC_009900	TGTT	2	8	159620	159627	0 %	75 %	25 %	0 %	157964178
4040	NC_009900	TAA	2	6	159639	159644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964178
4041	NC_009900	A	6	6	159643	159648	100 %	0 %	0 %	0 %	157964178
4042	NC_009900	AGA	3	9	159796	159804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964179
4043	NC_009900	GCA	2	6	159829	159834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964179
4044	NC_009900	AAG	2	6	159857	159862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964179
4045	NC_009900	GAG	2	6	159951	159956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964179
4046	NC_009900	TAG	2	6	160023	160028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964179
4047	NC_009900	CGA	2	6	160036	160041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964179
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4049	NC_009900	TTGC	3	12	160108	160119	0 %	50 %	25 %	25 %	157964179
4050	NC_009900	AAT	2	6	160139	160144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964179
4051	NC_009900	AAG	2	6	160218	160223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964179
4052	NC_009900	ATTT	2	8	160268	160275	25 %	75 %	0 %	0 %	157964179
4053	NC_009900	GAA	2	6	160307	160312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964179
4054	NC_009900	A	6	6	160340	160345	100 %	0 %	0 %	0 %	157964179
4055	NC_009900	GCC	2	6	160363	160368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964179
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4058	NC_009900	AGT	2	6	160432	160437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964179
4059	NC_009900	GAG	2	6	160455	160460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964179
4060	NC_009900	GAA	2	6	160550	160555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964179
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4062	NC_009900	GCGG	2	8	160595	160602	0 %	0 %	75 %	25 %	157964179
4063	NC_009900	GTG	2	6	160608	160613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964179
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4066	NC_009900	TAT	2	6	160741	160746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964179
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4068	NC_009900	CATG	2	8	160804	160811	25 %	25 %	25 %	25 %	157964179
4069	NC_009900	ATG	2	6	160868	160873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964179
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4071	NC_009900	GAAA	2	8	160930	160937	75 %	0 %	25 %	0 %	157964179
4072	NC_009900	GAG	2	6	161069	161074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_009900	GCGA	2	8	161108	161115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_009900	AAT	2	6	161149	161154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_009900	AAT	2	6	161222	161227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_009900	ATA	2	6	161247	161252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964180
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4082	NC_009900	ATT	2	6	161436	161441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964180
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4089	NC_009900	TA	4	8	161752	161759	50 %	50 %	0 %	0 %	157964180
4090	NC_009900	GATA	2	8	161762	161769	50 %	25 %	25 %	0 %	157964180
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4095	NC_009900	CAA	2	6	161913	161918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964180
4096	NC_009900	TGG	2	6	161927	161932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964180
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4098	NC_009900	GAT	2	6	162148	162153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964181
4099	NC_009900	TTTA	2	8	162216	162223	25 %	75 %	0 %	0 %	157964181
4100	NC_009900	ACTT	2	8	162312	162319	25 %	50 %	0 %	25 %	157964181
4101	NC_009900	A	6	6	162321	162326	100 %	0 %	0 %	0 %	157964181
4102	NC_009900	TA	3	6	162328	162333	50 %	50 %	0 %	0 %	157964181
4103	NC_009900	GAA	2	6	162349	162354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964181
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4105	NC_009900	TA	3	6	162417	162422	50 %	50 %	0 %	0 %	157964181
4106	NC_009900	AAC	2	6	162441	162446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964181
4107	NC_009900	ATC	2	6	162548	162553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964181
4108	NC_009900	ACCT	2	8	162554	162561	25 %	25 %	0 %	50 %	157964181
4109	NC_009900	AT	3	6	162562	162567	50 %	50 %	0 %	0 %	157964181
4110	NC_009900	GTAAAA	2	12	162619	162630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157964181
4111	NC_009900	AACA	2	8	162638	162645	75 %	0 %	0 %	25 %	157964181
4112	NC_009900	AAG	2	6	162665	162670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964181
4113	NC_009900	GCA	2	6	162682	162687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964181
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4115	NC_009900	GCC	2	6	162779	162784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964182
4116	NC_009900	AC	3	6	162792	162797	50 %	0 %	0 %	50 %	157964182
4117	NC_009900	GAAGT	2	10	162845	162854	40 %	20 %	40 %	0 %	157964182
4118	NC_009900	TTA	2	6	162926	162931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964182
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4120	NC_009900	ACT	2	6	162980	162985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964182
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4123	NC_009900	ATT	2	6	163136	163141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964182
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4498	NC_009900	TAAT	2	8	177175	177182	50 %	50 %	0 %	0 %	157964199
4499	NC_009900	GAA	2	6	177453	177458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964199
4500	NC_009900	AGT	2	6	177494	177499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964199

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