MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_009900	T	7	7	1349529	1349535	0 %	100 %	0 %	0 %	157965032
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34504	NC_009900	TTG	2	6	1349571	1349576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157965032
34505	NC_009900	AT	3	6	1349632	1349637	50 %	50 %	0 %	0 %	157965032
34506	NC_009900	A	6	6	1349686	1349691	100 %	0 %	0 %	0 %	157965032
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34508	NC_009900	GCC	2	6	1349740	1349745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157965032
34509	NC_009900	T	6	6	1349790	1349795	0 %	100 %	0 %	0 %	157965032
34510	NC_009900	AACA	2	8	1349839	1349846	75 %	0 %	0 %	25 %	157965032
34511	NC_009900	TG	3	6	1349862	1349867	0 %	50 %	50 %	0 %	157965032
34512	NC_009900	ATT	2	6	1349899	1349904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157965032
34513	NC_009900	AAGT	2	8	1349912	1349919	50 %	25 %	25 %	0 %	157965032
34514	NC_009900	CTT	2	6	1349937	1349942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157965032
34515	NC_009900	GGT	2	6	1349944	1349949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157965032
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34517	NC_009900	GTA	2	6	1350032	1350037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34519	NC_009900	TTTGA	2	10	1350191	1350200	20 %	60 %	20 %	0 %	157965033
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34521	NC_009900	A	6	6	1350256	1350261	100 %	0 %	0 %	0 %	157965033
34522	NC_009900	TAA	2	6	1350280	1350285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157965033
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34527	NC_009900	ATTT	2	8	1350407	1350414	25 %	75 %	0 %	0 %	157965033
34528	NC_009900	T	6	6	1350412	1350417	0 %	100 %	0 %	0 %	157965033
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34556	NC_009900	CAA	2	6	1351296	1351301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157965033
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.