MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009900	TAT	2	6	115837	115842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964147
3002	NC_009900	GCAAA	2	10	115851	115860	60 %	0 %	20 %	20 %	157964147
3003	NC_009900	CGG	3	9	115973	115981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964147
3004	NC_009900	CAT	2	6	116001	116006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964147
3005	NC_009900	TTA	2	6	116125	116130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964147
3006	NC_009900	AGT	2	6	116168	116173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964147
3007	NC_009900	AGT	2	6	116190	116195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964147
3008	NC_009900	AGA	2	6	116234	116239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964147
3009	NC_009900	ATT	2	6	116257	116262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964147
3010	NC_009900	TGA	2	6	116333	116338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964147
3011	NC_009900	CGC	2	6	116347	116352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964147
3012	NC_009900	TAAT	2	8	116365	116372	50 %	50 %	0 %	0 %	157964147
3013	NC_009900	GAA	3	9	116406	116414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964147
3014	NC_009900	TAT	2	6	116435	116440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964147
3015	NC_009900	TA	3	6	116514	116519	50 %	50 %	0 %	0 %	157964147
3016	NC_009900	A	7	7	116549	116555	100 %	0 %	0 %	0 %	157964147
3017	NC_009900	A	7	7	116557	116563	100 %	0 %	0 %	0 %	157964147
3018	NC_009900	TTA	2	6	116568	116573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964147
3019	NC_009900	TTA	2	6	116595	116600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964147
3020	NC_009900	A	6	6	116605	116610	100 %	0 %	0 %	0 %	157964147
3021	NC_009900	AGA	2	6	116618	116623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964147
3022	NC_009900	TAC	2	6	116636	116641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964147
3023	NC_009900	TA	3	6	116686	116691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_009900	GTC	2	6	116708	116713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_009900	AT	3	6	116725	116730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_009900	TAA	2	6	116732	116737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_009900	TGA	2	6	116762	116767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009900	GCT	2	6	116787	116792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_009900	A	6	6	116821	116826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009900	AT	3	6	116839	116844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009900	ATT	2	6	116936	116941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964148
3032	NC_009900	TA	4	8	117000	117007	50 %	50 %	0 %	0 %	157964148
3033	NC_009900	TGA	2	6	117017	117022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964148
3034	NC_009900	AT	3	6	117081	117086	50 %	50 %	0 %	0 %	157964148
3035	NC_009900	AAAG	2	8	117095	117102	75 %	0 %	25 %	0 %	157964148
3036	NC_009900	ATT	2	6	117113	117118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964148
3037	NC_009900	TGG	2	6	117203	117208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964148
3038	NC_009900	CTAA	2	8	117213	117220	50 %	25 %	0 %	25 %	157964148
3039	NC_009900	GAA	2	6	117282	117287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964148
3040	NC_009900	AAGA	2	8	117306	117313	75 %	0 %	25 %	0 %	157964148
3041	NC_009900	AAGA	2	8	117333	117340	75 %	0 %	25 %	0 %	157964148
3042	NC_009900	TCT	2	6	117392	117397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964148
3043	NC_009900	AGT	2	6	117398	117403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964148
3044	NC_009900	TAA	2	6	117413	117418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964148
3045	NC_009900	AGT	2	6	117470	117475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964148
3046	NC_009900	ATG	2	6	117523	117528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964148
3047	NC_009900	GAA	2	6	117591	117596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964148
3048	NC_009900	A	6	6	117690	117695	100 %	0 %	0 %	0 %	157964148
3049	NC_009900	TGA	2	6	117716	117721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964148
3050	NC_009900	AGCA	2	8	117742	117749	50 %	0 %	25 %	25 %	157964148
3051	NC_009900	ATG	2	6	117754	117759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964148
3052	NC_009900	GTT	2	6	117794	117799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_009900	TTC	2	6	117927	117932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_009900	ATA	2	6	117954	117959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_009900	AAAT	2	8	117986	117993	75 %	25 %	0 %	0 %	157964149
3056	NC_009900	TGC	2	6	117999	118004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964149
3057	NC_009900	A	6	6	118025	118030	100 %	0 %	0 %	0 %	157964149
3058	NC_009900	ATG	2	6	118042	118047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964149
3059	NC_009900	A	6	6	118054	118059	100 %	0 %	0 %	0 %	157964149
3060	NC_009900	GAA	2	6	118087	118092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964149
3061	NC_009900	TTC	2	6	118103	118108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964149
3062	NC_009900	TGC	2	6	118128	118133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964149
3063	NC_009900	AAAG	2	8	118134	118141	75 %	0 %	25 %	0 %	157964149
3064	NC_009900	TTG	2	6	118229	118234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964149
3065	NC_009900	GAA	3	9	118345	118353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964149
3066	NC_009900	CGT	2	6	118396	118401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964149
3067	NC_009900	AT	3	6	118406	118411	50 %	50 %	0 %	0 %	157964149
3068	NC_009900	TAG	2	6	118487	118492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964149
3069	NC_009900	GAT	2	6	118585	118590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964149
3070	NC_009900	GA	3	6	118621	118626	50 %	0 %	50 %	0 %	157964149
3071	NC_009900	T	6	6	118633	118638	0 %	100 %	0 %	0 %	157964149
3072	NC_009900	AGA	2	6	118650	118655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964149
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3074	NC_009900	A	6	6	118679	118684	100 %	0 %	0 %	0 %	157964149
3075	NC_009900	TTC	2	6	118708	118713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964149
3076	NC_009900	GCA	2	6	118804	118809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964149
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3079	NC_009900	GTT	2	6	118973	118978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_009900	AAC	2	6	119042	119047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_009900	T	7	7	119105	119111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_009900	CAA	2	6	119119	119124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_009900	CTCA	2	8	119175	119182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_009900	CAAA	2	8	119196	119203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3085	NC_009900	TC	3	6	119249	119254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_009900	CTAT	2	8	119268	119275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_009900	TAA	2	6	119276	119281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_009900	T	6	6	119293	119298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009900	TAA	2	6	119313	119318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_009900	TAA	2	6	119335	119340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_009900	AAT	3	9	119354	119362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_009900	TAT	2	6	119363	119368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_009900	TGC	2	6	119414	119419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_009900	ATG	2	6	119466	119471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_009900	TTA	2	6	119487	119492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_009900	TAG	2	6	119601	119606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_009900	TA	3	6	119639	119644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_009900	CTC	2	6	119739	119744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_009900	A	7	7	119778	119784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_009900	GGTA	2	8	119787	119794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_009900	GTC	2	6	119857	119862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_009900	CTA	2	6	119918	119923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_009900	GTT	2	6	119932	119937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009900	TAC	2	6	120075	120080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_009900	AGA	2	6	120081	120086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_009900	T	6	6	120162	120167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_009900	AGT	2	6	120297	120302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_009900	TAT	2	6	120382	120387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_009900	ATT	2	6	120529	120534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964150
3110	NC_009900	GCT	2	6	120593	120598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964150
3111	NC_009900	ATA	2	6	120656	120661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964150
3112	NC_009900	CCG	2	6	120716	120721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964150
3113	NC_009900	A	7	7	120744	120750	100 %	0 %	0 %	0 %	157964150
3114	NC_009900	TA	3	6	120778	120783	50 %	50 %	0 %	0 %	157964150
3115	NC_009900	ATC	2	6	120787	120792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964150
3116	NC_009900	TAGCGG	2	12	120822	120833	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157964150
3117	NC_009900	ATA	2	6	120899	120904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964150
3118	NC_009900	CTT	2	6	121032	121037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964150
3119	NC_009900	CGCT	2	8	121127	121134	0 %	25 %	25 %	50 %	157964150
3120	NC_009900	A	6	6	121174	121179	100 %	0 %	0 %	0 %	157964150
3121	NC_009900	CTTTTT	2	12	121181	121192	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157964150
3122	NC_009900	TAG	2	6	121234	121239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964150
3123	NC_009900	ATA	2	6	121346	121351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964150
3124	NC_009900	TATC	2	8	121353	121360	25 %	50 %	0 %	25 %	157964150
3125	NC_009900	AAG	2	6	121428	121433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964150
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3127	NC_009900	TAT	2	6	121470	121475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964150
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