MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_009900	CTG	2	6	820201	820206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21002	NC_009900	ATT	2	6	820329	820334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_009900	CTTT	2	8	820345	820352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21004	NC_009900	TAG	2	6	820358	820363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21005	NC_009900	GAG	2	6	820399	820404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_009900	AAT	2	6	820414	820419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21007	NC_009900	T	6	6	820426	820431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21008	NC_009900	CCCAT	2	10	820466	820475	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21009	NC_009900	GAT	2	6	820504	820509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21010	NC_009900	TGGATT	2	12	820523	820534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21011	NC_009900	ACT	2	6	820536	820541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21012	NC_009900	CTA	2	6	820558	820563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21013	NC_009900	TTA	2	6	820621	820626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_009900	TTC	2	6	820684	820689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21015	NC_009900	TAT	2	6	820714	820719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_009900	CTT	2	6	820756	820761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21017	NC_009900	TTTC	2	8	820779	820786	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21018	NC_009900	AAT	2	6	820817	820822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21019	NC_009900	T	6	6	820822	820827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21020	NC_009900	TGA	2	6	820869	820874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21021	NC_009900	ATACCG	2	12	820887	820898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21022	NC_009900	CAA	2	6	820933	820938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21023	NC_009900	TTC	2	6	820949	820954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21024	NC_009900	ATT	2	6	820958	820963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21025	NC_009900	GTA	2	6	821007	821012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21027	NC_009900	TTG	2	6	821072	821077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21028	NC_009900	T	6	6	821109	821114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21029	NC_009900	ATTA	2	8	821183	821190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21030	NC_009900	CTG	2	6	821212	821217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21031	NC_009900	CTT	2	6	821221	821226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21032	NC_009900	GGC	2	6	821250	821255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21038	NC_009900	AAT	2	6	821363	821368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21039	NC_009900	T	7	7	821375	821381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21040	NC_009900	TAT	2	6	821407	821412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21041	NC_009900	TA	4	8	821431	821438	50 %	50 %	0 %	0 %	157964666
21042	NC_009900	GTA	2	6	821501	821506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964666
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21047	NC_009900	TA	3	6	821642	821647	50 %	50 %	0 %	0 %	157964666
21048	NC_009900	TC	3	6	821667	821672	0 %	50 %	0 %	50 %	157964666
21049	NC_009900	TAA	2	6	821673	821678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964666
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21052	NC_009900	ATA	2	6	821744	821749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964666
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21056	NC_009900	T	6	6	821935	821940	0 %	100 %	0 %	0 %	157964666
21057	NC_009900	GAC	2	6	821949	821954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964666
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21059	NC_009900	AT	3	6	821982	821987	50 %	50 %	0 %	0 %	157964666
21060	NC_009900	CTT	2	6	821996	822001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964666
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21062	NC_009900	ATTG	2	8	822041	822048	25 %	50 %	25 %	0 %	157964666
21063	NC_009900	ATA	2	6	822049	822054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964666
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21069	NC_009900	TCC	2	6	822273	822278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157964666
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21073	NC_009900	T	6	6	822426	822431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21074	NC_009900	T	7	7	822435	822441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21075	NC_009900	TA	3	6	822479	822484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21083	NC_009900	ATA	2	6	822846	822851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21085	NC_009900	GTT	2	6	822879	822884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21086	NC_009900	TAC	2	6	822990	822995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21088	NC_009900	TCA	2	6	823055	823060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21089	NC_009900	ATA	2	6	823077	823082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21092	NC_009900	GAG	2	6	823184	823189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21096	NC_009900	AT	3	6	823312	823317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21097	NC_009900	TA	3	6	823330	823335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21098	NC_009900	AATA	2	8	823343	823350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21099	NC_009900	TAT	2	6	823507	823512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21101	NC_009900	TTCCA	2	10	823573	823582	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21102	NC_009900	AAT	2	6	823594	823599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21103	NC_009900	TC	3	6	823633	823638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21106	NC_009900	TTA	2	6	823702	823707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21107	NC_009900	TAT	2	6	823733	823738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21108	NC_009900	ATT	2	6	823757	823762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21109	NC_009900	T	6	6	823806	823811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21110	NC_009900	TAA	2	6	823844	823849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21111	NC_009900	CTAT	2	8	823935	823942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21112	NC_009900	TG	3	6	824053	824058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21113	NC_009900	TG	3	6	824077	824082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21114	NC_009900	TCA	2	6	824090	824095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21117	NC_009900	TAA	2	6	824150	824155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21118	NC_009900	TATT	2	8	824197	824204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_009900	ATTA	2	8	824207	824214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_009900	AGC	2	6	824222	824227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21122	NC_009900	TAA	2	6	824347	824352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21125	NC_009900	AGT	2	6	824481	824486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21127	NC_009900	AT	4	8	824641	824648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21128	NC_009900	TAG	2	6	824700	824705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21129	NC_009900	ATT	2	6	824790	824795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21130	NC_009900	CTT	2	6	824891	824896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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