MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009900	ATTG	2	8	39918	39925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009900	T	6	6	39990	39995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009900	ATCTTT	2	12	40005	40016	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1004	NC_009900	TAA	2	6	40041	40046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009900	CTTTT	2	10	40047	40056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_009900	TAAA	2	8	40079	40086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009900	AGA	2	6	40171	40176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009900	ATTT	2	8	40184	40191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009900	T	6	6	40224	40229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009900	TCT	2	6	40267	40272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_009900	TAA	2	6	40282	40287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009900	ATT	2	6	40350	40355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009900	T	7	7	40374	40380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009900	TA	3	6	40382	40387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009900	CTT	2	6	40417	40422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_009900	ATTA	2	8	40424	40431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009900	AT	3	6	40449	40454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009900	TTATT	2	10	40477	40486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009900	ATC	2	6	40511	40516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_009900	TGCT	2	8	40547	40554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_009900	TAA	2	6	40568	40573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009900	TTTTA	2	10	40582	40591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009900	TCA	2	6	40640	40645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_009900	ATT	2	6	40669	40674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009900	GCTT	2	8	40675	40682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_009900	ACT	2	6	40695	40700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_009900	AT	3	6	40728	40733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009900	AAT	2	6	40737	40742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009900	AGAGTT	2	12	40799	40810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009900	T	6	6	40824	40829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009900	TAG	2	6	40846	40851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009900	T	6	6	40869	40874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009900	AGC	2	6	40915	40920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_009900	T	6	6	40958	40963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009900	T	8	8	41004	41011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009900	TCT	2	6	41090	41095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009900	TTA	2	6	41123	41128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009900	AAT	2	6	41137	41142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009900	ATTA	2	8	41167	41174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009900	TCT	2	6	41240	41245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_009900	T	6	6	41245	41250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009900	CAT	2	6	41254	41259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_009900	ATT	2	6	41296	41301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009900	TTG	3	9	41354	41362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009900	AAAT	2	8	41377	41384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009900	CTA	2	6	41406	41411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_009900	T	6	6	41428	41433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009900	TAAT	2	8	41478	41485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009900	GTT	3	9	41496	41504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009900	TAA	2	6	41510	41515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009900	A	6	6	41537	41542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009900	TAA	2	6	41555	41560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009900	AATT	2	8	41564	41571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009900	GAT	2	6	41622	41627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009900	AT	3	6	41637	41642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009900	TAT	2	6	41658	41663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_009900	AAAT	2	8	41664	41671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009900	ATA	2	6	41698	41703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964095
1059	NC_009900	TAT	2	6	41717	41722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964095
1060	NC_009900	ATA	2	6	41757	41762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964095
1061	NC_009900	TTC	2	6	41774	41779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964095
1062	NC_009900	AAG	2	6	41863	41868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964095
1063	NC_009900	GAAA	2	8	41869	41876	75 %	0 %	25 %	0 %	157964095
1064	NC_009900	ATTT	2	8	41913	41920	25 %	75 %	0 %	0 %	157964095
1065	NC_009900	TAC	2	6	41924	41929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964095
1066	NC_009900	AGA	2	6	41966	41971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964095
1067	NC_009900	TAT	2	6	41972	41977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964095
1068	NC_009900	GAA	2	6	41987	41992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964095
1069	NC_009900	AGT	2	6	42011	42016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964095
1070	NC_009900	TTA	2	6	42019	42024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964095
1071	NC_009900	A	7	7	42059	42065	100 %	0 %	0 %	0 %	157964095
1072	NC_009900	A	6	6	42073	42078	100 %	0 %	0 %	0 %	157964095
1073	NC_009900	GAT	2	6	42081	42086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964095
1074	NC_009900	TCT	3	9	42148	42156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964095
1075	NC_009900	ACAA	2	8	42183	42190	75 %	0 %	0 %	25 %	157964095
1076	NC_009900	ACA	2	6	42200	42205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964095
1077	NC_009900	ATT	2	6	42253	42258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964095
1078	NC_009900	TGA	2	6	42313	42318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964096
1079	NC_009900	TCA	2	6	42329	42334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964096
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1081	NC_009900	TTA	2	6	42398	42403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964096
1082	NC_009900	TTC	3	9	42436	42444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964096
1083	NC_009900	TCT	2	6	42518	42523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964096
1084	NC_009900	AAT	2	6	42569	42574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964096
1085	NC_009900	TAT	2	6	42582	42587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964096
1086	NC_009900	GAA	2	6	42600	42605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964096
1087	NC_009900	A	6	6	42604	42609	100 %	0 %	0 %	0 %	157964096
1088	NC_009900	AT	3	6	42640	42645	50 %	50 %	0 %	0 %	157964096
1089	NC_009900	GTT	2	6	42662	42667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964096
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1091	NC_009900	A	6	6	42688	42693	100 %	0 %	0 %	0 %	157964096
1092	NC_009900	CTT	2	6	42747	42752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964096
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1095	NC_009900	TA	3	6	42882	42887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009900	AT	3	6	42888	42893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009900	ATT	2	6	42908	42913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009900	AAT	2	6	42928	42933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964097
1099	NC_009900	T	6	6	42941	42946	0 %	100 %	0 %	0 %	157964097
1100	NC_009900	TAT	2	6	42964	42969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964097
1101	NC_009900	TTA	2	6	43035	43040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964097
1102	NC_009900	T	6	6	43060	43065	0 %	100 %	0 %	0 %	157964097
1103	NC_009900	AT	3	6	43072	43077	50 %	50 %	0 %	0 %	157964097
1104	NC_009900	AT	3	6	43096	43101	50 %	50 %	0 %	0 %	157964097
1105	NC_009900	AAT	2	6	43120	43125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964097
1106	NC_009900	TAC	2	6	43264	43269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964097
1107	NC_009900	T	6	6	43286	43291	0 %	100 %	0 %	0 %	157964097
1108	NC_009900	GTA	2	6	43349	43354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964097
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1111	NC_009900	AAT	2	6	43496	43501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964097
1112	NC_009900	CT	3	6	43510	43515	0 %	50 %	0 %	50 %	157964097
1113	NC_009900	GAT	2	6	43538	43543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964097
1114	NC_009900	GAT	2	6	43589	43594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964097
1115	NC_009900	TAAT	2	8	43645	43652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009900	TTA	2	6	43674	43679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009900	ATTA	3	12	43676	43687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009900	TG	3	6	43689	43694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009900	TAAA	2	8	43698	43705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009900	TAAGT	2	10	43723	43732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009900	TAA	2	6	43776	43781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009900	A	7	7	43783	43789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009900	T	7	7	43791	43797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009900	AGTA	2	8	43819	43826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009900	ATT	2	6	43868	43873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009900	CGG	2	6	43875	43880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_009900	TCT	2	6	43889	43894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_009900	AGGTAC	2	12	43900	43911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1129	NC_009900	ATGA	2	8	43913	43920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009900	ATT	2	6	43967	43972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_009900	ATTAAT	2	12	44012	44023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009900	TAAC	2	8	44103	44110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_009900	AAT	3	9	44177	44185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009900	GGT	2	6	44318	44323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009900	TAA	2	6	44325	44330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_009900	AGA	2	6	44412	44417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_009900	TAC	3	9	44481	44489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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