MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009900	TAAG	2	8	237704	237711	50 %	25 %	25 %	0 %	157964242
6002	NC_009900	ACA	2	6	237754	237759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964242
6003	NC_009900	AAAGCA	2	12	237817	237828	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157964242
6004	NC_009900	CAA	2	6	237944	237949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964242
6005	NC_009900	A	6	6	237957	237962	100 %	0 %	0 %	0 %	157964242
6006	NC_009900	A	7	7	238026	238032	100 %	0 %	0 %	0 %	157964242
6007	NC_009900	TTG	2	6	238058	238063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964242
6008	NC_009900	TATG	2	8	238085	238092	25 %	50 %	25 %	0 %	157964242
6009	NC_009900	A	7	7	238143	238149	100 %	0 %	0 %	0 %	157964242
6010	NC_009900	GTA	2	6	238150	238155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964242
6011	NC_009900	A	6	6	238159	238164	100 %	0 %	0 %	0 %	157964242
6012	NC_009900	TCAT	2	8	238207	238214	25 %	50 %	0 %	25 %	157964242
6013	NC_009900	GAA	2	6	238239	238244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964242
6014	NC_009900	TA	3	6	238327	238332	50 %	50 %	0 %	0 %	157964242
6015	NC_009900	ATA	2	6	238339	238344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964242
6016	NC_009900	TACT	2	8	238390	238397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_009900	ATTT	2	8	238424	238431	25 %	75 %	0 %	0 %	157964243
6018	NC_009900	ATT	2	6	238432	238437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964243
6019	NC_009900	ATTT	2	8	238480	238487	25 %	75 %	0 %	0 %	157964243
6020	NC_009900	TTA	2	6	238488	238493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964243
6021	NC_009900	AGA	2	6	238552	238557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964243
6022	NC_009900	CCATC	2	10	238604	238613	20 %	20 %	0 %	60 %	157964243
6023	NC_009900	GCAG	2	8	238645	238652	25 %	0 %	50 %	25 %	157964243
6024	NC_009900	TAG	3	9	238707	238715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964243
6025	NC_009900	CAA	2	6	238751	238756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964244
6026	NC_009900	GAA	2	6	238794	238799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964244
6027	NC_009900	AT	3	6	238884	238889	50 %	50 %	0 %	0 %	157964244
6028	NC_009900	T	6	6	238889	238894	0 %	100 %	0 %	0 %	157964244
6029	NC_009900	TGC	2	6	238915	238920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964244
6030	NC_009900	TCA	2	6	238969	238974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964244
6031	NC_009900	T	6	6	238980	238985	0 %	100 %	0 %	0 %	157964244
6032	NC_009900	TTAA	2	8	238996	239003	50 %	50 %	0 %	0 %	157964244
6033	NC_009900	TACCA	2	10	239016	239025	40 %	20 %	0 %	40 %	157964244
6034	NC_009900	GGTTT	2	10	239034	239043	0 %	60 %	40 %	0 %	157964244
6035	NC_009900	ATTT	2	8	239093	239100	25 %	75 %	0 %	0 %	157964244
6036	NC_009900	ACG	2	6	239139	239144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964244
6037	NC_009900	ATT	2	6	239158	239163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964244
6038	NC_009900	CTTT	2	8	239173	239180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_009900	T	7	7	239193	239199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_009900	TTA	2	6	239274	239279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_009900	GCT	2	6	239307	239312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_009900	T	6	6	239324	239329	0 %	100 %	0 %	0 %	157964245
6043	NC_009900	GCT	2	6	239366	239371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964245
6044	NC_009900	CTT	2	6	239396	239401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964245
6045	NC_009900	GAT	2	6	239417	239422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964245
6046	NC_009900	TA	3	6	239436	239441	50 %	50 %	0 %	0 %	157964245
6047	NC_009900	CAT	2	6	239442	239447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964245
6048	NC_009900	GAG	2	6	239522	239527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964245
6049	NC_009900	TAA	2	6	239531	239536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964245
6050	NC_009900	ATA	2	6	239546	239551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964245
6051	NC_009900	T	6	6	239631	239636	0 %	100 %	0 %	0 %	157964245
6052	NC_009900	ACA	2	6	239704	239709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964245
6053	NC_009900	TA	3	6	239756	239761	50 %	50 %	0 %	0 %	157964245
6054	NC_009900	ATC	2	6	239766	239771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964245
6055	NC_009900	TTG	2	6	239819	239824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964245
6056	NC_009900	AAAG	2	8	239832	239839	75 %	0 %	25 %	0 %	157964245
6057	NC_009900	CTT	2	6	239879	239884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964245
6058	NC_009900	AGT	2	6	239934	239939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964245
6059	NC_009900	GCT	2	6	239947	239952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964245
6060	NC_009900	TTC	2	6	240024	240029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964245
6061	NC_009900	ATT	2	6	240129	240134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964245
6062	NC_009900	TAT	2	6	240185	240190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964245
6063	NC_009900	GCT	2	6	240238	240243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964245
6064	NC_009900	ATG	2	6	240264	240269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964245
6065	NC_009900	ATTT	2	8	240300	240307	25 %	75 %	0 %	0 %	157964245
6066	NC_009900	TTC	2	6	240315	240320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964245
6067	NC_009900	CTT	2	6	240452	240457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964245
6068	NC_009900	ATTT	2	8	240532	240539	25 %	75 %	0 %	0 %	157964245
6069	NC_009900	CGA	2	6	240608	240613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_009900	ATT	2	6	240672	240677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_009900	TGC	2	6	240707	240712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964246
6072	NC_009900	TAT	2	6	240736	240741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964246
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6074	NC_009900	ATT	2	6	240803	240808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964246
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6079	NC_009900	TAT	2	6	240910	240915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964246
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6081	NC_009900	T	8	8	240941	240948	0 %	100 %	0 %	0 %	157964246
6082	NC_009900	TAA	2	6	240973	240978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964246
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6085	NC_009900	AGT	2	6	241103	241108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964246
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6087	NC_009900	ATC	2	6	241196	241201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964246
6088	NC_009900	GTA	2	6	241242	241247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964246
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6091	NC_009900	GCC	2	6	241275	241280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964246
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6094	NC_009900	T	6	6	241467	241472	0 %	100 %	0 %	0 %	157964246
6095	NC_009900	ATT	2	6	241568	241573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964246
6096	NC_009900	TA	3	6	241580	241585	50 %	50 %	0 %	0 %	157964246
6097	NC_009900	GTA	2	6	241587	241592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964246
6098	NC_009900	TCA	2	6	241593	241598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964246
6099	NC_009900	CAAG	2	8	241684	241691	50 %	0 %	25 %	25 %	157964246
6100	NC_009900	CAAT	2	8	241722	241729	50 %	25 %	0 %	25 %	157964246
6101	NC_009900	TAGTT	2	10	241817	241826	20 %	60 %	20 %	0 %	157964246
6102	NC_009900	T	7	7	241843	241849	0 %	100 %	0 %	0 %	157964246
6103	NC_009900	GTACGA	2	12	241875	241886	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157964246
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6105	NC_009900	TTC	2	6	241976	241981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964246
6106	NC_009900	ATT	2	6	242000	242005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964246
6107	NC_009900	GTTT	2	8	242059	242066	0 %	75 %	25 %	0 %	157964246
6108	NC_009900	TAA	2	6	242068	242073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964246
6109	NC_009900	CTA	2	6	242149	242154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964246
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6111	NC_009900	CTA	2	6	242283	242288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964246
6112	NC_009900	GCA	2	6	242301	242306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964246
6113	NC_009900	ATT	2	6	242327	242332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964246
6114	NC_009900	CCG	2	6	242352	242357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964246
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6117	NC_009900	TGC	2	6	242455	242460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964246
6118	NC_009900	TTGCT	2	10	242483	242492	0 %	60 %	20 %	20 %	157964246
6119	NC_009900	TCA	2	6	242634	242639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964246
6120	NC_009900	TGC	2	6	242647	242652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964246
6121	NC_009900	CTA	2	6	242692	242697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964246
6122	NC_009900	TTAG	2	8	242700	242707	25 %	50 %	25 %	0 %	157964246
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