MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009900	ATT	2	6	218390	218395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_009900	A	6	6	218495	218500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009900	T	6	6	218547	218552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_009900	AAATT	2	10	218623	218632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_009900	TTTCT	2	10	218638	218647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5506	NC_009900	TAA	2	6	218667	218672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964229
5507	NC_009900	GCA	2	6	218692	218697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964229
5508	NC_009900	ACG	2	6	218732	218737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964229
5509	NC_009900	GAT	2	6	218743	218748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964229
5510	NC_009900	CTTT	2	8	218764	218771	0 %	75 %	0 %	25 %	157964229
5511	NC_009900	ATA	2	6	218780	218785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964229
5512	NC_009900	TAA	2	6	218874	218879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964229
5513	NC_009900	TAT	2	6	218978	218983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964229
5514	NC_009900	CTA	2	6	218990	218995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964229
5515	NC_009900	AGT	2	6	219006	219011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964229
5516	NC_009900	TAT	2	6	219152	219157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964230
5517	NC_009900	CTTGT	2	10	219173	219182	0 %	60 %	20 %	20 %	157964230
5518	NC_009900	TTC	2	6	219224	219229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964230
5519	NC_009900	ATTT	2	8	219230	219237	25 %	75 %	0 %	0 %	157964230
5520	NC_009900	AAT	2	6	219262	219267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964230
5521	NC_009900	AAAT	2	8	219282	219289	75 %	25 %	0 %	0 %	157964230
5522	NC_009900	A	6	6	219310	219315	100 %	0 %	0 %	0 %	157964230
5523	NC_009900	TCT	2	6	219325	219330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964230
5524	NC_009900	ACT	2	6	219414	219419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964230
5525	NC_009900	TTG	2	6	219464	219469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964230
5526	NC_009900	AGC	2	6	219477	219482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964230
5527	NC_009900	TTA	2	6	219515	219520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964230
5528	NC_009900	ATA	2	6	219530	219535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964230
5529	NC_009900	ATA	2	6	219542	219547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964230
5530	NC_009900	AAT	2	6	219549	219554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964230
5531	NC_009900	T	6	6	219598	219603	0 %	100 %	0 %	0 %	157964230
5532	NC_009900	T	6	6	219613	219618	0 %	100 %	0 %	0 %	157964230
5533	NC_009900	GAA	2	6	219631	219636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964230
5534	NC_009900	ATT	2	6	219640	219645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964230
5535	NC_009900	GTA	2	6	219659	219664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964230
5536	NC_009900	ATT	2	6	219834	219839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964230
5537	NC_009900	TAAAG	2	10	219843	219852	60 %	20 %	20 %	0 %	157964230
5538	NC_009900	AAT	2	6	219938	219943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964230
5539	NC_009900	TAT	2	6	219982	219987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_009900	AT	3	6	219986	219991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_009900	T	7	7	219996	220002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_009900	GAT	2	6	220025	220030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964231
5543	NC_009900	TGT	2	6	220047	220052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964231
5544	NC_009900	ATT	2	6	220092	220097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964231
5545	NC_009900	GTTTCA	2	12	220123	220134	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157964231
5546	NC_009900	TA	3	6	220145	220150	50 %	50 %	0 %	0 %	157964231
5547	NC_009900	ATT	2	6	220152	220157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964231
5548	NC_009900	T	6	6	220156	220161	0 %	100 %	0 %	0 %	157964231
5549	NC_009900	TGC	2	6	220194	220199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964231
5550	NC_009900	ATC	2	6	220206	220211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964231
5551	NC_009900	TTC	2	6	220284	220289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964231
5552	NC_009900	TTTG	2	8	220334	220341	0 %	75 %	25 %	0 %	157964231
5553	NC_009900	TA	3	6	220349	220354	50 %	50 %	0 %	0 %	157964231
5554	NC_009900	ATG	2	6	220358	220363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964231
5555	NC_009900	TTC	2	6	220368	220373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964231
5556	NC_009900	T	7	7	220391	220397	0 %	100 %	0 %	0 %	157964231
5557	NC_009900	GTT	2	6	220414	220419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964231
5558	NC_009900	TTA	2	6	220432	220437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964231
5559	NC_009900	TAA	2	6	220445	220450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964231
5560	NC_009900	TA	3	6	220466	220471	50 %	50 %	0 %	0 %	157964231
5561	NC_009900	TAGC	2	8	220484	220491	25 %	25 %	25 %	25 %	157964231
5562	NC_009900	GTT	2	6	220504	220509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964231
5563	NC_009900	TAAA	2	8	220520	220527	75 %	25 %	0 %	0 %	157964231
5564	NC_009900	T	7	7	220528	220534	0 %	100 %	0 %	0 %	157964231
5565	NC_009900	TTA	2	6	220588	220593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964231
5566	NC_009900	CTA	2	6	220619	220624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964231
5567	NC_009900	ATT	2	6	220639	220644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964231
5568	NC_009900	GCC	2	6	220698	220703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964231
5569	NC_009900	ATT	2	6	220714	220719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964231
5570	NC_009900	AGTT	2	8	220743	220750	25 %	50 %	25 %	0 %	157964231
5571	NC_009900	TAG	2	6	220751	220756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964231
5572	NC_009900	TAAG	2	8	220775	220782	50 %	25 %	25 %	0 %	157964231
5573	NC_009900	TAA	2	6	220788	220793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964231
5574	NC_009900	AT	4	8	220797	220804	50 %	50 %	0 %	0 %	157964231
5575	NC_009900	CTT	2	6	220835	220840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964231
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5577	NC_009900	CAGT	2	8	220910	220917	25 %	25 %	25 %	25 %	157964231
5578	NC_009900	ATC	2	6	220983	220988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964231
5579	NC_009900	TA	3	6	221013	221018	50 %	50 %	0 %	0 %	157964231
5580	NC_009900	T	6	6	221105	221110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_009900	A	6	6	221113	221118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_009900	GTCAA	2	10	221120	221129	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5583	NC_009900	TTA	2	6	221140	221145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_009900	TAT	2	6	221149	221154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_009900	TAAA	2	8	221155	221162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_009900	TA	3	6	221186	221191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_009900	TGCATT	2	12	221193	221204	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5588	NC_009900	AAC	2	6	221212	221217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_009900	ATT	2	6	221261	221266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964232
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5591	NC_009900	TTAC	2	8	221299	221306	25 %	50 %	0 %	25 %	157964232
5592	NC_009900	AAAAGC	2	12	221321	221332	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157964232
5593	NC_009900	TA	3	6	221346	221351	50 %	50 %	0 %	0 %	157964232
5594	NC_009900	AGT	2	6	221385	221390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964232
5595	NC_009900	T	8	8	221390	221397	0 %	100 %	0 %	0 %	157964232
5596	NC_009900	TAG	2	6	221402	221407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964232
5597	NC_009900	TAA	2	6	221428	221433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964232
5598	NC_009900	AT	3	6	221618	221623	50 %	50 %	0 %	0 %	157964232
5599	NC_009900	ATA	2	6	221643	221648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964232
5600	NC_009900	TGG	2	6	221714	221719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964232
5601	NC_009900	TAG	2	6	221728	221733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964232
5602	NC_009900	AAAT	2	8	221789	221796	75 %	25 %	0 %	0 %	157964232
5603	NC_009900	TTCT	2	8	221815	221822	0 %	75 %	0 %	25 %	157964232
5604	NC_009900	TAT	2	6	221834	221839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964232
5605	NC_009900	CAG	2	6	221841	221846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964232
5606	NC_009900	AG	3	6	221911	221916	50 %	0 %	50 %	0 %	157964232
5607	NC_009900	AAG	2	6	222004	222009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964232
5608	NC_009900	AAAT	2	8	222043	222050	75 %	25 %	0 %	0 %	157964232
5609	NC_009900	TAT	2	6	222064	222069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964232
5610	NC_009900	GAA	2	6	222096	222101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964232
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5612	NC_009900	TAA	2	6	222131	222136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964232
5613	NC_009900	ATG	2	6	222142	222147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964232
5614	NC_009900	AT	4	8	222185	222192	50 %	50 %	0 %	0 %	157964232
5615	NC_009900	AG	3	6	222228	222233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_009900	T	6	6	222261	222266	0 %	100 %	0 %	0 %	157964233
5617	NC_009900	TAA	2	6	222270	222275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964233
5618	NC_009900	T	6	6	222309	222314	0 %	100 %	0 %	0 %	157964233
5619	NC_009900	AT	3	6	222478	222483	50 %	50 %	0 %	0 %	157964233
5620	NC_009900	CAT	2	6	222486	222491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964233
5621	NC_009900	ATT	2	6	222574	222579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964233
5622	NC_009900	AAT	2	6	222586	222591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964233
5623	NC_009900	GT	3	6	222686	222691	0 %	50 %	50 %	0 %	157964233
5624	NC_009900	AAGGC	2	10	222694	222703	40 %	0 %	40 %	20 %	157964233
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