MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009900	A	6	6	198074	198079	100 %	0 %	0 %	0 %	157964212
5002	NC_009900	TTC	2	6	198134	198139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964212
5003	NC_009900	GTA	2	6	198227	198232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964212
5004	NC_009900	GCA	2	6	198247	198252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964212
5005	NC_009900	AG	3	6	198256	198261	50 %	0 %	50 %	0 %	157964212
5006	NC_009900	AAGA	2	8	198317	198324	75 %	0 %	25 %	0 %	157964212
5007	NC_009900	GCT	2	6	198329	198334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964212
5008	NC_009900	CTG	2	6	198406	198411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964212
5009	NC_009900	GAA	2	6	198443	198448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964212
5010	NC_009900	TTA	2	6	198536	198541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964212
5011	NC_009900	TTGT	2	8	198567	198574	0 %	75 %	25 %	0 %	157964212
5012	NC_009900	GAT	2	6	198688	198693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964212
5013	NC_009900	CCA	2	6	198716	198721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157964212
5014	NC_009900	TGG	2	6	198724	198729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964212
5015	NC_009900	TGC	2	6	198759	198764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964212
5016	NC_009900	CAA	2	6	198774	198779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964212
5017	NC_009900	AAT	2	6	198790	198795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964212
5018	NC_009900	A	6	6	198904	198909	100 %	0 %	0 %	0 %	157964212
5019	NC_009900	TA	3	6	198931	198936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_009900	GTT	2	6	198937	198942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_009900	TTA	2	6	198948	198953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_009900	T	6	6	199054	199059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_009900	T	8	8	199063	199070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_009900	ACG	2	6	199155	199160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_009900	TTG	2	6	199199	199204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964213
5026	NC_009900	TCCT	2	8	199212	199219	0 %	50 %	0 %	50 %	157964213
5027	NC_009900	TTTG	2	8	199266	199273	0 %	75 %	25 %	0 %	157964213
5028	NC_009900	CTT	2	6	199279	199284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964213
5029	NC_009900	CTT	2	6	199286	199291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964213
5030	NC_009900	TGT	2	6	199293	199298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964213
5031	NC_009900	AGT	2	6	199299	199304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964213
5032	NC_009900	TAT	2	6	199345	199350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964213
5033	NC_009900	TTTA	2	8	199355	199362	25 %	75 %	0 %	0 %	157964213
5034	NC_009900	AAT	2	6	199390	199395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964213
5035	NC_009900	CT	3	6	199414	199419	0 %	50 %	0 %	50 %	157964213
5036	NC_009900	AT	3	6	199445	199450	50 %	50 %	0 %	0 %	157964213
5037	NC_009900	TAA	2	6	199487	199492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964213
5038	NC_009900	T	7	7	199574	199580	0 %	100 %	0 %	0 %	157964213
5039	NC_009900	GTT	2	6	199638	199643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964213
5040	NC_009900	CAA	2	6	199660	199665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964213
5041	NC_009900	TTTC	2	8	199771	199778	0 %	75 %	0 %	25 %	157964213
5042	NC_009900	ATT	2	6	199818	199823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964213
5043	NC_009900	T	6	6	199826	199831	0 %	100 %	0 %	0 %	157964213
5044	NC_009900	ATT	2	6	199859	199864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964213
5045	NC_009900	TTA	2	6	199908	199913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964213
5046	NC_009900	AACC	2	8	199965	199972	50 %	0 %	0 %	50 %	157964213
5047	NC_009900	CTT	2	6	200035	200040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964213
5048	NC_009900	TGC	2	6	200065	200070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964213
5049	NC_009900	ATC	2	6	200090	200095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964213
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5051	NC_009900	T	7	7	200147	200153	0 %	100 %	0 %	0 %	157964213
5052	NC_009900	TCA	2	6	200157	200162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964213
5053	NC_009900	T	6	6	200164	200169	0 %	100 %	0 %	0 %	157964213
5054	NC_009900	TCA	2	6	200196	200201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964213
5055	NC_009900	AGC	2	6	200273	200278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964213
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5058	NC_009900	AGC	2	6	200450	200455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964213
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5063	NC_009900	TTA	2	6	200721	200726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964213
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5065	NC_009900	GCA	2	6	200745	200750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964213
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5069	NC_009900	TAGCA	2	10	200882	200891	40 %	20 %	20 %	20 %	157964213
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5079	NC_009900	TCA	2	6	201373	201378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5082	NC_009900	ATT	2	6	201446	201451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_009900	T	6	6	201450	201455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_009900	CAA	2	6	201510	201515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_009900	ACA	2	6	201556	201561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_009900	ACT	2	6	201677	201682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5091	NC_009900	A	6	6	201971	201976	100 %	0 %	0 %	0 %	157964214
5092	NC_009900	AAAG	2	8	202052	202059	75 %	0 %	25 %	0 %	157964214
5093	NC_009900	ATA	2	6	202138	202143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964214
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5096	NC_009900	TCA	2	6	202356	202361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964214
5097	NC_009900	T	6	6	202371	202376	0 %	100 %	0 %	0 %	157964214
5098	NC_009900	AGT	2	6	202382	202387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964214
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5100	NC_009900	ATA	2	6	202439	202444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964214
5101	NC_009900	T	6	6	202466	202471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_009900	ATTA	2	8	202480	202487	50 %	50 %	0 %	0 %	157964215
5103	NC_009900	ATT	2	6	202606	202611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964215
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5106	NC_009900	T	6	6	202734	202739	0 %	100 %	0 %	0 %	157964215
5107	NC_009900	AGCA	2	8	202755	202762	50 %	0 %	25 %	25 %	157964215
5108	NC_009900	CAG	2	6	202766	202771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964215
5109	NC_009900	T	6	6	202788	202793	0 %	100 %	0 %	0 %	157964215
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5113	NC_009900	GCT	2	6	202924	202929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964215
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5115	NC_009900	TAAT	3	12	203005	203016	50 %	50 %	0 %	0 %	157964215
5116	NC_009900	GAT	2	6	203046	203051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964215
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5120	NC_009900	TAA	2	6	203223	203228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964215
5121	NC_009900	AGTA	2	8	203235	203242	50 %	25 %	25 %	0 %	157964215
5122	NC_009900	TTA	2	6	203326	203331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964215
5123	NC_009900	GAC	2	6	203332	203337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964215
5124	NC_009900	ATTG	2	8	203379	203386	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_009900	TAA	2	6	203416	203421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_009900	CAA	2	6	208876	208881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_009900	ATT	2	6	208918	208923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964221
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