MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 19059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009881	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825126
2	NC_009881	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825126
3	NC_009881	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825126
4	NC_009881	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825126
5	NC_009881	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825126
6	NC_009881	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825126
7	NC_009881	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825126
8	NC_009881	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825126
9	NC_009881	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825126
10	NC_009881	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825126
11	NC_009881	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009881	ACA	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825127
13	NC_009881	CAT	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825127
14	NC_009881	ATA	2	6	1180	1185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825127
15	NC_009881	TGA	2	6	1239	1244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825127
16	NC_009881	TTC	2	6	1257	1262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825127
17	NC_009881	GTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825127
18	NC_009881	GCA	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825127
19	NC_009881	TAA	2	6	1368	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825127
20	NC_009881	AAG	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825128
21	NC_009881	TGC	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825128
22	NC_009881	ATA	3	9	1747	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825128
23	NC_009881	TAA	2	6	1814	1819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825128
24	NC_009881	TGA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825128
25	NC_009881	GCA	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825128
26	NC_009881	AAT	2	6	2000	2005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825128
27	NC_009881	TCA	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825128
28	NC_009881	AGA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825128
29	NC_009881	CAA	3	9	2118	2126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825128
30	NC_009881	CGG	2	6	2339	2344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825129
31	NC_009881	AGC	2	6	2370	2375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825129
32	NC_009881	ATA	2	6	2415	2420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825129
33	NC_009881	TAA	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825129
34	NC_009881	TTC	2	6	2757	2762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825129
35	NC_009881	ATG	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825129
36	NC_009881	CTC	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825130
37	NC_009881	TAT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
38	NC_009881	ATT	2	6	3069	3074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
39	NC_009881	ATT	2	6	3182	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
40	NC_009881	ATT	2	6	3335	3340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
41	NC_009881	AGA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
42	NC_009881	CCA	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825130
43	NC_009881	GAT	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
44	NC_009881	ATT	2	6	3663	3668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
45	NC_009881	GAT	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
46	NC_009881	AGA	2	6	3955	3960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
47	NC_009881	CTT	2	6	3998	4003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825130
48	NC_009881	CTA	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825130
49	NC_009881	TAT	2	6	4106	4111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
50	NC_009881	TTA	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
51	NC_009881	TGG	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825130
52	NC_009881	ATA	2	6	4326	4331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
53	NC_009881	ATA	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
54	NC_009881	GGT	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825130
55	NC_009881	GCA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825130
56	NC_009881	GAA	2	6	4679	4684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
57	NC_009881	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
58	NC_009881	AAG	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
59	NC_009881	AAT	2	6	4742	4747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
60	NC_009881	GAA	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
61	NC_009881	GGA	2	6	4778	4783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825130
62	NC_009881	TAT	2	6	4793	4798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
63	NC_009881	AAG	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
64	NC_009881	TAA	2	6	4993	4998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
65	NC_009881	AAG	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
66	NC_009881	ATG	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
67	NC_009881	ATA	2	6	5214	5219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
68	NC_009881	ATT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
69	NC_009881	TAA	2	6	5287	5292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
70	NC_009881	GAT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
71	NC_009881	CGC	2	6	5337	5342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825130
72	NC_009881	TGC	2	6	5344	5349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825130
73	NC_009881	ATT	2	6	5388	5393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
74	NC_009881	CTA	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825130
75	NC_009881	AGT	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
76	NC_009881	ATT	2	6	5591	5596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
77	NC_009881	TTA	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
78	NC_009881	ATA	2	6	5646	5651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
79	NC_009881	TAA	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
80	NC_009881	TGA	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
81	NC_009881	ATG	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
82	NC_009881	CTA	3	9	6046	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825131
83	NC_009881	ATT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825131
84	NC_009881	ATC	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825131
85	NC_009881	TGA	2	6	6340	6345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825131
86	NC_009881	ATT	2	6	6364	6369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825131
87	NC_009881	TAC	2	6	6420	6425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825131
88	NC_009881	ATT	3	9	6477	6485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825131
89	NC_009881	CCG	2	6	6505	6510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825131
90	NC_009881	TAT	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825131
91	NC_009881	GTA	2	6	6792	6797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825132
92	NC_009881	ACT	2	6	6813	6818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825132
93	NC_009881	TAG	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825134
94	NC_009881	AGC	2	6	7052	7057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825134
95	NC_009881	TTA	2	6	7170	7175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825134
96	NC_009881	TCT	2	6	7273	7278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009881	TAT	2	6	7310	7315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009881	CAT	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009881	GAA	2	6	7345	7350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009881	CGA	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009881	ATT	2	6	7410	7415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009881	CAT	2	6	7440	7445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009881	ACT	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825135
104	NC_009881	ATA	2	6	7523	7528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825135
105	NC_009881	ATA	2	6	7550	7555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825135
106	NC_009881	ACC	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825135
107	NC_009881	GCC	2	6	7619	7624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825135
108	NC_009881	TCC	2	6	7672	7677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825135
109	NC_009881	ATA	2	6	7733	7738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825135
110	NC_009881	TCT	2	6	7799	7804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825135
111	NC_009881	ATA	2	6	7805	7810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825135
112	NC_009881	TAG	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825135
113	NC_009881	ATT	2	6	7861	7866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825135
114	NC_009881	ACT	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825135
115	NC_009881	ATG	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825135
116	NC_009881	CGT	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825135
117	NC_009881	ATC	2	6	8077	8082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825135
118	NC_009881	TAA	2	6	8088	8093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825135
119	NC_009881	CAA	2	6	8157	8162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825135
120	NC_009881	ATT	2	6	8174	8179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825135
121	NC_009881	AGC	3	9	8311	8319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825135
122	NC_009881	TAG	2	6	8322	8327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825135
123	NC_009881	CTT	2	6	8385	8390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825135
124	NC_009881	AGG	2	6	8434	8439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825135
125	NC_009881	TAC	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825135
126	NC_009881	TAT	2	6	8572	8577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009881	CAA	2	6	8579	8584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009881	GAG	2	6	8639	8644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009881	GTT	2	6	8647	8652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009881	CAC	2	6	8679	8684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009881	TAA	2	6	8725	8730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009881	GAT	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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