MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009881	CCG	2	6	157378	157383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825284
4002	NC_009881	CTG	2	6	157399	157404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825284
4003	NC_009881	GAT	2	6	157415	157420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825284
4004	NC_009881	GAT	2	6	157455	157460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825284
4005	NC_009881	A	6	6	157463	157468	100 %	0 %	0 %	0 %	157825284
4006	NC_009881	A	7	7	157471	157477	100 %	0 %	0 %	0 %	157825284
4007	NC_009881	TAA	2	6	157486	157491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825284
4008	NC_009881	ATC	2	6	157545	157550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825284
4009	NC_009881	ATT	2	6	157598	157603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_009881	T	8	8	157630	157637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009881	AT	3	6	157646	157651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_009881	AT	3	6	157662	157667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_009881	GGA	2	6	157684	157689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_009881	AAAG	2	8	157714	157721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_009881	ATA	2	6	157744	157749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009881	ATG	2	6	157764	157769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_009881	A	6	6	157775	157780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009881	GCA	3	9	157825	157833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_009881	AGC	2	6	157859	157864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_009881	TA	3	6	157933	157938	50 %	50 %	0 %	0 %	157825285
4021	NC_009881	GCT	2	6	157942	157947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825285
4022	NC_009881	CAA	2	6	157999	158004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825285
4023	NC_009881	GTG	2	6	158024	158029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825285
4024	NC_009881	GCT	3	9	158035	158043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825285
4025	NC_009881	A	7	7	158044	158050	100 %	0 %	0 %	0 %	157825285
4026	NC_009881	AAAGA	2	10	158052	158061	80 %	0 %	20 %	0 %	157825285
4027	NC_009881	AATTA	2	10	158091	158100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_009881	CTA	2	6	158128	158133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_009881	GAA	2	6	158230	158235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825286
4030	NC_009881	CTAA	2	8	158279	158286	50 %	25 %	0 %	25 %	157825286
4031	NC_009881	TGA	3	9	158299	158307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825286
4032	NC_009881	TGG	2	6	158314	158319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825286
4033	NC_009881	A	6	6	158458	158463	100 %	0 %	0 %	0 %	157825286
4034	NC_009881	GAA	2	6	158534	158539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825286
4035	NC_009881	CGG	2	6	158566	158571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825286
4036	NC_009881	ACT	2	6	158611	158616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825286
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4038	NC_009881	TA	3	6	158703	158708	50 %	50 %	0 %	0 %	157825286
4039	NC_009881	TAT	2	6	158751	158756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825286
4040	NC_009881	TAAT	2	8	158772	158779	50 %	50 %	0 %	0 %	157825286
4041	NC_009881	A	6	6	158786	158791	100 %	0 %	0 %	0 %	157825286
4042	NC_009881	ATT	2	6	158870	158875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825287
4043	NC_009881	AACGG	2	10	159010	159019	40 %	0 %	40 %	20 %	157825287
4044	NC_009881	TCTT	2	8	159074	159081	0 %	75 %	0 %	25 %	157825287
4045	NC_009881	GTA	2	6	159158	159163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825287
4046	NC_009881	AGT	2	6	159172	159177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825287
4047	NC_009881	CGT	2	6	159179	159184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825287
4048	NC_009881	TAT	2	6	159194	159199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825287
4049	NC_009881	GCT	2	6	159351	159356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_009881	TTC	2	6	159402	159407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_009881	TTC	2	6	159414	159419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_009881	GTT	2	6	159455	159460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_009881	AAC	2	6	159471	159476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_009881	T	6	6	159566	159571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_009881	GGC	2	6	159602	159607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_009881	TTCCA	2	10	159625	159634	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4057	NC_009881	GCAA	2	8	159645	159652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_009881	CTA	2	6	159655	159660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825288
4059	NC_009881	AGCAT	2	10	159689	159698	40 %	20 %	20 %	20 %	157825288
4060	NC_009881	TTTATC	2	12	159712	159723	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157825288
4061	NC_009881	CTT	2	6	159804	159809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825288
4062	NC_009881	TA	3	6	159853	159858	50 %	50 %	0 %	0 %	157825288
4063	NC_009881	TAC	3	9	159877	159885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825288
4064	NC_009881	A	7	7	159895	159901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_009881	TA	3	6	159925	159930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_009881	TTA	2	6	159973	159978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_009881	TAAAA	2	10	160028	160037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_009881	CAG	2	6	160055	160060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_009881	TA	3	6	160061	160066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_009881	TAA	2	6	160087	160092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825289
4071	NC_009881	TAA	2	6	160121	160126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825289
4072	NC_009881	GATTTT	2	12	160131	160142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157825289
4073	NC_009881	AGTT	2	8	160157	160164	25 %	50 %	25 %	0 %	157825289
4074	NC_009881	ATT	2	6	160176	160181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825289
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4076	NC_009881	AATTT	2	10	160219	160228	40 %	60 %	0 %	0 %	157825289
4077	NC_009881	CGG	2	6	160244	160249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825289
4078	NC_009881	AGGTG	2	10	160325	160334	20 %	20 %	60 %	0 %	157825289
4079	NC_009881	TAG	2	6	160385	160390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825289
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4081	NC_009881	TTAA	2	8	160419	160426	50 %	50 %	0 %	0 %	157825289
4082	NC_009881	AGT	2	6	160440	160445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825289
4083	NC_009881	TTG	2	6	160480	160485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825289
4084	NC_009881	GTAG	2	8	160494	160501	25 %	25 %	50 %	0 %	157825289
4085	NC_009881	GCTATG	2	12	160521	160532	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157825289
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4087	NC_009881	ATG	2	6	160618	160623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825289
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4089	NC_009881	TAT	2	6	160697	160702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825289
4090	NC_009881	GTA	2	6	160725	160730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825289
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4092	NC_009881	A	8	8	160770	160777	100 %	0 %	0 %	0 %	157825289
4093	NC_009881	CGG	2	6	160877	160882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825289
4094	NC_009881	T	6	6	160914	160919	0 %	100 %	0 %	0 %	157825289
4095	NC_009881	ATA	2	6	160923	160928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825289
4096	NC_009881	TAA	2	6	160994	160999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825289
4097	NC_009881	A	6	6	161017	161022	100 %	0 %	0 %	0 %	157825289
4098	NC_009881	TG	3	6	161047	161052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_009881	T	7	7	161058	161064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_009881	TTA	2	6	161138	161143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_009881	T	6	6	161144	161149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_009881	GCT	2	6	161172	161177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_009881	AGA	3	9	161258	161266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825290
4104	NC_009881	G	6	6	161289	161294	0 %	0 %	100 %	0 %	157825290
4105	NC_009881	AAG	2	6	161319	161324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825290
4106	NC_009881	ATA	2	6	161338	161343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825290
4107	NC_009881	GGGCG	2	10	161409	161418	0 %	0 %	80 %	20 %	157825290
4108	NC_009881	TAG	2	6	161485	161490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825290
4109	NC_009881	CGA	2	6	161498	161503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825290
4110	NC_009881	AT	3	6	161533	161538	50 %	50 %	0 %	0 %	157825290
4111	NC_009881	TTGC	3	12	161570	161581	0 %	50 %	25 %	25 %	157825290
4112	NC_009881	AAT	2	6	161601	161606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825290
4113	NC_009881	CTATAT	2	12	161609	161620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157825290
4114	NC_009881	ATTT	2	8	161730	161737	25 %	75 %	0 %	0 %	157825290
4115	NC_009881	A	6	6	161802	161807	100 %	0 %	0 %	0 %	157825290
4116	NC_009881	GCC	2	6	161825	161830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825290
4117	NC_009881	ACT	2	6	161865	161870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825290
4118	NC_009881	ATAA	2	8	161871	161878	75 %	25 %	0 %	0 %	157825290
4119	NC_009881	AGT	2	6	161894	161899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825290
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4121	NC_009881	ATTG	2	8	162041	162048	25 %	50 %	25 %	0 %	157825290
4122	NC_009881	GGT	2	6	162060	162065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825290
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4124	NC_009881	GGT	2	6	162198	162203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825290
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