MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009881	A	6	6	58349	58354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_009881	T	6	6	58367	58372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_009881	AG	3	6	58423	58428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_009881	TTA	2	6	58429	58434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009881	AGA	2	6	58449	58454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_009881	TAA	2	6	58460	58465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_009881	TA	3	6	58467	58472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009881	TAT	2	6	58509	58514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825196
1509	NC_009881	AAT	2	6	58522	58527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825196
1510	NC_009881	AGG	2	6	58570	58575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825196
1511	NC_009881	ATT	2	6	58695	58700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825196
1512	NC_009881	AAAT	2	8	58715	58722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_009881	AG	3	6	58727	58732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_009881	AGT	2	6	58769	58774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825197
1515	NC_009881	A	7	7	58775	58781	100 %	0 %	0 %	0 %	157825197
1516	NC_009881	TGA	2	6	58856	58861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825197
1517	NC_009881	CTA	2	6	58867	58872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825197
1518	NC_009881	TTAA	2	8	58926	58933	50 %	50 %	0 %	0 %	157825197
1519	NC_009881	GGAA	2	8	58982	58989	50 %	0 %	50 %	0 %	157825197
1520	NC_009881	AGA	2	6	59051	59056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825197
1521	NC_009881	AGT	2	6	59099	59104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825197
1522	NC_009881	TGCT	2	8	59261	59268	0 %	50 %	25 %	25 %	157825197
1523	NC_009881	TGG	2	6	59292	59297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825197
1524	NC_009881	TAC	2	6	59329	59334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825197
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1527	NC_009881	TAAAA	2	10	59486	59495	80 %	20 %	0 %	0 %	157825197
1528	NC_009881	A	6	6	59492	59497	100 %	0 %	0 %	0 %	157825197
1529	NC_009881	CGC	2	6	59511	59516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825197
1530	NC_009881	ATG	2	6	59522	59527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825197
1531	NC_009881	TAA	2	6	59530	59535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009881	TAA	2	6	59591	59596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_009881	ATT	2	6	59620	59625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825198
1534	NC_009881	AT	3	6	59670	59675	50 %	50 %	0 %	0 %	157825198
1535	NC_009881	A	6	6	59723	59728	100 %	0 %	0 %	0 %	157825198
1536	NC_009881	TGG	2	6	59791	59796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825198
1537	NC_009881	GAA	2	6	59913	59918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_009881	AAT	2	6	59973	59978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825199
1539	NC_009881	CT	3	6	60006	60011	0 %	50 %	0 %	50 %	157825199
1540	NC_009881	TAT	2	6	60023	60028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825199
1541	NC_009881	TGCT	2	8	60032	60039	0 %	50 %	25 %	25 %	157825199
1542	NC_009881	TTGC	2	8	60113	60120	0 %	50 %	25 %	25 %	157825199
1543	NC_009881	A	6	6	60144	60149	100 %	0 %	0 %	0 %	157825199
1544	NC_009881	TTTAT	2	10	60177	60186	20 %	80 %	0 %	0 %	157825199
1545	NC_009881	TAT	2	6	60353	60358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825199
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1547	NC_009881	TAG	2	6	60470	60475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825199
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1549	NC_009881	AT	3	6	60579	60584	50 %	50 %	0 %	0 %	157825199
1550	NC_009881	TAT	3	9	60620	60628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825199
1551	NC_009881	T	7	7	60635	60641	0 %	100 %	0 %	0 %	157825199
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1553	NC_009881	TGA	2	6	60705	60710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825199
1554	NC_009881	GTA	2	6	60787	60792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825199
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1557	NC_009881	CCT	2	6	60997	61002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825199
1558	NC_009881	TAAT	2	8	61039	61046	50 %	50 %	0 %	0 %	157825199
1559	NC_009881	AGTTA	2	10	61123	61132	40 %	40 %	20 %	0 %	157825200
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1561	NC_009881	A	7	7	61297	61303	100 %	0 %	0 %	0 %	157825200
1562	NC_009881	AAG	2	6	61365	61370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825200
1563	NC_009881	TAA	2	6	61401	61406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825200
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1565	NC_009881	TAC	2	6	61441	61446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825200
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1571	NC_009881	A	6	6	61586	61591	100 %	0 %	0 %	0 %	157825200
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1573	NC_009881	TAT	2	6	61639	61644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825200
1574	NC_009881	TCT	2	6	61670	61675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825200
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1584	NC_009881	ATAAAA	2	12	62009	62020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009881	ATA	2	6	62030	62035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009881	A	6	6	62035	62040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_009881	ATTTAT	2	12	62042	62053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_009881	AAT	3	9	62054	62062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_009881	TAT	2	6	62121	62126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825201
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1592	NC_009881	CAT	2	6	62213	62218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825201
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1598	NC_009881	TTA	3	9	62402	62410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825201
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1602	NC_009881	ATT	2	6	62504	62509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825201
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1604	NC_009881	ACT	2	6	62657	62662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825201
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1609	NC_009881	TAATAT	2	12	62863	62874	50 %	50 %	0 %	0 %	157825201
1610	NC_009881	A	7	7	62917	62923	100 %	0 %	0 %	0 %	157825201
1611	NC_009881	AT	3	6	62931	62936	50 %	50 %	0 %	0 %	157825201
1612	NC_009881	AACA	2	8	62986	62993	75 %	0 %	0 %	25 %	157825201
1613	NC_009881	TA	3	6	63009	63014	50 %	50 %	0 %	0 %	157825201
1614	NC_009881	A	6	6	63028	63033	100 %	0 %	0 %	0 %	157825201
1615	NC_009881	T	6	6	63064	63069	0 %	100 %	0 %	0 %	157825201
1616	NC_009881	AT	5	10	63113	63122	50 %	50 %	0 %	0 %	157825201
1617	NC_009881	AAG	2	6	63129	63134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825201
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1620	NC_009881	TA	4	8	63292	63299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_009881	ATT	2	6	63307	63312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1623	NC_009881	AAT	3	9	63373	63381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825202
1624	NC_009881	TTAAT	2	10	63386	63395	40 %	60 %	0 %	0 %	157825202
1625	NC_009881	A	8	8	63461	63468	100 %	0 %	0 %	0 %	157825202
1626	NC_009881	CAGCAA	2	12	63469	63480	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	157825202
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1629	NC_009881	TTG	2	6	63551	63556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825202
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