MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009881	T	6	6	20034	20039	0 %	100 %	0 %	0 %	157825150
502	NC_009881	TGC	2	6	20104	20109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825150
503	NC_009881	TGAGCT	2	12	20134	20145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157825150
504	NC_009881	GCAC	2	8	20146	20153	25 %	0 %	25 %	50 %	157825150
505	NC_009881	TTG	2	6	20205	20210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009881	GCT	2	6	20215	20220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_009881	CAT	2	6	20222	20227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_009881	TGT	2	6	20239	20244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009881	TTG	2	6	20285	20290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825151
510	NC_009881	TCC	2	6	20300	20305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825151
511	NC_009881	TTG	2	6	20369	20374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825151
512	NC_009881	TGCT	2	8	20402	20409	0 %	50 %	25 %	25 %	157825151
513	NC_009881	TAT	2	6	20441	20446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825151
514	NC_009881	TC	3	6	20477	20482	0 %	50 %	0 %	50 %	157825151
515	NC_009881	TCA	2	6	20516	20521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825151
516	NC_009881	GCT	2	6	20590	20595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825152
517	NC_009881	TAC	2	6	20597	20602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825152
518	NC_009881	CTG	2	6	20614	20619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825152
519	NC_009881	TGCT	2	8	20624	20631	0 %	50 %	25 %	25 %	157825152
520	NC_009881	ATTA	2	8	20768	20775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009881	A	6	6	20816	20821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009881	ATTG	2	8	20936	20943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009881	TTTA	2	8	21059	21066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009881	ATT	2	6	21095	21100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009881	TAA	2	6	21156	21161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825153
526	NC_009881	CAT	2	6	21171	21176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825153
527	NC_009881	TTC	2	6	21232	21237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825153
528	NC_009881	ATT	2	6	21268	21273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825153
529	NC_009881	TAA	2	6	21285	21290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825153
530	NC_009881	TAT	2	6	21291	21296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825153
531	NC_009881	ATTA	2	8	21451	21458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009881	CTT	2	6	21467	21472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825154
533	NC_009881	ATAA	2	8	21476	21483	75 %	25 %	0 %	0 %	157825154
534	NC_009881	ATT	2	6	21513	21518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825154
535	NC_009881	TCC	2	6	21543	21548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825154
536	NC_009881	CATTA	2	10	21561	21570	40 %	40 %	0 %	20 %	157825154
537	NC_009881	GTAA	2	8	21572	21579	50 %	25 %	25 %	0 %	157825154
538	NC_009881	TAT	2	6	21581	21586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825154
539	NC_009881	CAA	3	9	21602	21610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825154
540	NC_009881	CTG	2	6	21649	21654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_009881	TTA	2	6	21670	21675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009881	T	7	7	21681	21687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009881	ACTTA	2	10	21738	21747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
544	NC_009881	TATT	2	8	21763	21770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009881	ATG	2	6	21772	21777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009881	AAT	2	6	21781	21786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009881	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009881	TAC	2	6	21800	21805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_009881	ATTA	2	8	21814	21821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009881	TTAT	2	8	21830	21837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009881	ATA	2	6	21849	21854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009881	GTTT	2	8	21888	21895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009881	A	6	6	21995	22000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009881	TAA	2	6	22004	22009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009881	ATA	2	6	22048	22053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009881	ATA	2	6	22093	22098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009881	TCA	2	6	22119	22124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825155
558	NC_009881	AT	3	6	22162	22167	50 %	50 %	0 %	0 %	157825155
559	NC_009881	TCA	2	6	22170	22175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825155
560	NC_009881	ATT	2	6	22214	22219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825155
561	NC_009881	AAT	2	6	22303	22308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825155
562	NC_009881	CTC	2	6	22333	22338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825155
563	NC_009881	TGCT	2	8	22350	22357	0 %	50 %	25 %	25 %	157825155
564	NC_009881	TAC	2	6	22361	22366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825155
565	NC_009881	A	6	6	22424	22429	100 %	0 %	0 %	0 %	157825155
566	NC_009881	TAG	2	6	22444	22449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825155
567	NC_009881	AAGAT	2	10	22565	22574	60 %	20 %	20 %	0 %	157825155
568	NC_009881	ATA	2	6	22575	22580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825155
569	NC_009881	AAT	2	6	22586	22591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825155
570	NC_009881	AT	3	6	22614	22619	50 %	50 %	0 %	0 %	157825155
571	NC_009881	AT	3	6	22638	22643	50 %	50 %	0 %	0 %	157825155
572	NC_009881	TA	3	6	22667	22672	50 %	50 %	0 %	0 %	157825155
573	NC_009881	TAA	2	6	22675	22680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825155
574	NC_009881	TAA	2	6	22744	22749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825155
575	NC_009881	A	6	6	22753	22758	100 %	0 %	0 %	0 %	157825155
576	NC_009881	A	6	6	22769	22774	100 %	0 %	0 %	0 %	157825155
577	NC_009881	ATT	2	6	22782	22787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825155
578	NC_009881	AAT	2	6	22802	22807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009881	TA	3	6	22821	22826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009881	TTCT	2	8	22869	22876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_009881	T	7	7	22894	22900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009881	TTTA	2	8	23011	23018	25 %	75 %	0 %	0 %	157825156
583	NC_009881	CA	3	6	23121	23126	50 %	0 %	0 %	50 %	157825156
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585	NC_009881	T	6	6	23189	23194	0 %	100 %	0 %	0 %	157825156
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587	NC_009881	GAC	2	6	23207	23212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825156
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589	NC_009881	TA	3	6	23236	23241	50 %	50 %	0 %	0 %	157825156
590	NC_009881	T	7	7	23272	23278	0 %	100 %	0 %	0 %	157825156
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596	NC_009881	TAA	2	6	23479	23484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825156
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598	NC_009881	TGA	2	6	23548	23553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825156
599	NC_009881	AT	3	6	23555	23560	50 %	50 %	0 %	0 %	157825156
600	NC_009881	AAT	2	6	23624	23629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825157
601	NC_009881	GCT	2	6	23649	23654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825157
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603	NC_009881	GTTT	2	8	23694	23701	0 %	75 %	25 %	0 %	157825157
604	NC_009881	AGA	2	6	23726	23731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825157
605	NC_009881	T	6	6	23801	23806	0 %	100 %	0 %	0 %	157825157
606	NC_009881	T	7	7	23814	23820	0 %	100 %	0 %	0 %	157825157
607	NC_009881	TAA	2	6	23855	23860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825157
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610	NC_009881	TAA	2	6	23900	23905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825157
611	NC_009881	TCT	2	6	23908	23913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825157
612	NC_009881	GTA	2	6	23950	23955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825157
613	NC_009881	ATAA	2	8	23961	23968	75 %	25 %	0 %	0 %	157825157
614	NC_009881	TTTC	2	8	24003	24010	0 %	75 %	0 %	25 %	157825157
615	NC_009881	GAA	2	6	24100	24105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825157
616	NC_009881	TAT	2	6	24182	24187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009881	ATT	2	6	24205	24210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009881	ATTT	2	8	24214	24221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009881	ATA	2	6	24222	24227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009881	AT	3	6	24243	24248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009881	ATC	2	6	24258	24263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_009881	TAT	2	6	24267	24272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009881	TTA	2	6	24346	24351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009881	T	6	6	24364	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009881	ATT	2	6	24390	24395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009881	A	6	6	24472	24477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009881	ATA	2	6	24482	24487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825158
628	NC_009881	TAG	2	6	24494	24499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825158
629	NC_009881	CTC	2	6	24574	24579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825158
630	NC_009881	AG	3	6	24603	24608	50 %	0 %	50 %	0 %	157825158
631	NC_009881	ATG	2	6	24641	24646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825158
632	NC_009881	A	6	6	24650	24655	100 %	0 %	0 %	0 %	157825158
633	NC_009881	GAA	2	6	24656	24661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825158
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635	NC_009881	TA	3	6	24697	24702	50 %	50 %	0 %	0 %	157825158
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