MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009881	ATT	2	6	216281	216286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_009881	T	6	6	216285	216290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009881	CTC	2	6	216310	216315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_009881	GAT	2	6	216321	216326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_009881	CAA	2	6	216339	216344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_009881	TGC	2	6	216410	216415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825343
5507	NC_009881	ATC	2	6	216418	216423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825343
5508	NC_009881	TCT	3	9	216429	216437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825343
5509	NC_009881	C	6	6	216573	216578	0 %	0 %	0 %	100 %	157825343
5510	NC_009881	TTAAA	2	10	216612	216621	60 %	40 %	0 %	0 %	157825343
5511	NC_009881	T	7	7	216701	216707	0 %	100 %	0 %	0 %	157825343
5512	NC_009881	ACC	2	6	216721	216726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825343
5513	NC_009881	TCC	2	6	216790	216795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825343
5514	NC_009881	CAC	2	6	216810	216815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825343
5515	NC_009881	GCA	2	6	216818	216823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825343
5516	NC_009881	TATG	2	8	216846	216853	25 %	50 %	25 %	0 %	157825343
5517	NC_009881	TA	3	6	216889	216894	50 %	50 %	0 %	0 %	157825343
5518	NC_009881	TAT	2	6	216897	216902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5519	NC_009881	AAT	2	6	217089	217094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825343
5520	NC_009881	AG	3	6	217133	217138	50 %	0 %	50 %	0 %	157825343
5521	NC_009881	TGT	2	6	217177	217182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825343
5522	NC_009881	A	6	6	217253	217258	100 %	0 %	0 %	0 %	157825343
5523	NC_009881	ATA	2	6	217279	217284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825343
5524	NC_009881	TACT	2	8	217299	217306	25 %	50 %	0 %	25 %	157825343
5525	NC_009881	AAG	2	6	217321	217326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825343
5526	NC_009881	ACC	2	6	217378	217383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825343
5527	NC_009881	TAT	2	6	217389	217394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5528	NC_009881	TCA	2	6	217430	217435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825343
5529	NC_009881	TCAACA	2	12	217439	217450	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157825343
5530	NC_009881	CTTTAG	2	12	217461	217472	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157825343
5531	NC_009881	AAT	2	6	217503	217508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825343
5532	NC_009881	AT	3	6	217541	217546	50 %	50 %	0 %	0 %	157825343
5533	NC_009881	CTT	2	6	217566	217571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825343
5534	NC_009881	TCT	2	6	217585	217590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825343
5535	NC_009881	TTA	2	6	217616	217621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5536	NC_009881	ATA	2	6	217622	217627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825343
5537	NC_009881	TTA	2	6	217634	217639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5538	NC_009881	AAT	2	6	217663	217668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825343
5539	NC_009881	T	6	6	217697	217702	0 %	100 %	0 %	0 %	157825343
5540	NC_009881	T	7	7	217761	217767	0 %	100 %	0 %	0 %	157825343
5541	NC_009881	ATC	2	6	217774	217779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825343
5542	NC_009881	ACCTT	2	10	217799	217808	20 %	40 %	0 %	40 %	157825343
5543	NC_009881	TTA	2	6	217826	217831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5544	NC_009881	TTATAT	2	12	217839	217850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5545	NC_009881	TAT	2	6	217938	217943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5546	NC_009881	CT	3	6	218002	218007	0 %	50 %	0 %	50 %	157825343
5547	NC_009881	CGTA	2	8	218043	218050	25 %	25 %	25 %	25 %	157825343
5548	NC_009881	A	6	6	218063	218068	100 %	0 %	0 %	0 %	157825343
5549	NC_009881	AAAT	2	8	218141	218148	75 %	25 %	0 %	0 %	157825343
5550	NC_009881	TGT	2	6	218202	218207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825343
5551	NC_009881	GTA	2	6	218237	218242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825343
5552	NC_009881	T	8	8	218277	218284	0 %	100 %	0 %	0 %	157825343
5553	NC_009881	TAC	2	6	218383	218388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825343
5554	NC_009881	ACT	2	6	218389	218394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825343
5555	NC_009881	ATATTT	2	12	218450	218461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5556	NC_009881	TCT	2	6	218501	218506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825343
5557	NC_009881	ATT	2	6	218512	218517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825343
5558	NC_009881	TAG	2	6	218556	218561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825343
5559	NC_009881	ATA	2	6	218629	218634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825343
5560	NC_009881	A	6	6	218634	218639	100 %	0 %	0 %	0 %	157825343
5561	NC_009881	TAA	3	9	218644	218652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825343
5562	NC_009881	TAC	2	6	218664	218669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825343
5563	NC_009881	CTT	2	6	218696	218701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_009881	ATTTA	2	10	218706	218715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_009881	ATA	2	6	218772	218777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_009881	ACA	2	6	218853	218858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_009881	TAAT	2	8	218898	218905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_009881	TAG	2	6	218917	218922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_009881	ATA	2	6	218923	218928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_009881	AGCA	2	8	218937	218944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_009881	AG	3	6	218988	218993	50 %	0 %	50 %	0 %	157825344
5572	NC_009881	TAA	2	6	218996	219001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825344
5573	NC_009881	ATT	3	9	219007	219015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825344
5574	NC_009881	GCT	2	6	219016	219021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825344
5575	NC_009881	CCG	2	6	219103	219108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825344
5576	NC_009881	GTA	2	6	219125	219130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825344
5577	NC_009881	ATA	2	6	219170	219175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825344
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5579	NC_009881	TAG	2	6	219311	219316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825344
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5581	NC_009881	ATT	2	6	219436	219441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825344
5582	NC_009881	TTTC	2	8	219478	219485	0 %	75 %	0 %	25 %	157825344
5583	NC_009881	AGA	2	6	219498	219503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825344
5584	NC_009881	TTAA	2	8	219514	219521	50 %	50 %	0 %	0 %	157825344
5585	NC_009881	TTTC	2	8	219524	219531	0 %	75 %	0 %	25 %	157825344
5586	NC_009881	CTA	2	6	219623	219628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825344
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5591	NC_009881	A	6	6	219736	219741	100 %	0 %	0 %	0 %	157825344
5592	NC_009881	CTT	2	6	219785	219790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825344
5593	NC_009881	ACC	2	6	219837	219842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825344
5594	NC_009881	CAATA	2	10	219953	219962	60 %	20 %	0 %	20 %	157825344
5595	NC_009881	TAA	2	6	220004	220009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825344
5596	NC_009881	TAA	2	6	220048	220053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_009881	GTT	2	6	220096	220101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_009881	AAATT	2	10	220185	220194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_009881	CTTT	2	8	220203	220210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5600	NC_009881	TAA	2	6	220228	220233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825345
5601	NC_009881	A	6	6	220232	220237	100 %	0 %	0 %	0 %	157825345
5602	NC_009881	GCA	2	6	220253	220258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825345
5603	NC_009881	ACG	2	6	220293	220298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825345
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5605	NC_009881	CTTT	2	8	220325	220332	0 %	75 %	0 %	25 %	157825345
5606	NC_009881	TAA	2	6	220435	220440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825345
5607	NC_009881	TAC	2	6	220503	220508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825345
5608	NC_009881	TA	3	6	220528	220533	50 %	50 %	0 %	0 %	157825345
5609	NC_009881	CTA	2	6	220551	220556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825345
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5613	NC_009881	AAAT	2	8	220704	220711	75 %	25 %	0 %	0 %	157825346
5614	NC_009881	A	6	6	220732	220737	100 %	0 %	0 %	0 %	157825346
5615	NC_009881	TCT	2	6	220747	220752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825346
5616	NC_009881	ACT	2	6	220836	220841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825346
5617	NC_009881	TTG	2	6	220886	220891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825346
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5620	NC_009881	AAT	2	6	220963	220968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825346
5621	NC_009881	AAT	2	6	220971	220976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825346
5622	NC_009881	TAT	2	6	221004	221009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825346
5623	NC_009881	GAGTT	2	10	221012	221021	20 %	40 %	40 %	0 %	157825346
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