MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009881	TCC	2	6	195431	195436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825322
5002	NC_009881	ATGT	2	8	195511	195518	25 %	50 %	25 %	0 %	157825322
5003	NC_009881	CAA	2	6	195520	195525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825322
5004	NC_009881	TTC	2	6	195545	195550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825322
5005	NC_009881	T	6	6	195554	195559	0 %	100 %	0 %	0 %	157825322
5006	NC_009881	ATAC	2	8	195562	195569	50 %	25 %	0 %	25 %	157825322
5007	NC_009881	CTG	3	9	195595	195603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825322
5008	NC_009881	TCA	2	6	195606	195611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825322
5009	NC_009881	T	7	7	195628	195634	0 %	100 %	0 %	0 %	157825322
5010	NC_009881	TCT	2	6	195652	195657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825322
5011	NC_009881	ATA	2	6	195748	195753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825322
5012	NC_009881	GCG	2	6	195790	195795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825322
5013	NC_009881	TCC	2	6	195810	195815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825322
5014	NC_009881	ATG	2	6	195835	195840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_009881	AAG	2	6	195874	195879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_009881	ATT	2	6	195899	195904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_009881	CAAAA	2	10	195934	195943	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5018	NC_009881	A	6	6	195947	195952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009881	ATTTT	2	10	195983	195992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_009881	TAA	2	6	196001	196006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_009881	ATA	2	6	196054	196059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_009881	TGAA	2	8	196091	196098	50 %	25 %	25 %	0 %	157825323
5023	NC_009881	ATC	2	6	196101	196106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825323
5024	NC_009881	TAG	2	6	196121	196126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
5025	NC_009881	TGA	2	6	196134	196139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
5026	NC_009881	CAA	2	6	196177	196182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825323
5027	NC_009881	AGGTG	2	10	196275	196284	20 %	20 %	60 %	0 %	157825323
5028	NC_009881	ATA	2	6	196294	196299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825323
5029	NC_009881	GAA	2	6	196315	196320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825323
5030	NC_009881	CTA	2	6	196391	196396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825323
5031	NC_009881	TAG	2	6	196422	196427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
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5033	NC_009881	AAG	2	6	196514	196519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825323
5034	NC_009881	ATA	2	6	196559	196564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825323
5035	NC_009881	ATT	2	6	196581	196586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825323
5036	NC_009881	A	6	6	196594	196599	100 %	0 %	0 %	0 %	157825323
5037	NC_009881	T	6	6	196618	196623	0 %	100 %	0 %	0 %	157825323
5038	NC_009881	AT	3	6	196631	196636	50 %	50 %	0 %	0 %	157825323
5039	NC_009881	GATGTT	2	12	196714	196725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	157825323
5040	NC_009881	TAG	2	6	196805	196810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
5041	NC_009881	GGC	2	6	196825	196830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825323
5042	NC_009881	ATT	2	6	196846	196851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825323
5043	NC_009881	TGGT	2	8	196856	196863	0 %	50 %	50 %	0 %	157825323
5044	NC_009881	GCA	2	6	196948	196953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825323
5045	NC_009881	ACT	2	6	197071	197076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825323
5046	NC_009881	GTA	2	6	197225	197230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
5047	NC_009881	GTT	2	6	197240	197245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825323
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5049	NC_009881	TAA	2	6	197276	197281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825323
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5051	NC_009881	ATG	2	6	197327	197332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
5052	NC_009881	GCT	2	6	197395	197400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825323
5053	NC_009881	TGC	2	6	197412	197417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825323
5054	NC_009881	TAA	2	6	197490	197495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825323
5055	NC_009881	AT	3	6	197565	197570	50 %	50 %	0 %	0 %	157825323
5056	NC_009881	T	7	7	197614	197620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_009881	AAT	3	9	197652	197660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_009881	TTA	2	6	197669	197674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_009881	GTT	2	6	197684	197689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_009881	AGTCA	2	10	197703	197712	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5061	NC_009881	AATA	2	8	197763	197770	75 %	25 %	0 %	0 %	157825324
5062	NC_009881	TA	3	6	197776	197781	50 %	50 %	0 %	0 %	157825324
5063	NC_009881	CTG	2	6	197823	197828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825324
5064	NC_009881	ATA	2	6	197839	197844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825324
5065	NC_009881	GTA	2	6	197869	197874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825324
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5072	NC_009881	AAT	2	6	198040	198045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825324
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5074	NC_009881	TGAT	2	8	198065	198072	25 %	50 %	25 %	0 %	157825324
5075	NC_009881	ATT	2	6	198127	198132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825324
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5080	NC_009881	TAAA	2	8	198317	198324	75 %	25 %	0 %	0 %	157825324
5081	NC_009881	TAT	2	6	198341	198346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825324
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5083	NC_009881	AT	3	6	198403	198408	50 %	50 %	0 %	0 %	157825324
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5088	NC_009881	GAA	2	6	198677	198682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825325
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5096	NC_009881	GTA	2	6	198867	198872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825325
5097	NC_009881	TAT	2	6	198900	198905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825325
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5099	NC_009881	AAT	2	6	198919	198924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825325
5100	NC_009881	TAG	2	6	198930	198935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825325
5101	NC_009881	AT	3	6	198974	198979	50 %	50 %	0 %	0 %	157825325
5102	NC_009881	CAA	3	9	199016	199024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825325
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5104	NC_009881	TA	4	8	199114	199121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_009881	TAA	2	6	199138	199143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_009881	AGAAAT	2	12	199144	199155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157825326
5107	NC_009881	AAG	2	6	199209	199214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825326
5108	NC_009881	AGA	3	9	199238	199246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825326
5109	NC_009881	GGA	2	6	199333	199338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825326
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5118	NC_009881	ATTT	2	8	199932	199939	25 %	75 %	0 %	0 %	157825326
5119	NC_009881	TCGT	2	8	199977	199984	0 %	50 %	25 %	25 %	157825326
5120	NC_009881	TAT	2	6	200044	200049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825326
5121	NC_009881	GTGC	2	8	200126	200133	0 %	25 %	50 %	25 %	157825326
5122	NC_009881	TTC	2	6	200171	200176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825326
5123	NC_009881	GCA	2	6	200284	200289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825326
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