MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. McKiel

Total Repeats: 30431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009879	TGA	2	6	38535	38540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803222
1003	NC_009879	AT	3	6	38574	38579	50 %	50 %	0 %	0 %	157803222
1004	NC_009879	CTC	2	6	38612	38617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157803222
1005	NC_009879	ATT	2	6	38688	38693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803222
1006	NC_009879	TGA	2	6	38694	38699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803222
1007	NC_009879	TGC	2	6	38735	38740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157803222
1008	NC_009879	TGA	2	6	38748	38753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803222
1009	NC_009879	TAT	2	6	38802	38807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803222
1010	NC_009879	AAG	2	6	38852	38857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803222
1011	NC_009879	ATTAT	2	10	38944	38953	40 %	60 %	0 %	0 %	157803222
1012	NC_009879	TGA	2	6	39051	39056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803222
1013	NC_009879	ATT	2	6	39068	39073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803222
1014	NC_009879	AAT	2	6	39145	39150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803222
1015	NC_009879	AGA	2	6	39216	39221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803222
1016	NC_009879	ATTTAT	2	12	39333	39344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009879	TAA	2	6	39387	39392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803223
1018	NC_009879	TTTCAA	2	12	39394	39405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157803223
1019	NC_009879	TTA	2	6	39412	39417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803223
1020	NC_009879	TAA	2	6	39435	39440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803223
1021	NC_009879	ACT	2	6	39443	39448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803223
1022	NC_009879	AAT	2	6	39474	39479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803223
1023	NC_009879	T	6	6	39484	39489	0 %	100 %	0 %	0 %	157803223
1024	NC_009879	CTT	2	6	39490	39495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157803223
1025	NC_009879	TAAG	2	8	39509	39516	50 %	25 %	25 %	0 %	157803223
1026	NC_009879	AGT	2	6	39547	39552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803223
1027	NC_009879	TTG	2	6	39553	39558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157803223
1028	NC_009879	TTA	2	6	39570	39575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803223
1029	NC_009879	T	6	6	39614	39619	0 %	100 %	0 %	0 %	157803223
1030	NC_009879	GTT	2	6	39654	39659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157803223
1031	NC_009879	AT	3	6	39668	39673	50 %	50 %	0 %	0 %	157803223
1032	NC_009879	A	6	6	39730	39735	100 %	0 %	0 %	0 %	157803223
1033	NC_009879	ATA	2	6	39744	39749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803223
1034	NC_009879	A	6	6	39783	39788	100 %	0 %	0 %	0 %	157803223
1035	NC_009879	TTG	2	6	39814	39819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157803223
1036	NC_009879	T	6	6	39886	39891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009879	TTA	3	9	39918	39926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009879	AAG	2	6	39942	39947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009879	TA	3	6	39964	39969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009879	GTT	2	6	39996	40001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009879	TAT	2	6	40014	40019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009879	CTC	2	6	40032	40037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_009879	TTC	2	6	40073	40078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157803224
1044	NC_009879	TTA	3	9	40125	40133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803224
1045	NC_009879	ATAA	2	8	40196	40203	75 %	25 %	0 %	0 %	157803224
1046	NC_009879	CAC	2	6	40225	40230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157803224
1047	NC_009879	AGC	2	6	40259	40264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803224
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1049	NC_009879	TAC	2	6	40345	40350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803224
1050	NC_009879	TGC	2	6	40382	40387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157803224
1051	NC_009879	ATT	2	6	40428	40433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803224
1052	NC_009879	GTAC	2	8	40437	40444	25 %	25 %	25 %	25 %	157803224
1053	NC_009879	ATTTAT	2	12	40507	40518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803224
1054	NC_009879	TCC	2	6	40556	40561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157803224
1055	NC_009879	CAT	2	6	40615	40620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803224
1056	NC_009879	TAG	2	6	40624	40629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803224
1057	NC_009879	ATAAGG	2	12	40706	40717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157803224
1058	NC_009879	T	7	7	40781	40787	0 %	100 %	0 %	0 %	157803224
1059	NC_009879	CCG	2	6	40833	40838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157803224
1060	NC_009879	GCA	2	6	40860	40865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803224
1061	NC_009879	CTTT	2	8	40896	40903	0 %	75 %	0 %	25 %	157803224
1062	NC_009879	GCA	2	6	40950	40955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157803224
1063	NC_009879	TAC	2	6	40964	40969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803224
1064	NC_009879	ATC	2	6	41057	41062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803224
1065	NC_009879	ATTA	2	8	41106	41113	50 %	50 %	0 %	0 %	157803225
1066	NC_009879	AAT	2	6	41170	41175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803225
1067	NC_009879	T	7	7	41175	41181	0 %	100 %	0 %	0 %	157803225
1068	NC_009879	T	6	6	41287	41292	0 %	100 %	0 %	0 %	157803225
1069	NC_009879	GAT	2	6	41315	41320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803225
1070	NC_009879	GTA	2	6	41459	41464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803225
1071	NC_009879	ATG	2	6	41572	41577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803225
1072	NC_009879	AAT	2	6	41606	41611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803225
1073	NC_009879	CCA	2	6	41617	41622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157803225
1074	NC_009879	T	6	6	41650	41655	0 %	100 %	0 %	0 %	157803225
1075	NC_009879	TTG	3	9	41698	41706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157803225
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1077	NC_009879	CCG	2	6	41762	41767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157803225
1078	NC_009879	ATAA	2	8	41780	41787	75 %	25 %	0 %	0 %	157803225
1079	NC_009879	GCT	2	6	41810	41815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157803225
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1081	NC_009879	TAA	2	6	41845	41850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803225
1082	NC_009879	TTC	2	6	41855	41860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157803225
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1084	NC_009879	CATC	2	8	41917	41924	25 %	25 %	0 %	50 %	157803225
1085	NC_009879	ATG	2	6	42007	42012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803225
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1087	NC_009879	ATT	2	6	42154	42159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803225
1088	NC_009879	ATA	2	6	42163	42168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803225
1089	NC_009879	CAAA	2	8	42213	42220	75 %	0 %	0 %	25 %	157803225
1090	NC_009879	ATA	2	6	42239	42244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803225
1091	NC_009879	A	7	7	42323	42329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009879	TAAT	2	8	42375	42382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009879	A	6	6	42454	42459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009879	ATT	2	6	42475	42480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009879	TAA	2	6	42510	42515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009879	TATT	2	8	42606	42613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009879	A	6	6	42646	42651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009879	GTA	2	6	42652	42657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009879	TAA	2	6	42706	42711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009879	ATA	2	6	42834	42839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009879	T	6	6	42873	42878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009879	TAA	2	6	42897	42902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009879	A	6	6	42926	42931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009879	TA	5	10	42968	42977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009879	T	6	6	43008	43013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009879	T	7	7	43015	43021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009879	TTA	2	6	43101	43106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009879	T	6	6	43161	43166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009879	ATA	2	6	43170	43175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009879	GTT	2	6	43195	43200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009879	GTTT	2	8	43220	43227	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009879	TA	3	6	43240	43245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009879	TAT	2	6	43271	43276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803226
1114	NC_009879	TGA	2	6	43316	43321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803226
1115	NC_009879	ATT	2	6	43332	43337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803226
1116	NC_009879	ATA	2	6	43342	43347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803226
1117	NC_009879	A	7	7	43361	43367	100 %	0 %	0 %	0 %	157803226
1118	NC_009879	GTA	2	6	43405	43410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803226
1119	NC_009879	ATT	3	9	43423	43431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157803226
1120	NC_009879	T	6	6	43430	43435	0 %	100 %	0 %	0 %	157803226
1121	NC_009879	AGA	2	6	43463	43468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157803226
1122	NC_009879	AGAA	2	8	43472	43479	75 %	0 %	25 %	0 %	157803226
1123	NC_009879	TAG	2	6	43535	43540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157803226
1124	NC_009879	A	6	6	43559	43564	100 %	0 %	0 %	0 %	157803226
1125	NC_009879	AAT	2	6	43578	43583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803226
1126	NC_009879	TAA	2	6	43604	43609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803226
1127	NC_009879	TAA	2	6	43649	43654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157803227
1128	NC_009879	ACT	2	6	43668	43673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157803227
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