MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 5422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009767	ATCGG	2	10	1197	1206	20 %	20 %	40 %	20 %	156740029
2	NC_009767	CAGCG	2	10	4463	4472	20 %	0 %	40 %	40 %	156740034
3	NC_009767	GCGGT	2	10	4919	4928	0 %	20 %	60 %	20 %	156740035
4	NC_009767	CAACG	2	10	9411	9420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009767	GCGCC	2	10	9594	9603	0 %	0 %	40 %	60 %	156740039
6	NC_009767	GGCGT	2	10	11260	11269	0 %	20 %	60 %	20 %	156740041
7	NC_009767	TGCGC	2	10	12039	12048	0 %	20 %	40 %	40 %	156740041
8	NC_009767	GACGG	2	10	12399	12408	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009767	CGAGC	2	10	12461	12470	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009767	CGAGC	2	10	12601	12610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009767	CGAGC	2	10	12741	12750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009767	CGAGC	2	10	12881	12890	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009767	CGAGC	2	10	13021	13030	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009767	CGAGC	2	10	13442	13451	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009767	GCGTC	2	10	13864	13873	0 %	20 %	40 %	40 %	156740042
16	NC_009767	CCGAT	2	10	13877	13886	20 %	20 %	20 %	40 %	156740042
17	NC_009767	CGCTG	2	10	15029	15038	0 %	20 %	40 %	40 %	156740043
18	NC_009767	GCAAC	2	10	15072	15081	40 %	0 %	20 %	40 %	156740043
19	NC_009767	ACCGC	2	10	16924	16933	20 %	0 %	20 %	60 %	156740044
20	NC_009767	GGGTT	2	10	18899	18908	0 %	40 %	60 %	0 %	156740046
21	NC_009767	GGTTG	2	10	21214	21223	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009767	GCGCC	2	10	21781	21790	0 %	0 %	40 %	60 %	156740047
23	NC_009767	GCGCC	2	10	23197	23206	0 %	0 %	40 %	60 %	156740048
24	NC_009767	CCGCC	2	10	23488	23497	0 %	0 %	20 %	80 %	156740048
25	NC_009767	AGCGA	2	10	24267	24276	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009767	CGCTA	2	10	24403	24412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009767	CGCTA	2	10	24472	24481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009767	CTCGC	2	10	25087	25096	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_009767	CGCCC	2	10	26374	26383	0 %	0 %	20 %	80 %	156740049
30	NC_009767	CTGCA	2	10	27017	27026	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009767	CCGCA	2	10	28333	28342	20 %	0 %	20 %	60 %	156740050
32	NC_009767	GCGCA	2	10	28816	28825	20 %	0 %	40 %	40 %	156740051
33	NC_009767	GCCGC	2	10	29382	29391	0 %	0 %	40 %	60 %	156740051
34	NC_009767	CAGCG	2	10	29965	29974	20 %	0 %	40 %	40 %	156740051
35	NC_009767	CTGCG	2	10	31684	31693	0 %	20 %	40 %	40 %	156740053
36	NC_009767	TCTCA	2	10	31833	31842	20 %	40 %	0 %	40 %	156740053
37	NC_009767	TCCCA	2	10	32390	32399	20 %	20 %	0 %	60 %	156740054
38	NC_009767	CGAGA	2	10	34548	34557	40 %	0 %	40 %	20 %	156740056
39	NC_009767	TGCGC	2	10	36038	36047	0 %	20 %	40 %	40 %	156740056
40	NC_009767	ATTTC	2	10	37447	37456	20 %	60 %	0 %	20 %	156740057
41	NC_009767	GCGCC	2	10	37694	37703	0 %	0 %	40 %	60 %	156740057
42	NC_009767	CGCGC	2	10	38277	38286	0 %	0 %	40 %	60 %	156740057
43	NC_009767	GCGCG	2	10	39224	39233	0 %	0 %	60 %	40 %	156740058
44	NC_009767	CGGAT	2	10	39505	39514	20 %	20 %	40 %	20 %	156740059
45	NC_009767	TGTGC	2	10	40136	40145	0 %	40 %	40 %	20 %	156740059
46	NC_009767	CCATG	2	10	41376	41385	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009767	GCTTG	2	10	44078	44087	0 %	40 %	40 %	20 %	156740060
48	NC_009767	CGCGA	2	10	45894	45903	20 %	0 %	40 %	40 %	156740060
49	NC_009767	TGGTC	2	10	46062	46071	0 %	40 %	40 %	20 %	156740061
50	NC_009767	TCGAT	2	10	46184	46193	20 %	40 %	20 %	20 %	156740061
51	NC_009767	TGGTC	2	10	46278	46287	0 %	40 %	40 %	20 %	156740061
52	NC_009767	CCGCG	2	10	48118	48127	0 %	0 %	40 %	60 %	156740063
53	NC_009767	AACGC	2	10	49182	49191	40 %	0 %	20 %	40 %	156740064
54	NC_009767	CGCCA	2	10	49988	49997	20 %	0 %	20 %	60 %	156740064
55	NC_009767	GCTTC	2	10	51305	51314	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009767	GATCG	2	10	52228	52237	20 %	20 %	40 %	20 %	156740066
57	NC_009767	CCACA	2	10	53575	53584	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_009767	CGATC	2	10	55556	55565	20 %	20 %	20 %	40 %	156740068
59	NC_009767	CACGC	2	10	57465	57474	20 %	0 %	20 %	60 %	156740070
60	NC_009767	ATGGC	2	10	58162	58171	20 %	20 %	40 %	20 %	156740071
61	NC_009767	CTGCG	2	10	58242	58251	0 %	20 %	40 %	40 %	156740071
62	NC_009767	AGGAC	2	10	60382	60391	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009767	AGGGT	2	10	61254	61263	20 %	20 %	60 %	0 %	156740073
64	NC_009767	TCAAC	2	10	64747	64756	40 %	20 %	0 %	40 %	156740077
65	NC_009767	ACTGG	2	10	66682	66691	20 %	20 %	40 %	20 %	156740078
66	NC_009767	CGCGG	2	10	68704	68713	0 %	0 %	60 %	40 %	156740081
67	NC_009767	GACCT	2	10	69874	69883	20 %	20 %	20 %	40 %	156740082
68	NC_009767	GCTGC	2	10	69991	70000	0 %	20 %	40 %	40 %	156740082
69	NC_009767	CGCGC	2	10	70503	70512	0 %	0 %	40 %	60 %	156740084
70	NC_009767	AATGG	2	10	71949	71958	40 %	20 %	40 %	0 %	156740085
71	NC_009767	GGCGT	2	10	72683	72692	0 %	20 %	60 %	20 %	156740087
72	NC_009767	GCCGT	2	10	73827	73836	0 %	20 %	40 %	40 %	156740087
73	NC_009767	CGGCG	2	10	74469	74478	0 %	0 %	60 %	40 %	156740087
74	NC_009767	GGCGC	2	10	77129	77138	0 %	0 %	60 %	40 %	156740089
75	NC_009767	GGCGC	2	10	78665	78674	0 %	0 %	60 %	40 %	156740089
76	NC_009767	AGCAG	2	10	79061	79070	40 %	0 %	40 %	20 %	156740089
77	NC_009767	CTGGT	2	10	80232	80241	0 %	40 %	40 %	20 %	156740091
78	NC_009767	GGCGC	2	10	81073	81082	0 %	0 %	60 %	40 %	156740092
79	NC_009767	TGAAC	2	10	81267	81276	40 %	20 %	20 %	20 %	156740092
80	NC_009767	GCGCG	2	10	81498	81507	0 %	0 %	60 %	40 %	156740092
81	NC_009767	GCGGG	2	10	81825	81834	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009767	GCTGC	2	10	83032	83041	0 %	20 %	40 %	40 %	156740093
83	NC_009767	TTCCT	2	10	84166	84175	0 %	60 %	0 %	40 %	156740095
84	NC_009767	GTCCG	2	10	87562	87571	0 %	20 %	40 %	40 %	156740096
85	NC_009767	GCGTG	2	10	87616	87625	0 %	20 %	60 %	20 %	156740096
86	NC_009767	CGGGA	2	10	89276	89285	20 %	0 %	60 %	20 %	156740098
87	NC_009767	TCGTC	2	10	89313	89322	0 %	40 %	20 %	40 %	156740098
88	NC_009767	TATCA	2	10	90707	90716	40 %	40 %	0 %	20 %	156740099
89	NC_009767	TTTCG	2	10	90756	90765	0 %	60 %	20 %	20 %	156740099
90	NC_009767	CAGCG	2	10	92204	92213	20 %	0 %	40 %	40 %	156740100
91	NC_009767	GCTGC	2	10	93293	93302	0 %	20 %	40 %	40 %	156740101
92	NC_009767	CACGC	2	10	93445	93454	20 %	0 %	20 %	60 %	156740101
93	NC_009767	CAGCA	2	10	95049	95058	40 %	0 %	20 %	40 %	156740102
94	NC_009767	TCCAG	2	10	95669	95678	20 %	20 %	20 %	40 %	156740102
95	NC_009767	ACCCG	2	10	97221	97230	20 %	0 %	20 %	60 %	156740103
96	NC_009767	TCCAT	2	10	97486	97495	20 %	40 %	0 %	40 %	156740103
97	NC_009767	GACCG	2	10	97607	97616	20 %	0 %	40 %	40 %	156740103
98	NC_009767	CGCGC	2	10	98050	98059	0 %	0 %	40 %	60 %	156740103
99	NC_009767	TTCCC	2	10	98281	98290	0 %	40 %	0 %	60 %	156740103
100	NC_009767	CGGCG	2	10	98701	98710	0 %	0 %	60 %	40 %	156740103
101	NC_009767	GCCCC	2	10	99851	99860	0 %	0 %	20 %	80 %	156740104
102	NC_009767	ATCGC	2	10	100059	100068	20 %	20 %	20 %	40 %	156740104
103	NC_009767	TGCGA	2	10	100484	100493	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009767	CTGAT	2	10	100545	100554	20 %	40 %	20 %	20 %	156740105
105	NC_009767	GCGCA	2	10	102086	102095	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_009767	CAGGG	2	10	104069	104078	20 %	0 %	60 %	20 %	156740109
107	NC_009767	CTTCG	2	10	106341	106350	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009767	TCGGG	2	10	107041	107050	0 %	20 %	60 %	20 %	156740112
109	NC_009767	CGATC	2	10	107944	107953	20 %	20 %	20 %	40 %	156740112
110	NC_009767	GCGCG	2	10	108822	108831	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009767	AGCGC	2	10	110023	110032	20 %	0 %	40 %	40 %	156740113
112	NC_009767	CAGAG	2	10	113957	113966	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009767	ACGCC	2	10	114179	114188	20 %	0 %	20 %	60 %	156740118
114	NC_009767	TGCCG	2	10	115533	115542	0 %	20 %	40 %	40 %	156740119
115	NC_009767	GCCCC	2	10	117619	117628	0 %	0 %	20 %	80 %	156740122
116	NC_009767	AGCGA	2	10	118141	118150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009767	CGCTT	2	10	118656	118665	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009767	GCGCG	2	10	119045	119054	0 %	0 %	60 %	40 %	156740124
119	NC_009767	TGCTC	2	10	119329	119338	0 %	40 %	20 %	40 %	156740124
120	NC_009767	GGATG	2	10	121494	121503	20 %	20 %	60 %	0 %	156740125
121	NC_009767	TCGCC	2	10	122299	122308	0 %	20 %	20 %	60 %	156740126
122	NC_009767	GTGCA	2	10	122978	122987	20 %	20 %	40 %	20 %	156740127
123	NC_009767	GCGCG	2	10	123491	123500	0 %	0 %	60 %	40 %	156740128
124	NC_009767	TCGAG	2	10	123833	123842	20 %	20 %	40 %	20 %	156740128
125	NC_009767	TGCGC	2	10	128971	128980	0 %	20 %	40 %	40 %	156740133
126	NC_009767	GTCGT	2	10	131071	131080	0 %	40 %	40 %	20 %	156740134
127	NC_009767	GACCG	2	10	131537	131546	20 %	0 %	40 %	40 %	156740135
128	NC_009767	TGATC	2	10	131681	131690	20 %	40 %	20 %	20 %	156740135
129	NC_009767	GGAGA	2	10	132873	132882	40 %	0 %	60 %	0 %	156740136
130	NC_009767	GCGCC	2	10	134660	134669	0 %	0 %	40 %	60 %	156740137
131	NC_009767	CGACT	2	10	135349	135358	20 %	20 %	20 %	40 %	156740138
132	NC_009767	ACCCT	2	10	136888	136897	20 %	20 %	0 %	60 %	156740139
133	NC_009767	CGGCA	2	10	137158	137167	20 %	0 %	40 %	40 %	156740139
134	NC_009767	CAGCG	2	10	138598	138607	20 %	0 %	40 %	40 %	156740140
135	NC_009767	ACACG	2	10	138692	138701	40 %	0 %	20 %	40 %	156740140
136	NC_009767	TGCGG	2	10	142764	142773	0 %	20 %	60 %	20 %	156740145
137	NC_009767	TGCGC	2	10	142776	142785	0 %	20 %	40 %	40 %	156740145
138	NC_009767	AGCGC	2	10	144551	144560	20 %	0 %	40 %	40 %	156740146
139	NC_009767	TCGCC	2	10	144639	144648	0 %	20 %	20 %	60 %	156740147
140	NC_009767	ACCGC	2	10	145022	145031	20 %	0 %	20 %	60 %	156740147
141	NC_009767	AGATC	2	10	145122	145131	40 %	20 %	20 %	20 %	156740147
142	NC_009767	CCTAC	2	10	146356	146365	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_009767	GGTGG	2	10	146763	146772	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009767	AGCGC	2	10	148232	148241	20 %	0 %	40 %	40 %	156740149
145	NC_009767	GCGCC	2	10	148449	148458	0 %	0 %	40 %	60 %	156740149
146	NC_009767	ACAAG	2	10	149122	149131	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009767	GAAAA	2	10	149369	149378	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009767	GTGAG	2	10	150578	150587	20 %	20 %	60 %	0 %	156740150
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152	NC_009767	TGATC	2	10	152061	152070	20 %	40 %	20 %	20 %	156740150
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154	NC_009767	CTCGC	2	10	152633	152642	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
155	NC_009767	GAGAG	2	10	153061	153070	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009767	GCGCG	2	10	153399	153408	0 %	0 %	60 %	40 %	156740151
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164	NC_009767	GCGAG	2	10	160784	160793	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
165	NC_009767	CGGCA	2	10	162075	162084	20 %	0 %	40 %	40 %	156740158
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176	NC_009767	TGTGG	2	10	174989	174998	0 %	40 %	60 %	0 %	156740169
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178	NC_009767	TTATA	2	10	175960	175969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_009767	ACCAG	2	10	179883	179892	40 %	0 %	20 %	40 %	156740171
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198	NC_009767	GGTGG	2	10	191841	191850	0 %	20 %	80 %	0 %	156740182
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202	NC_009767	CAATC	2	10	193545	193554	40 %	20 %	0 %	40 %	156740183
203	NC_009767	GCCGA	2	10	195526	195535	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
204	NC_009767	CAGCG	2	10	196094	196103	20 %	0 %	40 %	40 %	156740185
205	NC_009767	CCGTA	2	10	197999	198008	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
206	NC_009767	CTATT	2	10	198271	198280	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
207	NC_009767	ATCCG	2	10	200351	200360	20 %	20 %	20 %	40 %	156740187
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216	NC_009767	GAGCG	2	10	211725	211734	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
217	NC_009767	AGCGC	2	10	213311	213320	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
218	NC_009767	GCCCA	2	10	213856	213865	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
219	NC_009767	ATGCG	2	10	213930	213939	20 %	20 %	40 %	20 %	156740200
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223	NC_009767	AGCGA	2	10	220754	220763	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
224	NC_009767	CTGCG	2	10	221259	221268	0 %	20 %	40 %	40 %	156740206
225	NC_009767	TTGCG	2	10	221346	221355	0 %	40 %	40 %	20 %	156740206
226	NC_009767	CGGGG	2	10	221370	221379	0 %	0 %	80 %	20 %	156740206
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229	NC_009767	CCCGC	2	10	223979	223988	0 %	0 %	20 %	80 %	156740209
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231	NC_009767	GGGTC	2	10	224387	224396	0 %	20 %	60 %	20 %	156740209
232	NC_009767	CCCGC	2	10	224958	224967	0 %	0 %	20 %	80 %	156740210
233	NC_009767	AGGTC	2	10	224985	224994	20 %	20 %	40 %	20 %	156740210
234	NC_009767	GCAGC	2	10	226776	226785	20 %	0 %	40 %	40 %	156740212
235	NC_009767	GCCGC	2	10	227231	227240	0 %	0 %	40 %	60 %	156740213
236	NC_009767	CGAAC	2	10	227351	227360	40 %	0 %	20 %	40 %	156740213
237	NC_009767	AGCGA	2	10	231358	231367	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
238	NC_009767	CGACC	2	10	232636	232645	20 %	0 %	20 %	60 %	156740216
239	NC_009767	CACGC	2	10	234521	234530	20 %	0 %	20 %	60 %	156740217
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243	NC_009767	GCCGC	2	10	237414	237423	0 %	0 %	40 %	60 %	156740219
244	NC_009767	TGGTG	2	10	241813	241822	0 %	40 %	60 %	0 %	156740220
245	NC_009767	TGCGC	2	10	242377	242386	0 %	20 %	40 %	40 %	156740220
246	NC_009767	TTCGG	2	10	242715	242724	0 %	40 %	40 %	20 %	156740221
247	NC_009767	TGGCG	2	10	242795	242804	0 %	20 %	60 %	20 %	156740221
248	NC_009767	AACCG	2	10	245849	245858	40 %	0 %	20 %	40 %	156740223
249	NC_009767	AGACC	2	10	247061	247070	40 %	0 %	20 %	40 %	156740223
250	NC_009767	GACCG	2	10	247388	247397	20 %	0 %	40 %	40 %	156740223
251	NC_009767	CGACG	2	10	247828	247837	20 %	0 %	40 %	40 %	156740223
252	NC_009767	ATCGT	2	10	248115	248124	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_009767	CGGCT	2	10	250596	250605	0 %	20 %	40 %	40 %	156740225
254	NC_009767	CAGCG	2	10	258149	258158	20 %	0 %	40 %	40 %	156740230
255	NC_009767	GACTG	2	10	259239	259248	20 %	20 %	40 %	20 %	156740231
256	NC_009767	CGCTG	2	10	259652	259661	0 %	20 %	40 %	40 %	156740231
257	NC_009767	TGGAA	2	10	260049	260058	40 %	20 %	40 %	0 %	156740232
258	NC_009767	GCGCC	2	10	260118	260127	0 %	0 %	40 %	60 %	156740232
259	NC_009767	TGCGC	2	10	262845	262854	0 %	20 %	40 %	40 %	156740234
260	NC_009767	GTACA	2	10	263542	263551	40 %	20 %	20 %	20 %	156740235
261	NC_009767	TGCGC	2	10	268477	268486	0 %	20 %	40 %	40 %	156740237
262	NC_009767	GCGCC	2	10	269896	269905	0 %	0 %	40 %	60 %	156740237
263	NC_009767	GAACA	2	10	269963	269972	60 %	0 %	20 %	20 %	156740237
264	NC_009767	GCATG	2	10	270851	270860	20 %	20 %	40 %	20 %	156740237
265	NC_009767	GCTGC	2	10	272712	272721	0 %	20 %	40 %	40 %	156740238
266	NC_009767	CAGCG	2	10	273131	273140	20 %	0 %	40 %	40 %	156740238
267	NC_009767	GGCGC	2	10	274521	274530	0 %	0 %	60 %	40 %	156740238
268	NC_009767	GACCT	2	10	274593	274602	20 %	20 %	20 %	40 %	156740238
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388	NC_009767	GCGCA	2	10	392275	392284	20 %	0 %	40 %	40 %	156740340
389	NC_009767	ACAGG	2	10	392698	392707	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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391	NC_009767	CCGCC	2	10	394892	394901	0 %	0 %	20 %	80 %	156740343
392	NC_009767	GTCGC	2	10	394954	394963	0 %	20 %	40 %	40 %	156740343
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396	NC_009767	ACCGC	2	10	399341	399350	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
397	NC_009767	GTGCG	2	10	400450	400459	0 %	20 %	60 %	20 %	156740345
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