MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 13611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009767	GCTG	2	8	282	289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009767	GGCA	2	8	649	656	25 %	0 %	50 %	25 %	156740029
3	NC_009767	TGAT	2	8	1358	1365	25 %	50 %	25 %	0 %	156740029
4	NC_009767	CTCC	2	8	1575	1582	0 %	25 %	0 %	75 %	156740029
5	NC_009767	AGGC	2	8	2198	2205	25 %	0 %	50 %	25 %	156740030
6	NC_009767	CTGG	2	8	2405	2412	0 %	25 %	50 %	25 %	156740030
7	NC_009767	TGGA	2	8	2658	2665	25 %	25 %	50 %	0 %	156740030
8	NC_009767	CAGA	2	8	3076	3083	50 %	0 %	25 %	25 %	156740030
9	NC_009767	AATC	2	8	3266	3273	50 %	25 %	0 %	25 %	156740031
10	NC_009767	CGGG	2	8	3593	3600	0 %	0 %	75 %	25 %	156740032
11	NC_009767	TTTC	2	8	3810	3817	0 %	75 %	0 %	25 %	156740032
12	NC_009767	CAGG	2	8	3967	3974	25 %	0 %	50 %	25 %	156740033
13	NC_009767	TCGC	2	8	4239	4246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009767	TCCC	2	8	4693	4700	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_009767	CGTC	2	8	5397	5404	0 %	25 %	25 %	50 %	156740035
16	NC_009767	ATCG	2	8	5960	5967	25 %	25 %	25 %	25 %	156740035
17	NC_009767	CACG	2	8	6175	6182	25 %	0 %	25 %	50 %	156740035
18	NC_009767	CCTG	2	8	6793	6800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009767	CGCA	2	8	7871	7878	25 %	0 %	25 %	50 %	156740037
20	NC_009767	GCCC	2	8	8141	8148	0 %	0 %	25 %	75 %	156740037
21	NC_009767	CAAC	2	8	8164	8171	50 %	0 %	0 %	50 %	156740037
22	NC_009767	TCTA	2	8	8184	8191	25 %	50 %	0 %	25 %	156740037
23	NC_009767	CGCA	2	8	8288	8295	25 %	0 %	25 %	50 %	156740037
24	NC_009767	CGAT	2	8	8433	8440	25 %	25 %	25 %	25 %	156740037
25	NC_009767	GATG	2	8	8848	8855	25 %	25 %	50 %	0 %	156740037
26	NC_009767	GGCT	2	8	9119	9126	0 %	25 %	50 %	25 %	156740038
27	NC_009767	ACGG	2	8	9364	9371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009767	CTGG	2	8	9788	9795	0 %	25 %	50 %	25 %	156740039
29	NC_009767	TTCG	2	8	10679	10686	0 %	50 %	25 %	25 %	156740040
30	NC_009767	ATGC	2	8	10727	10734	25 %	25 %	25 %	25 %	156740040
31	NC_009767	AGAA	2	8	10993	11000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009767	CTGA	2	8	14844	14851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009767	GCAG	2	8	15204	15211	25 %	0 %	50 %	25 %	156740043
34	NC_009767	TTTC	2	8	15843	15850	0 %	75 %	0 %	25 %	156740043
35	NC_009767	AGCG	2	8	16865	16872	25 %	0 %	50 %	25 %	156740044
36	NC_009767	CAGG	2	8	17145	17152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009767	TCTT	2	8	17227	17234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009767	CCAT	2	8	17877	17884	25 %	25 %	0 %	50 %	156740045
39	NC_009767	GCGA	2	8	18336	18343	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009767	CAAA	2	8	18349	18356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009767	TCGC	2	8	18491	18498	0 %	25 %	25 %	50 %	156740046
42	NC_009767	TGGC	2	8	18914	18921	0 %	25 %	50 %	25 %	156740046
43	NC_009767	TCCC	2	8	20633	20640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_009767	TCCG	2	8	21077	21084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009767	GCTT	2	8	21115	21122	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009767	GACA	2	8	21395	21402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009767	GCCC	2	8	21696	21703	0 %	0 %	25 %	75 %	156740047
48	NC_009767	AGCG	2	8	22171	22178	25 %	0 %	50 %	25 %	156740047
49	NC_009767	GGTC	2	8	22417	22424	0 %	25 %	50 %	25 %	156740047
50	NC_009767	CGGG	2	8	22724	22731	0 %	0 %	75 %	25 %	156740048
51	NC_009767	CAGG	2	8	22733	22740	25 %	0 %	50 %	25 %	156740048
52	NC_009767	CCTC	2	8	23184	23191	0 %	25 %	0 %	75 %	156740048
53	NC_009767	TTCC	2	8	23282	23289	0 %	50 %	0 %	50 %	156740048
54	NC_009767	TCTG	2	8	23697	23704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009767	GAGC	2	8	23721	23728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009767	TGGA	2	8	25434	25441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009767	ACCA	2	8	25777	25784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009767	CACC	2	8	25875	25882	25 %	0 %	0 %	75 %	156740049
59	NC_009767	CAGT	2	8	26710	26717	25 %	25 %	25 %	25 %	156740049
60	NC_009767	GCGT	2	8	26844	26851	0 %	25 %	50 %	25 %	156740049
61	NC_009767	TCCT	2	8	27378	27385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009767	CCAA	2	8	27624	27631	50 %	0 %	0 %	50 %	156740050
63	NC_009767	CGGT	2	8	28207	28214	0 %	25 %	50 %	25 %	156740050
64	NC_009767	CCAT	2	8	28535	28542	25 %	25 %	0 %	50 %	156740051
65	NC_009767	ATCG	2	8	28900	28907	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
66	NC_009767	GATC	2	8	29661	29668	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
67	NC_009767	CGAT	2	8	29694	29701	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
68	NC_009767	GCCA	2	8	30198	30205	25 %	0 %	25 %	50 %	156740051
69	NC_009767	TGCC	2	8	30261	30268	0 %	25 %	25 %	50 %	156740051
70	NC_009767	GGTC	2	8	31958	31965	0 %	25 %	50 %	25 %	156740053
71	NC_009767	TGGC	2	8	32007	32014	0 %	25 %	50 %	25 %	156740053
72	NC_009767	CCGT	2	8	32423	32430	0 %	25 %	25 %	50 %	156740054
73	NC_009767	TCCG	2	8	32455	32462	0 %	25 %	25 %	50 %	156740054
74	NC_009767	CCGC	2	8	32486	32493	0 %	0 %	25 %	75 %	156740054
75	NC_009767	CACG	2	8	32522	32529	25 %	0 %	25 %	50 %	156740054
76	NC_009767	CCAC	2	8	32850	32857	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_009767	GCGG	2	8	33085	33092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009767	TGAC	2	8	33492	33499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009767	CTTC	2	8	33559	33566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009767	ACCC	2	8	33567	33574	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_009767	GGAG	2	8	33706	33713	25 %	0 %	75 %	0 %	156740055
82	NC_009767	GCAT	2	8	34235	34242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009767	CATG	2	8	34272	34279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009767	GCCA	2	8	35155	35162	25 %	0 %	25 %	50 %	156740056
85	NC_009767	CCTT	2	8	35191	35198	0 %	50 %	0 %	50 %	156740056
86	NC_009767	CCGG	2	8	35463	35470	0 %	0 %	50 %	50 %	156740056
87	NC_009767	TTGG	2	8	35528	35535	0 %	50 %	50 %	0 %	156740056
88	NC_009767	CGTT	2	8	36813	36820	0 %	50 %	25 %	25 %	156740057
89	NC_009767	TGGC	2	8	37007	37014	0 %	25 %	50 %	25 %	156740057
90	NC_009767	CATT	2	8	37459	37466	25 %	50 %	0 %	25 %	156740057
91	NC_009767	GCTG	2	8	37686	37693	0 %	25 %	50 %	25 %	156740057
92	NC_009767	CTGC	2	8	38125	38132	0 %	25 %	25 %	50 %	156740057
93	NC_009767	GACC	2	8	38455	38462	25 %	0 %	25 %	50 %	156740057
94	NC_009767	GACG	2	8	38486	38493	25 %	0 %	50 %	25 %	156740057
95	NC_009767	AACG	2	8	39074	39081	50 %	0 %	25 %	25 %	156740058
96	NC_009767	CCAT	2	8	39436	39443	25 %	25 %	0 %	50 %	156740059
97	NC_009767	ATCA	2	8	39912	39919	50 %	25 %	0 %	25 %	156740059
98	NC_009767	TCGA	2	8	40251	40258	25 %	25 %	25 %	25 %	156740059
99	NC_009767	TTTC	2	8	41532	41539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009767	CGAT	2	8	42526	42533	25 %	25 %	25 %	25 %	156740060
101	NC_009767	CCGA	2	8	42558	42565	25 %	0 %	25 %	50 %	156740060
102	NC_009767	TCGA	2	8	43422	43429	25 %	25 %	25 %	25 %	156740060
103	NC_009767	CGAC	2	8	43914	43921	25 %	0 %	25 %	50 %	156740060
104	NC_009767	GACA	2	8	43960	43967	50 %	0 %	25 %	25 %	156740060
105	NC_009767	TTCA	2	8	44297	44304	25 %	50 %	0 %	25 %	156740060
106	NC_009767	TTTC	2	8	44380	44387	0 %	75 %	0 %	25 %	156740060
107	NC_009767	AGGA	2	8	44623	44630	50 %	0 %	50 %	0 %	156740060
108	NC_009767	TGAG	2	8	44725	44732	25 %	25 %	50 %	0 %	156740060
109	NC_009767	AACC	2	8	45665	45672	50 %	0 %	0 %	50 %	156740060
110	NC_009767	GATG	2	8	46086	46093	25 %	25 %	50 %	0 %	156740061
111	NC_009767	TATG	2	8	46463	46470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009767	GGAA	2	8	46814	46821	50 %	0 %	50 %	0 %	156740062
113	NC_009767	GCAG	2	8	47034	47041	25 %	0 %	50 %	25 %	156740063
114	NC_009767	GCGA	2	8	47063	47070	25 %	0 %	50 %	25 %	156740063
115	NC_009767	CGAC	2	8	47086	47093	25 %	0 %	25 %	50 %	156740063
116	NC_009767	ATCA	2	8	47114	47121	50 %	25 %	0 %	25 %	156740063
117	NC_009767	GCCA	2	8	47199	47206	25 %	0 %	25 %	50 %	156740063
118	NC_009767	CAGT	2	8	47401	47408	25 %	25 %	25 %	25 %	156740063
119	NC_009767	CAGA	2	8	47564	47571	50 %	0 %	25 %	25 %	156740063
120	NC_009767	GTGC	2	8	47989	47996	0 %	25 %	50 %	25 %	156740063
121	NC_009767	ATCC	2	8	48389	48396	25 %	25 %	0 %	50 %	156740064
122	NC_009767	CGGT	2	8	48408	48415	0 %	25 %	50 %	25 %	156740064
123	NC_009767	TGCG	2	8	49083	49090	0 %	25 %	50 %	25 %	156740064
124	NC_009767	TCCA	2	8	50797	50804	25 %	25 %	0 %	50 %	156740065
125	NC_009767	ATCC	2	8	51847	51854	25 %	25 %	0 %	50 %	156740066
126	NC_009767	TTGG	2	8	52008	52015	0 %	50 %	50 %	0 %	156740066
127	NC_009767	ACCG	2	8	52657	52664	25 %	0 %	25 %	50 %	156740066
128	NC_009767	TGGA	2	8	54379	54386	25 %	25 %	50 %	0 %	156740068
129	NC_009767	GATC	2	8	54984	54991	25 %	25 %	25 %	25 %	156740068
130	NC_009767	TGAG	2	8	55082	55089	25 %	25 %	50 %	0 %	156740068
131	NC_009767	GATG	2	8	55092	55099	25 %	25 %	50 %	0 %	156740068
132	NC_009767	GGCG	2	8	55909	55916	0 %	0 %	75 %	25 %	156740069
133	NC_009767	ATGT	2	8	56744	56751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009767	GCCT	2	8	56901	56908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009767	CGAA	2	8	57097	57104	50 %	0 %	25 %	25 %	156740070
136	NC_009767	ATGA	2	8	57887	57894	50 %	25 %	25 %	0 %	156740070
137	NC_009767	GCCG	2	8	58302	58309	0 %	0 %	50 %	50 %	156740071
138	NC_009767	GCAC	2	8	58577	58584	25 %	0 %	25 %	50 %	156740071
139	NC_009767	TGCC	2	8	59670	59677	0 %	25 %	25 %	50 %	156740072
140	NC_009767	TGAG	2	8	60140	60147	25 %	25 %	50 %	0 %	156740072
141	NC_009767	CGCA	2	8	60235	60242	25 %	0 %	25 %	50 %	156740072
142	NC_009767	TGCC	2	8	60349	60356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009767	TGCC	2	8	60397	60404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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