MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 134693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009767	CAC	2	6	170531	170536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740166
4003	NC_009767	GCG	2	6	170596	170601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740166
4004	NC_009767	GGTT	2	8	170616	170623	0 %	50 %	50 %	0 %	156740166
4005	NC_009767	CTG	2	6	170655	170660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740166
4006	NC_009767	CAG	2	6	170670	170675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740166
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4010	NC_009767	GC	3	6	170892	170897	0 %	0 %	50 %	50 %	156740166
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4013	NC_009767	GCC	2	6	171006	171011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740166
4014	NC_009767	GTT	2	6	171019	171024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740166
4015	NC_009767	TGG	2	6	171031	171036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740166
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4018	NC_009767	CTG	2	6	171317	171322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740166
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4022	NC_009767	ATTG	2	8	171418	171425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_009767	CT	3	6	171428	171433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4025	NC_009767	AAT	2	6	171562	171567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_009767	ACG	2	6	171632	171637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740167
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4093	NC_009767	GC	4	8	174500	174507	0 %	0 %	50 %	50 %	156740169
4094	NC_009767	GAC	2	6	174522	174527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740169
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4103	NC_009767	TGA	2	6	174973	174978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740169
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4105	NC_009767	ACG	2	6	175001	175006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740169
4106	NC_009767	ATCGTG	2	12	175113	175124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156740169
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4112	NC_009767	CAA	2	6	175254	175259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740169
4113	NC_009767	CCGCA	2	10	175267	175276	20 %	0 %	20 %	60 %	156740169
4114	NC_009767	TGC	2	6	175369	175374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740169
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4119	NC_009767	TG	3	6	175523	175528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_009767	GCG	2	6	175545	175550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4359	NC_009767	CAT	2	6	185565	185570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740178
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4401	NC_009767	GC	3	6	187607	187612	0 %	0 %	50 %	50 %	156740179
4402	NC_009767	GAC	2	6	187683	187688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740179
4403	NC_009767	CGACA	2	10	187753	187762	40 %	0 %	20 %	40 %	156740179
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4438	NC_009767	GTCCT	2	10	189169	189178	0 %	40 %	20 %	40 %	156740179
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4446	NC_009767	ACA	2	6	189502	189507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4451	NC_009767	GCTGC	2	10	189740	189749	0 %	20 %	40 %	40 %	156740180
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4455	NC_009767	CAG	2	6	189811	189816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740180
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4459	NC_009767	GAA	2	6	189964	189969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740180
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4478	NC_009767	TGCC	2	8	190672	190679	0 %	25 %	25 %	50 %	156740181
4479	NC_009767	CG	3	6	190731	190736	0 %	0 %	50 %	50 %	156740181
4480	NC_009767	GCT	2	6	190752	190757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740181
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4487	NC_009767	ATG	2	6	191084	191089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740181
4488	NC_009767	TGGCA	2	10	191132	191141	20 %	20 %	40 %	20 %	156740181
4489	NC_009767	CCA	2	6	191171	191176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740181
4490	NC_009767	GCT	2	6	191196	191201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740181
4491	NC_009767	CGA	2	6	191259	191264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740181
4492	NC_009767	AC	3	6	191300	191305	50 %	0 %	0 %	50 %	156740181
4493	NC_009767	CA	3	6	191335	191340	50 %	0 %	0 %	50 %	156740181
4494	NC_009767	GTT	2	6	191349	191354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740181
4495	NC_009767	CGG	2	6	191427	191432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740181
4496	NC_009767	TTCC	2	8	191453	191460	0 %	50 %	0 %	50 %	156740181
4497	NC_009767	GTCGGT	2	12	191478	191489	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	156740181
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4499	NC_009767	GAT	2	6	191524	191529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740181
4500	NC_009767	TCACA	2	10	191531	191540	40 %	20 %	0 %	40 %	156740181

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