MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 134693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_009767	AGCC	2	8	148361	148368	25 %	0 %	25 %	50 %	156740149
3503	NC_009767	AAT	2	6	148374	148379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156740149
3504	NC_009767	CGA	2	6	148388	148393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740149
3505	NC_009767	CTGG	2	8	148412	148419	0 %	25 %	50 %	25 %	156740149
3506	NC_009767	GCGCC	2	10	148449	148458	0 %	0 %	40 %	60 %	156740149
3507	NC_009767	CAG	2	6	148476	148481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740149
3508	NC_009767	GC	3	6	148498	148503	0 %	0 %	50 %	50 %	156740149
3509	NC_009767	TGC	2	6	148514	148519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740149
3510	NC_009767	GAA	2	6	148653	148658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740149
3511	NC_009767	CTG	2	6	148665	148670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740149
3512	NC_009767	CG	3	6	148691	148696	0 %	0 %	50 %	50 %	156740149
3513	NC_009767	GC	3	6	148708	148713	0 %	0 %	50 %	50 %	156740149
3514	NC_009767	GCG	2	6	148734	148739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740149
3515	NC_009767	CG	5	10	148748	148757	0 %	0 %	50 %	50 %	156740149
3516	NC_009767	GCC	2	6	148804	148809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740149
3517	NC_009767	GGC	2	6	148872	148877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740149
3518	NC_009767	GAC	2	6	148887	148892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740149
3519	NC_009767	GC	3	6	148950	148955	0 %	0 %	50 %	50 %	156740149
3520	NC_009767	ACC	2	6	148990	148995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740149
3521	NC_009767	ATCG	2	8	149049	149056	25 %	25 %	25 %	25 %	156740149
3522	NC_009767	GT	3	6	149086	149091	0 %	50 %	50 %	0 %	156740149
3523	NC_009767	TCC	2	6	149112	149117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_009767	ACAAG	2	10	149122	149131	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3525	NC_009767	GTA	2	6	149250	149255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009767	AGA	2	6	149289	149294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_009767	GAAAA	2	10	149369	149378	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_009767	CG	3	6	149477	149482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_009767	G	10	10	149619	149628	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_009767	AGC	2	6	149650	149655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_009767	GGC	2	6	149656	149661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_009767	TCC	2	6	149669	149674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_009767	AC	3	6	149685	149690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_009767	GAG	2	6	149738	149743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_009767	A	7	7	149785	149791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_009767	ATA	2	6	149797	149802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_009767	GCA	2	6	149867	149872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_009767	TTCG	2	8	149912	149919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_009767	TCG	2	6	150028	150033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740150
3540	NC_009767	GC	5	10	150046	150055	0 %	0 %	50 %	50 %	156740150
3541	NC_009767	CG	5	10	150056	150065	0 %	0 %	50 %	50 %	156740150
3542	NC_009767	GCTG	2	8	150113	150120	0 %	25 %	50 %	25 %	156740150
3543	NC_009767	GCT	2	6	150133	150138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740150
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3547	NC_009767	TCG	2	6	150230	150235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740150
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3550	NC_009767	GCT	2	6	150318	150323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740150
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3553	NC_009767	GCC	2	6	150428	150433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740150
3554	NC_009767	C	6	6	150503	150508	0 %	0 %	0 %	100 %	156740150
3555	NC_009767	CTG	2	6	150544	150549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740150
3556	NC_009767	GTGAG	2	10	150578	150587	20 %	20 %	60 %	0 %	156740150
3557	NC_009767	CGGCG	2	10	150588	150597	0 %	0 %	60 %	40 %	156740150
3558	NC_009767	TGC	2	6	150608	150613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740150
3559	NC_009767	CGA	2	6	150666	150671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740150
3560	NC_009767	GGC	3	9	150702	150710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740150
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3563	NC_009767	ATG	2	6	150800	150805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740150
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3565	NC_009767	CGCTGG	2	12	150830	150841	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156740150
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3567	NC_009767	ATG	3	9	150860	150868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740150
3568	NC_009767	TGA	2	6	150933	150938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740150
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3573	NC_009767	GC	3	6	151102	151107	0 %	0 %	50 %	50 %	156740150
3574	NC_009767	GAT	2	6	151114	151119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740150
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3579	NC_009767	CGGCGC	2	12	151326	151337	0 %	0 %	50 %	50 %	156740150
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3588	NC_009767	GCGCA	2	10	151618	151627	20 %	0 %	40 %	40 %	156740150
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3591	NC_009767	ACT	2	6	151721	151726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740150
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3594	NC_009767	TGC	2	6	151797	151802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740150
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3597	NC_009767	GCC	2	6	151957	151962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740150
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3604	NC_009767	ATC	2	6	152214	152219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740150
3605	NC_009767	TCAAC	2	10	152222	152231	40 %	20 %	0 %	40 %	156740150
3606	NC_009767	CG	3	6	152241	152246	0 %	0 %	50 %	50 %	156740150
3607	NC_009767	CCG	2	6	152272	152277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740150
3608	NC_009767	CG	3	6	152316	152321	0 %	0 %	50 %	50 %	156740150
3609	NC_009767	GAG	2	6	152368	152373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_009767	CGC	2	6	152473	152478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_009767	CTCGC	2	10	152633	152642	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3612	NC_009767	C	6	6	152924	152929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3613	NC_009767	GAGAG	2	10	153061	153070	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_009767	GAAG	2	8	153121	153128	50 %	0 %	50 %	0 %	156740151
3615	NC_009767	ACA	2	6	153156	153161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740151
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3617	NC_009767	GC	3	6	153232	153237	0 %	0 %	50 %	50 %	156740151
3618	NC_009767	CAA	2	6	153263	153268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740151
3619	NC_009767	CGT	2	6	153274	153279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740151
3620	NC_009767	TGG	2	6	153293	153298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740151
3621	NC_009767	AC	4	8	153342	153349	50 %	0 %	0 %	50 %	156740151
3622	NC_009767	AGA	2	6	153381	153386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740151
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3624	NC_009767	CGG	2	6	153412	153417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740151
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3993	NC_009767	TGC	2	6	170174	170179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740165
3994	NC_009767	GTTG	2	8	170245	170252	0 %	50 %	50 %	0 %	156740165
3995	NC_009767	GCGT	2	8	170280	170287	0 %	25 %	50 %	25 %	156740165
3996	NC_009767	GC	3	6	170314	170319	0 %	0 %	50 %	50 %	156740165
3997	NC_009767	GCC	2	6	170370	170375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740165
3998	NC_009767	CG	3	6	170395	170400	0 %	0 %	50 %	50 %	156740165
3999	NC_009767	GGCAT	2	10	170433	170442	20 %	20 %	40 %	20 %	156740165
4000	NC_009767	GAA	2	6	170501	170506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740166

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