MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 134693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009767	GC	3	6	127156	127161	0 %	0 %	50 %	50 %	156740131
3002	NC_009767	TGT	3	9	127337	127345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_009767	GCGT	2	8	127362	127369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_009767	A	6	6	127383	127388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_009767	AG	3	6	127439	127444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009767	GCAT	2	8	127507	127514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_009767	GGC	2	6	127520	127525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_009767	AAG	2	6	127527	127532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_009767	CTG	2	6	127540	127545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_009767	CCG	2	6	127590	127595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_009767	CGGT	2	8	127643	127650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_009767	CAT	2	6	127708	127713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_009767	GGT	2	6	127772	127777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009767	CAG	2	6	127862	127867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_009767	GCG	2	6	127898	127903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_009767	TG	3	6	127916	127921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_009767	GCG	2	6	128037	128042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_009767	CCT	2	6	128071	128076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_009767	TGC	2	6	128132	128137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_009767	GTT	2	6	128144	128149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740132
3021	NC_009767	GCT	2	6	128203	128208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740132
3022	NC_009767	CAA	2	6	128226	128231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740132
3023	NC_009767	TTG	2	6	128345	128350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740132
3024	NC_009767	TTC	2	6	128370	128375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740132
3025	NC_009767	CTG	2	6	128523	128528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_009767	CGC	2	6	128555	128560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_009767	CGG	2	6	128582	128587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_009767	GGC	2	6	128612	128617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_009767	TGA	2	6	128637	128642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009767	GGA	2	6	128663	128668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009767	TGC	2	6	128712	128717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740133
3032	NC_009767	GC	3	6	128743	128748	0 %	0 %	50 %	50 %	156740133
3033	NC_009767	GCC	2	6	128754	128759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740133
3034	NC_009767	TGA	2	6	128806	128811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740133
3035	NC_009767	CAG	3	9	128861	128869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740133
3036	NC_009767	TGCGC	2	10	128971	128980	0 %	20 %	40 %	40 %	156740133
3037	NC_009767	AGC	2	6	128997	129002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740133
3038	NC_009767	TGA	2	6	129067	129072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009767	CAA	2	6	129175	129180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_009767	AC	3	6	129204	129209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_009767	AGG	2	6	129235	129240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_009767	TGC	2	6	129275	129280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740134
3043	NC_009767	TGT	2	6	129309	129314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740134
3044	NC_009767	ATC	2	6	129328	129333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740134
3045	NC_009767	TCA	2	6	129335	129340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740134
3046	NC_009767	CGC	2	6	129390	129395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740134
3047	NC_009767	CTA	2	6	129438	129443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740134
3048	NC_009767	TTCACG	2	12	129496	129507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156740134
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3050	NC_009767	GC	3	6	129534	129539	0 %	0 %	50 %	50 %	156740134
3051	NC_009767	CTTC	2	8	129567	129574	0 %	50 %	0 %	50 %	156740134
3052	NC_009767	GAC	2	6	129606	129611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740134
3053	NC_009767	CAGC	2	8	129659	129666	25 %	0 %	25 %	50 %	156740134
3054	NC_009767	TAC	2	6	129729	129734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740134
3055	NC_009767	TGC	2	6	129764	129769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740134
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3057	NC_009767	GAT	2	6	129840	129845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740134
3058	NC_009767	GGC	2	6	129856	129861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740134
3059	NC_009767	GGT	2	6	129894	129899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740134
3060	NC_009767	GCT	2	6	129999	130004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740134
3061	NC_009767	ATC	2	6	130006	130011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740134
3062	NC_009767	TCG	2	6	130046	130051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740134
3063	NC_009767	AAGTTC	2	12	130063	130074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156740134
3064	NC_009767	TGC	2	6	130112	130117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740134
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3068	NC_009767	TGG	2	6	130494	130499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740134
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3070	NC_009767	TTG	2	6	130528	130533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740134
3071	NC_009767	GAC	2	6	130558	130563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740134
3072	NC_009767	GCC	3	9	130567	130575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740134
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3083	NC_009767	GTCGT	2	10	131071	131080	0 %	40 %	40 %	20 %	156740134
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3088	NC_009767	CTG	2	6	131436	131441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740135
3089	NC_009767	TGC	2	6	131470	131475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740135
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3091	NC_009767	GACCG	2	10	131537	131546	20 %	0 %	40 %	40 %	156740135
3092	NC_009767	CT	3	6	131581	131586	0 %	50 %	0 %	50 %	156740135
3093	NC_009767	CGG	4	12	131655	131666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740135
3094	NC_009767	TGATC	2	10	131681	131690	20 %	40 %	20 %	20 %	156740135
3095	NC_009767	GC	3	6	131843	131848	0 %	0 %	50 %	50 %	156740135
3096	NC_009767	ATC	2	6	131976	131981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740135
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3099	NC_009767	GCC	2	6	132039	132044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740135
3100	NC_009767	GAC	2	6	132068	132073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740135
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3104	NC_009767	TGA	2	6	132394	132399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740135
3105	NC_009767	TGG	2	6	132412	132417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740135
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3107	NC_009767	ACG	2	6	132571	132576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740135
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3109	NC_009767	GGC	2	6	132586	132591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740135
3110	NC_009767	ACGC	2	8	132639	132646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_009767	CCA	2	6	132681	132686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_009767	TG	3	6	132771	132776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_009767	CGA	2	6	132850	132855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_009767	GCG	2	6	132858	132863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_009767	GGAGA	2	10	132873	132882	40 %	0 %	60 %	0 %	156740136
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3118	NC_009767	TGGT	2	8	132994	133001	0 %	50 %	50 %	0 %	156740136
3119	NC_009767	TGG	2	6	133051	133056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740136
3120	NC_009767	GCCT	2	8	133065	133072	0 %	25 %	25 %	50 %	156740136
3121	NC_009767	ACG	2	6	133197	133202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740136
3122	NC_009767	GAC	2	6	133214	133219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740136
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3124	NC_009767	TGGC	2	8	133278	133285	0 %	25 %	50 %	25 %	156740136
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3248	NC_009767	CGA	2	6	138743	138748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740140
3249	NC_009767	CGG	2	6	138751	138756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740140
3250	NC_009767	TGC	2	6	138825	138830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740140
3251	NC_009767	AGC	3	9	138832	138840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740140
3252	NC_009767	CG	3	6	138887	138892	0 %	0 %	50 %	50 %	156740140
3253	NC_009767	GC	3	6	138898	138903	0 %	0 %	50 %	50 %	156740140
3254	NC_009767	AC	3	6	138920	138925	50 %	0 %	0 %	50 %	156740140
3255	NC_009767	GCA	2	6	139045	139050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_009767	ACCA	2	8	139084	139091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_009767	GAA	2	6	139200	139205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_009767	TGG	2	6	139218	139223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_009767	ATC	2	6	139282	139287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_009767	AAG	2	6	139293	139298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_009767	GAT	2	6	139324	139329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_009767	GGC	2	6	139361	139366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740141
3263	NC_009767	GCT	2	6	139367	139372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740141
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3271	NC_009767	TCG	2	6	139622	139627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3272	NC_009767	GCT	2	6	139628	139633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3273	NC_009767	TTC	2	6	139640	139645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3274	NC_009767	GCC	2	6	139651	139656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3275	NC_009767	GCA	2	6	139692	139697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740142
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3282	NC_009767	CGG	2	6	139861	139866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740142
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3285	NC_009767	TCG	2	6	139956	139961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740142
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3289	NC_009767	GCT	2	6	140234	140239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740142
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3338	NC_009767	CT	3	6	142562	142567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3339	NC_009767	AAC	2	6	142583	142588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740145
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3350	NC_009767	CTC	2	6	142934	142939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3351	NC_009767	GC	3	6	142952	142957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3352	NC_009767	GC	3	6	142960	142965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3353	NC_009767	GC	3	6	143013	143018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3354	NC_009767	GC	3	6	143021	143026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3355	NC_009767	GCG	2	6	143029	143034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3356	NC_009767	CG	3	6	143051	143056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3357	NC_009767	CG	3	6	143065	143070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3358	NC_009767	CATC	2	8	143076	143083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3359	NC_009767	C	7	7	143087	143093	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3360	NC_009767	TG	3	6	143127	143132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_009767	CAC	2	6	143211	143216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3362	NC_009767	CAC	2	6	143218	143223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3363	NC_009767	ACC	2	6	143224	143229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3364	NC_009767	GCA	2	6	143306	143311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740146
3365	NC_009767	ATT	2	6	143313	143318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156740146
3366	NC_009767	GAT	2	6	143412	143417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740146
3367	NC_009767	CGG	2	6	143447	143452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740146
3368	NC_009767	GGC	2	6	143536	143541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740146
3369	NC_009767	GATATC	2	12	143613	143624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156740146
3370	NC_009767	TCA	2	6	143716	143721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740146
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3372	NC_009767	CG	4	8	143747	143754	0 %	0 %	50 %	50 %	156740146
3373	NC_009767	TGA	2	6	143765	143770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740146
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3495	NC_009767	GCC	2	6	148140	148145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740149
3496	NC_009767	GCG	2	6	148157	148162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740149
3497	NC_009767	CGC	2	6	148202	148207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740149
3498	NC_009767	AGCGC	2	10	148232	148241	20 %	0 %	40 %	40 %	156740149
3499	NC_009767	CCG	2	6	148256	148261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740149
3500	NC_009767	CGT	2	6	148278	148283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740149

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