MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 134693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009767	CCGCC	2	10	23488	23497	0 %	0 %	20 %	80 %	156740048
502	NC_009767	GTC	2	6	23512	23517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740048
503	NC_009767	GCG	2	6	23536	23541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740048
504	NC_009767	TTG	2	6	23572	23577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740048
505	NC_009767	ACT	2	6	23654	23659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_009767	TCTG	2	8	23697	23704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_009767	GAGC	2	8	23721	23728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_009767	AGC	2	6	23925	23930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_009767	GC	3	6	23929	23934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_009767	AGC	2	6	24212	24217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_009767	AGCGA	2	10	24267	24276	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
512	NC_009767	CGCTA	2	10	24403	24412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
513	NC_009767	CGCTA	2	10	24472	24481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
514	NC_009767	GC	3	6	24875	24880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_009767	TC	3	6	25031	25036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_009767	CTCGC	2	10	25087	25096	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
517	NC_009767	GCA	2	6	25350	25355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009767	TGGA	2	8	25434	25441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009767	CTT	2	6	25505	25510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009767	CA	3	6	25526	25531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_009767	CA	3	6	25554	25559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_009767	CAG	2	6	25668	25673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009767	TCT	2	6	25717	25722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_009767	CGC	3	9	25726	25734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_009767	ACCA	2	8	25777	25784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_009767	CACC	2	8	25875	25882	25 %	0 %	0 %	75 %	156740049
527	NC_009767	CGC	2	6	25897	25902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740049
528	NC_009767	CTG	2	6	25926	25931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740049
529	NC_009767	GCG	2	6	26014	26019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740049
530	NC_009767	GCC	2	6	26065	26070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740049
531	NC_009767	AGC	2	6	26115	26120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740049
532	NC_009767	GC	3	6	26134	26139	0 %	0 %	50 %	50 %	156740049
533	NC_009767	CGT	2	6	26140	26145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740049
534	NC_009767	CGC	2	6	26193	26198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740049
535	NC_009767	TGC	3	9	26227	26235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740049
536	NC_009767	ACT	2	6	26346	26351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740049
537	NC_009767	TCG	2	6	26361	26366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740049
538	NC_009767	CGCCC	2	10	26374	26383	0 %	0 %	20 %	80 %	156740049
539	NC_009767	ATC	2	6	26406	26411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740049
540	NC_009767	CGG	2	6	26412	26417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740049
541	NC_009767	GC	3	6	26419	26424	0 %	0 %	50 %	50 %	156740049
542	NC_009767	TTA	2	6	26488	26493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156740049
543	NC_009767	GAT	2	6	26498	26503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740049
544	NC_009767	CTC	2	6	26510	26515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740049
545	NC_009767	GCC	2	6	26549	26554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740049
546	NC_009767	CTG	2	6	26600	26605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740049
547	NC_009767	ACG	2	6	26619	26624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740049
548	NC_009767	GC	3	6	26636	26641	0 %	0 %	50 %	50 %	156740049
549	NC_009767	CGG	2	6	26657	26662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740049
550	NC_009767	GCG	2	6	26677	26682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740049
551	NC_009767	CAGT	2	8	26710	26717	25 %	25 %	25 %	25 %	156740049
552	NC_009767	CGA	2	6	26794	26799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740049
553	NC_009767	GCG	2	6	26825	26830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740049
554	NC_009767	GCGT	2	8	26844	26851	0 %	25 %	50 %	25 %	156740049
555	NC_009767	GCT	2	6	26884	26889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740049
556	NC_009767	ATGCCG	2	12	26913	26924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156740049
557	NC_009767	CGC	3	9	26935	26943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740049
558	NC_009767	GCT	2	6	26992	26997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740049
559	NC_009767	CTGCA	2	10	27017	27026	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
560	NC_009767	GA	3	6	27033	27038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009767	GC	3	6	27045	27050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_009767	CGG	3	9	27076	27084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_009767	AGT	2	6	27085	27090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009767	GTT	2	6	27091	27096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009767	CTC	2	6	27202	27207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_009767	CCG	2	6	27247	27252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_009767	GCA	2	6	27262	27267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_009767	GGT	2	6	27284	27289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009767	GTG	2	6	27290	27295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009767	CGG	2	6	27296	27301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_009767	TGC	2	6	27305	27310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_009767	AGA	2	6	27327	27332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009767	TCCT	2	8	27378	27385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_009767	CAT	2	6	27420	27425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740050
575	NC_009767	CAC	2	6	27442	27447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740050
576	NC_009767	GAA	2	6	27519	27524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740050
577	NC_009767	ACC	2	6	27554	27559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740050
578	NC_009767	TTC	2	6	27604	27609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740050
579	NC_009767	CCAA	2	8	27624	27631	50 %	0 %	0 %	50 %	156740050
580	NC_009767	TGG	2	6	27697	27702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740050
581	NC_009767	ATC	2	6	27742	27747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740050
582	NC_009767	CG	3	6	27760	27765	0 %	0 %	50 %	50 %	156740050
583	NC_009767	CTG	3	9	27799	27807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740050
584	NC_009767	CGG	2	6	27816	27821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740050
585	NC_009767	GCA	2	6	27830	27835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740050
586	NC_009767	CG	3	6	27990	27995	0 %	0 %	50 %	50 %	156740050
587	NC_009767	CGG	2	6	28089	28094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740050
588	NC_009767	CAC	2	6	28099	28104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740050
589	NC_009767	CGA	2	6	28122	28127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740050
590	NC_009767	GCA	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740050
591	NC_009767	TAC	2	6	28198	28203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740050
592	NC_009767	CGGT	2	8	28207	28214	0 %	25 %	50 %	25 %	156740050
593	NC_009767	CCG	2	6	28318	28323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740050
594	NC_009767	CCGCA	2	10	28333	28342	20 %	0 %	20 %	60 %	156740050
595	NC_009767	AGG	2	6	28415	28420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009767	CGT	2	6	28425	28430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_009767	CTT	2	6	28448	28453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_009767	TGC	2	6	28468	28473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_009767	CGG	2	6	28478	28483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_009767	GC	3	6	28529	28534	0 %	0 %	50 %	50 %	156740051
601	NC_009767	CCAT	2	8	28535	28542	25 %	25 %	0 %	50 %	156740051
602	NC_009767	GCG	2	6	28548	28553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740051
603	NC_009767	CAG	2	6	28645	28650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740051
604	NC_009767	ATC	2	6	28676	28681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740051
605	NC_009767	CAA	2	6	28701	28706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740051
606	NC_009767	GCG	2	6	28761	28766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740051
607	NC_009767	GCGCA	2	10	28816	28825	20 %	0 %	40 %	40 %	156740051
608	NC_009767	AGC	2	6	28829	28834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740051
609	NC_009767	TCC	2	6	28838	28843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740051
610	NC_009767	CAC	2	6	28882	28887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740051
611	NC_009767	ATCG	2	8	28900	28907	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
612	NC_009767	AGC	2	6	28931	28936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740051
613	NC_009767	CGC	2	6	29029	29034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740051
614	NC_009767	GC	4	8	29033	29040	0 %	0 %	50 %	50 %	156740051
615	NC_009767	CAC	2	6	29080	29085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740051
616	NC_009767	CGA	2	6	29109	29114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740051
617	NC_009767	CCA	2	6	29115	29120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740051
618	NC_009767	GC	3	6	29128	29133	0 %	0 %	50 %	50 %	156740051
619	NC_009767	CAC	2	6	29158	29163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740051
620	NC_009767	CA	3	6	29245	29250	50 %	0 %	0 %	50 %	156740051
621	NC_009767	GATAAT	2	12	29308	29319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156740051
622	NC_009767	GCCGC	2	10	29382	29391	0 %	0 %	40 %	60 %	156740051
623	NC_009767	CAC	2	6	29437	29442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740051
624	NC_009767	GC	3	6	29585	29590	0 %	0 %	50 %	50 %	156740051
625	NC_009767	CGA	2	6	29625	29630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740051
626	NC_009767	AGC	2	6	29642	29647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740051
627	NC_009767	GATC	2	8	29661	29668	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
628	NC_009767	CGAT	2	8	29694	29701	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
629	NC_009767	AAC	2	6	29708	29713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740051
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631	NC_009767	ATG	2	6	29755	29760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740051
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