MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009523	TCA	2	6	152600	152605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654313
3502	NC_009523	TCC	2	6	152835	152840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654313
3503	NC_009523	ACT	2	6	152918	152923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654313
3504	NC_009523	TGG	2	6	152938	152943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654313
3505	NC_009523	GTG	2	6	152980	152985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654313
3506	NC_009523	TGC	2	6	152998	153003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3507	NC_009523	GCG	2	6	153033	153038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
3508	NC_009523	GC	3	6	153099	153104	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3509	NC_009523	GGC	2	6	153111	153116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
3510	NC_009523	TTG	2	6	153160	153165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654313
3511	NC_009523	GCAG	2	8	153168	153175	25 %	0 %	50 %	25 %	148654313
3512	NC_009523	TGG	2	6	153176	153181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654313
3513	NC_009523	TGC	2	6	153258	153263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3514	NC_009523	CGA	2	6	153343	153348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3515	NC_009523	GCA	2	6	153363	153368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3516	NC_009523	GC	3	6	153381	153386	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3517	NC_009523	CGC	2	6	153419	153424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654313
3518	NC_009523	CGC	2	6	153436	153441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654313
3519	NC_009523	TGC	2	6	153449	153454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3520	NC_009523	TTG	2	6	153461	153466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654313
3521	NC_009523	GC	3	6	153513	153518	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3522	NC_009523	CGG	2	6	153522	153527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
3523	NC_009523	CTG	2	6	153532	153537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3524	NC_009523	AGC	2	6	153565	153570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3525	NC_009523	TGAACC	2	12	153597	153608	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148654313
3526	NC_009523	GCTGC	2	10	153655	153664	0 %	20 %	40 %	40 %	148654313
3527	NC_009523	ACCT	2	8	153721	153728	25 %	25 %	0 %	50 %	148654313
3528	NC_009523	ACA	2	6	153758	153763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654313
3529	NC_009523	CTG	2	6	153775	153780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3530	NC_009523	ACCTG	2	10	153840	153849	20 %	20 %	20 %	40 %	148654313
3531	NC_009523	GCC	2	6	153888	153893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654313
3532	NC_009523	GTG	2	6	153898	153903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654313
3533	NC_009523	CGA	2	6	153924	153929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3534	NC_009523	TGCC	2	8	153973	153980	0 %	25 %	25 %	50 %	148654313
3535	NC_009523	GCT	2	6	154008	154013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3536	NC_009523	GC	3	6	154037	154042	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3537	NC_009523	CA	3	6	154124	154129	50 %	0 %	0 %	50 %	148654313
3538	NC_009523	CGC	2	6	154137	154142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654313
3539	NC_009523	CGG	2	6	154150	154155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
3540	NC_009523	CTG	2	6	154243	154248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3541	NC_009523	GCTG	2	8	154257	154264	0 %	25 %	50 %	25 %	148654313
3542	NC_009523	TC	3	6	154310	154315	0 %	50 %	0 %	50 %	148654313
3543	NC_009523	G	7	7	154347	154353	0 %	0 %	100 %	0 %	148654313
3544	NC_009523	CGC	2	6	154440	154445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654313
3545	NC_009523	GTG	2	6	154482	154487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654313
3546	NC_009523	CAAC	2	8	154513	154520	50 %	0 %	0 %	50 %	148654313
3547	NC_009523	GCG	2	6	154585	154590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
3548	NC_009523	GAC	2	6	154600	154605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3549	NC_009523	GCG	2	6	154647	154652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
3550	NC_009523	GCA	2	6	154734	154739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3551	NC_009523	TGGC	2	8	154750	154757	0 %	25 %	50 %	25 %	148654313
3552	NC_009523	CTG	2	6	154777	154782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3553	NC_009523	AAC	2	6	154898	154903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654313
3554	NC_009523	GGGC	2	8	154927	154934	0 %	0 %	75 %	25 %	148654313
3555	NC_009523	CGG	2	6	154956	154961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
3556	NC_009523	CGT	2	6	154975	154980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3557	NC_009523	GCT	2	6	154987	154992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
3558	NC_009523	GC	3	6	155019	155024	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3559	NC_009523	GC	3	6	155034	155039	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3560	NC_009523	GGC	3	9	155055	155063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
3561	NC_009523	GAG	2	6	155074	155079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654313
3562	NC_009523	GCGG	2	8	155082	155089	0 %	0 %	75 %	25 %	148654313
3563	NC_009523	GC	3	6	155118	155123	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3564	NC_009523	GC	3	6	155147	155152	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3565	NC_009523	GCGG	2	8	155157	155164	0 %	0 %	75 %	25 %	148654313
3566	NC_009523	GAG	2	6	155173	155178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654313
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3568	NC_009523	CGA	2	6	155211	155216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654313
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3570	NC_009523	GC	3	6	155246	155251	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3571	NC_009523	GGC	3	9	155253	155261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
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3574	NC_009523	GC	3	6	155316	155321	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3575	NC_009523	GC	3	6	155345	155350	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3576	NC_009523	GAC	2	6	155371	155376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654313
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3578	NC_009523	GC	3	6	155444	155449	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
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3582	NC_009523	CGG	2	6	155489	155494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
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3587	NC_009523	GCGG	2	8	155577	155584	0 %	0 %	75 %	25 %	148654313
3588	NC_009523	CGG	2	6	155588	155593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
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3590	NC_009523	GC	3	6	155642	155647	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3591	NC_009523	GGC	3	9	155649	155657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
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3593	NC_009523	GCGCA	2	10	155674	155683	20 %	0 %	40 %	40 %	148654313
3594	NC_009523	GCGG	2	8	155697	155704	0 %	0 %	75 %	25 %	148654313
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3603	NC_009523	TGC	2	6	155843	155848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654313
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3605	NC_009523	GGC	3	9	155868	155876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
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3608	NC_009523	GC	3	6	155931	155936	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
3609	NC_009523	GC	3	6	155960	155965	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
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3623	NC_009523	GCGG	2	8	156192	156199	0 %	0 %	75 %	25 %	148654313
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3700	NC_009523	GC	3	6	157572	157577	0 %	0 %	50 %	50 %	148654313
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3703	NC_009523	GCGCAG	2	12	157645	157656	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654313
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3705	NC_009523	GGC	2	6	157723	157728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654313
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3707	NC_009523	GCCT	2	8	157804	157811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3708	NC_009523	GC	3	6	157857	157862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3711	NC_009523	T	6	6	157879	157884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3712	NC_009523	TGA	2	6	157890	157895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3714	NC_009523	AGCGC	2	10	157964	157973	20 %	0 %	40 %	40 %	148654314
3715	NC_009523	TGG	2	6	157995	158000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654314
3716	NC_009523	CTT	2	6	158012	158017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654314
3717	NC_009523	CGC	2	6	158020	158025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654314
3718	NC_009523	CCGC	2	8	158039	158046	0 %	0 %	25 %	75 %	148654314
3719	NC_009523	GCC	3	9	158063	158071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654314
3720	NC_009523	TTG	2	6	158223	158228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654314
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3726	NC_009523	ACG	2	6	158425	158430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654314
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3730	NC_009523	TCA	2	6	158620	158625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654314
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3732	NC_009523	GAT	2	6	158685	158690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654314
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3739	NC_009523	TCAG	2	8	159016	159023	25 %	25 %	25 %	25 %	148654314
3740	NC_009523	CGG	2	6	159026	159031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654314
3741	NC_009523	GTC	2	6	159036	159041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654314
3742	NC_009523	CTC	2	6	159048	159053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654314
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3744	NC_009523	GCG	2	6	159102	159107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654314
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3746	NC_009523	CTGG	2	8	159164	159171	0 %	25 %	50 %	25 %	148654314
3747	NC_009523	TGG	2	6	159207	159212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654314
3748	NC_009523	GAT	2	6	159251	159256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654314
3749	NC_009523	CGA	2	6	159269	159274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654314
3750	NC_009523	CGA	2	6	159371	159376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654314
3751	NC_009523	GCG	2	6	159389	159394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654314
3752	NC_009523	CGA	2	6	159403	159408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654314
3753	NC_009523	TTC	2	6	159438	159443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654314
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3755	NC_009523	ATG	4	12	159456	159467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654314
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3762	NC_009523	GCTG	2	8	159779	159786	0 %	25 %	50 %	25 %	148654314
3763	NC_009523	CG	3	6	159964	159969	0 %	0 %	50 %	50 %	148654314
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3771	NC_009523	CG	3	6	160292	160297	0 %	0 %	50 %	50 %	148654314
3772	NC_009523	CGA	2	6	160313	160318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654314
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3780	NC_009523	CGG	2	6	160651	160656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654315
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3803	NC_009523	TAG	2	6	161693	161698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3850	NC_009523	GCTCT	2	10	163270	163279	0 %	40 %	20 %	40 %	148654317
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3855	NC_009523	TGC	2	6	163352	163357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654317
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3999	NC_009523	GCG	2	6	170127	170132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654319
4000	NC_009523	CG	3	6	170131	170136	0 %	0 %	50 %	50 %	148654319

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