MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009523	CGG	2	6	109950	109955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654279
2502	NC_009523	GCG	2	6	110060	110065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654279
2503	NC_009523	GCA	2	6	110079	110084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654279
2504	NC_009523	CCGC	2	8	110107	110114	0 %	0 %	25 %	75 %	148654279
2505	NC_009523	TGCC	2	8	110134	110141	0 %	25 %	25 %	50 %	148654279
2506	NC_009523	GC	3	6	110162	110167	0 %	0 %	50 %	50 %	148654279
2507	NC_009523	CGG	2	6	110296	110301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654279
2508	NC_009523	GC	3	6	110348	110353	0 %	0 %	50 %	50 %	148654279
2509	NC_009523	ATA	2	6	110416	110421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654279
2510	NC_009523	ACTC	2	8	110502	110509	25 %	25 %	0 %	50 %	148654279
2511	NC_009523	GC	3	6	110612	110617	0 %	0 %	50 %	50 %	148654279
2512	NC_009523	CGG	3	9	110667	110675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654279
2513	NC_009523	CGG	2	6	110683	110688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654279
2514	NC_009523	CGC	2	6	110689	110694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654279
2515	NC_009523	ATC	2	6	110722	110727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654279
2516	NC_009523	TGA	2	6	110781	110786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654279
2517	NC_009523	AAC	2	6	110806	110811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654279
2518	NC_009523	CAG	2	6	110962	110967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654279
2519	NC_009523	GC	3	6	110987	110992	0 %	0 %	50 %	50 %	148654279
2520	NC_009523	CGG	2	6	111028	111033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654279
2521	NC_009523	ATC	2	6	111050	111055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654279
2522	NC_009523	CGC	2	6	111070	111075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654279
2523	NC_009523	TGG	2	6	111099	111104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654279
2524	NC_009523	GGTCGG	2	12	111139	111150	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148654279
2525	NC_009523	AGC	2	6	111200	111205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654279
2526	NC_009523	GCG	2	6	111218	111223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654279
2527	NC_009523	GCA	2	6	111428	111433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654280
2528	NC_009523	GC	3	6	111466	111471	0 %	0 %	50 %	50 %	148654280
2529	NC_009523	GCA	2	6	111475	111480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654280
2530	NC_009523	ATG	2	6	111481	111486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654280
2531	NC_009523	GCG	2	6	111551	111556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654280
2532	NC_009523	GC	3	6	111618	111623	0 %	0 %	50 %	50 %	148654280
2533	NC_009523	ACGGG	2	10	111654	111663	20 %	0 %	60 %	20 %	148654280
2534	NC_009523	GCG	2	6	111677	111682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654280
2535	NC_009523	TGC	2	6	111726	111731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654280
2536	NC_009523	GCG	2	6	111761	111766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654280
2537	NC_009523	TGG	2	6	111773	111778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654280
2538	NC_009523	TTGC	2	8	111820	111827	0 %	50 %	25 %	25 %	148654280
2539	NC_009523	CCG	2	6	111831	111836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654280
2540	NC_009523	ATGC	2	8	111854	111861	25 %	25 %	25 %	25 %	148654280
2541	NC_009523	G	7	7	111871	111877	0 %	0 %	100 %	0 %	148654280
2542	NC_009523	GTG	2	6	111911	111916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654280
2543	NC_009523	TGC	2	6	111938	111943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654280
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2545	NC_009523	CCG	2	6	111971	111976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654280
2546	NC_009523	AGG	2	6	112046	112051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654280
2547	NC_009523	CGG	2	6	112062	112067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654280
2548	NC_009523	GAG	2	6	112099	112104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654280
2549	NC_009523	CAATAT	2	12	112230	112241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148654280
2550	NC_009523	CCG	2	6	112267	112272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654280
2551	NC_009523	GCC	2	6	112366	112371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654280
2552	NC_009523	CCCG	2	8	112416	112423	0 %	0 %	25 %	75 %	148654280
2553	NC_009523	CGA	2	6	112437	112442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654280
2554	NC_009523	AT	3	6	112476	112481	50 %	50 %	0 %	0 %	148654280
2555	NC_009523	GC	3	6	112582	112587	0 %	0 %	50 %	50 %	148654280
2556	NC_009523	CGAA	2	8	112610	112617	50 %	0 %	25 %	25 %	148654280
2557	NC_009523	GCA	2	6	112650	112655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654280
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2560	NC_009523	TCT	2	6	112787	112792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654281
2561	NC_009523	GCA	2	6	112809	112814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2562	NC_009523	CGG	2	6	112837	112842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654281
2563	NC_009523	GCC	2	6	112854	112859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654281
2564	NC_009523	CGA	2	6	112882	112887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2565	NC_009523	GCCT	2	8	112946	112953	0 %	25 %	25 %	50 %	148654281
2566	NC_009523	TGCGC	2	10	112980	112989	0 %	20 %	40 %	40 %	148654281
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2568	NC_009523	TGCG	2	8	113045	113052	0 %	25 %	50 %	25 %	148654281
2569	NC_009523	GCGCTG	2	12	113058	113069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654281
2570	NC_009523	GCT	2	6	113120	113125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2571	NC_009523	TCG	2	6	113137	113142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2572	NC_009523	CGCTGG	2	12	113143	113154	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654281
2573	NC_009523	CG	3	6	113163	113168	0 %	0 %	50 %	50 %	148654281
2574	NC_009523	GC	3	6	113181	113186	0 %	0 %	50 %	50 %	148654281
2575	NC_009523	GCG	2	6	113211	113216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654281
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2579	NC_009523	CG	3	6	113331	113336	0 %	0 %	50 %	50 %	148654281
2580	NC_009523	GTG	2	6	113486	113491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654281
2581	NC_009523	TGG	2	6	113497	113502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654281
2582	NC_009523	CTG	2	6	113505	113510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2583	NC_009523	GCG	2	6	113515	113520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654281
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2586	NC_009523	GGCGT	2	10	113619	113628	0 %	20 %	60 %	20 %	148654281
2587	NC_009523	CGT	2	6	113633	113638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654281
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2589	NC_009523	TGC	2	6	113722	113727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2590	NC_009523	TGC	3	9	113770	113778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2591	NC_009523	TCGGCG	2	12	113794	113805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654281
2592	NC_009523	CCG	2	6	113819	113824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654281
2593	NC_009523	TGGGG	2	10	113890	113899	0 %	20 %	80 %	0 %	148654281
2594	NC_009523	AGC	2	6	113926	113931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2595	NC_009523	TGC	2	6	113974	113979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654281
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2597	NC_009523	TGG	2	6	114040	114045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654281
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2599	NC_009523	TGT	2	6	114074	114079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654281
2600	NC_009523	GAT	2	6	114090	114095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654281
2601	NC_009523	ACG	2	6	114116	114121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2602	NC_009523	CGA	2	6	114194	114199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654281
2603	NC_009523	CAG	2	6	114247	114252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_009523	TTC	2	6	114310	114315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_009523	TCG	2	6	114373	114378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654282
2606	NC_009523	AGC	2	6	114400	114405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654282
2607	NC_009523	CAG	2	6	114483	114488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654282
2608	NC_009523	GC	3	6	114516	114521	0 %	0 %	50 %	50 %	148654282
2609	NC_009523	CGA	2	6	114545	114550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654282
2610	NC_009523	GC	3	6	114553	114558	0 %	0 %	50 %	50 %	148654282
2611	NC_009523	GC	3	6	114630	114635	0 %	0 %	50 %	50 %	148654282
2612	NC_009523	CGG	2	6	114649	114654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654282
2613	NC_009523	GAG	2	6	114723	114728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654282
2614	NC_009523	GCG	2	6	114733	114738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654282
2615	NC_009523	CGT	2	6	114765	114770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654282
2616	NC_009523	GCACC	2	10	114806	114815	20 %	0 %	20 %	60 %	148654282
2617	NC_009523	CG	3	6	114845	114850	0 %	0 %	50 %	50 %	148654282
2618	NC_009523	CGC	3	9	114863	114871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654282
2619	NC_009523	CG	3	6	114915	114920	0 %	0 %	50 %	50 %	148654282
2620	NC_009523	TCA	2	6	114934	114939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654282
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2622	NC_009523	CA	3	6	114963	114968	50 %	0 %	0 %	50 %	148654282
2623	NC_009523	CG	3	6	114977	114982	0 %	0 %	50 %	50 %	148654282
2624	NC_009523	CCG	2	6	114983	114988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654282
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2742	NC_009523	TGC	2	6	120121	120126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654286
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2744	NC_009523	GTC	3	9	120159	120167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654286
2745	NC_009523	CGCC	2	8	120188	120195	0 %	0 %	25 %	75 %	148654286
2746	NC_009523	CTCG	2	8	120329	120336	0 %	25 %	25 %	50 %	148654286
2747	NC_009523	CGGA	2	8	120388	120395	25 %	0 %	50 %	25 %	148654286
2748	NC_009523	CTG	2	6	120405	120410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654286
2749	NC_009523	ACG	2	6	120427	120432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654286
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2775	NC_009523	TCG	2	6	121654	121659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2778	NC_009523	GAT	2	6	121709	121714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2780	NC_009523	CTC	2	6	121801	121806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2782	NC_009523	AAGC	2	8	121828	121835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2783	NC_009523	TGCG	2	8	121891	121898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2784	NC_009523	TCA	2	6	121913	121918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654287
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2862	NC_009523	GC	4	8	125131	125138	0 %	0 %	50 %	50 %	148654290
2863	NC_009523	GTT	2	6	125143	125148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654290
2864	NC_009523	GCATG	2	10	125158	125167	20 %	20 %	40 %	20 %	148654290
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2867	NC_009523	TCA	2	6	125266	125271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654290
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2870	NC_009523	GTA	2	6	125308	125313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654291
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2979	NC_009523	CGAG	2	8	130577	130584	25 %	0 %	50 %	25 %	148654296
2980	NC_009523	A	6	6	130606	130611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2981	NC_009523	AAG	2	6	130764	130769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2982	NC_009523	GGT	2	6	130779	130784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2983	NC_009523	GC	3	6	130824	130829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2984	NC_009523	CTCGTC	2	12	130856	130867	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2985	NC_009523	AC	3	6	130899	130904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2986	NC_009523	G	7	7	131017	131023	0 %	0 %	100 %	0 %	148654297
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2988	NC_009523	GCG	2	6	131056	131061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654297
2989	NC_009523	TGGA	2	8	131111	131118	25 %	25 %	50 %	0 %	148654297
2990	NC_009523	TGA	2	6	131129	131134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654297
2991	NC_009523	AGA	2	6	131207	131212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654297
2992	NC_009523	GCC	2	6	131242	131247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654297
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