MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009523	GCC	2	6	23132	23137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654211
502	NC_009523	CCTG	2	8	23171	23178	0 %	25 %	25 %	50 %	148654211
503	NC_009523	CG	3	6	23182	23187	0 %	0 %	50 %	50 %	148654211
504	NC_009523	CAG	2	6	23191	23196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654211
505	NC_009523	AGC	2	6	23222	23227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654211
506	NC_009523	GGC	3	9	23243	23251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654211
507	NC_009523	CAG	2	6	23272	23277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654211
508	NC_009523	TCG	2	6	23289	23294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654211
509	NC_009523	CGG	2	6	23376	23381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654211
510	NC_009523	AGA	2	6	23402	23407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654211
511	NC_009523	CCG	2	6	23417	23422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654211
512	NC_009523	GCA	2	6	23436	23441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654211
513	NC_009523	ATC	2	6	23455	23460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654211
514	NC_009523	CGATA	2	10	23472	23481	40 %	20 %	20 %	20 %	148654211
515	NC_009523	GAA	2	6	23503	23508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654211
516	NC_009523	GAT	2	6	23563	23568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654211
517	NC_009523	GCG	2	6	23637	23642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654211
518	NC_009523	TCA	2	6	23654	23659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654211
519	NC_009523	CAG	2	6	23674	23679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654211
520	NC_009523	CAGCGC	2	12	23695	23706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654211
521	NC_009523	AGC	2	6	23739	23744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654211
522	NC_009523	TGC	2	6	23824	23829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654211
523	NC_009523	CAC	2	6	23878	23883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654211
524	NC_009523	CGC	2	6	23886	23891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654211
525	NC_009523	GCA	2	6	23918	23923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654211
526	NC_009523	GTTC	2	8	23937	23944	0 %	50 %	25 %	25 %	148654211
527	NC_009523	CGA	2	6	23973	23978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654211
528	NC_009523	GC	3	6	23998	24003	0 %	0 %	50 %	50 %	148654211
529	NC_009523	CAT	2	6	24031	24036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654211
530	NC_009523	CGG	2	6	24040	24045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654212
531	NC_009523	CTT	2	6	24104	24109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654212
532	NC_009523	AGA	2	6	24119	24124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654212
533	NC_009523	TCG	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654212
534	NC_009523	CGCC	2	8	24137	24144	0 %	0 %	25 %	75 %	148654212
535	NC_009523	TCCA	2	8	24165	24172	25 %	25 %	0 %	50 %	148654212
536	NC_009523	AGCC	2	8	24185	24192	25 %	0 %	25 %	50 %	148654212
537	NC_009523	TCA	2	6	24265	24270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654212
538	NC_009523	CAC	2	6	24276	24281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654212
539	NC_009523	CTG	2	6	24309	24314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654212
540	NC_009523	GGC	2	6	24326	24331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654212
541	NC_009523	TCT	2	6	24356	24361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654212
542	NC_009523	CGC	2	6	24372	24377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654212
543	NC_009523	CGC	2	6	24491	24496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654212
544	NC_009523	CAG	2	6	24515	24520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654212
545	NC_009523	GTTGCA	2	12	24554	24565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148654212
546	NC_009523	GTC	2	6	24591	24596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654212
547	NC_009523	CGC	2	6	24629	24634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654212
548	NC_009523	CGGA	2	8	24756	24763	25 %	0 %	50 %	25 %	148654212
549	NC_009523	CGGT	2	8	24780	24787	0 %	25 %	50 %	25 %	148654212
550	NC_009523	GC	3	6	24798	24803	0 %	0 %	50 %	50 %	148654212
551	NC_009523	GCC	3	9	24807	24815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654212
552	NC_009523	CTG	2	6	24898	24903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_009523	CTC	2	6	24904	24909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_009523	T	6	6	24927	24932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009523	AGA	2	6	24959	24964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009523	GAC	2	6	25110	25115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654213
557	NC_009523	GC	4	8	25127	25134	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
558	NC_009523	GAT	2	6	25150	25155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654213
559	NC_009523	GC	4	8	25163	25170	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
560	NC_009523	GC	3	6	25190	25195	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
561	NC_009523	CGC	2	6	25246	25251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
562	NC_009523	GCG	2	6	25272	25277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654213
563	NC_009523	AAT	2	6	25284	25289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654213
564	NC_009523	GCC	3	9	25336	25344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
565	NC_009523	GTT	2	6	25348	25353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654213
566	NC_009523	AGC	2	6	25355	25360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654213
567	NC_009523	CGC	2	6	25377	25382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
568	NC_009523	CAA	2	6	25434	25439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654213
569	NC_009523	GTC	2	6	25461	25466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654213
570	NC_009523	CGA	2	6	25596	25601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654213
571	NC_009523	CGC	2	6	25606	25611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
572	NC_009523	GCA	2	6	25620	25625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654213
573	NC_009523	CGT	2	6	25635	25640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654213
574	NC_009523	CAG	2	6	25644	25649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654213
575	NC_009523	TCG	2	6	25667	25672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654213
576	NC_009523	GCTTCC	2	12	25706	25717	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148654213
577	NC_009523	CGC	2	6	25836	25841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
578	NC_009523	GC	3	6	25844	25849	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
579	NC_009523	CCG	2	6	25860	25865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
580	NC_009523	CAC	3	9	25927	25935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654213
581	NC_009523	G	6	6	25939	25944	0 %	0 %	100 %	0 %	148654213
582	NC_009523	TGC	2	6	26129	26134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654213
583	NC_009523	AGG	2	6	26138	26143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654213
584	NC_009523	GGAAG	2	10	26292	26301	40 %	0 %	60 %	0 %	148654213
585	NC_009523	CAC	2	6	26311	26316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654213
586	NC_009523	GGC	2	6	26321	26326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654213
587	NC_009523	TCGC	2	8	26346	26353	0 %	25 %	25 %	50 %	148654213
588	NC_009523	GCC	2	6	26354	26359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
589	NC_009523	CAC	2	6	26377	26382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654213
590	NC_009523	CGG	3	9	26386	26394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654213
591	NC_009523	GCC	2	6	26437	26442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
592	NC_009523	CAG	2	6	26518	26523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654213
593	NC_009523	GAAA	2	8	26559	26566	75 %	0 %	25 %	0 %	148654213
594	NC_009523	CGC	3	9	26569	26577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
595	NC_009523	AAC	2	6	26593	26598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654213
596	NC_009523	CGCCAG	2	12	26617	26628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654213
597	NC_009523	A	6	6	26638	26643	100 %	0 %	0 %	0 %	148654213
598	NC_009523	CGC	2	6	26644	26649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
599	NC_009523	GC	4	8	26692	26699	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
600	NC_009523	GCG	2	6	26712	26717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654213
601	NC_009523	CA	3	6	26741	26746	50 %	0 %	0 %	50 %	148654213
602	NC_009523	CCA	2	6	26775	26780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654213
603	NC_009523	A	6	6	26793	26798	100 %	0 %	0 %	0 %	148654213
604	NC_009523	CGG	2	6	26929	26934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654214
605	NC_009523	TTCGT	2	10	26973	26982	0 %	60 %	20 %	20 %	148654214
606	NC_009523	CGA	2	6	27010	27015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654214
607	NC_009523	CGAA	2	8	27062	27069	50 %	0 %	25 %	25 %	148654214
608	NC_009523	GTCG	2	8	27097	27104	0 %	25 %	50 %	25 %	148654214
609	NC_009523	CG	3	6	27133	27138	0 %	0 %	50 %	50 %	148654214
610	NC_009523	CGC	2	6	27170	27175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654214
611	NC_009523	CCG	2	6	27189	27194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654214
612	NC_009523	CGA	2	6	27220	27225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654214
613	NC_009523	CG	3	6	27238	27243	0 %	0 %	50 %	50 %	148654214
614	NC_009523	TCA	2	6	27298	27303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654214
615	NC_009523	GCAC	2	8	27351	27358	25 %	0 %	25 %	50 %	148654214
616	NC_009523	CCA	2	6	27364	27369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654214
617	NC_009523	AGC	2	6	27405	27410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654214
618	NC_009523	TCG	2	6	27432	27437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
619	NC_009523	CAC	2	6	27445	27450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654214
620	NC_009523	TGC	2	6	27457	27462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
621	NC_009523	CAGC	2	8	27463	27470	25 %	0 %	25 %	50 %	148654214
622	NC_009523	TCA	2	6	27478	27483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654214
623	NC_009523	GAA	2	6	27527	27532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654214
624	NC_009523	CGT	2	6	27582	27587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
625	NC_009523	CCG	2	6	27616	27621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654214
626	NC_009523	TCG	2	6	27624	27629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
627	NC_009523	TTC	2	6	27663	27668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654214
628	NC_009523	CTG	2	6	27686	27691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
629	NC_009523	TGA	2	6	27752	27757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654214
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631	NC_009523	GAA	2	6	27774	27779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654214
632	NC_009523	CGAT	2	8	27795	27802	25 %	25 %	25 %	25 %	148654214
633	NC_009523	TCG	2	6	27975	27980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
634	NC_009523	CGCGG	2	10	28005	28014	0 %	0 %	60 %	40 %	148654214
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639	NC_009523	CGG	2	6	28204	28209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654214
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641	NC_009523	TCC	2	6	28294	28299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654215
642	NC_009523	GCA	2	6	28319	28324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654215
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646	NC_009523	GCA	2	6	28495	28500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654215
647	NC_009523	TCT	2	6	28526	28531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654215
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652	NC_009523	CG	3	6	28657	28662	0 %	0 %	50 %	50 %	148654215
653	NC_009523	GC	3	6	28675	28680	0 %	0 %	50 %	50 %	148654215
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658	NC_009523	GACT	2	8	28916	28923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
659	NC_009523	GCGTG	2	10	29008	29017	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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667	NC_009523	TCG	2	6	29778	29783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654216
668	NC_009523	CCGGT	2	10	29803	29812	0 %	20 %	40 %	40 %	148654216
669	NC_009523	GACGC	2	10	29876	29885	20 %	0 %	40 %	40 %	148654216
670	NC_009523	CGA	2	6	29972	29977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654216
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673	NC_009523	TCA	2	6	30187	30192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654216
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675	NC_009523	GC	3	6	30775	30780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
676	NC_009523	GC	3	6	30872	30877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
677	NC_009523	CTC	2	6	31063	31068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654217
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679	NC_009523	CGACA	2	10	31168	31177	40 %	0 %	20 %	40 %	148654217
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683	NC_009523	CGG	2	6	31352	31357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654217
684	NC_009523	TTCG	2	8	31363	31370	0 %	50 %	25 %	25 %	148654217
685	NC_009523	TCC	2	6	31393	31398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654218
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688	NC_009523	CGA	2	6	31522	31527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654218
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749	NC_009523	GC	3	6	34647	34652	0 %	0 %	50 %	50 %	148654221
750	NC_009523	AACC	3	12	34653	34664	50 %	0 %	0 %	50 %	148654221
751	NC_009523	GAG	2	6	34676	34681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654221
752	NC_009523	TCC	2	6	34683	34688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654221
753	NC_009523	GC	3	6	34714	34719	0 %	0 %	50 %	50 %	148654221
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755	NC_009523	GCG	2	6	34794	34799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654221
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757	NC_009523	CGT	2	6	34840	34845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654221
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