MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_009523	ACC	2	6	255389	255394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654391
6003	NC_009523	TA	3	6	255424	255429	50 %	50 %	0 %	0 %	148654391
6004	NC_009523	ATGA	2	8	255434	255441	50 %	25 %	25 %	0 %	148654391
6005	NC_009523	CAGG	2	8	255462	255469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_009523	ATG	3	9	255499	255507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_009523	GAG	2	6	255550	255555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_009523	GCG	2	6	255603	255608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654392
6009	NC_009523	GTG	2	6	255622	255627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654392
6010	NC_009523	CTT	2	6	255632	255637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654392
6011	NC_009523	GCT	2	6	255662	255667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654392
6012	NC_009523	TTG	2	6	255682	255687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654392
6013	NC_009523	CTG	2	6	255693	255698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654392
6014	NC_009523	TCA	2	6	255704	255709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654392
6015	NC_009523	GCTC	2	8	255718	255725	0 %	25 %	25 %	50 %	148654392
6016	NC_009523	GAT	2	6	255786	255791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654392
6017	NC_009523	GCG	2	6	255804	255809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654392
6018	NC_009523	GC	3	6	255824	255829	0 %	0 %	50 %	50 %	148654392
6019	NC_009523	GGT	2	6	255840	255845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654392
6020	NC_009523	CTA	4	12	255866	255877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654392
6021	NC_009523	TGG	2	6	255919	255924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654392
6022	NC_009523	TGC	2	6	255946	255951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654392
6023	NC_009523	TCG	2	6	255976	255981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654392
6024	NC_009523	GCCC	2	8	256048	256055	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6025	NC_009523	CACAC	2	10	256076	256085	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6026	NC_009523	GCC	2	6	256202	256207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654393
6027	NC_009523	ATCC	2	8	256248	256255	25 %	25 %	0 %	50 %	148654393
6028	NC_009523	ACG	2	6	256289	256294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654393
6029	NC_009523	AAC	2	6	256352	256357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654393
6030	NC_009523	T	6	6	256371	256376	0 %	100 %	0 %	0 %	148654393
6031	NC_009523	CG	3	6	256395	256400	0 %	0 %	50 %	50 %	148654393
6032	NC_009523	GAG	2	6	256460	256465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654393
6033	NC_009523	CAT	2	6	256491	256496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654393
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6035	NC_009523	CGA	2	6	256614	256619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654393
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6037	NC_009523	GTCCG	2	10	256678	256687	0 %	20 %	40 %	40 %	148654393
6038	NC_009523	CGC	2	6	256698	256703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654393
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6040	NC_009523	GCC	2	6	256853	256858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654393
6041	NC_009523	TCG	2	6	256892	256897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654393
6042	NC_009523	GCA	2	6	256932	256937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654393
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6044	NC_009523	GGC	2	6	257044	257049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654393
6045	NC_009523	CGCGC	2	10	257055	257064	0 %	0 %	40 %	60 %	148654393
6046	NC_009523	CAG	2	6	257065	257070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654393
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6049	NC_009523	CGG	2	6	257142	257147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654393
6050	NC_009523	TGC	2	6	257218	257223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654393
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6052	NC_009523	TGGT	2	8	257264	257271	0 %	50 %	50 %	0 %	148654393
6053	NC_009523	CAG	2	6	257272	257277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654393
6054	NC_009523	CAGC	2	8	257283	257290	25 %	0 %	25 %	50 %	148654393
6055	NC_009523	TTG	2	6	257309	257314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654393
6056	NC_009523	CATT	2	8	257373	257380	25 %	50 %	0 %	25 %	148654393
6057	NC_009523	CTC	2	6	257382	257387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_009523	GAC	2	6	257423	257428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654394
6059	NC_009523	ATG	2	6	257463	257468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654394
6060	NC_009523	TTTC	2	8	257528	257535	0 %	75 %	0 %	25 %	148654394
6061	NC_009523	GCC	2	6	257680	257685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654394
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6063	NC_009523	CGGG	2	8	257837	257844	0 %	0 %	75 %	25 %	148654394
6064	NC_009523	CGCCAG	2	12	257853	257864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654394
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6068	NC_009523	GC	3	6	258022	258027	0 %	0 %	50 %	50 %	148654394
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6082	NC_009523	CAG	2	6	258588	258593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6114	NC_009523	TCG	2	6	260033	260038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654395
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6116	NC_009523	GATG	2	8	260193	260200	25 %	25 %	50 %	0 %	148654395
6117	NC_009523	CG	3	6	260202	260207	0 %	0 %	50 %	50 %	148654395
6118	NC_009523	GGA	2	6	260352	260357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654395
6119	NC_009523	GC	3	6	260360	260365	0 %	0 %	50 %	50 %	148654395
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6121	NC_009523	CAT	2	6	260410	260415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654395
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6123	NC_009523	AGA	2	6	260538	260543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654396
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6243	NC_009523	GGT	2	6	265610	265615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654400
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6247	NC_009523	AGC	2	6	265825	265830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654400
6248	NC_009523	GCG	2	6	265900	265905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654400
6249	NC_009523	GGC	2	6	265946	265951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654400
6250	NC_009523	CGCT	2	8	265972	265979	0 %	25 %	25 %	50 %	148654400
6251	NC_009523	ATCGAT	2	12	266031	266042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148654400
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6253	NC_009523	GGAA	2	8	266079	266086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_009523	CGTT	2	8	266115	266122	0 %	50 %	25 %	25 %	148654401
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6263	NC_009523	GCAG	2	8	266349	266356	25 %	0 %	50 %	25 %	148654401
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6275	NC_009523	GCAG	2	8	266816	266823	25 %	0 %	50 %	25 %	148654401
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6370	NC_009523	GAC	2	6	271091	271096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
6371	NC_009523	ATC	2	6	271128	271133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654404
6372	NC_009523	ATC	2	6	271188	271193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654404
6373	NC_009523	CAGGCG	2	12	271224	271235	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654404
6374	NC_009523	GC	3	6	271284	271289	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
6375	NC_009523	ACG	2	6	271306	271311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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6377	NC_009523	CGC	2	6	271339	271344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654404
6378	NC_009523	GAG	2	6	271395	271400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654404
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6380	NC_009523	GTG	2	6	271440	271445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654404
6381	NC_009523	CGA	2	6	271448	271453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
6382	NC_009523	TACC	2	8	271460	271467	25 %	25 %	0 %	50 %	148654404
6383	NC_009523	GCG	2	6	271502	271507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654404
6384	NC_009523	TGA	2	6	271583	271588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654404
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6386	NC_009523	TCC	2	6	271733	271738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654404
6387	NC_009523	CTGGA	2	10	271746	271755	20 %	20 %	40 %	20 %	148654404
6388	NC_009523	GC	3	6	271779	271784	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
6389	NC_009523	GCGCC	2	10	271832	271841	0 %	0 %	40 %	60 %	148654404
6390	NC_009523	GCA	2	6	271880	271885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
6391	NC_009523	TTC	2	6	271929	271934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654404
6392	NC_009523	GCA	2	6	271942	271947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
6393	NC_009523	GCA	2	6	272069	272074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
6394	NC_009523	ACG	2	6	272161	272166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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6401	NC_009523	TGC	2	6	272450	272455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654404
6402	NC_009523	GCG	2	6	272479	272484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654404
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6409	NC_009523	CGT	2	6	272659	272664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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6425	NC_009523	GC	3	6	273328	273333	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
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6459	NC_009523	CGA	2	6	274361	274366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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6488	NC_009523	GATC	2	8	275564	275571	25 %	25 %	25 %	25 %	148654404
6489	NC_009523	CAGCGC	2	12	275589	275600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654404
6490	NC_009523	GAT	2	6	275604	275609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654404
6491	NC_009523	TC	3	6	275644	275649	0 %	50 %	0 %	50 %	148654404
6492	NC_009523	GGGC	2	8	275687	275694	0 %	0 %	75 %	25 %	148654404
6493	NC_009523	GCC	2	6	275731	275736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654404
6494	NC_009523	CTC	2	6	275797	275802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654404
6495	NC_009523	GC	3	6	275804	275809	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
6496	NC_009523	GTC	3	9	275835	275843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654404
6497	NC_009523	ACG	2	6	275854	275859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
6498	NC_009523	GTT	2	6	275941	275946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_009523	TTTCT	2	10	275948	275957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6500	NC_009523	AT	3	6	275975	275980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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