MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009523	AAT	2	6	232655	232660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_009523	ACG	2	6	232775	232780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_009523	CGC	2	6	232831	232836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_009523	CCCG	2	8	232837	232844	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5505	NC_009523	ACG	2	6	232869	232874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_009523	AGC	2	6	232918	232923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654367
5507	NC_009523	CG	3	6	232969	232974	0 %	0 %	50 %	50 %	148654367
5508	NC_009523	GC	3	6	232981	232986	0 %	0 %	50 %	50 %	148654367
5509	NC_009523	ATGC	2	8	232991	232998	25 %	25 %	25 %	25 %	148654367
5510	NC_009523	CGC	2	6	233019	233024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654367
5511	NC_009523	CCCG	2	8	233025	233032	0 %	0 %	25 %	75 %	148654367
5512	NC_009523	ACG	2	6	233057	233062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654367
5513	NC_009523	AGC	2	6	233106	233111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654367
5514	NC_009523	CGCCC	2	10	233116	233125	0 %	0 %	20 %	80 %	148654367
5515	NC_009523	AAT	2	6	233147	233152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_009523	AGA	2	6	233304	233309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_009523	ACG	2	6	233324	233329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_009523	CTC	2	6	233420	233425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654368
5519	NC_009523	GC	3	6	233442	233447	0 %	0 %	50 %	50 %	148654368
5520	NC_009523	TGC	2	6	233523	233528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654368
5521	NC_009523	CCTGCG	2	12	233572	233583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148654368
5522	NC_009523	ACC	2	6	233652	233657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654368
5523	NC_009523	GCC	2	6	233681	233686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654368
5524	NC_009523	GCA	2	6	233779	233784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654368
5525	NC_009523	CTT	2	6	233797	233802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654368
5526	NC_009523	ATGCC	2	10	233820	233829	20 %	20 %	20 %	40 %	148654368
5527	NC_009523	CCT	2	6	233848	233853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654368
5528	NC_009523	GCA	2	6	233878	233883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654368
5529	NC_009523	CTCG	2	8	233885	233892	0 %	25 %	25 %	50 %	148654368
5530	NC_009523	AAT	2	6	233909	233914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654368
5531	NC_009523	TGACG	2	10	234009	234018	20 %	20 %	40 %	20 %	148654368
5532	NC_009523	GTC	2	6	234078	234083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654368
5533	NC_009523	CCG	2	6	234120	234125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654368
5534	NC_009523	CAG	2	6	234131	234136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654368
5535	NC_009523	TCC	2	6	234147	234152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654368
5536	NC_009523	AGC	2	6	234162	234167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654368
5537	NC_009523	GAC	2	6	234212	234217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654368
5538	NC_009523	GAT	2	6	234233	234238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654368
5539	NC_009523	CGG	2	6	234281	234286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654368
5540	NC_009523	GCA	2	6	234367	234372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654368
5541	NC_009523	GC	3	6	234386	234391	0 %	0 %	50 %	50 %	148654368
5542	NC_009523	CGGT	2	8	234412	234419	0 %	25 %	50 %	25 %	148654368
5543	NC_009523	CG	3	6	234437	234442	0 %	0 %	50 %	50 %	148654368
5544	NC_009523	GCG	2	6	234446	234451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654368
5545	NC_009523	CCG	2	6	234460	234465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654368
5546	NC_009523	GC	3	6	234513	234518	0 %	0 %	50 %	50 %	148654368
5547	NC_009523	CGC	2	6	234577	234582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654368
5548	NC_009523	TGG	2	6	234598	234603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654368
5549	NC_009523	AAC	2	6	234620	234625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_009523	GAC	2	6	234814	234819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654369
5551	NC_009523	TTC	2	6	234846	234851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654369
5552	NC_009523	ATC	2	6	234956	234961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654369
5553	NC_009523	TGC	2	6	234972	234977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654369
5554	NC_009523	GAAA	2	8	235015	235022	75 %	0 %	25 %	0 %	148654369
5555	NC_009523	CTG	2	6	235040	235045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654369
5556	NC_009523	ACG	2	6	235056	235061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654369
5557	NC_009523	CG	3	6	235332	235337	0 %	0 %	50 %	50 %	148654369
5558	NC_009523	GCTG	2	8	235407	235414	0 %	25 %	50 %	25 %	148654369
5559	NC_009523	GGA	2	6	235525	235530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654369
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5561	NC_009523	GC	3	6	235586	235591	0 %	0 %	50 %	50 %	148654370
5562	NC_009523	GC	3	6	235603	235608	0 %	0 %	50 %	50 %	148654370
5563	NC_009523	GC	3	6	235615	235620	0 %	0 %	50 %	50 %	148654370
5564	NC_009523	GTC	2	6	235624	235629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654370
5565	NC_009523	CG	3	6	235653	235658	0 %	0 %	50 %	50 %	148654370
5566	NC_009523	GC	3	6	235679	235684	0 %	0 %	50 %	50 %	148654370
5567	NC_009523	CGA	2	6	235869	235874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654370
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5571	NC_009523	CAA	2	6	236066	236071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_009523	GCG	2	6	236118	236123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_009523	GC	3	6	236134	236139	0 %	0 %	50 %	50 %	148654371
5574	NC_009523	CGT	2	6	236179	236184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654371
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5583	NC_009523	ACC	2	6	236393	236398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654371
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5586	NC_009523	CG	3	6	236631	236636	0 %	0 %	50 %	50 %	148654371
5587	NC_009523	CGC	2	6	236664	236669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654371
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5591	NC_009523	CGCAT	2	10	237054	237063	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5592	NC_009523	TAG	2	6	237199	237204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_009523	AAC	2	6	237212	237217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_009523	G	6	6	237256	237261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_009523	TTG	2	6	237290	237295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_009523	AAG	2	6	237377	237382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654372
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5605	NC_009523	AGC	2	6	237830	237835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654372
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5607	NC_009523	AAG	2	6	237907	237912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654372
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5610	NC_009523	GC	3	6	237972	237977	0 %	0 %	50 %	50 %	148654372
5611	NC_009523	TGG	2	6	238030	238035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654372
5612	NC_009523	CAG	2	6	238144	238149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654372
5613	NC_009523	CGA	2	6	238205	238210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654372
5614	NC_009523	CGC	2	6	238216	238221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654372
5615	NC_009523	CTCG	2	8	238248	238255	0 %	25 %	25 %	50 %	148654372
5616	NC_009523	GAC	2	6	238306	238311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654372
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5618	NC_009523	GAGCGC	2	12	238390	238401	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654372
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5621	NC_009523	AAG	2	6	238546	238551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654372
5622	NC_009523	CTT	2	6	238616	238621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_009523	TAC	2	6	238666	238671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_009523	CATC	2	8	238688	238695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_009523	GCC	2	6	238705	238710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_009523	TTGT	2	8	238804	238811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_009523	TGT	2	6	238959	238964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654373
5628	NC_009523	GCT	2	6	238987	238992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654373
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5633	NC_009523	AGCG	2	8	239118	239125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5634	NC_009523	TGC	2	6	239230	239235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5635	NC_009523	CGA	2	6	239252	239257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5641	NC_009523	TGC	3	9	239556	239564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654374
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5643	NC_009523	CG	3	6	239596	239601	0 %	0 %	50 %	50 %	148654374
5644	NC_009523	CCAC	2	8	239640	239647	25 %	0 %	0 %	75 %	148654374
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5729	NC_009523	ACA	2	6	243047	243052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5730	NC_009523	A	6	6	243085	243090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5731	NC_009523	AGG	2	6	243093	243098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5732	NC_009523	GAT	2	6	243141	243146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654378
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5739	NC_009523	CTGCC	2	10	243569	243578	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5740	NC_009523	GGGCA	2	10	243600	243609	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5741	NC_009523	GTC	2	6	243647	243652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5742	NC_009523	GCAGC	2	10	243714	243723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5743	NC_009523	GC	3	6	243961	243966	0 %	0 %	50 %	50 %	148654379
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5993	NC_009523	CCG	2	6	255009	255014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5994	NC_009523	GAACCA	2	12	255113	255124	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5995	NC_009523	TTC	2	6	255152	255157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654391
5996	NC_009523	TGA	2	6	255183	255188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654391
5997	NC_009523	AGC	3	9	255200	255208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654391
5998	NC_009523	GCG	2	6	255270	255275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654391
5999	NC_009523	ACC	2	6	255311	255316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654391
6000	NC_009523	GCG	2	6	255332	255337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654391

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