MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	CAG	2	6	49	54	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009432	TCC	2	6	80	85	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009432	CTT	2	6	161	166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009432	GCC	2	6	514	519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
5	NC_009432	GCT	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280353
6	NC_009432	GCG	2	6	535	540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280353
7	NC_009432	GCC	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
8	NC_009432	GCG	3	9	632	640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280353
9	NC_009432	GAG	2	6	806	811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280353
10	NC_009432	TTC	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280353
11	NC_009432	CGC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
12	NC_009432	GCC	2	6	873	878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
13	NC_009432	AGG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280354
14	NC_009432	CGC	2	6	1128	1133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
15	NC_009432	GTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280354
16	NC_009432	GGC	2	6	1229	1234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
17	NC_009432	GCC	2	6	1314	1319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
18	NC_009432	ACG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280354
19	NC_009432	TCT	2	6	1408	1413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280354
20	NC_009432	GGC	2	6	1486	1491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
21	NC_009432	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280354
22	NC_009432	CGC	2	6	1689	1694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
23	NC_009432	CGG	2	6	1761	1766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
24	NC_009432	AGC	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280354
25	NC_009432	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
26	NC_009432	GCC	2	6	1857	1862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
27	NC_009432	GCG	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009432	CTG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009432	CAT	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280355
30	NC_009432	ATC	2	6	2494	2499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009432	TGG	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009432	GGA	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009432	GAC	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009432	CAG	2	6	2752	2757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009432	AAG	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009432	AAG	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009432	GGT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009432	CGA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009432	CGA	2	6	3089	3094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009432	CGA	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
41	NC_009432	GCG	2	6	3289	3294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280356
42	NC_009432	TGG	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280356
43	NC_009432	GAG	2	6	3543	3548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
44	NC_009432	AGC	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
45	NC_009432	TCT	2	6	3584	3589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
46	NC_009432	GCC	3	9	3604	3612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
47	NC_009432	GCT	2	6	3626	3631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
48	NC_009432	AGC	2	6	3760	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
49	NC_009432	AGC	2	6	3822	3827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
50	NC_009432	GGC	2	6	3892	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280356
51	NC_009432	GCC	2	6	3963	3968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
52	NC_009432	CGC	2	6	3982	3987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
53	NC_009432	GGA	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
54	NC_009432	GCC	2	6	4233	4238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
55	NC_009432	GGA	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
56	NC_009432	GCT	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
57	NC_009432	ATG	2	6	4513	4518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280356
58	NC_009432	CTT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
59	NC_009432	TAG	2	6	4546	4551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280356
60	NC_009432	CCG	2	6	4780	4785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
61	NC_009432	TAC	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280356
62	NC_009432	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
63	NC_009432	CCT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280356
64	NC_009432	TCT	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
65	NC_009432	CTG	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
66	NC_009432	CAT	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280356
67	NC_009432	AAG	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280356
68	NC_009432	CGA	3	9	5390	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
69	NC_009432	TCG	2	6	5428	5433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
70	NC_009432	TCG	2	6	6096	6101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
71	NC_009432	GAA	2	6	6103	6108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280357
72	NC_009432	CGA	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280357
73	NC_009432	GTC	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
74	NC_009432	GGC	2	6	6298	6303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280357
75	NC_009432	CAT	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280357
76	NC_009432	TGC	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
77	NC_009432	GCG	2	6	6349	6354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280357
78	NC_009432	ATC	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280357
79	NC_009432	GAG	2	6	6406	6411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280357
80	NC_009432	CCA	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280357
81	NC_009432	ATT	2	6	6606	6611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009432	GCT	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009432	CTG	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009432	TGG	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009432	TTA	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146280358
86	NC_009432	TAT	2	6	6878	6883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146280358
87	NC_009432	TCG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280358
88	NC_009432	CTT	3	9	6908	6916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280358
89	NC_009432	ATG	2	6	6971	6976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280358
90	NC_009432	GAG	2	6	7101	7106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280358
91	NC_009432	CTA	2	6	7244	7249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280358
92	NC_009432	GTC	3	9	7251	7259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280358
93	NC_009432	AGC	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280358
94	NC_009432	TCC	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280358
95	NC_009432	CAA	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280358
96	NC_009432	TCG	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280359
97	NC_009432	GCC	2	6	7567	7572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
98	NC_009432	CCG	2	6	7576	7581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
99	NC_009432	GGC	2	6	7620	7625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280359
100	NC_009432	CGC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
101	NC_009432	CGA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
102	NC_009432	ACG	2	6	7705	7710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
103	NC_009432	GCC	2	6	7741	7746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
104	NC_009432	CGA	3	9	7874	7882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
105	NC_009432	GGC	2	6	7981	7986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280359
106	NC_009432	CGC	2	6	8008	8013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
107	NC_009432	GCC	2	6	8014	8019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280359
108	NC_009432	GTC	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280359
109	NC_009432	TGC	2	6	8129	8134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280359
110	NC_009432	CGG	2	6	8202	8207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280359
111	NC_009432	GCA	2	6	8312	8317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
112	NC_009432	GTC	2	6	8358	8363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280359
113	NC_009432	GAC	2	6	8373	8378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
114	NC_009432	TGG	2	6	8525	8530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280359
115	NC_009432	GAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280359
116	NC_009432	TGA	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280359
117	NC_009432	ATG	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280359
118	NC_009432	CAC	2	6	8984	8989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280360
119	NC_009432	CGA	2	6	8990	8995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280360
120	NC_009432	GCC	2	6	9011	9016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280360
121	NC_009432	GGC	2	6	9151	9156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280360
122	NC_009432	ACG	3	9	9180	9188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280360
123	NC_009432	TGT	2	6	9205	9210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280360
124	NC_009432	CTT	2	6	9253	9258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280360
125	NC_009432	CTG	2	6	9314	9319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280360
126	NC_009432	CGG	2	6	9363	9368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280360
127	NC_009432	GCC	2	6	9488	9493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009432	CGC	2	6	9734	9739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280361
129	NC_009432	CAC	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280361
130	NC_009432	CCG	2	6	9802	9807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280361
131	NC_009432	CTG	2	6	9866	9871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280361
132	NC_009432	ATC	3	9	9878	9886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280361
133	NC_009432	AGC	2	6	9900	9905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280361
134	NC_009432	CTG	2	6	9959	9964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280361
135	NC_009432	CGG	2	6	10093	10098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009432	GCG	2	6	10121	10126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009432	CCT	2	6	10203	10208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009432	CGT	3	9	10243	10251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009432	GTC	2	6	10280	10285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009432	GGT	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009432	GTT	2	6	10386	10391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280362
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382	NC_009432	ACG	2	6	22479	22484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280373
383	NC_009432	CGA	2	6	22516	22521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280373
384	NC_009432	GCT	2	6	22573	22578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280373
385	NC_009432	TGT	2	6	22603	22608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280373
386	NC_009432	GCC	2	6	22770	22775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280374
387	NC_009432	GCC	2	6	22963	22968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280374
388	NC_009432	GCA	2	6	22991	22996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280374
389	NC_009432	GCC	3	9	23005	23013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280374
390	NC_009432	GGC	2	6	23139	23144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280374
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392	NC_009432	CGA	2	6	23228	23233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280374
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394	NC_009432	ACG	2	6	23332	23337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_009432	AGA	2	6	23362	23367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
396	NC_009432	CGC	2	6	23426	23431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
397	NC_009432	CGG	2	6	23556	23561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_009432	CGC	2	6	23688	23693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
399	NC_009432	TGG	2	6	23998	24003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
400	NC_009432	GAG	2	6	24006	24011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
401	NC_009432	TCG	2	6	24079	24084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_009432	CTC	2	6	24088	24093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_009432	TGC	2	6	24170	24175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280375
404	NC_009432	TCA	2	6	24190	24195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280375
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415	NC_009432	AAC	2	6	24734	24739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_009432	CAC	2	6	24765	24770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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438	NC_009432	ATT	2	6	26202	26207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_009432	TGC	2	6	26232	26237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_009432	GAG	2	6	26330	26335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_009432	GCG	2	6	26492	26497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_009432	GGC	2	6	26506	26511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_009432	TGG	2	6	26693	26698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280377
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491	NC_009432	GCA	2	6	29729	29734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_009432	AAC	2	6	29760	29765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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495	NC_009432	CCG	2	6	29949	29954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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499	NC_009432	CGG	2	6	30120	30125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280380
500	NC_009432	TTC	2	6	30193	30198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280380

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