MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA03

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009431	GC	3	6	447	452	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
2	NC_009431	CG	3	6	736	741	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
3	NC_009431	CG	3	6	1501	1506	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
4	NC_009431	GC	3	6	1669	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
5	NC_009431	GC	3	6	2093	2098	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
6	NC_009431	GC	3	6	2165	2170	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
7	NC_009431	GC	3	6	2214	2219	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
8	NC_009431	GC	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
9	NC_009431	GC	3	6	2670	2675	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
10	NC_009431	GC	3	6	2850	2855	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
11	NC_009431	CG	3	6	3477	3482	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
12	NC_009431	GA	3	6	4733	4738	50 %	0 %	50 %	0 %	146280244
13	NC_009431	CG	3	6	5626	5631	0 %	0 %	50 %	50 %	146280245
14	NC_009431	GA	3	6	5736	5741	50 %	0 %	50 %	0 %	146280245
15	NC_009431	GC	4	8	5961	5968	0 %	0 %	50 %	50 %	146280245
16	NC_009431	GC	3	6	6091	6096	0 %	0 %	50 %	50 %	146280245
17	NC_009431	GC	3	6	7181	7186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009431	TG	3	6	7393	7398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009431	CG	4	8	7985	7992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009431	GC	3	6	8321	8326	0 %	0 %	50 %	50 %	146280246
21	NC_009431	GC	4	8	8558	8565	0 %	0 %	50 %	50 %	146280246
22	NC_009431	GC	3	6	8621	8626	0 %	0 %	50 %	50 %	146280246
23	NC_009431	GC	3	6	8690	8695	0 %	0 %	50 %	50 %	146280246
24	NC_009431	CG	3	6	8943	8948	0 %	0 %	50 %	50 %	146280247
25	NC_009431	GC	3	6	9165	9170	0 %	0 %	50 %	50 %	146280247
26	NC_009431	GC	3	6	9231	9236	0 %	0 %	50 %	50 %	146280247
27	NC_009431	CG	3	6	9303	9308	0 %	0 %	50 %	50 %	146280247
28	NC_009431	GC	3	6	9438	9443	0 %	0 %	50 %	50 %	146280247
29	NC_009431	GC	4	8	9655	9662	0 %	0 %	50 %	50 %	146280247
30	NC_009431	CG	5	10	10419	10428	0 %	0 %	50 %	50 %	146280248
31	NC_009431	GC	3	6	10483	10488	0 %	0 %	50 %	50 %	146280248
32	NC_009431	CG	5	10	10522	10531	0 %	0 %	50 %	50 %	146280248
33	NC_009431	GC	3	6	10717	10722	0 %	0 %	50 %	50 %	146280248
34	NC_009431	GC	3	6	10823	10828	0 %	0 %	50 %	50 %	146280248
35	NC_009431	GC	3	6	11992	11997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009431	CG	3	6	12013	12018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009431	GC	3	6	12245	12250	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
38	NC_009431	GC	3	6	12268	12273	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
39	NC_009431	CG	3	6	12391	12396	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
40	NC_009431	GC	3	6	12464	12469	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
41	NC_009431	CG	3	6	12684	12689	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
42	NC_009431	CG	3	6	12826	12831	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
43	NC_009431	GC	3	6	12863	12868	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
44	NC_009431	GC	5	10	13188	13197	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
45	NC_009431	CG	3	6	13299	13304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009431	CG	3	6	13350	13355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009431	CG	3	6	13779	13784	0 %	0 %	50 %	50 %	146280251
48	NC_009431	CG	3	6	14212	14217	0 %	0 %	50 %	50 %	146280252
49	NC_009431	CG	4	8	14307	14314	0 %	0 %	50 %	50 %	146280252
50	NC_009431	CG	3	6	14373	14378	0 %	0 %	50 %	50 %	146280252
51	NC_009431	CG	3	6	14907	14912	0 %	0 %	50 %	50 %	146280253
52	NC_009431	GA	3	6	15144	15149	50 %	0 %	50 %	0 %	146280253
53	NC_009431	CT	3	6	15381	15386	0 %	50 %	0 %	50 %	146280253
54	NC_009431	CG	4	8	15677	15684	0 %	0 %	50 %	50 %	146280254
55	NC_009431	GC	3	6	16449	16454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009431	GC	3	6	16653	16658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009431	CG	4	8	16689	16696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009431	CG	4	8	17445	17452	0 %	0 %	50 %	50 %	146280256
59	NC_009431	CG	3	6	17772	17777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009431	GC	3	6	18123	18128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009431	GC	3	6	18640	18645	0 %	0 %	50 %	50 %	146280257
62	NC_009431	CG	3	6	18703	18708	0 %	0 %	50 %	50 %	146280257
63	NC_009431	CG	3	6	19786	19791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009431	CG	3	6	20180	20185	0 %	0 %	50 %	50 %	146280259
65	NC_009431	GC	3	6	20335	20340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009431	GC	3	6	20588	20593	0 %	0 %	50 %	50 %	146280260
67	NC_009431	CG	3	6	21066	21071	0 %	0 %	50 %	50 %	146280260
68	NC_009431	CG	3	6	21673	21678	0 %	0 %	50 %	50 %	146280261
69	NC_009431	GC	3	6	22070	22075	0 %	0 %	50 %	50 %	146280261
70	NC_009431	CG	3	6	23011	23016	0 %	0 %	50 %	50 %	146280262
71	NC_009431	GC	3	6	23211	23216	0 %	0 %	50 %	50 %	146280263
72	NC_009431	CG	3	6	23681	23686	0 %	0 %	50 %	50 %	146280263
73	NC_009431	GC	3	6	24480	24485	0 %	0 %	50 %	50 %	146280264
74	NC_009431	GC	3	6	24608	24613	0 %	0 %	50 %	50 %	146280264
75	NC_009431	GC	3	6	25402	25407	0 %	0 %	50 %	50 %	146280264
76	NC_009431	GC	3	6	25457	25462	0 %	0 %	50 %	50 %	146280264
77	NC_009431	GC	3	6	25763	25768	0 %	0 %	50 %	50 %	146280264
78	NC_009431	GC	3	6	26134	26139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009431	CG	3	6	26210	26215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009431	CG	3	6	27230	27235	0 %	0 %	50 %	50 %	146280266
81	NC_009431	CG	3	6	27429	27434	0 %	0 %	50 %	50 %	146280266
82	NC_009431	GC	3	6	27470	27475	0 %	0 %	50 %	50 %	146280266
83	NC_009431	GC	3	6	27705	27710	0 %	0 %	50 %	50 %	146280267
84	NC_009431	GC	3	6	28050	28055	0 %	0 %	50 %	50 %	146280267
85	NC_009431	TC	3	6	28213	28218	0 %	50 %	0 %	50 %	146280267
86	NC_009431	AT	3	6	28306	28311	50 %	50 %	0 %	0 %	146280267
87	NC_009431	GC	3	6	28495	28500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009431	CG	3	6	28811	28816	0 %	0 %	50 %	50 %	146280268
89	NC_009431	CG	3	6	29032	29037	0 %	0 %	50 %	50 %	146280268
90	NC_009431	GC	3	6	29860	29865	0 %	0 %	50 %	50 %	146280268
91	NC_009431	CG	3	6	30504	30509	0 %	0 %	50 %	50 %	146280269
92	NC_009431	CG	3	6	30572	30577	0 %	0 %	50 %	50 %	146280269
93	NC_009431	GC	3	6	30592	30597	0 %	0 %	50 %	50 %	146280269
94	NC_009431	CG	4	8	30799	30806	0 %	0 %	50 %	50 %	146280269
95	NC_009431	CG	4	8	32343	32350	0 %	0 %	50 %	50 %	146280269
96	NC_009431	CG	3	6	32565	32570	0 %	0 %	50 %	50 %	146280269
97	NC_009431	GC	3	6	33411	33416	0 %	0 %	50 %	50 %	146280270
98	NC_009431	CG	3	6	33477	33482	0 %	0 %	50 %	50 %	146280270
99	NC_009431	GC	3	6	33666	33671	0 %	0 %	50 %	50 %	146280270
100	NC_009431	CG	3	6	34436	34441	0 %	0 %	50 %	50 %	146280271
101	NC_009431	CG	3	6	34565	34570	0 %	0 %	50 %	50 %	146280271
102	NC_009431	GC	4	8	35194	35201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009431	GC	3	6	35475	35480	0 %	0 %	50 %	50 %	146280273
104	NC_009431	CG	3	6	35762	35767	0 %	0 %	50 %	50 %	146280273
105	NC_009431	CG	3	6	36396	36401	0 %	0 %	50 %	50 %	146280273
106	NC_009431	GC	3	6	36570	36575	0 %	0 %	50 %	50 %	146280273
107	NC_009431	GC	3	6	36668	36673	0 %	0 %	50 %	50 %	146280273
108	NC_009431	GC	4	8	36953	36960	0 %	0 %	50 %	50 %	146280273
109	NC_009431	GC	3	6	37252	37257	0 %	0 %	50 %	50 %	146280274
110	NC_009431	CG	3	6	37559	37564	0 %	0 %	50 %	50 %	146280274
111	NC_009431	GC	3	6	37574	37579	0 %	0 %	50 %	50 %	146280274
112	NC_009431	GC	4	8	37627	37634	0 %	0 %	50 %	50 %	146280274
113	NC_009431	GC	3	6	38055	38060	0 %	0 %	50 %	50 %	146280275
114	NC_009431	GC	3	6	38204	38209	0 %	0 %	50 %	50 %	146280275
115	NC_009431	CG	3	6	38575	38580	0 %	0 %	50 %	50 %	146280275
116	NC_009431	CG	3	6	39345	39350	0 %	0 %	50 %	50 %	146280275
117	NC_009431	CG	3	6	39481	39486	0 %	0 %	50 %	50 %	146280275
118	NC_009431	CG	3	6	40318	40323	0 %	0 %	50 %	50 %	146280275
119	NC_009431	CT	3	6	40716	40721	0 %	50 %	0 %	50 %	146280275
120	NC_009431	CG	3	6	40794	40799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009431	GC	4	8	40808	40815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009431	GC	3	6	40936	40941	0 %	0 %	50 %	50 %	146280276
123	NC_009431	CG	5	10	40959	40968	0 %	0 %	50 %	50 %	146280276
124	NC_009431	GC	3	6	41658	41663	0 %	0 %	50 %	50 %	146280276
125	NC_009431	GC	4	8	41910	41917	0 %	0 %	50 %	50 %	146280276
126	NC_009431	CG	3	6	42865	42870	0 %	0 %	50 %	50 %	146280277
127	NC_009431	CG	3	6	42872	42877	0 %	0 %	50 %	50 %	146280277
128	NC_009431	GC	3	6	43016	43021	0 %	0 %	50 %	50 %	146280277
129	NC_009431	AG	3	6	43211	43216	50 %	0 %	50 %	0 %	146280277
130	NC_009431	CG	3	6	45281	45286	0 %	0 %	50 %	50 %	146280278
131	NC_009431	GC	3	6	45307	45312	0 %	0 %	50 %	50 %	146280278
132	NC_009431	CG	3	6	45672	45677	0 %	0 %	50 %	50 %	146280278
133	NC_009431	TC	3	6	46186	46191	0 %	50 %	0 %	50 %	146280278
134	NC_009431	GC	3	6	46219	46224	0 %	0 %	50 %	50 %	146280279
135	NC_009431	GA	3	6	46339	46344	50 %	0 %	50 %	0 %	146280279
136	NC_009431	GC	3	6	46800	46805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009431	GC	3	6	46833	46838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009431	GA	3	6	47612	47617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009431	AC	3	6	47881	47886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009431	GC	3	6	48110	48115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009431	GT	3	6	48437	48442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009431	GC	3	6	49696	49701	0 %	0 %	50 %	50 %	146280281
143	NC_009431	TC	3	6	50372	50377	0 %	50 %	0 %	50 %	146280281
144	NC_009431	CG	3	6	50474	50479	0 %	0 %	50 %	50 %	146280281
145	NC_009431	CG	3	6	50796	50801	0 %	0 %	50 %	50 %	146280281
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.