MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 4824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009430	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146279974
2	NC_009430	GCC	2	6	179	184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279974
3	NC_009430	GCG	2	6	224	229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279974
4	NC_009430	GAA	2	6	240	245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279974
5	NC_009430	GGC	2	6	246	251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279974
6	NC_009430	CGA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279974
7	NC_009430	CTC	2	6	412	417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279974
8	NC_009430	GCA	2	6	504	509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279974
9	NC_009430	GCC	2	6	519	524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009430	TGC	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279975
11	NC_009430	GGT	2	6	640	645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279975
12	NC_009430	GCC	2	6	715	720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279975
13	NC_009430	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279975
14	NC_009430	CCA	2	6	817	822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279975
15	NC_009430	GGA	2	6	838	843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279975
16	NC_009430	GCC	2	6	879	884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279975
17	NC_009430	CCG	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279975
18	NC_009430	CAC	2	6	940	945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279975
19	NC_009430	GGC	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279975
20	NC_009430	AGG	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279975
21	NC_009430	GAC	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279975
22	NC_009430	CCT	3	9	1129	1137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279975
23	NC_009430	TCG	2	6	1205	1210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279975
24	NC_009430	AGC	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279976
25	NC_009430	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279976
26	NC_009430	AGG	2	6	1362	1367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279976
27	NC_009430	CGA	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
28	NC_009430	CCG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
29	NC_009430	GGC	2	6	1799	1804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279977
30	NC_009430	AAG	2	6	1836	1841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
31	NC_009430	GCC	2	6	1854	1859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
32	NC_009430	CAG	3	9	1886	1894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
33	NC_009430	CCA	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279977
34	NC_009430	GAC	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
35	NC_009430	GCC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
36	NC_009430	ACG	2	6	1977	1982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
37	NC_009430	GAA	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
38	NC_009430	GCC	2	6	2078	2083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
39	NC_009430	GCA	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
40	NC_009430	TTC	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279977
41	NC_009430	GCA	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
42	NC_009430	CGA	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
43	NC_009430	AGA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
44	NC_009430	GAA	2	6	2438	2443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
45	NC_009430	CAG	3	9	2540	2548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
46	NC_009430	CCA	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279977
47	NC_009430	CCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279977
48	NC_009430	GCC	2	6	2637	2642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
49	NC_009430	CAG	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
50	NC_009430	CAG	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
51	NC_009430	GCC	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
52	NC_009430	GCG	2	6	2883	2888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279977
53	NC_009430	GGT	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279977
54	NC_009430	CGT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279977
55	NC_009430	AGC	3	9	2952	2960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
56	NC_009430	GCC	2	6	2973	2978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
57	NC_009430	AGG	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279977
58	NC_009430	AAG	2	6	3044	3049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
59	NC_009430	GCA	2	6	3070	3075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
60	NC_009430	CAG	2	6	3098	3103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
61	NC_009430	GGC	2	6	3104	3109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279977
62	NC_009430	TCA	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279977
63	NC_009430	CGC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
64	NC_009430	GAT	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279978
65	NC_009430	ATG	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279978
66	NC_009430	CGG	2	6	3329	3334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
67	NC_009430	CCT	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279978
68	NC_009430	GAG	2	6	3566	3571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279978
69	NC_009430	CCA	2	6	3576	3581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279978
70	NC_009430	GCC	3	9	3671	3679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279978
71	NC_009430	GCC	2	6	3695	3700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279978
72	NC_009430	GGC	2	6	3775	3780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
73	NC_009430	CGG	2	6	3842	3847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
74	NC_009430	CGC	2	6	3874	3879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279978
75	NC_009430	CGG	2	6	3900	3905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
76	NC_009430	GGC	2	6	3909	3914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
77	NC_009430	GGC	2	6	4068	4073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
78	NC_009430	GCC	2	6	4119	4124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
79	NC_009430	GCG	2	6	4170	4175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
80	NC_009430	CGG	2	6	4515	4520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
81	NC_009430	GCC	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
82	NC_009430	GCC	2	6	4729	4734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
83	NC_009430	GAT	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279979
84	NC_009430	CGC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
85	NC_009430	CGG	2	6	4867	4872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
86	NC_009430	GGT	3	9	4934	4942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279979
87	NC_009430	CGG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
88	NC_009430	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
89	NC_009430	ATC	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279979
90	NC_009430	GGC	2	6	5127	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
91	NC_009430	GGC	2	6	5141	5146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
92	NC_009430	GCG	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
93	NC_009430	TCG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279980
94	NC_009430	CGG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279980
95	NC_009430	AGG	2	6	5458	5463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279980
96	NC_009430	ATC	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279980
97	NC_009430	GCC	2	6	5555	5560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
98	NC_009430	CCT	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279980
99	NC_009430	CGT	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279980
100	NC_009430	CGG	2	6	5734	5739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279980
101	NC_009430	CCA	2	6	5773	5778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279980
102	NC_009430	GGC	2	6	5942	5947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279980
103	NC_009430	CCG	2	6	5956	5961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
104	NC_009430	CCG	2	6	5986	5991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
105	NC_009430	CAG	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279980
106	NC_009430	GGC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279980
107	NC_009430	CGG	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279980
108	NC_009430	GAT	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279980
109	NC_009430	GCC	2	6	6108	6113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
110	NC_009430	CGC	2	6	6146	6151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
111	NC_009430	CGA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279980
112	NC_009430	AGA	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279980
113	NC_009430	GAG	3	9	6201	6209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279980
114	NC_009430	GCC	2	6	6242	6247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
115	NC_009430	GCA	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279980
116	NC_009430	ATC	2	6	6287	6292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279980
117	NC_009430	GCC	2	6	6318	6323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
118	NC_009430	CAC	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279980
119	NC_009430	CCG	2	6	6529	6534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279981
120	NC_009430	CCA	2	6	6537	6542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279981
121	NC_009430	AGA	2	6	6563	6568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279981
122	NC_009430	CGT	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279981
123	NC_009430	CGC	2	6	6633	6638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279981
124	NC_009430	GAA	2	6	6645	6650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279981
125	NC_009430	CAC	2	6	6678	6683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279981
126	NC_009430	TCG	2	6	6733	6738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279981
127	NC_009430	CAG	2	6	6744	6749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279981
128	NC_009430	CCA	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279982
129	NC_009430	TCG	2	6	6924	6929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279982
130	NC_009430	CGC	2	6	6937	6942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279982
131	NC_009430	AGC	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279982
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133	NC_009430	CGC	2	6	7082	7087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279982
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261	NC_009430	GCC	2	6	13297	13302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279990
262	NC_009430	CTG	2	6	13376	13381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279990
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325	NC_009430	GAT	2	6	17440	17445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279994
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327	NC_009430	GCA	2	6	17602	17607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279994
328	NC_009430	CCG	2	6	17661	17666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
329	NC_009430	GCC	2	6	17706	17711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279995
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379	NC_009430	CCA	2	6	19978	19983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279996
380	NC_009430	GCG	2	6	19994	19999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
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382	NC_009430	GCG	2	6	20029	20034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
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384	NC_009430	CGG	2	6	20098	20103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
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