MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 7172

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009430	AAG	2	6	39192	39197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280010
1002	NC_009430	CGT	2	6	39206	39211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280010
1003	NC_009430	GCT	2	6	39266	39271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280010
1004	NC_009430	CTT	2	6	39275	39280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280010
1005	NC_009430	TGGC	2	8	39333	39340	0 %	25 %	50 %	25 %	146280010
1006	NC_009430	CAA	2	6	39413	39418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280010
1007	NC_009430	GCG	3	9	39435	39443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280010
1008	NC_009430	CGA	2	6	39466	39471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280010
1009	NC_009430	GCATC	2	10	39521	39530	20 %	20 %	20 %	40 %	146280010
1010	NC_009430	GAT	2	6	39539	39544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280010
1011	NC_009430	TGA	2	6	39562	39567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280010
1012	NC_009430	TGC	2	6	39691	39696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280010
1013	NC_009430	ACC	2	6	39721	39726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280010
1014	NC_009430	GCT	2	6	39839	39844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280010
1015	NC_009430	GCC	3	9	39846	39854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280010
1016	NC_009430	GC	3	6	39879	39884	0 %	0 %	50 %	50 %	146280010
1017	NC_009430	CTGG	2	8	39896	39903	0 %	25 %	50 %	25 %	146280010
1018	NC_009430	CCG	2	6	39913	39918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280010
1019	NC_009430	GCT	2	6	39944	39949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280010
1020	NC_009430	GCTG	2	8	40051	40058	0 %	25 %	50 %	25 %	146280010
1021	NC_009430	TCG	2	6	40096	40101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280010
1022	NC_009430	CAA	2	6	40109	40114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280010
1023	NC_009430	CCCG	2	8	40144	40151	0 %	0 %	25 %	75 %	146280010
1024	NC_009430	CGAA	2	8	40167	40174	50 %	0 %	25 %	25 %	146280010
1025	NC_009430	TGA	2	6	40225	40230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009430	A	6	6	40265	40270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009430	CGA	2	6	40285	40290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_009430	CGCGG	2	10	40306	40315	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1029	NC_009430	TCA	2	6	40319	40324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009430	CTGA	2	8	40346	40353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_009430	TCA	2	6	40388	40393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280011
1032	NC_009430	TCA	2	6	40442	40447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280011
1033	NC_009430	ATC	2	6	40490	40495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280011
1034	NC_009430	GCC	3	9	40499	40507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280011
1035	NC_009430	GC	3	6	40528	40533	0 %	0 %	50 %	50 %	146280011
1036	NC_009430	GCT	2	6	40548	40553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280011
1037	NC_009430	GTC	2	6	40567	40572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280011
1038	NC_009430	CG	4	8	40581	40588	0 %	0 %	50 %	50 %	146280011
1039	NC_009430	CGC	2	6	40600	40605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280011
1040	NC_009430	GC	5	10	40622	40631	0 %	0 %	50 %	50 %	146280011
1041	NC_009430	ACG	2	6	40646	40651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280011
1042	NC_009430	CCG	2	6	40728	40733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280011
1043	NC_009430	CCGC	2	8	40809	40816	0 %	0 %	25 %	75 %	146280011
1044	NC_009430	TCC	2	6	40847	40852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280011
1045	NC_009430	TGT	2	6	40875	40880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280011
1046	NC_009430	GGC	2	6	40883	40888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280011
1047	NC_009430	CCG	2	6	40905	40910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280011
1048	NC_009430	TTCCG	2	10	40913	40922	0 %	40 %	20 %	40 %	146280011
1049	NC_009430	TGTCC	2	10	40941	40950	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1050	NC_009430	CGCC	2	8	40951	40958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1051	NC_009430	CGC	2	6	41041	41046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_009430	GCG	2	6	41150	41155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_009430	AAG	2	6	41271	41276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009430	AGC	2	6	41293	41298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_009430	CTG	2	6	41310	41315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_009430	GAA	2	6	41346	41351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280012
1057	NC_009430	CAT	2	6	41375	41380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280012
1058	NC_009430	CGA	2	6	41411	41416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280012
1059	NC_009430	CTG	2	6	41546	41551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280012
1060	NC_009430	CGA	2	6	41620	41625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280013
1061	NC_009430	GC	3	6	41627	41632	0 %	0 %	50 %	50 %	146280013
1062	NC_009430	GCGG	2	8	41656	41663	0 %	0 %	75 %	25 %	146280013
1063	NC_009430	CTC	2	6	41765	41770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280013
1064	NC_009430	GCG	2	6	41837	41842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280013
1065	NC_009430	TCC	2	6	41855	41860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280013
1066	NC_009430	CCG	2	6	41865	41870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280013
1067	NC_009430	CGCA	2	8	41911	41918	25 %	0 %	25 %	50 %	146280013
1068	NC_009430	CGGC	2	8	41977	41984	0 %	0 %	50 %	50 %	146280013
1069	NC_009430	CGA	2	6	42000	42005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280013
1070	NC_009430	GCC	2	6	42027	42032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280013
1071	NC_009430	GAA	2	6	42052	42057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280013
1072	NC_009430	CTT	2	6	42121	42126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280013
1073	NC_009430	GCTG	2	8	42147	42154	0 %	25 %	50 %	25 %	146280013
1074	NC_009430	GAG	2	6	42206	42211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280013
1075	NC_009430	CAT	2	6	42221	42226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280013
1076	NC_009430	GCC	2	6	42244	42249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280013
1077	NC_009430	GC	3	6	42300	42305	0 %	0 %	50 %	50 %	146280013
1078	NC_009430	CGCC	2	8	42328	42335	0 %	0 %	25 %	75 %	146280013
1079	NC_009430	GCA	3	9	42442	42450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280014
1080	NC_009430	GCC	2	6	42460	42465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280014
1081	NC_009430	CGT	2	6	42478	42483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280014
1082	NC_009430	CGT	2	6	42499	42504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280014
1083	NC_009430	CAG	2	6	42530	42535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280014
1084	NC_009430	CG	3	6	42537	42542	0 %	0 %	50 %	50 %	146280014
1085	NC_009430	CGG	2	6	42562	42567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280014
1086	NC_009430	GCG	2	6	42628	42633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280014
1087	NC_009430	CGGC	2	8	42637	42644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_009430	GCCC	2	8	42652	42659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1089	NC_009430	CAG	2	6	42695	42700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280015
1090	NC_009430	TGC	2	6	42702	42707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280015
1091	NC_009430	CG	3	6	42719	42724	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1092	NC_009430	GC	4	8	42759	42766	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1093	NC_009430	CGGCAG	2	12	42776	42787	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280015
1094	NC_009430	CGGC	2	8	42793	42800	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1095	NC_009430	GCG	2	6	42819	42824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280015
1096	NC_009430	GCCCG	2	10	42845	42854	0 %	0 %	40 %	60 %	146280015
1097	NC_009430	CTC	2	6	42956	42961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280015
1098	NC_009430	CCGG	2	8	43036	43043	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1099	NC_009430	CCGA	2	8	43053	43060	25 %	0 %	25 %	50 %	146280015
1100	NC_009430	GCC	2	6	43072	43077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280015
1101	NC_009430	CCG	2	6	43078	43083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280015
1102	NC_009430	AGGAC	2	10	43099	43108	40 %	0 %	40 %	20 %	146280015
1103	NC_009430	CAG	2	6	43122	43127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280015
1104	NC_009430	TGG	2	6	43147	43152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280015
1105	NC_009430	GCG	2	6	43174	43179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280015
1106	NC_009430	CCT	2	6	43225	43230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280015
1107	NC_009430	CCG	2	6	43234	43239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280015
1108	NC_009430	GC	4	8	43273	43280	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1109	NC_009430	GCC	2	6	43286	43291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280015
1110	NC_009430	GTG	2	6	43296	43301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280015
1111	NC_009430	CGCC	2	8	43363	43370	0 %	0 %	25 %	75 %	146280015
1112	NC_009430	CG	3	6	43424	43429	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1113	NC_009430	CAG	2	6	43436	43441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280015
1114	NC_009430	AGC	2	6	43494	43499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280015
1115	NC_009430	GCGCC	2	10	43509	43518	0 %	0 %	40 %	60 %	146280015
1116	NC_009430	GC	3	6	43533	43538	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1117	NC_009430	CCGG	2	8	43557	43564	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1118	NC_009430	GGC	2	6	43618	43623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280015
1119	NC_009430	CGGC	2	8	43642	43649	0 %	0 %	50 %	50 %	146280015
1120	NC_009430	CAG	2	6	43658	43663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280015
1121	NC_009430	TCG	2	6	43710	43715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280015
1122	NC_009430	GCC	3	9	43850	43858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280015
1123	NC_009430	CAC	4	12	43859	43870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280015
1124	NC_009430	ATG	2	6	43962	43967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280015
1125	NC_009430	GCC	2	6	43992	43997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_009430	CGG	3	9	44062	44070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_009430	CGA	2	6	44084	44089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_009430	GCG	2	6	44112	44117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009430	TCG	2	6	44131	44136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_009430	GC	3	6	44171	44176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_009430	CCG	2	6	44188	44193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_009430	CGGG	2	8	44213	44220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_009430	CCGG	2	8	44225	44232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_009430	AGG	2	6	44248	44253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_009430	GCC	2	6	44333	44338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1139	NC_009430	TGG	2	6	44364	44369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_009430	CCGCG	2	10	48209	48218	0 %	0 %	40 %	60 %	146280018
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1257	NC_009430	CCG	2	6	48816	48821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280019
1258	NC_009430	CAC	2	6	48850	48855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280019
1259	NC_009430	ACG	2	6	48888	48893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280019
1260	NC_009430	GCG	2	6	49028	49033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280019
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1262	NC_009430	GGT	2	6	49114	49119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280019
1263	NC_009430	CG	4	8	49138	49145	0 %	0 %	50 %	50 %	146280019
1264	NC_009430	GGA	2	6	49156	49161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280019
1265	NC_009430	CGC	2	6	49168	49173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280019
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1268	NC_009430	CCG	2	6	49371	49376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280019
1269	NC_009430	C	6	6	49417	49422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1270	NC_009430	C	6	6	49426	49431	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1271	NC_009430	CGC	2	6	49515	49520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280020
1272	NC_009430	TCAACA	2	12	49547	49558	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146280020
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1274	NC_009430	TCA	2	6	49613	49618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280020
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1279	NC_009430	CAA	2	6	49734	49739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280020
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1282	NC_009430	CGG	2	6	49823	49828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280020
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1285	NC_009430	CAGC	2	8	49983	49990	25 %	0 %	25 %	50 %	146280020
1286	NC_009430	GACC	2	8	49995	50002	25 %	0 %	25 %	50 %	146280020
1287	NC_009430	GAA	2	6	50025	50030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280020
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1292	NC_009430	GCA	2	6	50355	50360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280020
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1294	NC_009430	AAGATC	2	12	50470	50481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146280020
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1302	NC_009430	TGA	2	6	50809	50814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280021
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1306	NC_009430	CTGACG	2	12	50883	50894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146280021
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1323	NC_009430	ACC	2	6	51427	51432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280021
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1329	NC_009430	CTGG	2	8	51638	51645	0 %	25 %	50 %	25 %	146280021
1330	NC_009430	ACG	2	6	51657	51662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280021
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1332	NC_009430	G	6	6	51674	51679	0 %	0 %	100 %	0 %	146280021
1333	NC_009430	CTT	2	6	51704	51709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280021
1334	NC_009430	GCG	3	9	51748	51756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280021
1335	NC_009430	CGG	2	6	51773	51778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280021
1336	NC_009430	CGG	2	6	51781	51786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280021
1337	NC_009430	GGCG	2	8	51824	51831	0 %	0 %	75 %	25 %	146280021
1338	NC_009430	GAC	2	6	52017	52022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1339	NC_009430	TG	3	6	52074	52079	0 %	50 %	50 %	0 %	146280022
1340	NC_009430	G	6	6	52082	52087	0 %	0 %	100 %	0 %	146280022
1341	NC_009430	CGCGG	2	10	52120	52129	0 %	0 %	60 %	40 %	146280022
1342	NC_009430	GGC	2	6	52163	52168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280022
1343	NC_009430	GATCCT	2	12	52217	52228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146280022
1344	NC_009430	GGCGCG	2	12	52230	52241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280022
1345	NC_009430	GAC	2	6	52247	52252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280022
1346	NC_009430	CGA	2	6	52304	52309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280022
1347	NC_009430	GCA	2	6	52316	52321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280022
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1354	NC_009430	CCG	3	9	52627	52635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280022
1355	NC_009430	CG	3	6	52634	52639	0 %	0 %	50 %	50 %	146280022
1356	NC_009430	GGC	2	6	52653	52658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280022
1357	NC_009430	CCCGC	2	10	52672	52681	0 %	0 %	20 %	80 %	146280022
1358	NC_009430	GC	3	6	52702	52707	0 %	0 %	50 %	50 %	146280022
1359	NC_009430	CGA	2	6	52730	52735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280022
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1362	NC_009430	GCG	2	6	52904	52909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280022
1363	NC_009430	CTT	2	6	52913	52918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280022
1364	NC_009430	GC	3	6	52979	52984	0 %	0 %	50 %	50 %	146280022
1365	NC_009430	GGT	2	6	52991	52996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280022
1366	NC_009430	CCCTG	2	10	53008	53017	0 %	20 %	20 %	60 %	146280022
1367	NC_009430	GGCG	2	8	53111	53118	0 %	0 %	75 %	25 %	146280022
1368	NC_009430	GGT	2	6	53162	53167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280022
1369	NC_009430	ATC	2	6	53173	53178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280022
1370	NC_009430	CGC	2	6	53183	53188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280022
1371	NC_009430	GAT	2	6	53240	53245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280022
1372	NC_009430	AAC	2	6	53289	53294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280022
1373	NC_009430	TGA	2	6	53353	53358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280022
1374	NC_009430	TGC	2	6	53392	53397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280022
1375	NC_009430	GAG	2	6	53410	53415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280022
1376	NC_009430	GAG	2	6	53460	53465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280023
1377	NC_009430	TGG	2	6	53494	53499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280023
1378	NC_009430	GCT	2	6	53519	53524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280023
1379	NC_009430	GCC	2	6	53563	53568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280023
1380	NC_009430	GC	4	8	53576	53583	0 %	0 %	50 %	50 %	146280023
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