MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 21852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009429	CCGG	2	8	38440	38447	0 %	0 %	50 %	50 %	146279207
1002	NC_009429	ACCGGC	2	12	38481	38492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146279207
1003	NC_009429	CGC	2	6	38510	38515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279207
1004	NC_009429	CG	3	6	38529	38534	0 %	0 %	50 %	50 %	146279207
1005	NC_009429	CCG	2	6	38536	38541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279207
1006	NC_009429	AGG	2	6	38597	38602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009429	CGA	2	6	38642	38647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279208
1008	NC_009429	CCA	2	6	38771	38776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279208
1009	NC_009429	GCC	2	6	38789	38794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279208
1010	NC_009429	GCCT	2	8	38853	38860	0 %	25 %	25 %	50 %	146279208
1011	NC_009429	CAT	2	6	38873	38878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279208
1012	NC_009429	TGA	2	6	38941	38946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279208
1013	NC_009429	ACT	2	6	38992	38997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279208
1014	NC_009429	GCC	3	9	39006	39014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279208
1015	NC_009429	CGC	2	6	39097	39102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279208
1016	NC_009429	GCGCC	2	10	39119	39128	0 %	0 %	40 %	60 %	146279208
1017	NC_009429	TCG	2	6	39136	39141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279208
1018	NC_009429	ATGC	2	8	39147	39154	25 %	25 %	25 %	25 %	146279208
1019	NC_009429	GC	3	6	39153	39158	0 %	0 %	50 %	50 %	146279208
1020	NC_009429	ACG	2	6	39214	39219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279208
1021	NC_009429	GGC	2	6	39246	39251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279208
1022	NC_009429	GC	3	6	39298	39303	0 %	0 %	50 %	50 %	146279208
1023	NC_009429	ACCTG	2	10	39307	39316	20 %	20 %	20 %	40 %	146279208
1024	NC_009429	GAC	2	6	39318	39323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279208
1025	NC_009429	GGCG	2	8	39335	39342	0 %	0 %	75 %	25 %	146279208
1026	NC_009429	CTT	2	6	39350	39355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279208
1027	NC_009429	GCC	2	6	39480	39485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279208
1028	NC_009429	CTT	2	6	39524	39529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279208
1029	NC_009429	GACCG	2	10	39639	39648	20 %	0 %	40 %	40 %	146279208
1030	NC_009429	GCA	2	6	39861	39866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279209
1031	NC_009429	CGA	2	6	39894	39899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279209
1032	NC_009429	GGTC	2	8	39911	39918	0 %	25 %	50 %	25 %	146279209
1033	NC_009429	CGGTGG	2	12	39926	39937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146279209
1034	NC_009429	GCT	2	6	39963	39968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279209
1035	NC_009429	CGA	2	6	39987	39992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279209
1036	NC_009429	GAG	2	6	40042	40047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279209
1037	NC_009429	ATC	2	6	40063	40068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279209
1038	NC_009429	AACC	2	8	40081	40088	50 %	0 %	0 %	50 %	146279209
1039	NC_009429	CGG	2	6	40097	40102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279209
1040	NC_009429	GCC	2	6	40154	40159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279209
1041	NC_009429	GACGG	2	10	40162	40171	20 %	0 %	60 %	20 %	146279209
1042	NC_009429	TGC	3	9	40205	40213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279209
1043	NC_009429	G	6	6	40245	40250	0 %	0 %	100 %	0 %	146279209
1044	NC_009429	GCG	2	6	40279	40284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279209
1045	NC_009429	AGG	2	6	40307	40312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279209
1046	NC_009429	CG	3	6	40313	40318	0 %	0 %	50 %	50 %	146279209
1047	NC_009429	GGTC	2	8	40352	40359	0 %	25 %	50 %	25 %	146279209
1048	NC_009429	GCG	3	9	40442	40450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279209
1049	NC_009429	GC	4	8	40460	40467	0 %	0 %	50 %	50 %	146279209
1050	NC_009429	ACC	2	6	40468	40473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279209
1051	NC_009429	CTG	2	6	40501	40506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279209
1052	NC_009429	CGGC	2	8	40511	40518	0 %	0 %	50 %	50 %	146279209
1053	NC_009429	GGC	2	6	40600	40605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279209
1054	NC_009429	CG	3	6	40677	40682	0 %	0 %	50 %	50 %	146279209
1055	NC_009429	CGA	2	6	40788	40793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279209
1056	NC_009429	CGG	2	6	40815	40820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009429	GCC	2	6	40904	40909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_009429	GTC	2	6	40943	40948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_009429	GCC	2	6	40996	41001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279210
1060	NC_009429	CG	3	6	41067	41072	0 %	0 %	50 %	50 %	146279210
1061	NC_009429	GGC	2	6	41079	41084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279210
1062	NC_009429	TCC	2	6	41113	41118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279210
1063	NC_009429	CG	3	6	41124	41129	0 %	0 %	50 %	50 %	146279210
1064	NC_009429	AGC	2	6	41158	41163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279210
1065	NC_009429	CG	4	8	41176	41183	0 %	0 %	50 %	50 %	146279210
1066	NC_009429	CGT	2	6	41358	41363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279210
1067	NC_009429	TCC	2	6	41425	41430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279210
1068	NC_009429	GGAT	2	8	41444	41451	25 %	25 %	50 %	0 %	146279210
1069	NC_009429	GCC	2	6	41517	41522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279210
1070	NC_009429	CGGC	2	8	41542	41549	0 %	0 %	50 %	50 %	146279210
1071	NC_009429	GCT	2	6	41579	41584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279210
1072	NC_009429	GCCA	2	8	41587	41594	25 %	0 %	25 %	50 %	146279210
1073	NC_009429	GCA	2	6	41615	41620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279210
1074	NC_009429	GGTA	2	8	41679	41686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009429	CGT	2	6	41704	41709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_009429	TGT	2	6	41719	41724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009429	GTC	2	6	41758	41763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279211
1078	NC_009429	CGC	2	6	41786	41791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279211
1079	NC_009429	CTGG	2	8	41946	41953	0 %	25 %	50 %	25 %	146279211
1080	NC_009429	TGC	2	6	41954	41959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279211
1081	NC_009429	GTCG	2	8	42026	42033	0 %	25 %	50 %	25 %	146279211
1082	NC_009429	CGATGC	2	12	42053	42064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146279211
1083	NC_009429	ACG	2	6	42073	42078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279211
1084	NC_009429	CG	3	6	42208	42213	0 %	0 %	50 %	50 %	146279211
1085	NC_009429	GCC	2	6	42252	42257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279211
1086	NC_009429	AGG	2	6	42271	42276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279211
1087	NC_009429	TCT	2	6	42293	42298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279211
1088	NC_009429	GGC	2	6	42300	42305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279211
1089	NC_009429	GTGC	2	8	42315	42322	0 %	25 %	50 %	25 %	146279211
1090	NC_009429	TGACG	2	10	42329	42338	20 %	20 %	40 %	20 %	146279211
1091	NC_009429	CGG	2	6	42404	42409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279211
1092	NC_009429	CCGCCT	2	12	42410	42421	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	146279211
1093	NC_009429	GGT	2	6	42436	42441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279211
1094	NC_009429	CGG	2	6	42476	42481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279211
1095	NC_009429	G	6	6	42612	42617	0 %	0 %	100 %	0 %	146279211
1096	NC_009429	CCGC	2	8	42634	42641	0 %	0 %	25 %	75 %	146279211
1097	NC_009429	GAC	2	6	42685	42690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_009429	GCA	2	6	42730	42735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_009429	GAT	2	6	42795	42800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279212
1100	NC_009429	ACC	2	6	42802	42807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279212
1101	NC_009429	GAC	2	6	42809	42814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279212
1102	NC_009429	ACG	2	6	42823	42828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279212
1103	NC_009429	GGC	2	6	42859	42864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279212
1104	NC_009429	GAA	2	6	42874	42879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279212
1105	NC_009429	GC	4	8	42903	42910	0 %	0 %	50 %	50 %	146279212
1106	NC_009429	GC	3	6	42979	42984	0 %	0 %	50 %	50 %	146279212
1107	NC_009429	GC	3	6	43027	43032	0 %	0 %	50 %	50 %	146279212
1108	NC_009429	GCC	2	6	43051	43056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279212
1109	NC_009429	CATC	2	8	43140	43147	25 %	25 %	0 %	50 %	146279212
1110	NC_009429	CG	3	6	43164	43169	0 %	0 %	50 %	50 %	146279212
1111	NC_009429	AAC	2	6	43174	43179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146279212
1112	NC_009429	CGC	2	6	43311	43316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279212
1113	NC_009429	GCG	2	6	43400	43405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279212
1114	NC_009429	TCG	2	6	43415	43420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279212
1115	NC_009429	GAG	2	6	43423	43428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279212
1116	NC_009429	ATC	2	6	43453	43458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279212
1117	NC_009429	CGG	2	6	43522	43527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279212
1118	NC_009429	CGG	2	6	43604	43609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279212
1119	NC_009429	GAG	2	6	43657	43662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279212
1120	NC_009429	GAT	2	6	43683	43688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279212
1121	NC_009429	AGG	2	6	43877	43882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279212
1122	NC_009429	CAC	2	6	43903	43908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279212
1123	NC_009429	AAC	2	6	43978	43983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146279212
1124	NC_009429	GC	3	6	44107	44112	0 %	0 %	50 %	50 %	146279212
1125	NC_009429	CGCC	2	8	44174	44181	0 %	0 %	25 %	75 %	146279212
1126	NC_009429	GAT	2	6	44205	44210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279212
1127	NC_009429	GCG	3	9	44213	44221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279212
1128	NC_009429	GGCG	2	8	44238	44245	0 %	0 %	75 %	25 %	146279212
1129	NC_009429	CG	3	6	44272	44277	0 %	0 %	50 %	50 %	146279212
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1132	NC_009429	CAG	2	6	44451	44456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279212
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1238	NC_009429	CGG	2	6	48187	48192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1239	NC_009429	GC	3	6	48280	48285	0 %	0 %	50 %	50 %	146279216
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1241	NC_009429	ACC	2	6	48352	48357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279216
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1249	NC_009429	C	6	6	48701	48706	0 %	0 %	0 %	100 %	146279216
1250	NC_009429	AGA	2	6	48749	48754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279216
1251	NC_009429	CAT	2	6	48758	48763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279216
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1253	NC_009429	CCGT	2	8	48907	48914	0 %	25 %	25 %	50 %	146279216
1254	NC_009429	GGA	2	6	48939	48944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279216
1255	NC_009429	GCG	2	6	48986	48991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279216
1256	NC_009429	GC	3	6	49013	49018	0 %	0 %	50 %	50 %	146279216
1257	NC_009429	GAA	2	6	49020	49025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279216
1258	NC_009429	GGC	2	6	49028	49033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279216
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1260	NC_009429	GAC	2	6	49125	49130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279216
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1262	NC_009429	CG	4	8	49218	49225	0 %	0 %	50 %	50 %	146279216
1263	NC_009429	GC	3	6	49247	49252	0 %	0 %	50 %	50 %	146279216
1264	NC_009429	GGC	2	6	49269	49274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279216
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1267	NC_009429	C	6	6	49420	49425	0 %	0 %	0 %	100 %	146279216
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1272	NC_009429	GC	3	6	49618	49623	0 %	0 %	50 %	50 %	146279216
1273	NC_009429	CAG	2	6	49629	49634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279216
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1279	NC_009429	GCC	2	6	49911	49916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1280	NC_009429	CGG	2	6	49992	49997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1281	NC_009429	GGAC	2	8	49998	50005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1292	NC_009429	GCG	2	6	50643	50648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1293	NC_009429	GGCG	2	8	50665	50672	0 %	0 %	75 %	25 %	146279218
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1331	NC_009429	GGGC	2	8	51863	51870	0 %	0 %	75 %	25 %	146279219
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1334	NC_009429	CGG	2	6	51923	51928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279219
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1354	NC_009429	TGG	2	6	52457	52462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1355	NC_009429	GACG	2	8	52477	52484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1356	NC_009429	CG	4	8	52483	52490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1357	NC_009429	GGCA	2	8	52540	52547	25 %	0 %	50 %	25 %	146279221
1358	NC_009429	GTC	2	6	52553	52558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279221
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1362	NC_009429	TCCT	2	8	52790	52797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1366	NC_009429	GCG	2	6	52862	52867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279222
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1374	NC_009429	GTCC	2	8	53290	53297	0 %	25 %	25 %	50 %	146279222
1375	NC_009429	CGG	2	6	53324	53329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279222
1376	NC_009429	ATG	2	6	53387	53392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279222
1377	NC_009429	TCA	2	6	53451	53456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279222
1378	NC_009429	TCG	2	6	53504	53509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279222
1379	NC_009429	TCG	2	6	53519	53524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279222
1380	NC_009429	AGC	2	6	53558	53563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279222
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1382	NC_009429	GGT	2	6	53614	53619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279222
1383	NC_009429	CGC	2	6	53697	53702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279222
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1495	NC_009429	CGAC	2	8	58016	58023	25 %	0 %	25 %	50 %	146279226
1496	NC_009429	CGG	2	6	58043	58048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279226
1497	NC_009429	TGGCG	2	10	58065	58074	0 %	20 %	60 %	20 %	146279226
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