MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 21852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009429	GCG	2	6	197466	197471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_009429	GCCG	2	8	197472	197479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_009429	CGA	2	6	197564	197569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_009429	GCG	2	6	197597	197602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_009429	GCG	2	6	197643	197648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_009429	CTG	2	6	197652	197657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_009429	TCG	2	6	197658	197663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_009429	GACC	2	8	197690	197697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_009429	GGC	2	6	197762	197767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_009429	CGGCC	2	10	197791	197800	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5011	NC_009429	GCC	2	6	197805	197810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_009429	GGGC	2	8	197834	197841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_009429	GC	3	6	197872	197877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_009429	CGA	2	6	197878	197883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_009429	TGG	2	6	197925	197930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_009429	GCC	2	6	197947	197952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_009429	CTG	2	6	198070	198075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279352
5018	NC_009429	TGG	2	6	198197	198202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279352
5019	NC_009429	GGCG	2	8	198228	198235	0 %	0 %	75 %	25 %	146279352
5020	NC_009429	CTG	3	9	198292	198300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279352
5021	NC_009429	TCTGGC	2	12	198327	198338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279352
5022	NC_009429	GCC	2	6	198361	198366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279352
5023	NC_009429	CGG	2	6	198398	198403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279352
5024	NC_009429	GCG	2	6	198463	198468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279352
5025	NC_009429	GGCGC	2	10	198489	198498	0 %	0 %	60 %	40 %	146279352
5026	NC_009429	CGGCG	2	10	198501	198510	0 %	0 %	60 %	40 %	146279352
5027	NC_009429	GGC	2	6	198570	198575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279352
5028	NC_009429	GGT	2	6	198576	198581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279352
5029	NC_009429	GAC	2	6	198586	198591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279352
5030	NC_009429	GCT	2	6	198624	198629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279352
5031	NC_009429	CGG	2	6	198641	198646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279352
5032	NC_009429	CGACG	2	10	198678	198687	20 %	0 %	40 %	40 %	146279352
5033	NC_009429	GCG	2	6	198688	198693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279352
5034	NC_009429	GCC	2	6	198694	198699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279352
5035	NC_009429	GTGG	2	8	198703	198710	0 %	25 %	75 %	0 %	146279352
5036	NC_009429	CGCGGC	2	12	198711	198722	0 %	0 %	50 %	50 %	146279352
5037	NC_009429	CGC	2	6	198728	198733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279352
5038	NC_009429	TTC	2	6	198752	198757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279352
5039	NC_009429	GCT	2	6	198765	198770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279352
5040	NC_009429	CGC	2	6	198789	198794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279352
5041	NC_009429	CTT	2	6	198837	198842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279353
5042	NC_009429	GCC	2	6	198846	198851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279353
5043	NC_009429	GAG	2	6	198858	198863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279353
5044	NC_009429	CGC	2	6	198976	198981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279353
5045	NC_009429	TCT	2	6	198982	198987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279353
5046	NC_009429	TCAG	2	8	198988	198995	25 %	25 %	25 %	25 %	146279353
5047	NC_009429	GCG	2	6	199038	199043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279353
5048	NC_009429	CGAC	2	8	199120	199127	25 %	0 %	25 %	50 %	146279353
5049	NC_009429	G	7	7	199160	199166	0 %	0 %	100 %	0 %	146279353
5050	NC_009429	CG	3	6	199200	199205	0 %	0 %	50 %	50 %	146279353
5051	NC_009429	GAG	2	6	199212	199217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279353
5052	NC_009429	GGT	2	6	199241	199246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279353
5053	NC_009429	CGA	2	6	199265	199270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279353
5054	NC_009429	CTC	2	6	199275	199280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279353
5055	NC_009429	GAG	2	6	199300	199305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279353
5056	NC_009429	CCG	3	9	199368	199376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279354
5057	NC_009429	CCGCGC	2	12	199424	199435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279354
5058	NC_009429	GC	4	8	199515	199522	0 %	0 %	50 %	50 %	146279354
5059	NC_009429	CG	3	6	199533	199538	0 %	0 %	50 %	50 %	146279354
5060	NC_009429	CG	3	6	199578	199583	0 %	0 %	50 %	50 %	146279354
5061	NC_009429	CG	3	6	199591	199596	0 %	0 %	50 %	50 %	146279354
5062	NC_009429	CTG	2	6	199624	199629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279354
5063	NC_009429	GCG	2	6	199645	199650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279354
5064	NC_009429	GGC	2	6	199669	199674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279354
5065	NC_009429	CGA	2	6	199685	199690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279354
5066	NC_009429	CGGC	2	8	199727	199734	0 %	0 %	50 %	50 %	146279354
5067	NC_009429	CGC	2	6	199758	199763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279354
5068	NC_009429	CGTC	2	8	199812	199819	0 %	25 %	25 %	50 %	146279354
5069	NC_009429	CGGA	2	8	199958	199965	25 %	0 %	50 %	25 %	146279354
5070	NC_009429	G	6	6	199990	199995	0 %	0 %	100 %	0 %	146279354
5071	NC_009429	GGC	2	6	200019	200024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279354
5072	NC_009429	CGC	2	6	200039	200044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279354
5073	NC_009429	ACC	2	6	200050	200055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279354
5074	NC_009429	GCG	2	6	200071	200076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279354
5075	NC_009429	CG	3	6	200115	200120	0 %	0 %	50 %	50 %	146279354
5076	NC_009429	GGC	2	6	200123	200128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279354
5077	NC_009429	GCG	2	6	200152	200157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279354
5078	NC_009429	CAT	2	6	200241	200246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279354
5079	NC_009429	GC	3	6	200253	200258	0 %	0 %	50 %	50 %	146279354
5080	NC_009429	CAG	2	6	200373	200378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279355
5081	NC_009429	CCG	2	6	200384	200389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279355
5082	NC_009429	CCT	2	6	200438	200443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279355
5083	NC_009429	GAT	2	6	200475	200480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279355
5084	NC_009429	GCG	2	6	200486	200491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279355
5085	NC_009429	GCCC	2	8	200508	200515	0 %	0 %	25 %	75 %	146279355
5086	NC_009429	GGC	2	6	200526	200531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279355
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5088	NC_009429	GGT	2	6	200604	200609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279355
5089	NC_009429	CCG	2	6	200645	200650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279355
5090	NC_009429	CG	3	6	200680	200685	0 %	0 %	50 %	50 %	146279355
5091	NC_009429	CGG	2	6	200690	200695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279355
5092	NC_009429	ACC	2	6	200704	200709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279355
5093	NC_009429	CG	3	6	200731	200736	0 %	0 %	50 %	50 %	146279355
5094	NC_009429	ATG	2	6	200746	200751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279355
5095	NC_009429	CGC	2	6	200787	200792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279355
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5098	NC_009429	CAGCG	2	10	200920	200929	20 %	0 %	40 %	40 %	146279355
5099	NC_009429	CCG	3	9	200930	200938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279355
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5106	NC_009429	GGC	3	9	201171	201179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279355
5107	NC_009429	CG	3	6	201203	201208	0 %	0 %	50 %	50 %	146279355
5108	NC_009429	GCCC	2	8	201214	201221	0 %	0 %	25 %	75 %	146279355
5109	NC_009429	CAG	2	6	201234	201239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279355
5110	NC_009429	CAG	2	6	201243	201248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279355
5111	NC_009429	GCG	2	6	201265	201270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279355
5112	NC_009429	GCA	2	6	201272	201277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279355
5113	NC_009429	GCG	2	6	201280	201285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279355
5114	NC_009429	TC	3	6	201296	201301	0 %	50 %	0 %	50 %	146279355
5115	NC_009429	GCC	2	6	201322	201327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279355
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5117	NC_009429	CAG	2	6	201381	201386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279355
5118	NC_009429	ACG	2	6	201394	201399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279355
5119	NC_009429	CGG	2	6	201408	201413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279355
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5122	NC_009429	GGGC	2	8	201605	201612	0 %	0 %	75 %	25 %	146279355
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5124	NC_009429	TGG	2	6	201629	201634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279355
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5247	NC_009429	AGAT	2	8	206594	206601	50 %	25 %	25 %	0 %	146279358
5248	NC_009429	GTC	2	6	206611	206616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279358
5249	NC_009429	GCTCAG	2	12	206644	206655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146279358
5250	NC_009429	CGC	2	6	206658	206663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279358
5251	NC_009429	CAT	2	6	206706	206711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279358
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5264	NC_009429	GCA	2	6	207279	207284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279358
5265	NC_009429	GTC	3	9	207293	207301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279358
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5268	NC_009429	GAG	2	6	207358	207363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279358
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5272	NC_009429	CGA	2	6	207444	207449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279358
5273	NC_009429	TGC	2	6	207505	207510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279358
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5275	NC_009429	GC	3	6	207580	207585	0 %	0 %	50 %	50 %	146279358
5276	NC_009429	TCA	2	6	207667	207672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5277	NC_009429	GCTG	2	8	207673	207680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5278	NC_009429	GAT	2	6	207689	207694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5279	NC_009429	CGC	2	6	207782	207787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5280	NC_009429	G	6	6	207842	207847	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_009429	ATCC	2	8	207851	207858	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5355	NC_009429	GCCG	2	8	210300	210307	0 %	0 %	50 %	50 %	146279361
5356	NC_009429	TCGGCC	2	12	210310	210321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146279361
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5368	NC_009429	GC	3	6	210649	210654	0 %	0 %	50 %	50 %	146279361
5369	NC_009429	GCT	2	6	210660	210665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279361
5370	NC_009429	ATC	2	6	210667	210672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279361
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5372	NC_009429	CGC	2	6	210753	210758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279361
5373	NC_009429	GCCGG	2	10	210771	210780	0 %	0 %	60 %	40 %	146279361
5374	NC_009429	GCC	2	6	210796	210801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279361
5375	NC_009429	TGC	3	9	210848	210856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279361
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5377	NC_009429	ATCT	2	8	210910	210917	25 %	50 %	0 %	25 %	146279361
5378	NC_009429	TGG	2	6	210967	210972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279362
5379	NC_009429	TGC	2	6	211009	211014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279362
5380	NC_009429	GCT	2	6	211088	211093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279362
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5389	NC_009429	G	6	6	211379	211384	0 %	0 %	100 %	0 %	146279362
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5398	NC_009429	CGC	2	6	211562	211567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279362
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5400	NC_009429	CTG	2	6	211581	211586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279362
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5407	NC_009429	CG	3	6	211768	211773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5425	NC_009429	CGG	2	6	212606	212611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5426	NC_009429	CG	3	6	212640	212645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5427	NC_009429	CCCG	2	8	212646	212653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5454	NC_009429	TGGGT	2	10	213584	213593	0 %	40 %	60 %	0 %	146279365
5455	NC_009429	TCGTCA	2	12	213602	213613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146279365
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5472	NC_009429	CAG	2	6	214392	214397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279366
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5480	NC_009429	TGCG	2	8	214695	214702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5481	NC_009429	AC	3	6	214744	214749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5482	NC_009429	GGA	2	6	214785	214790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_009429	CGC	2	6	214848	214853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279367
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5486	NC_009429	GCG	2	6	214889	214894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279367
5487	NC_009429	GGGCTG	2	12	214939	214950	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146279367
5488	NC_009429	GCT	2	6	214965	214970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279367
5489	NC_009429	TCG	2	6	215006	215011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279367
5490	NC_009429	CGT	2	6	215025	215030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279367
5491	NC_009429	TGG	2	6	215081	215086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279367
5492	NC_009429	TGC	2	6	215111	215116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279367
5493	NC_009429	CG	3	6	215144	215149	0 %	0 %	50 %	50 %	146279367
5494	NC_009429	GC	3	6	215158	215163	0 %	0 %	50 %	50 %	146279367
5495	NC_009429	GGCG	2	8	215172	215179	0 %	0 %	75 %	25 %	146279367
5496	NC_009429	CG	3	6	215225	215230	0 %	0 %	50 %	50 %	146279367
5497	NC_009429	AGG	2	6	215243	215248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279367
5498	NC_009429	CGCCGG	2	12	215267	215278	0 %	0 %	50 %	50 %	146279367
5499	NC_009429	ACG	2	6	215296	215301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279367
5500	NC_009429	CGG	2	6	215342	215347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279367

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