MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 chromosome 2

Total Repeats: 31663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009050	CGC	2	6	45	50	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009050	CGC	2	6	60	65	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009050	CCCG	2	8	102	109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009050	CGC	2	6	129	134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009050	CCG	2	6	199	204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009050	CAT	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009050	GGCCG	2	10	266	275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009050	CCG	2	6	302	307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009050	GACAG	2	10	310	319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009050	CCG	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009050	GGGC	2	8	355	362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009050	GCC	2	6	364	369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009050	CGC	2	6	370	375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009050	GCC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009050	GGGCAG	2	12	401	412	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009050	GGAC	2	8	436	443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009050	CGA	2	6	452	457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463753
18	NC_009050	AGG	2	6	538	543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463753
19	NC_009050	GAG	2	6	591	596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463753
20	NC_009050	CAC	2	6	600	605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126463753
21	NC_009050	ATC	2	6	627	632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126463753
22	NC_009050	CGC	2	6	716	721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463753
23	NC_009050	CG	3	6	731	736	0 %	0 %	50 %	50 %	126463753
24	NC_009050	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	126463753
25	NC_009050	GCG	2	6	928	933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463753
26	NC_009050	CGGC	2	8	946	953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009050	CGC	2	6	954	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009050	GCG	2	6	969	974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009050	CCG	2	6	990	995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009050	CGGCG	2	10	1003	1012	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009050	GGC	2	6	1097	1102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009050	CGA	2	6	1154	1159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009050	CG	3	6	1163	1168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009050	GCCC	2	8	1182	1189	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_009050	CGG	2	6	1193	1198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009050	CCG	2	6	1258	1263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009050	TCC	2	6	1274	1279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009050	CTT	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009050	ACG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009050	CGG	2	6	1327	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009050	GCAG	2	8	1363	1370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009050	CCT	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009050	CTCC	2	8	1412	1419	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_009050	GAC	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009050	TGCC	2	8	1560	1567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009050	GCC	2	6	1586	1591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009050	GTC	2	6	1657	1662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463754
48	NC_009050	ACCCGG	2	12	1684	1695	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126463754
49	NC_009050	CACC	2	8	1728	1735	25 %	0 %	0 %	75 %	126463754
50	NC_009050	GGGCC	2	10	1782	1791	0 %	0 %	60 %	40 %	126463754
51	NC_009050	CCG	2	6	1797	1802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463754
52	NC_009050	GGC	2	6	1845	1850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463754
53	NC_009050	TCT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126463754
54	NC_009050	GCT	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463754
55	NC_009050	CG	3	6	2001	2006	0 %	0 %	50 %	50 %	126463754
56	NC_009050	CTT	2	6	2124	2129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126463754
57	NC_009050	CCG	2	6	2158	2163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463754
58	NC_009050	GGA	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463754
59	NC_009050	GC	3	6	2233	2238	0 %	0 %	50 %	50 %	126463754
60	NC_009050	GC	4	8	2337	2344	0 %	0 %	50 %	50 %	126463754
61	NC_009050	GCC	4	12	2350	2361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463754
62	NC_009050	TGG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126463754
63	NC_009050	TGC	2	6	2369	2374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463754
64	NC_009050	GGCCAT	2	12	2421	2432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126463754
65	NC_009050	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126463754
66	NC_009050	CCTG	2	8	2495	2502	0 %	25 %	25 %	50 %	126463754
67	NC_009050	CCG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463754
68	NC_009050	TCT	2	6	2550	2555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126463754
69	NC_009050	GGA	2	6	2607	2612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463754
70	NC_009050	CG	3	6	2646	2651	0 %	0 %	50 %	50 %	126463754
71	NC_009050	GCC	2	6	2669	2674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463754
72	NC_009050	CGG	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463754
73	NC_009050	GGC	2	6	2722	2727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463754
74	NC_009050	TCG	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463755
75	NC_009050	GTT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126463755
76	NC_009050	GAG	2	6	2923	2928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463755
77	NC_009050	CTCG	2	8	2965	2972	0 %	25 %	25 %	50 %	126463755
78	NC_009050	ACC	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126463755
79	NC_009050	TCG	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463755
80	NC_009050	CCG	2	6	3002	3007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463755
81	NC_009050	GCGG	2	8	3010	3017	0 %	0 %	75 %	25 %	126463755
82	NC_009050	GCC	3	9	3032	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463755
83	NC_009050	GCC	2	6	3060	3065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463755
84	NC_009050	AGC	2	6	3068	3073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463755
85	NC_009050	CGT	2	6	3099	3104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463755
86	NC_009050	TCG	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463755
87	NC_009050	GTT	2	6	3202	3207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126463755
88	NC_009050	CTT	2	6	3259	3264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126463755
89	NC_009050	TCGTGC	2	12	3308	3319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463755
90	NC_009050	GCA	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463755
91	NC_009050	ATG	2	6	3341	3346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126463755
92	NC_009050	CAC	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126463755
93	NC_009050	GCT	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463755
94	NC_009050	CG	4	8	3617	3624	0 %	0 %	50 %	50 %	126463755
95	NC_009050	CG	3	6	3718	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	126463755
96	NC_009050	GC	3	6	3733	3738	0 %	0 %	50 %	50 %	126463755
97	NC_009050	AGG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463755
98	NC_009050	GCA	2	6	3804	3809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463755
99	NC_009050	GCCC	2	8	3840	3847	0 %	0 %	25 %	75 %	126463755
100	NC_009050	GTTC	2	8	3906	3913	0 %	50 %	25 %	25 %	126463755
101	NC_009050	GTC	2	6	3931	3936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463755
102	NC_009050	CG	3	6	3978	3983	0 %	0 %	50 %	50 %	126463755
103	NC_009050	GGC	2	6	4042	4047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463755
104	NC_009050	GC	3	6	4100	4105	0 %	0 %	50 %	50 %	126463755
105	NC_009050	CGC	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463755
106	NC_009050	TCG	2	6	4194	4199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463755
107	NC_009050	CATGC	2	10	4207	4216	20 %	20 %	20 %	40 %	126463755
108	NC_009050	GAG	2	6	4266	4271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009050	CTGC	2	8	4292	4299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009050	GC	3	6	4308	4313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009050	CTG	2	6	4344	4349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009050	T	6	6	4363	4368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009050	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009050	CGG	2	6	4532	4537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463756
115	NC_009050	CGG	2	6	4544	4549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463756
116	NC_009050	CCTC	2	8	4586	4593	0 %	25 %	0 %	75 %	126463756
117	NC_009050	GC	3	6	4658	4663	0 %	0 %	50 %	50 %	126463756
118	NC_009050	TCA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126463756
119	NC_009050	GTG	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126463756
120	NC_009050	TCG	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463756
121	NC_009050	CG	4	8	4798	4805	0 %	0 %	50 %	50 %	126463756
122	NC_009050	CTGG	2	8	4834	4841	0 %	25 %	50 %	25 %	126463756
123	NC_009050	AGC	2	6	4844	4849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463756
124	NC_009050	GCT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463756
125	NC_009050	CTG	2	6	4862	4867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463756
126	NC_009050	GCC	2	6	4958	4963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463756
127	NC_009050	TCT	2	6	4974	4979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126463756
128	NC_009050	GAG	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463756
129	NC_009050	CTC	2	6	5014	5019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126463756
130	NC_009050	CGC	2	6	5059	5064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463756
131	NC_009050	CGCC	2	8	5182	5189	0 %	0 %	25 %	75 %	126463756
132	NC_009050	GAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463756
133	NC_009050	CTG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463756
134	NC_009050	TGG	2	6	5451	5456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126463756
135	NC_009050	CG	3	6	5507	5512	0 %	0 %	50 %	50 %	126463756
136	NC_009050	ATC	3	9	5534	5542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126463756
137	NC_009050	TGA	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126463756
138	NC_009050	CG	3	6	5667	5672	0 %	0 %	50 %	50 %	126463756
139	NC_009050	CCCCG	2	10	5712	5721	0 %	0 %	20 %	80 %	126463756
140	NC_009050	CCCGAG	2	12	5729	5740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126463756
141	NC_009050	CGG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463756
142	NC_009050	GGC	2	6	5783	5788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463757
143	NC_009050	GCCA	2	8	5813	5820	25 %	0 %	25 %	50 %	126463757
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152	NC_009050	GCCC	2	8	6323	6330	0 %	0 %	25 %	75 %	126463757
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160	NC_009050	GC	3	6	6559	6564	0 %	0 %	50 %	50 %	126463757
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164	NC_009050	CCGG	2	8	6718	6725	0 %	0 %	50 %	50 %	126463757
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169	NC_009050	CG	3	6	6899	6904	0 %	0 %	50 %	50 %	126463757
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232	NC_009050	TCAGGA	2	12	9330	9341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126463758
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234	NC_009050	GTG	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126463758
235	NC_009050	GCAGCC	2	12	9382	9393	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126463758
236	NC_009050	TCC	2	6	9401	9406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126463758
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238	NC_009050	ATC	2	6	9606	9611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
239	NC_009050	CGACC	2	10	9648	9657	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
240	NC_009050	GC	3	6	9750	9755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
241	NC_009050	GCTT	2	8	9769	9776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
242	NC_009050	TCC	2	6	9809	9814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
243	NC_009050	CG	3	6	9867	9872	0 %	0 %	50 %	50 %	126463759
244	NC_009050	CTG	2	6	9911	9916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463759
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247	NC_009050	GATC	2	8	10063	10070	25 %	25 %	25 %	25 %	126463759
248	NC_009050	CGG	2	6	10117	10122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463759
249	NC_009050	TCA	2	6	10146	10151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126463759
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251	NC_009050	GCG	3	9	10221	10229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463759
252	NC_009050	GTC	2	6	10235	10240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126463759
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254	NC_009050	CAG	2	6	10288	10293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463759
255	NC_009050	TAC	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126463759
256	NC_009050	CGG	2	6	10366	10371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463759
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258	NC_009050	AGG	2	6	10458	10463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126463759
259	NC_009050	G	7	7	10532	10538	0 %	0 %	100 %	0 %	126463759
260	NC_009050	GGGT	2	8	10557	10564	0 %	25 %	75 %	0 %	126463759
261	NC_009050	CT	3	6	10574	10579	0 %	50 %	0 %	50 %	126463759
262	NC_009050	GCA	2	6	10599	10604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463759
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264	NC_009050	ACGAG	2	10	10614	10623	40 %	0 %	40 %	20 %	126463759
265	NC_009050	GCA	2	6	10630	10635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463759
266	NC_009050	CGA	2	6	10636	10641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463759
267	NC_009050	ACC	2	6	10649	10654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126463759
268	NC_009050	TCT	2	6	10701	10706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126463759
269	NC_009050	GCG	2	6	10741	10746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463760
270	NC_009050	GCC	2	6	10762	10767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463760
271	NC_009050	GCCG	2	8	10770	10777	0 %	0 %	50 %	50 %	126463760
272	NC_009050	GCG	2	6	10811	10816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463760
273	NC_009050	TGG	2	6	10820	10825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126463760
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280	NC_009050	CTGG	2	8	11052	11059	0 %	25 %	50 %	25 %	126463760
281	NC_009050	GC	3	6	11122	11127	0 %	0 %	50 %	50 %	126463760
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285	NC_009050	CTGC	2	8	11271	11278	0 %	25 %	25 %	50 %	126463760
286	NC_009050	AGC	2	6	11290	11295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126463760
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294	NC_009050	CGGC	2	8	12083	12090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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313	NC_009050	GGT	2	6	13139	13144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126463762
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323	NC_009050	CGC	2	6	13456	13461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463762
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392	NC_009050	TCGA	2	8	16199	16206	25 %	25 %	25 %	25 %	126463765
393	NC_009050	TC	4	8	16333	16340	0 %	50 %	0 %	50 %	126463765
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398	NC_009050	CTC	2	6	16791	16796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126463766
399	NC_009050	ATT	2	6	16867	16872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126463766
400	NC_009050	ATG	3	9	16888	16896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126463766
401	NC_009050	GCG	2	6	16946	16951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126463766
402	NC_009050	TCC	2	6	17000	17005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126463766
403	NC_009050	GGC	2	6	17076	17081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_009050	CGG	2	6	17111	17116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_009050	CGG	2	6	17130	17135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_009050	CGC	2	6	18530	18535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126463768
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443	NC_009050	CG	3	6	18621	18626	0 %	0 %	50 %	50 %	126463768
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